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基于变量聚类的BP神经网络术后生存期预测模型

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浙江大学学报（工学版） 2018年第12期52卷 2365-2371页

作者：孟濬邓晓雨虞捷舟浙江大学电气工程学院浙江杭州310058

针对结直肠癌患者术后生存期预测,基于模糊C均值(FCM)聚类算法,提出一种结合场景认知和隶属度排序的变量聚类方法,对结直肠癌患者样本进行降维,并筛选出6个特征变量.结合BP神经网络,建立一个结直肠癌患者术后生存期预测模型.为了验证该... 详细信息

针对结直肠癌患者术后生存期预测,基于模糊C均值(FCM)聚类算法,提出一种结合场景认知和隶属度排序的变量聚类方法,对结直肠癌患者样本进行降维,并筛选出6个特征变量.结合BP神经网络,建立一个结直肠癌患者术后生存期预测模型.为了验证该模型的有效性,利用主成分分析(PCA)对样本进行降维,并训练BP神经网络,对比FCM模型及PCA模型的预测准确率.结果显示,基于FCM变量聚类的BP神经网络模型预测准确率更高,所提出的变量聚类方法能够有效筛选出对于生存期有相关性和解释性的变量,从而提高BP神经网络模型的预测准确率.

关键词：结直肠癌生存期预测变量聚类模糊均值(FCM)聚类 BP神经网络主成分分析(PCA)

抗Pneumolysin O的全人源基因工程抗体的构建及其生物学活性分析

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抗Pneumolysin O的全人源基因工程抗体的构建及其生物学活性分析

作者：邓晓雨西南大学

学位级别：硕士

肺炎链球菌能引起中耳炎、肺炎、脑膜炎、心内膜炎和败血症。据WHO统计全球每年约100万婴幼儿死于肺炎链球菌感染,其中我国约占3万。近年肺炎链球菌耐药性日益严重,且引起肺炎的病原体复杂多样难以快速鉴别诊断,从而导致用药不当或用药... 详细信息

肺炎链球菌能引起中耳炎、肺炎、脑膜炎、心内膜炎和败血症。据WHO统计全球每年约100万婴幼儿死于肺炎链球菌感染,其中我国约占3万。近年肺炎链球菌耐药性日益严重,且引起肺炎的病原体复杂多样难以快速鉴别诊断,从而导致用药不当或用药延迟,诸多因素导致肺炎链球菌感染成为婴幼儿死亡的重要原因。肺炎链球菌溶血素(Pneumolysin O,PLY)在肺炎链球菌的致病过程中发挥了重要作用:它能破坏气管上皮和血脑屏障的完整性,细菌得以进入血液、入侵大脑;激活NLRP3炎症小体,刺激多种细胞分泌炎性细胞因子,引发细胞因子风暴。在7价、10价、13价PCVs的基础上研制的新型蛋白结合疫苗含有PLY类毒素,动物实验、1期和2期临床试验结果表明新型疫苗具有良好的免疫原性和安全性。由于含PLY类毒素的蛋白质结合疫苗应用于临床还将有很长一段时间,研发全人源抗PLY中和性抗体辅助治疗肺炎链球菌重症感染者对于降低病死率、保护年轻家庭具有重大现实意义。我们前期获得的抗SLY全人源单克隆抗体可以有效阻断r PLY的溶血活性,本研究利用该抗体的可变区序列构建基因工程抗体,通过细胞试验和动物试验验证其对r PLY的中和作用。主要研究方法和结果如下:***及其不同结构域蛋白的原核表达将肺炎链球菌D39株的ply基因及编码PLY D1-3和PLY D4的基因片段克隆到p ET28a质粒的Xho I-Bam H I位点之间,成功构建了重组质粒p ET28a-ply、p ET28a-ply d1-3和p ET28a-ply d4。将重组质粒导入*** BL21(DE3)中,重组菌在16℃经1 m M IPTG诱导18 h,菌体经超声破碎后检测发现r PLY、r PLY D1-3、r PLY D4三种重组蛋白均可溶性表达。表达产物经Ni-NTA亲和柱纯化,SDS-PAGE及溶血试验,结果显示各重组蛋白的分子量与理论值相符,纯度在90%以上;r PLY具有溶血活性。2.抗PLY全人源基因工程抗体的研制通过蛋白免疫印迹实验、酶联免疫吸附法和溶血阻断实验发现本实验室前期获得的三株抗SLY全人源单克隆抗体1-10F、2-2G、4-2G对r PLY有较高亲和力,也能阻断其溶血作用。克隆这三株杂交瘤细胞的抗体轻链和重链可变区基因到改造后的p CDNA3.4载体中,得到重组质粒p CDNA3.4-1-10F-V、p CDNA3.4-1-10F-V、p CDNA3.4-2-2G-V、p CDNA3.4-2-2G-V、p CDNA3.4-4-2G-V和p CDNA3.4-4-2G-V。分别将3株抗体轻链和重链的表达载体共转染HEK293F细胞,7天后收集细胞培养液,利用Protein A亲和层析柱纯化得到基因工程抗体1-10F、2-2G和4-2G,经SDS-PAGE检测抗体分子量与理论值相符,纯度在98%以上。用ELISA法检测1-10F、2-2G和4-2G对r PLY的EC值分别为:41.61μM,15.52μM,48.40μM;K值分别是:1.99×10,3.99×10,9.31×10。2-2G的亲和力最高,1-10F和4-2G次之。蛋白免疫印迹显示这三株抗体识别的抗原表位存在于r PLY第1-3结构域,它们不结合第四结构域。3.基因工程抗体的体内、体外中和作用分别用红细胞和HEK293细胞测定三株全人源基因工程抗体的体外中和作用,结果表明500μg/m L 1-10F对2.7 n M r PLY(相当于1个溶血单位)溶血作用的阻断率达到了95%以上,对10.8 n M r PLY的阻断率达到了80%以上。其它两株抗体阻断效果稍差,250μg/m L 2-2G对2.7 n M r PLY的阻断率仅为45%,对10.8n M r PLY的阻断率为20%,且抗体剂量提高后阻断率并无明显提高。抗体4-2G的阻断效果界于两者之间,在500μg/m L浓度下对2.7 n M r PLY的阻断率达到了75%以上,对10.8 n M r PLY也可达到60%。对于HEK293细胞,750μg/m L1-10F可阻断1090 n M r PLY(相当于2 IC)70%的细胞毒性作用,其他2种抗体无明显阻断效果。体内中和作用采用预防性被动免疫试验评估抗体对r PLY导致的炎症反应和组织损伤的保护作用。给5周龄BALB/c小鼠皮下注射160μg基因工程抗体1-10F,对照组注射生理盐水,24 h后腹腔注射45μg r PLY,在攻毒后的1、3、5 h取血测定各组血清中IL-1β、TNF-α、IFN-γ和IL-8浓度,在最后一个时间点取各组小鼠的心脏、肺脏、肝脏、脾脏,经多聚甲醛固定后进行免疫组化和病理分析。结果显示:攻毒后对照组小鼠血清中IL-1β、TNF-α、IFN-γ和IL-8水平随时间延长逐渐

关键词：肺炎链球菌肺炎链球菌溶血素全人源基因工程抗体中和作用

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当代文学视阈下的非虚构文学

当代文学视阈下的非虚构文学

作者：邓晓雨东北师范大学

学位级别：硕士

2010年2月，人民文学开启了“非虚构”栏目，“非虚构”这一概念再次引起了广泛的反响与热潮，本文从“非虚构”一词在西语文化语境和中国近现代文学史上的发展脉络入手探寻，从阐释学等当代文化批评的角度探讨了这一概念在文学理论上... 详细信息

2010年2月，人民文学开启了“非虚构”栏目，“非虚构”这一概念再次引起了广泛的反响与热潮，本文从“非虚构”一词在西语文化语境和中国近现代文学史上的发展脉络入手探寻，从阐释学等当代文化批评的角度探讨了这一概念在文学理论上的合法界定，即与史传作品以及报告文学等传统非虚构问题的区别。同时对非虚构在20世纪初又一次成为热点的社会美学成因，进行了深入的讨论。“非虚构”不仅仅显现出文学的需求，更显示了当代社会某种“真文化”的缺失。

关键词：非虚构人民文学文学批评

焙烤平欧榛子挥发性成分分析及酶法生香工艺初探

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焙烤平欧榛子挥发性成分分析及酶法生香工艺初探

作者：邓晓雨沈阳农业大学

学位级别：硕士

榛子是我国重要的木本油料之一。平欧榛子是由我国原产的平榛(***)与引入我国的欧洲榛(*** L)种间远缘杂交育出的优良品种,由于具有抗寒适应性强、果实大、丰产、出仁率高的特点,在我国发展迅速。焙烤对榛子油脂香气具有重要的影响,使... 详细信息

榛子是我国重要的木本油料之一。平欧榛子是由我国原产的平榛(***)与引入我国的欧洲榛(*** L)种间远缘杂交育出的优良品种,由于具有抗寒适应性强、果实大、丰产、出仁率高的特点,在我国发展迅速。焙烤对榛子油脂香气具有重要的影响,使榛仁获得特有的风味。焙烤产生的特征性香气物质不仅可作为榛仁的重要品质指标,还可用为烘焙过程中的生物安全标记物用于风险评估和质量管控,通过客观和可衡量的指标适当地监控焙烤过程,进而可能调整获得产品所需的感官性状。本研究以高质量的平欧榛子为试材,结合多种挥发性香气成分检测、分析技术,明确平欧榛子的特征挥发性香气物质,研究香气前体物质在焙烤过程中的生化变化及其与焙烤香气形成的关系,以及明确对平欧榛子固有香气成分的化学本质及其在加工过程中的变化规律,为烘焙榛仁生产标准化程序的完善和品质判别等提供理论依据。本文试验采用HS-SPME-GC-MS技术对不同焙烤程度榛子中挥发性成分进行收集、检测、定性定量分析,主成分分析法法进行进一步分析确定挥发性成分中的香气成分及其贡献率;使用氨基酸分析仪和滴定法分别确定了焙烤过程中氨基酸和糖消耗的量和种类,模拟美拉德反应并进行抗氧化实验;将榛子粕使用碱性蛋白酶和风味酶水解,以水解度和可溶性氮含量作为水解指标,水解产物进行模拟美拉德反应,通过HS-SPME-GC-MS技术对产物进行检测分析,主要研究结果如下:1.采用固相微萃取与气质联用技术,根据平欧榛子中挥发性成分峰面积来优化固相微萃取针头萃取效率,最佳萃取条件是:萃取温度60℃、萃取时间30min,解析时间3.5min。2.利用HS-SPME-GC/MS技术分析检测生的榛子、1号榛子、2号榛子和3号榛子榛子的中挥发性成分,进行定性和定量分析。结果表明,生榛子中的挥发性成分种类和数量最少,具有焙烤坚果特征香气的吡嗪类物质在不同焙烤程度的榛子中均被检测。随着焙烤程度的增加,挥发性成分种类和数量递增,3号榛子中检测到的挥发性成分种类数量最多。3.通过主成分分析法确定了 11种对微波炉焙烤后的平欧榛子香气有贡献的挥发性成分,分别是:甲基吡嗪、2,5-二甲基吡嗪、3-乙基-2,5-二甲基吡嗪、2-乙基-3,5-二甲基吡嗪、苯乙醛、2,4-癸二烯醛、糠醛、,5-二甲基-4-羟基-3(2H)-呋喃酮、2-乙基-1-己醇、麦芽酚、2,3-二氢-2,3-二羟基-6-甲基-4H-吡喃-4-酮。通过主成分分析法,可以将11种香气成分分为两个主成分,并且通过计算F值,比较出来焙烤出的全熟平欧榛子香气质量最佳。4.应用氨基酸分析仪分析微波炉焙烤平欧榛子过程中游离氨基酸变化,其结果表明平欧榛子在焙烤过程中参与美拉德反应生成香气物质的主要氨基酸是精氨酸、谷氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸。5.可溶性糖的测定采用国标第二方法(滴定法),测得在微波炉焙烤榛子过程中大量消耗的糖类是蔗糖,而蔗糖不会直接参与美拉德反应,其水解物葡萄糖和果糖参与反应。6.利用上述六种氨基酸与两种单糖分别进行模拟美拉德反应,反应产物加入到生榛子油中,在40℃条件下保存,测定油脂过氧化值变化。结果表明葡萄糖与氨基酸美拉德反应产物的抗氧化性优于果糖与氨基酸的组合。其中,在第20天时,葡萄糖与亮氨酸的美拉德反应体系产物的抗氧化效果最好,该模拟体系中检测到的醛类和吡嗪类化合物最多。7.通过水解度和可溶性氮含量对碱性蛋白酶和风味酶水解榛子蛋白进行优化,得到在底物浓度3%时最佳水解条件是:碱性蛋白酶水解温度为55℃、水解时间为2.5h、水解pH值为10.0,酶添加量为3%;风味酶水解温度为48℃、水解时间为4h、水解pH值为6.3、酶添加量为3%。最终两种酶共同作用,榛子粕酶解液的水解度为28.93%。8.将水解后的榛子粕酶解液加入葡萄糖与果糖各1g,在油浴锅120℃条件下反应2h,反应产物冷却后利用HS-SPME-GC-MS进行挥发性成分提取分析,模拟体系检测出来30种挥发性成分,其中13种与焙烤后的平欧榛子中挥发性成分相同,占了总挥发性成分的 43.44%。

关键词：平欧榛子 HS-SPME-GC-MS 美拉德反应挥发性成分

基于机器学习和非线性理论的环境与生命信息分析研究

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基于机器学习和非线性理论的环境与生命信息分析研究

作者：邓晓雨浙江大学

学位级别：硕士

对于任何个体,其状态和活动情况都与环境有着密不可分的关系,将信息挖掘和利用延伸到环境信息中,可以进一步揭示事物规律。机器学习是21世纪初期发展起来的一项重要技术,是人工智能实现的基础;非线性理论更是研究方法从独立研究到整体... 详细信息

对于任何个体,其状态和活动情况都与环境有着密不可分的关系,将信息挖掘和利用延伸到环境信息中,可以进一步揭示事物规律。机器学习是21世纪初期发展起来的一项重要技术,是人工智能实现的基础;非线性理论更是研究方法从独立研究到整体和系统性研究的极大转变。因此,利用机器学习和非线性理论的方法分别来研究不同的环境信息,将能较为全面和深入地展现环境信息以及环境信息与个体互动关系。本文在查阅大量国内外相关文献的基础上,以“环境信息”为主要内容展开,并取得了一系列有价值的成果。本文具体从四个部分进行研究:(1)外环境信息分析。本文基于车辆自动驾驶引导方法的研究,将环境信息量化为引力场的大小和方向,得出了基本规则和强规则的自动驾驶引导方法,从而展现环境信息的利用可以引导个体行为。(2)体内微环境的外在表征分析。很多医疗指标均是体内微环境的外在表征,本文基于结直肠癌术后存活期预测的问题,提出基于FCM聚类方法的一种加入场景认知的变量聚类法,筛选出对术后生存期有关联性的指标,用以训练BP神经网络,得到了结直肠癌术后存活期预测模型。该部分通过外在表征指标展现了体内微环境对整个机体生存状态的影响作用。(3)体内微环境分析。本文深入到基因层面,利用非线性混沌思想,基于微环境的三维表征Landscape概念,给出了一种领域压缩修复法的基因修复方法,该修复法具有稳定性和兼容性,开拓了新的基因修复思路。(4)进化外环境与体内微环境的互相作用分析。本文以微环境的N维表征——基因调控网络切入,首先提出基于时间的基因调控网络构建方法,得到了基因的表达顺序,再与基因的位置顺序对比,发现了基因的“时空一致性”,展现了进化过程中外环境的改变影响着体内微环境中基因的激活和产生,进一步推论得出,基因位置或能反映进化的进程。综上所述,本文以机器学习与非线性理论为主要技术手段,从外环境到体内微环境环境再到内外环境结合,由浅入深地探索分析环境信息与个体的互动关系,得到的方法和结论对以后相关领域的研究提供了借鉴和指导。

关键词：环境信息机器学习非线性理论自动驾驶术后预测基因修复时空一致性

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不平衡学习技术在医疗数据中的应用研究

不平衡学习技术在医疗数据中的应用研究

作者：邓晓雨北京邮电大学

学位级别：硕士

随着机器学习相关技术的进步,各领域都积极地将这些技术应用到其生产经营的过程中。然而,大多数原始数据中的样本分布是不均衡的,若是使用标准的机器学习算法对不平衡数据集进行分类,会导致最终分类结果产生偏差。因此,人们针对该问题... 详细信息

随着机器学习相关技术的进步,各领域都积极地将这些技术应用到其生产经营的过程中。然而,大多数原始数据中的样本分布是不均衡的,若是使用标准的机器学习算法对不平衡数据集进行分类,会导致最终分类结果产生偏差。因此,人们针对该问题提出了一系列不平衡学习的相关技术。本文在已有不平衡学习技术的基础上,面向小样本量数据的不平衡分类问题提出了基于样本合成的偏差随机森林算法KS-BRAF和基于粒子群优化的KS-BRAF算法(KS-BRAF(PSO)),并将其应用于不平衡的医学诊断数据集的分类任务中。本文首先对原始偏差随机森林算法(Biased Random Forest,BRAF)中在合成关键区域的方法上进行了初步改进。提出的KS-BRAF算法中采用了 K-means SMOTE算法对样本进行合成,该方法既避免了生成的训练数据集信息丢失又有效减少了噪声的生成,从而提高了模型的分类效果。该算法与相关算法在KEEL公开数据集上进行的对比实验结果表明KS-BRAF算法在提高对少数类分类效果的同时又保证了较高的分类精度。随后,为了使KS-BRAF算法的分类性能更加稳定,本文提出了基于粒子群优化的KS-BRAF算法,简称KS-BRAF(PSO)算法。该算法在原始KS-BRAF算法的基础上,通过将K-means SMOTE算法与随机欠采样相结合,并采用粒子群优化算法对过采样与欠采样的样本比例分别进行优化,通过迭代使生成的关键区域数据的分布达到相对最优状态,从而提升算法的分类性能,且文中的大量实验结果也对优化后算法的分类性能进行了验证。最后,本文将KS-BRAF(PSO)算法应用到公开的宫颈癌数据集的分类预测任务中,并与已有研究中用于该数据集分类预测的算法进行对比实验,验证了该算法在该不平衡医学数据集上的分类任务中具有较好的性能,在医学诊断方面能够起到一定的辅助作用。

关键词：不平衡学习偏差随机森林粒子群优化样本合成

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诺曼·梅勒的纪实文学

戏剧之家 2016年第24期 254-255,271页

作者：邓晓雨吉林大学文学院吉林长春130000

梅勒的纪实文学主要有新新闻体和非虚构小说这两大部分,在梅勒的一生中,这两大文体占据大部分作品,并在他整个文学创作史上占有重要地位。本文主要从梅勒的两类文体为入手点,并探究其在写作特点上的突破。分析梅勒的代表作品,笔者认为,... 详细信息

梅勒的纪实文学主要有新新闻体和非虚构小说这两大部分,在梅勒的一生中,这两大文体占据大部分作品,并在他整个文学创作史上占有重要地位。本文主要从梅勒的两类文体为入手点,并探究其在写作特点上的突破。分析梅勒的代表作品,笔者认为,新新闻体写作过程中,运用明确的主观性以及纯熟的小说技巧能作为新闻报道撰写的最佳方式,也能颠覆人们对此类文体的传统理念。非虚构小说写作过程中,梅勒走出了自己的道路和想法,将原来真实的身份隐藏在小说内,并将真实的自己写入事件报道中,通过自由叙述的方式,还原事件的真相,并获取较好的文学效果,可以说是超越了同类型的作家水平,也超越了自己。

关键词：小说新新闻体自由叙述

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网络科普传播体系机制构建与效应分析

无线互联科技 2021年第21期18卷 25-26页

作者：邓晓雨吉林建筑大学科学研究处吉林长春130118

随着网络时代的到来,科普传播体系也发生了巨大变革。文章基于互联网传播的特点,对线上科学普及方式、传播内容和传播效果展开了分析,进一步阐述了科普传播体系机制的构建路径与新媒体传播方向。

关键词：互联网传播科学普及新文化传媒

猪链球菌溶血素双抗体夹心酶联免疫吸附测定方法的建立

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疾病监测 2024年

作者：陈志萍陈益吴梦邓晓雨高雅晴葛良鹏杜华茂西南大学蚕桑纺织与生物质科学学院重庆金迈博生物科技有限公司

目的建立猪链球菌溶血素（SLY）的双抗体夹心酶联免疫吸附测定（ELISA）方法，通过对SLY进行定量检测来评价猪链球菌产生SLY的能力与致病力。方法用4种胆固醇依赖性溶细胞毒素的类毒素（CDC）免疫BALB/c鼠、新西兰大白兔制备高免血清... 详细信息

目的建立猪链球菌溶血素（SLY）的双抗体夹心酶联免疫吸附测定（ELISA）方法，通过对SLY进行定量检测来评价猪链球菌产生SLY的能力与致病力。方法用4种胆固醇依赖性溶细胞毒素的类毒素（CDC）免疫BALB/c鼠、新西兰大白兔制备高免血清，以间接ELISA方法检测高免血清与重组猪溶素（rSLY）、重组肺溶血素（rPLY）、重组李斯特菌溶血素O（rLLO）和重组产气荚膜梭菌溶血素O（rPFO）的反应性。以全人单克隆抗体1-10F（专利号CN113957057B）为捕获抗体、高免血清为检测抗体，经正交试验优化两类抗体的工作浓度，建立双抗体夹心ELISA方法，并对猪链球菌、肺炎球菌、单增李斯特菌、产气荚膜梭菌、溶血性大肠埃希菌和金黄色葡萄球菌的培养液进行特异性试验。结果间接ELISA方法显示兔抗rSLYP353L血清与rPLY有交叉反应，鼠抗rPLY血清与rSLY、rLLO有交叉反应，四联血清与rPLY、rSLY、rLLO有较强反应，rPFO与3种血清的反应性较弱。经优化，双抗体夹心ELISA方法的捕获抗体包被量为100 ng，检测抗体为鼠抗rPLY血清（1:1 000），在此条件下，检测25～800ng/mL的rSLY呈线性关系，R2值为0.986；对猪链球菌培养液为强阳性反应，对肺炎球菌培养液为弱阳性反应，其他为阴性反应。结论本研究建立的双抗体夹心ELISA方法能定量检测SLY，将为诊断高致病性猪链球菌感染提供新手段。

关键词：胆固醇依赖性溶细胞素猪链球菌肺炎球菌双抗体夹心酶联免疫吸附法