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主题

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机构

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143 篇 东南大学
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117 篇 河北科技大学
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97 篇 《信息化建设》编辑...
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作者

984 篇 邢佰英
834 篇 邢兆远
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778 篇 邢生祥
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387 篇 邢曼玉
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249 篇 邢少文
215 篇 邢邦明
215 篇 邢天笑
215 篇 邢丁
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194 篇 邢海洋
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176 篇 邢梦宇
162 篇 邢亚辉
160 篇 邢皓
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乙型流感病毒蛋白BM2与BM1结合机制的分子动力学模拟研究

乙型流感病毒蛋白BM2与BM1结合机制的分子动力学模拟研究

引用

作者：邢贵轩吉林大学

学位级别：硕士

流行性感冒病毒（简称流感）严重影响了人类的生命健康和社会经济的正常运行。根据世界卫生组织的统计,每年约有29-65万人死于流感或流感引起的并发症。在人类社会中,甲型流感病毒和乙型流感病毒是引起人类疾病的主要元凶。其中,乙型流... 详细信息

流行性感冒病毒（简称流感）严重影响了人类的生命健康和社会经济的正常运行。根据世界卫生组织的统计,每年约有29-65万人死于流感或流感引起的并发症。在人类社会中,甲型流感病毒和乙型流感病毒是引起人类疾病的主要元凶。其中,乙型流感病毒引起的疾病占总体疾病数目的50%以上。在流感病毒粒子中,存在两种重要的蛋白,即Influenza B Virus Matrix Protein 2（BM2）和Influenza B Virus Matrix Protein 1（BM1）蛋白。BM2与BM1之间的相互作用对于病毒的组装和复制至关重要。明确BM2与BM1之间的结合机制有利于了解病毒的组装与复制过程,可为设计阻断BM2与BM1之间相互作用的抑制剂提供有益的参考。本论文利用分子动力学模拟的方法研究了BM2与BM1的相互作用细节及不同结合区域的残基突变对结合的影响情况。主要研究内容如下:1.乙型流感病毒野生型体系中BM2与BM1结合的关键因素乙型流感病毒蛋白BM2与BM1在病毒复制过程中发挥重要作用,在病毒复制的后期,BM2负责募集BM1到病毒包膜表面完成病毒的组装。BM2与BM1结构的完整性是研究BM2-BM1相互作用的前提。但由于病毒内部环境复杂,BM1的晶体结构尚未被解析,且BM2碳端螺旋的部分残基缺失,在一定程度上影响了对BM2与BM1相互作用的研究。在本部分的研究工作中,我们借助同源模建方法构建了BM1的氮端结构,通过I-TASSER服务器补全了BM2的碳端结构,并在所构建的BM1和BM2模型的基础上,使用分子对接构建了BM2-BM1的复合物模型,采用分子动力学模拟结合自由能面图（FEL）和MM-GBSA等方法考察了BM2与BM1之间的相互作用细节。研究结果表明,BM2和BM1结合界面处的R1、R2和R3三个区域形成了氢键和盐桥相互作用。其中R1区域是BM2与BM1结合的关键区域,残基E94B与R101BM1、K102BM1、R105BM1、E88B和E104B形成了一个稳定的氢键网络和盐桥相互作用对结合做出重要贡献。R2区域中,BM2中的E94D、D83D和D81B与BM1的K92BM1、K93BM1、K94BM1与形成稳定的盐桥相互作用。在R3区域中,BM2的C链螺旋的残基（E94C、K97C、T101C、E104C）与BM1的残基M86BM1、E81BM1、D54BM1、C51BM1、R50BM1形成了氢键相互作用。这些盐桥和氢键相互作用对二者稳定结合有一定的辅助作用。该项工作丰富了BM2与BM1结合界面的相互作用信息,为靶向BM2与BM1相互作用界面的抗流感抑制剂设计提供了一定的理论参考。2.乙型流感病毒不同区域残基突变对BM2与BM1结合的影响R1区域中,关键残基E94B发挥了重要作用,它与周围的残基形成了稳定的氢键网络和盐桥相互作用,对BM2与BM1的结合做出较大贡献,该残基位于实验上鉴定的BM2的效应区（86-97号残基）中。实验表明,包含E94残基突变的92-94A突变体会极大程度上影响病毒组装和复制。此外,89-91A突变体也会造成与92-94A突变体相同程度的影响。这两组突变位点残基分别对应于效应区域中BM2的碳端螺旋前部与loop区的残基。效应区域外,BM2与BM1结合界面碳端螺旋中部的98-100A突变体对病毒组装和复制影响较小,这一现象尚未有明确的解释。针对这三个区域,我们分别选取了BM2的效应区域内碳端螺旋前部（92-94A）、loop区（89-91A）以及效应区外碳端螺旋中部区域（98-100A）残基进行突变型体系的构建,以考察突变对BM2与BM1结合的影响。分子动力学模拟结果表明,突变直接或间接的破坏R1区域以E94B为中心的氢键网络从而改变蛋白的结合模式,在第一组突变型体系（92-94A）中,突变直接破坏了R1区域的氢键网络,改变了病毒的结合模式从而影响了病毒的组装和复制。在二组突变型体系中（89-91A）,突变很大程度上破坏了BM2与BM1之间的盐桥和氢键相互作用,BM1蛋白因失去氢键和盐桥的稳定作用而发生位移,因此对病毒组装和复制有较大影响。在第三组突变型体系中（98-100A）,突变仅破坏了R2区域的盐桥相互作用,而R1区域的氢键网络并未破坏,因此对病毒组装和复制影响较小。该部分工作在原子水平上阐明了三个不同区域残基突变对BM2与BM1相互作用的影响,有助于我们更好地理解BM2与BM1之间的相互作用机制。

关键词： BM2-BM1结合蛋白-蛋白相互作用分子对接残基突变分子动力学模拟

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基于硫化物异质结构纳米阵列的制备及光电探测性能研究

基于硫化物异质结构纳米阵列的制备及光电探测性能研究

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作者：邢士博河南工业大学

学位级别：硕士

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沉香来源2-（2-苯乙基）色酮衍生物靶向c-Met抑制突变非小细胞肺癌的作用机制研究

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作者：邢宝娟南京中医药大学

学位级别：硕士

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组蛋白H2A.Z变体调控番茄侧枝生长的分子机制

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作者：邢恩杰扬州大学

学位级别：硕士

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青少年自然联结、反刍思维和抑郁的关系及干预研究

青少年自然联结、反刍思维和抑郁的关系及干预研究

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作者：邢紫璇闽南师范大学

学位级别：硕士

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两类3X3块鞍点系统的结构向后误差分析

两类3X3块鞍点系统的结构向后误差分析

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作者：邢嘉璐西北师范大学

学位级别：硕士

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吉祥纹样的数字化设计与创新表达 ——以互动影像作品《幻境花园》为例

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作者：邢梓萱山东工艺美术学院

学位级别：硕士

中华优秀传统文化的创造性转化与创新性发展,是当今中国文化事业发展的重要政策,也是民族传统文化向现代转型的主要路径。传统艺术在科技的影响下发生变革,现代设计开始运用新的媒介和技术创作,产生了多维度、多感官的作品,为传统艺术... 详细信息

中华优秀传统文化的创造性转化与创新性发展,是当今中国文化事业发展的重要政策,也是民族传统文化向现代转型的主要路径。传统艺术在科技的影响下发生变革,现代设计开始运用新的媒介和技术创作,产生了多维度、多感官的作品,为传统艺术注入新的活力。当前,国家大力推动文化数字化发展,实施国家文化数字化战略。吉祥纹样具有深厚的文化底蕴和历史内涵,是我国历史文化的生动体现。数字化技术的运用,吉祥纹样被赋予丰富的表现形式和内涵,从而更好地传承和弘扬中华优秀传统文化。本文以吉祥纹样的文化寓意为研究对象,首先梳理吉祥纹样的历史传承,总结其文化价值与艺术价值。从媒介进化的视域下,分析媒介的发展对吉祥纹样的展示和传播产生的影响。阐述了吉祥纹样进行数字转译的必要性。通过对作品的案例分析,归纳总结虚拟现实、人工智能等数字技术在吉祥纹样创新设计中的应用价值和优势。探索在保持中华优秀传统文化和吉祥纹样的精神内涵的基础上,如何创新性地呈现吉祥纹样,满足当代人的审美和需求。以此为基础展开互动影像作品《幻境花园》的设计实践。利用数字技术将吉祥纹样进行视觉转化,延续吉祥纹样的文化内涵。通过创设沉浸式的虚拟空间,探索吉祥纹样在虚拟世界的视觉表现和载体。本文的研究探讨了数字技术在吉祥纹样传承与创新中的应用可行性,为吉祥纹样的未来发展提供新的思路和方向。

关键词：吉祥纹样数字化设计数字媒介互动影像作品

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四数九里香叶片类黄酮累积规律及CHS功能分析

四数九里香叶片类黄酮累积规律及CHS功能分析

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作者：邢琴琴中南林业科技大学

学位级别：硕士

四数九里香(Murraya tetramera Huang)为芸香科(Rutaceae)九里香属(Murraya)植物,主要生长于中国广西、云南,其根、叶均可入药,是中国传统的中草药。然而由于该植物的采收、栽培模式还较为落后,导致采收的药材有效成分含量较低,导致对... 详细信息

四数九里香(Murraya tetramera Huang)为芸香科(Rutaceae)九里香属(Murraya)植物,主要生长于中国广西、云南,其根、叶均可入药,是中国传统的中草药。然而由于该植物的采收、栽培模式还较为落后,导致采收的药材有效成分含量较低,导致对该植物开采过度,使得野生资源濒临灭绝。因此揭示四数九里香中有效成分的积累机制,建立科学的栽培与采摘体系将为野生植物资源的保护与开发奠定基础。本研究通过转录组与代谢组学联合分析揭示四数九里香叶片类黄酮累积规律以及研究类黄酮代谢的查尔酮合成酶基因(CHS)的生物学功能的调控机制,通过生物技术手段提高四数九里香类黄酮类含量,为建立四数九里香采摘与培育模式提供科学依据。主要研究结果如下:1.四数九里香叶片在不同的生长周期下具有显著的转录差异,该转录差异可能是其老叶与新叶具有不同药用价值的分子机制之一。通过对比老叶与新叶类黄酮及生物碱的总含量,结果表明老叶显著高于新叶。进一步对新叶与老叶进行转录组测序分析,组装后共获得38,989条unigenes,GO富集分析表明,差异基因主要富集在生物过程中的代谢过程(metabolic process),分子功能中的结合(binding)和催化活性(catalytic activity)。KEGG分析表明,植物激素信号转导(plant hormone signal transduction)、MAPK信号通路-植物(MAPK signaling pathway-plant)、植物-病原体相互作用(plant-pathogen interaction)、类苯丙酸生物合成(phenylpropanoid biosynthesis)是主要的富集途径,并筛选出多个MYB和bHLH转录因子可能在调控四数九里香类黄酮化合物合成中发挥重要作用。2.初步揭示了四数九里香的类黄酮合成途径,并从中分析了关键代谢产物响应生长周期的差异累积现象。通过对四数九里香新叶与老叶的代谢组进行分析,差异代谢物主要富集在2-氧代羧酸代谢(ko01210)、嘌呤代谢(ko00230)、苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成(ko00400)、乙醛酸和二羧酸代谢(ko00630)、色氨酸代谢(ko00380)、嘧啶代谢(ko00240)等代谢通路。通过转录组与代谢组学联合分析揭示了在类黄酮合成中的关键基因PAL、CYP73A、4CL、CCR,F5H、CHS、DFR、ANR、CYP81E,初步揭示了类黄酮合成通路。3.成功克隆了四数九里香的MtCHS基因及启动子序列。通过生物技术手段构建了 MtCHS基因的原核表达载体,并在大肠杆菌中成功表达了 MtCHS蛋白,验证其具有柚皮素-查尔酮合成酶活性。通过对MtCHS基因的启动子进行了克隆和分析,预测其具MYB、MYC重要的转录因子结合位点。综上所述,本研究首次针对四数九里香不同生长周期下的叶片,进行了转录与代谢差异研究,从中初步揭示了调控类黄酮合成的转录代谢通路,并进一步克隆了类黄酮合成调控相关的重要酶基因MtCHS,其进一步的生物学功能与药用物质的促合成机制还有待深入研究。

关键词：四数九里香转录组代谢组类黄酮合成 CHS 原核表达

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Cu-Cr-Zr合金的组织调控方法及性能研究

Cu-Cr-Zr合金的组织调控方法及性能研究

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作者：邢海志燕山大学

学位级别：硕士

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诺诺混合类电子音乐作品研究 ——以《灯光明照的工厂》为例

诺诺混合类电子音乐作品研究 ——以《灯光明照的工厂》为例

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作者：邢若茜中国音乐学院

学位级别：硕士

本论文的研究对象是路易吉·诺诺的《灯光明照的工厂》,通过诺诺该首作品的乐谱以及听记,将音乐信息转录的方式得出作曲技术和电子音乐技术的创作规律。在作曲技术方面,发现诺诺是如何按表意需求结构声部关系;通过二度级进结合四度五度... 详细信息

本论文的研究对象是路易吉·诺诺的《灯光明照的工厂》,通过诺诺该首作品的乐谱以及听记,将音乐信息转录的方式得出作曲技术和电子音乐技术的创作规律。在作曲技术方面,发现诺诺是如何按表意需求结构声部关系;通过二度级进结合四度五度跳进为核心音程、以及二度级进接大跳的方式完成现场女高音声部的音高组织;还使用了通过微分音增加音乐表现力、根据内容标记现场女高音不同演唱技巧、通过反差增加音乐表现力等其它作曲技术来完成作品。在电子音乐技术方面,发现诺诺在作品中以音乐的方式组织具体声音,包括通过拼贴技术完成音乐的某些特殊发展方式、为了连贯性采用“接力式”衔接、挖掘具体声音的音乐性以及引入意外声音作为强调;使用了配合声部关系的声场布局、通过声场技术再现场景、以及通过声场技术间接表意的声场技术;同时还使用了通过均衡器效果造成独特听感、通过多重混响实现声音分层、通过电子音乐技术强调突出某声部或声音等其它电子音乐技术。

关键词：路易吉·诺诺混合类灯光明照的工厂作曲技术电子音乐技术

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