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水稻NAC家族转录因子OsNAC071的生信及抗非生物胁迫分析

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分子植物育种 2024年

作者：刘福根李欣飞王春丽李俊杰何玉陈丽娟朱骞李东宣 1.云南农业大学稻作研究所 2.云南农业大学云南省作物生产与智慧农业重点实验室 3.云南农业大学省部共建云南生物资源保护与利用国家重点实验室云南农业大学稻作研究所云南农业大学云南省作物生产与智慧农业重点实验室云南农业大学省部共建云南生物资源保护与利用国家重点实验室

NAC (NAM、ATAF1/2和CUC2)转录因子是植物中存在的最大的特异转录因子家族之一，广泛参与植物分生组织和器官边界的形成、根的发育、细胞次生壁的生长、衰老、激素调控、胁迫反应等。本研究从前期的水稻雌性核不育基因FEMALE-STERILE(F... 详细信息

NAC (NAM、ATAF1/2和CUC2)转录因子是植物中存在的最大的特异转录因子家族之一，广泛参与植物分生组织和器官边界的形成、根的发育、细胞次生壁的生长、衰老、激素调控、胁迫反应等。本研究从前期的水稻雌性核不育基因FEMALE-STERILE(FST)表达谱芯片数据中筛选出一个差异表达基因OsNAC071，该基因编码NAC结构域蛋白质。生物信息学分析发现，该基因位于11号染色体，ORF(Open reading frame)全长990 bp，编码329个氨基酸，蛋白分子量为35.5 kD，包含典型NAC结构域；启动子元件分析发现该基因启动子含有大量的激素响应、光调控、胁迫诱导和组织特异性元件；RiceXPro和RiceGE数据库表达分析显示OsNAC071基因在整个生育时期均有表达，干旱，高盐及冷胁迫会使表达量增加；本研究成功克隆了该基因，构建了pCaMV35S×2::OsNAC071:EGFP、pCaMV35S×2::OsNAC071:RNAi1和pCaMV35S×2::OsNAC071:RNAi3三种转化载体并获得相应转基因植株。通过胁迫实验发现过表达OsNAC071会增强水稻的耐盐及抗旱性。本研究为进一步明晰OsNAC071的功能提供了理论基础，为作物抗非生物胁迫分子育种开拓新空间。

关键词：水稻(Oryza sativa L. OsNAC071 生物信息学非生物胁迫

甘蔗杂交品种初级核心种质遗传多样性与群体结构分析

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分子植物育种 2024年

作者：徐超华刘洪博毛钧李旭娟林秀琴李纯佳孔春艳田春艳陆鑫刘新龙云南省农业科学院甘蔗研究所云南省甘蔗遗传改良重点实验室云南省农业科学院甘蔗研究所云南省甘蔗遗传改良重点实验室

为探究国家甘蔗种质资源圃(开远)构建的甘蔗杂交品种初级核心种质的遗传背景，本研究利用20对SSR和10对AFLP引物，对来自14个国家和国内8个省(区)的159份甘蔗杂交品种初级核心种质进行遗传多样性和群体结构分析。结果显示：(1)共检测到... 详细信息

为探究国家甘蔗种质资源圃(开远)构建的甘蔗杂交品种初级核心种质的遗传背景，本研究利用20对SSR和10对AFLP引物，对来自14个国家和国内8个省(区)的159份甘蔗杂交品种初级核心种质进行遗传多样性和群体结构分析。结果显示：(1)共检测到939个条谱带，其中SSR标记检测到294条谱带，多态性条带比率(PPB)为98.42%；AFLP标记检测到645条谱带，多态性条带比率(PPB)为80.35%。(2)通过绘制K与△K的关系图，将K=3确定为初级核心种质最佳分组数，类群Ⅰ包含47份材料，95.7%来源于国内甘蔗自育品种；类群Ⅱ包含74份材料，54.05%来源于国内种质，45.95%来源于国外种质；类群Ⅲ包含38份材料，78.95%来源于国外甘蔗种质，表明国内甘蔗自育种质有逐渐形成自己独特血缘的趋势。111份材料Q值≥0.6，占比69.81%，48份材料Q值≤0.6，占比30.19%，说明各类群中大部分甘蔗品种资源亲缘关系单一，少部分品种含其他类群的遗传成分。结合地理来源来看，来源地相同的甘蔗种质资源有聚集在一起的趋势，但也有少数来源地相同却被分在不同的类群。(3) PCoA作图分析显示甘蔗杂交品种初级核心种质存在3个明显的分类区域，且与三大类群的群体结构分析结果相对应，类群Ⅰ具有较高的遗传多样性。综上，甘蔗杂交品种初级核心种质遗传多样性丰富，有望成为扩宽甘蔗品种遗传基础。本研究为初级核心种质在育种中的利用提供了一定的理论基础。

关键词：甘蔗 SSR标记 AFLP标记遗传多样性群体结构

鄂尔多斯盆地东缘大吉地区山亚段海陆过渡相页岩气富集控制因素

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天然气地球科学 2024年

作者：罗力元李勇李树新何清波陈世加李翔李星涛路俊刚肖正录尹相东 1.油气藏地质及开发工程全国重点实验室.西南石油大学 2.天然气地质四川省重点实验室 3.西南石油大学地球科学与技术学院 4.中国石油煤层气有限责任公司 5.贵州省油气勘查开发工程研究院 6.自然资源部复杂构造区非常规天然气评价与开发重点实验室西南石油大学地球科学与技术学院天然气地质四川省重点实验室中国石油煤层气有限责任公司油气藏地质及开发工程全国重点实验室.西南石油大学贵州省油气勘查开发工程研究院自然资源部复杂构造区非常规天然气评价与开发重点实验室

海陆过渡相页岩气是继海相页岩气商业开发后的又一重要战略接替资源。海陆过渡相页岩具有非均质性强、沉积相变快、岩性组合复杂的特征，海相页岩气地质理论不能完全适用于海陆过渡相，海陆过渡相页岩气富集控制因素认识不清，制约了高... 详细信息

海陆过渡相页岩气是继海相页岩气商业开发后的又一重要战略接替资源。海陆过渡相页岩具有非均质性强、沉积相变快、岩性组合复杂的特征，海相页岩气地质理论不能完全适用于海陆过渡相，海陆过渡相页岩气富集控制因素认识不清，制约了高效勘探与开发。以鄂尔多斯盆地东缘大吉地区山23亚段页岩为例，通过显微组分、气体吸附、高压压汞、突破压力、扩散系数和覆压孔渗等实验分析，开展了页岩地球化学特征和储层特征研究，明确了海陆过渡相页岩气富集控制因素。研究结果表明：山23亚段海陆过渡相页岩具有高有机质丰度、过成熟度和腐殖型为主的特征，孔隙类型主要以无机矿物孔为主，有机孔和微裂缝相对较少。明确了海陆过渡相页岩气富集主要受有机质丰度、孔径大小、岩性组合和构造演化共同控制：高有机质丰度增强了页岩的吸附能力，微孔为甲烷气体分子提供更多的吸附点位，页—煤和页—灰组合有利于页岩气滞留原位富集，平稳的构造和适当的埋深有利于页岩气保存，建立了大吉地区海陆过渡相页岩气储集能力和封闭能力的演化模式。以上认识，可以为海陆过渡相页岩气甜点预测和先导试验区快速建产提供地质理论指导。

关键词：页岩气海陆过渡相岩性组合富集机理大吉地区鄂尔多斯盆地

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哺乳动物心肌细胞再生专家共识

生理学报 2024年第2期76卷 175-214页

作者：中国生理学会整合生理学专业委员会老年心脑血管病教育部重点实验室李良鹏曾春雨杨黄恬管又飞不详第三军医大学大坪医院中国科学院上海营养与健康研究所大连医科大学

心肌梗死引起的大量心肌细胞损失导致心脏病理性重构和心力衰竭的发生,如何促进心肌再生是修复受损心脏的关键问题。心肌细胞再生主要源于原有心肌细胞的增殖已被广泛认同。近年来,该领域的快速发展加深了我们对心肌细胞再生的内源性细... 详细信息

心肌梗死引起的大量心肌细胞损失导致心脏病理性重构和心力衰竭的发生,如何促进心肌再生是修复受损心脏的关键问题。心肌细胞再生主要源于原有心肌细胞的增殖已被广泛认同。近年来,该领域的快速发展加深了我们对心肌细胞再生的内源性细胞和微环境特征、外源性影响因素、分子生物学机制以及干预策略等各方面的认识。因此,我们对哺乳动物心肌细胞再生的定义、特征、评价和研究方法、调控机制以及干预措施等进行整理并形成共识,旨在明确该领域尚需进一步阐明的重要问题,推动心肌再生研究的深化及其在临床上的应用转化。

关键词：心肌梗死心力衰竭心脏重塑心肌再生心肌细胞增殖

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基于多分辨率点云表型重建的田间植株叶面积指数估算

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热带地理 2024年

作者：龙洋洋周忠发赵馨张田彭睿文伍贵洁郑佳佳陈淋淋 1.贵州师范大学喀斯特研究院/地理与环境科学学院 2.贵州喀斯特山地生态环境国家重点实验室培育基地 3.国家喀斯特石漠化防治工程技术研究中心贵州师范大学喀斯特研究院/地理与环境科学学院贵州喀斯特山地生态环境国家重点实验室培育基地国家喀斯特石漠化防治工程技术研究中心

为解决传统田间植株叶面积参数测量精度低、破坏性大和劳动强度大等问题，本文选取烟草作为研究对象，利用无人机摄影测量进行特征点匹配生成密集点云构建烟草点云表型模型，并利用Lambert球面坐标系将三维坐标转换为球面坐标，分别计... 详细信息

为解决传统田间植株叶面积参数测量精度低、破坏性大和劳动强度大等问题，本文选取烟草作为研究对象，利用无人机摄影测量进行特征点匹配生成密集点云构建烟草点云表型模型，并利用Lambert球面坐标系将三维坐标转换为球面坐标，分别计算孔隙度、有效叶面积指数和丛生指数进而得到真实叶面积指数，以半球摄影法计算的结果作为参考值分析不同空间分辨率下单株和地块尺度叶面积指数的计算精度。结果表明：无人机摄影测量中0.43、0.86、1.29、2.15 cm 4种分辨率点云模型计算的结果和数字半球摄影法计算得到的结果的决定系数R2分别为0.959、0.931、0.967和0.985，相对误差RE分别为11.87%、19.74%、14.96%和11.79%，均方根误差RMSE分别为0.150、0.195、0.136和0.094，相对均方根误差r RMSE分别为20.81%、26.97%、18.87%和13.10%。4种分辨率模型的整体计算精度较高，其中单株烟草和地块尺度烟草最佳计算精度模型均为分辨率2.15 cm的点云模型，计算精度分别为87.29%、94.24%，研究结果表明通过无人机摄影测量获取三维点云能够对喀斯特山区石漠化较为严重地区的烟草LAI进行估算，同时证明无人机点云表型模型估算田间植株叶面积指数具有可行性、准确性和高效性的特点。

关键词：叶面积指数无人机点云孔隙度烟草

曾克武和屠鹏飞团队揭示藤黄酸诱导前列腺癌细胞焦亡靶点

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Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences 2024年第6期33卷 583-583页

作者：北京大学药学院天然药物及仿生药物全国重点实验室北京大学药学院天然药物及仿生药物全国重点实验室

近日,北京大学药学院天然药物及仿生药物全国重点实验室曾克武和屠鹏飞团队在Journal of Medicinal Chemistry上在线发表了关于天然活性分子藤黄酸诱导肿瘤细胞焦亡的全新靶点及作用机制的研究论文:“Thermal proteome profiling strate... 详细信息

近日,北京大学药学院天然药物及仿生药物全国重点实验室曾克武和屠鹏飞团队在Journal of Medicinal Chemistry上在线发表了关于天然活性分子藤黄酸诱导肿瘤细胞焦亡的全新靶点及作用机制的研究论文:“Thermal proteome profiling strategy identifies CNPY3 as a cellular target of gambogic acid for inducing prostate cancer pyroptosis”。

关键词：藤黄酸细胞焦亡北京大学药学院前列腺癌重点实验室新靶点天然活性鹏飞

基于同源建模-分子对接筛选的五味子“酸味”成分

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陕西中医药大学学报 2024年

作者：冯石卜张婷康惠丽姜祎张化为宋小妹颜永刚谢允东张东东李玉泽邓翀 1.陕西中医药大学 2.陕西省中药基础与新药研究重点实验室 3.陕西中医药大学药学院/陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心 4.陕西省中医药管理局“秦药”研发重点实验室陕西中医药大学陕西省中药基础与新药研究重点实验室陕西中医药大学药学院/陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心陕西省中医药管理局“秦药”研发重点实验室

目的采用同源建模与分子对接技术预测南五味子中的“酸味”成分。方法利用同源建模的方法构建酸味受体PKD2L1的三维结构模型,通过Discovery Studio软件将南五味子中125种化学成分与酸味受体进行对接,将对接分数较好的活性成分与核心靶... 详细信息

目的采用同源建模与分子对接技术预测南五味子中的“酸味”成分。方法利用同源建模的方法构建酸味受体PKD2L1的三维结构模型,通过Discovery Studio软件将南五味子中125种化学成分与酸味受体进行对接,将对接分数较好的活性成分与核心靶点进行可视化分析。结果发现南五味子中38种化学成分对接分数较高,其中木脂素类化合物33种,三萜类化合物3种,甾醇类化合物1种,脂肪酸化合物1种。推测“酸味”化学成分群主要为木脂素类化合物,即南五味子中木脂素类化学成分能调控酸味受体并对二型糖尿病(TypeⅡdiabetes,T2DM)产生防治作用。结论研究发现南五味子“酸味”化学成分群主要为木脂素类成分,为揭示“酸味”中药的物质基础提供方法学参考。

关键词：南五味子酸味受体分子对接同源建模化学成分

蛋白凝集:STM调控植物干细胞活性的新机制

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科学通报 2024年第4期69卷 482-484页

作者：苏英华张宪省山东农业大学生命科学学院小麦育种全国重点实验室泰安271018

与动物不同,植物一生都维持着器官发生的能力.植物的茎尖分生组织(shoot apical meristem)不仅具有干细胞,能够维持其自身活性,还能形成茎、叶和花等组织和器官,共同构成植物的地上部分.茎尖分生组织活性如何被精准调控是发育生物学的... 详细信息

与动物不同,植物一生都维持着器官发生的能力.植物的茎尖分生组织(shoot apical meristem)不仅具有干细胞,能够维持其自身活性,还能形成茎、叶和花等组织和器官,共同构成植物的地上部分.茎尖分生组织活性如何被精准调控是发育生物学的重要科学问题之一,也是一直以来研究的前沿和热点.植物学家很早就发现了一类调控茎尖分生组织活性的转录因子——KNOX1(class 1 KNOTTED1-LIKE HOMEOBOX)[1,2].

关键词：茎尖分生组织器官发生植物干细胞发育生物学新机制组织和器官

CpG寡脱氧核苷酸增强小鼠抗结核分枝杆菌感染的作用与机制

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中华结核和呼吸杂志 2006年第2期29卷 87-91页

作者：任涛李传友蔡映云金美玲胡芸文复旦大学医学分子病毒学教育部重点实验室袁正宏复旦大学医学分子病毒学教育部重点实验室田苗赵冰复旦大学附属中山医院呼吸病研究所北京市结核病胸部肿瘤研究所微生物与免疫学室

目的观察CpG寡脱氧核苷酸(ODN)对结核分枝杆菌感染小鼠的保护作用及其机制。方法将96只雌性BALB/c小鼠按随机数字表法分为4组,每组24只,分别为CpGODN免疫组(A组)、对照ODN免疫组(B组)、感染对照组(C组)和正常对照组(D组)。A组和B组小鼠... 详细信息

目的观察CpG寡脱氧核苷酸(ODN)对结核分枝杆菌感染小鼠的保护作用及其机制。方法将96只雌性BALB/c小鼠按随机数字表法分为4组,每组24只,分别为CpGODN免疫组(A组)、对照ODN免疫组(B组)、感染对照组(C组)和正常对照组(D组)。A组和B组小鼠于攻毒前2周腹腔注射CpGODN和对照ODN(30μg/只)。A、B、C3组小鼠经尾静脉注射结核分枝杆菌(H37Rv,1×106条/只)。攻毒后3周,每组处死12只小鼠,观察肺脾组织病理学变化,检测肺脾组织Toll样受体9(TLR9)mRNA、γ干扰素(IFNγ)mRNA、白细胞介素(IL)4mRNA、IL10mRNA和IL6mRNA表达以及肺和脾组织菌落计数。同时观察4组小鼠生存率。结果CpGODN能够提高结核分枝杆菌感染小鼠的生存率。A组[(20.37±1.12)g]小鼠体重高于B组[(17.50±0.62)g]和C组[(17.15±0.97)g,P均0.05]相似,但低于C组[(0.28±0.26)g,P0.05),但高于D组(分别为0.11±0.08和0.26±0.22,P0.05);A组脾组织IL10mRNA的表达(0.05±0.02)低于B组(0.57±0.09)和C组(0.65±0.15,P均<0.01)。结论CpGODN可促进Th1型免疫反应,抑制Th2型免疫反应,增强小鼠抵抗结核分枝菌感染的能力。

关键词：分枝杆菌结核寡脱氧核糖核苷酸类受体细胞表面细胞因子