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Ⅱ组内含子是一类具有自我催化功能的大分子RNA,分布于低等真核生物和植物的细胞器、细菌和古细菌基因组中,细胞核基因组和高等真核生物中至今没有发现Ⅱ组内含子。Ⅱ组内含子的一级结构保守性很低,但是都能形成高度保守的二级结构。其二级结构包括6个结构域,即DI～DVI;DI是最大的结构域,而DV是最保守的结构域,它们共同构成Ⅱ组内含子的催化活性中心。很多Ⅱ组内含子的DIV编码成熟酶,负责Ⅱ组内含子的自我剪接和移动。在体内,Ⅱ组内含子能够在多种蛋白质因子的帮助下正确折叠形成天然构象,催化自我剪接;这些蛋白质因子有的由Ⅱ组内含子编码(成熟酶),有的由宿主基因编码。Ⅱ组内含子除了作为催化RNA(核酶)之外,还是一类逆转座子,能够有效地归巢(homing)进入无内含子的等位基因,也能够以极低频率转座(transposition)进入无内含子的非等位基因。现在一般认为Ⅱ组内含子是细胞核剪接体内含子和非长末端逆转座子的祖先。本论文鉴定了红海束毛藻(Trichodesmium erythraeum)基因组中的Ⅱ组内含子,分析了这些Ⅱ组内含子的分布特征,并运用生物信息学工具(如BLAST、CLUSTAL、Mfold)比较系统地研究了这些内含子的结构特征。同时,在大肠杆菌中研究了Ⅱ组内含子的剪接机理;分别构建含有Ⅱ组内含子和成熟酶编码序列的重组质粒,依次转化大肠杆菌,通过筛选获得含有双质粒的阳性克隆,然后诱导表达,提取总RNA,进行逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR),经琼脂糖凝胶电泳检测,最后测序鉴定。研究表明:红海束毛藻基因组中Ⅱ组内含子的分布具有特殊性;约50%的Ⅱ组内含子插入高度保守的蛋白质编码基因内,几个保守基因中存在多个Ⅱ组内含子,而且存在Ⅱ组内含子和蛋白质内含子共存的现象。绝大部分Ⅱ组内含子之间具有高度的同源性(大于70%),而它们的插入位点序列差异性很大,这说明在红海束毛藻基因组中多次发生Ⅱ组内含子的逆转座现象。实验证明TerⅡ6、TerⅡ7、TerⅡ18和TerⅡ24编码成熟酶不能帮助TerⅡ1、TerⅡ2、TerⅡ3、TerⅡ4、TerⅡ6、TerⅡ7和TerⅡ16剪接;TerⅡ8和TerⅡ10编码成熟酶不能帮助TerⅡ6、TerⅡ7和TerⅡ16剪接;TerⅡ16编码成熟酶也不能帮助TerⅡ1、TerⅡ2、TerⅡ3、TerⅡ4和TerⅡ7剪接,但能帮助TerⅡ6和TerⅡ16剪接。

关键词： II组内含子成熟酶剪接机理同源性分析

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巯基改性稻壳炭对镉的吸附特性及土壤中镉活性的影响

巯基改性稻壳炭对镉的吸附特性及土壤中镉活性的影响

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作者：邵爱云南京农业大学

学位级别：硕士

重金属污染的治理问题一直是全球研究的热点,镉作为具有代表性的重金属污染物之一,当人体摄入量积累到一定程度后会严重影响神经系统、消化系统、造血系统和血液循环系统的机能,甚至可能导致人或动物死亡。因重金属污染物不会转化消失,... 详细信息

重金属污染的治理问题一直是全球研究的热点,镉作为具有代表性的重金属污染物之一,当人体摄入量积累到一定程度后会严重影响神经系统、消化系统、造血系统和血液循环系统的机能,甚至可能导致人或动物死亡。因重金属污染物不会转化消失,所以需采用各种手段将其固定下来,而巯基基团可以与重金属形成稳定的金属络合物。本文介绍的稻壳是一种天然的农林废弃物,常被热解制成生物炭,以得到更好的资源化利用,稻壳生物炭又具有比表面积大、孔隙率高、表面官能团丰富、稳定性强等优良特性,因此可以用来改善土壤性质和去除废水中的重金属,所以它是一种重要的吸附和钝化材料。但生物炭吸附重金属的能力有限,如何通过改性的方法提高生物炭对重金属钝化能力的研究是十分必要的。本文通过在稻壳炭上嫁接巯基,借此对稻壳炭进行改性,制备在两种不同热解温度和两种不同巯基改性方法下的四种巯基改性稻壳炭,利用各种分析检测手段,对巯基改性生物炭的物理化学性状进行比较分析,确定最佳的巯基改性材料。通过批量吸附实验探讨了巯基改性稻壳炭对镉的吸附特性,并通过在室内进行土壤培养试验研究巯基改性稻壳炭的施用对土壤性质和镉金属形态的影响,以期为水体和土壤中重金属污染的治理提供实践基础。所得试验结果如下:首先,分别对350℃和550℃下热解制成的稻壳炭嫁接巯基基团,将疏基乙酸和3-巯丙基三甲氧基硅烷(MPTMS)作为巯基供体,对稻壳炭进行巯基改性。采用比表面积及孔径分析、带能谱的扫描电镜、傅里叶红外光谱、X射线衍射等手段进行表征,结果表明:在350℃热解温度下制备的稻壳炭利用MPTMS作为改性剂改性得到的巯基改性稻壳炭:表面更加清晰光滑,硫占比相对更大,比表面积相对改性前增加,巯基含量最多。然后选取在350℃热解温度下制备的稻壳炭,进行巯基改性稻壳炭对镉的吸附效果研究。通过批量试验得到:反应温度45℃,pH=5,固液比1 g·L,反应时间240 min;吸附模型更符合langmuir等温吸附模型,拟合等到的最大吸附量从改性前的12.80 mg·g增加至21.05 mg·g;吸附动力学表明更符合准二级动力学,相关系数R2>0.9992;吸附解吸实验表明巯基改性稻壳炭吸附重金属镉后有更好的亲和力及稳定性。整个吸附过程是以自发均匀单分子层快速吸热的化学吸附为主。最后,将巯基改性前、后的稻壳炭添加至土壤中,得到其对土壤基本性质的影响情况如下:能改善土壤pH,提高土壤阳离子交换量(3.15～3.65ccom·Kg),在模拟重金属镉污染的土壤中,镉的有机结合态和残渣态随稻壳炭添加比例增加而增加,且用添加巯基改性稻壳炭的土壤吸附重金属镉后解吸率最低,第三个月内解吸率在0.01%～2.62%。巯基改性后不会影响稻壳炭原有的特性,并且能在此基础上改善土壤性质和提高稻壳炭对土壤中重金属镉的钝化能力。

关键词：镉巯基改性吸附特性稻壳炭

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断裂蛋白质内含子的剪接机制、起源和进化

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中国生物化学与分子生物学报 2008年第6期24卷 512-521页

作者：邵爱云孟清东华大学生物科学与技术研究所上海201620

蛋白质内含子(intein)是具有自我催化活性的蛋白质.翻译后,通过蛋白质剪接从蛋白质前体中去掉,并以肽键连接两侧蛋白质外显子(extein)形成成熟蛋白质.断裂蛋白质内含子(splitintein)在蛋白质内含子中部区域特定位点发生断裂,形成N端片段... 详细信息

蛋白质内含子(intein)是具有自我催化活性的蛋白质.翻译后,通过蛋白质剪接从蛋白质前体中去掉,并以肽键连接两侧蛋白质外显子(extein)形成成熟蛋白质.断裂蛋白质内含子(splitintein)在蛋白质内含子中部区域特定位点发生断裂,形成N端片段和C端片段,分别由基因组上相距较远的两个基因编码.现在已知,它仅分布于蓝细菌和古细菌中.断裂蛋白质内含子的N端片段和C端片段通过非共价键(如静电作用)相互识别,重建催化活性中心,介导蛋白质反式剪接.断裂蛋白质内含子的发现进一步深化了人们对基因表达和蛋白质翻译后成熟过程复杂性的认识,而且它在蛋白质工程、蛋白质药物开发和蛋白质结构与功能研究等方面有非常广泛的应用.本文试图综述断裂蛋白质内含子的分布、结构特征和剪接机制,并分析其可能的起源和进化途径.

关键词：蛋白质内含子断裂蛋白质内含子等位蛋白质内含子蛋白质反式剪接起源进化

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丛书名：扬州房地产发展文存

2009年

作者：邵爱云徐伟萍编

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Ⅱ组内含子(Group Ⅱ Introns)的分布及多样性

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中国生物化学与分子生物学报 2007年第8期23卷 605-611页

作者：周海燕邵爱云孟清东华大学生物科学与技术研究所上海201620

Ⅱ组内含子(groupⅡintron)存在于原生生物、真菌、藻类、植物细胞器以及细菌和古细菌基因组中.在体内,Ⅱ组内含子可通过两步连续的转酯反应从前体RNA中自剪接,并连接两侧外显子.许多Ⅱ组内含子的剪接反应是由蛋白质辅助完成的,这种蛋... 详细信息

Ⅱ组内含子(groupⅡintron)存在于原生生物、真菌、藻类、植物细胞器以及细菌和古细菌基因组中.在体内,Ⅱ组内含子可通过两步连续的转酯反应从前体RNA中自剪接,并连接两侧外显子.许多Ⅱ组内含子的剪接反应是由蛋白质辅助完成的,这种蛋白质有的是由内含子编码,有的是由宿主基因编码.Ⅱ组内含子能够有效地归巢进入无内含子的等位基因,也能够以低频率逆转座进入非等位基因.转座过程依赖内含子RNA和内含子编码的蛋白质(内切核酸酶活性和逆转录酶活性).本论文在总结Ⅱ组内含子最新研究成果的基础上,分析Ⅱ组内含子可能的起源和进化途径.

关键词： Ⅱ组内含子逆转座子 RNA剪接逆转录归巢逆转座

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村庄整治项目的确定及相关措施——以北京市平谷区甘营村村庄整治规划为例

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建筑学报 2006年第5期 8-11页

作者：邵爱云方明李霞中国建筑设计研究院小城镇发展研究中心北京100044

在新农村建设的大背景下,以北京市平谷区甘营村为例,深入分析新时期村庄建设存在的具体问题及村庄发展需求,充分尊重村民意愿,对村庄具体整治项目及相关措施进行梳理总结,将整治项目重点放在设施配套和环境治理上,改变农村环境、基础设... 详细信息

在新农村建设的大背景下,以北京市平谷区甘营村为例,深入分析新时期村庄建设存在的具体问题及村庄发展需求,充分尊重村民意愿,对村庄具体整治项目及相关措施进行梳理总结,将整治项目重点放在设施配套和环境治理上,改变农村环境、基础设施、社会事业发展滞后状况,逐步实现工业反哺农业、城市带动农村的转变,为全面构建小康社会打下良好基础。

关键词：村庄规划整治项目因地制宜设施配套村庄人居环境

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