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新疆动物源葡萄球菌cfr基因及其移动元件检测分析

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新疆动物源葡萄球菌cfr基因及其移动元件检测分析

作者：轩慧勇新疆农业大学

学位级别：硕士

氟苯尼考作为动物专用抗菌药,对G菌、G菌、多种敏感菌和支原体等均有作用,但由于我国并未明确氟苯尼考的使用对象,导致耐药菌株的出现,随着编码23S r RNA甲基转移酶的cfr基因和介导低水平耐药的fex A基因的发现,有研究认为,cfr基因的存... 详细信息

氟苯尼考作为动物专用抗菌药,对G菌、G菌、多种敏感菌和支原体等均有作用,但由于我国并未明确氟苯尼考的使用对象,导致耐药菌株的出现,随着编码23S r RNA甲基转移酶的cfr基因和介导低水平耐药的fex A基因的发现,有研究认为,cfr基因的存在是导致氟苯尼考耐药菌暴发的原因之一,然而新疆有关cfr和fex A基因在葡萄球菌中的研究现状鲜见报道。因此,本试验通过对新疆部分地区不同动物源分离的葡萄球菌进行临床常用11种抗菌药物的耐药性检测,采用PCR方法进行cfr、fex A和fex B基因检测,同时对影响cfr基因传播的移动元件IS21-558(包括:ist AS和ist BS)和Tn558转座酶基因(包括:tnp A、tnp B、tnp C)进行检测。此外,对阳性菌株进行6种(喹诺酮类(nor A)、大环内酯-林可胺类(erm B)、四环素类(tet A、tet M)、β-内酰胺类(mec A、fem A)耐药基因的检测,了解新疆不同动物源耐药葡萄球菌中耐药基因共存的现状。通过上述试验可掌握新疆不同动物源葡萄球菌耐药现状、cfr基因携带情况以及耐药基因共存现状,为进一步研究cfr基因的耐药机制和传播机制奠定基础,具体研究结果如下:1.在新疆部分地区采集不同动物源肛拭子和/或鼻拭子样品共计1781份,从中分离试验用葡萄球菌共1667株,其中宠物源154株、羊源110株、牛源168株、猪源597株和禽源638株。耐药结果显示:耐药严重程度为羊源>宠物源>禽源>猪源>牛源,不同动物源葡萄球菌对青霉素耐药率超过54.7%;除牛源(36.3%)外,对苯唑西林耐药率超过51.1%;对阿米卡星有较好的敏感性,耐药率未超过35.0%。耐药谱型多样化,羊源葡萄球菌以4耐和5耐谱型为主;宠物源葡萄球菌以4耐谱型为主;禽源葡萄球菌以11耐谱型为主;猪源葡萄球菌以8耐谱型为主;牛源葡萄球菌以耐青霉素的1耐谱型为主。2.1667株葡萄球菌酰胺醇类耐药基因的检测结果显示,4株携带cfr基因的阳性菌均来自妊娠母猪鼻拭子样,种属鉴定为模仿葡萄球菌。除牛源葡萄球菌外,在其余动物源中都有检出fex A基因,不同动物源fex A基因检出率依次为宠物源(31.2%)>猪源(28.1%)>禽源(25.8%)>羊源(12.7%);未检测出fex B基因。此外,携带cfr的阳性菌株全部检出IS21-558移动元件(ist AS,ist BS)和Tn558转座酶基因(tnp A,tnp B,tnp C)。阳性菌除携带cfr和fex A基因及其相关移动元件外,还携带四环素类(tet A、tet M)、β-内酰胺类(mec A、fem A)和喹诺酮类(nor A)部分耐药基因。结论:新疆不同动物源葡萄球菌对临床被检抗菌药物耐药存在不同程度耐药,且耐药情况严重,不同动物源葡萄球菌多耐谱型多样化,并且检出cfr和fex A基因及与cfr转移相关的IS21-558移动元件和Tn558转座酶基因,阳性菌株存在多种耐药基因共存现象,提示耐药菌株有向超级耐药菌发展的风险。而移动元件的检出,表明cfr基因向其他菌种属间转移的概率较大,应加大耐药菌的监控,建立完整的耐药菌株检测系统,合理用药,防止短期内耐药菌株的暴发。

关键词：葡萄球菌耐药性 cfr fexA 移动元件

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细菌耐药基因cfr的研究进展

中国农业科技导报 2019年第1期21卷 43-50页

作者：轩慧勇蔡建星夏利宁新疆农业大学动物医学学院乌鲁木齐830052

随着抗菌药物在兽医临床的广泛使用,耐药菌株数量逐年上升,使耐药机制成为研究热点。耐药基因cfr(chloramphenicol-florfenicol resistance)可编码合成细菌的23S rRNA甲基化酶,该酶可影响抗菌药物与转肽酶结合,使细菌产生耐药性。而携带... 详细信息

随着抗菌药物在兽医临床的广泛使用,耐药菌株数量逐年上升,使耐药机制成为研究热点。耐药基因cfr(chloramphenicol-florfenicol resistance)可编码合成细菌的23S rRNA甲基化酶,该酶可影响抗菌药物与转肽酶结合,使细菌产生耐药性。而携带cfr基因的菌株可对氯霉素类、林可酰胺类、截短侧耳素、链阳菌素A和恶唑烷酮类五大类常用抗菌药物耐药,使细菌产生多药耐药。因此耐药基因cfr的作用机理和传播机制的研究是细菌耐药性研究的关键。对多重耐药基因cfr的发现、危害、耐药机制及其在不同类型菌体中的传播机制和流行情况进行综述,讨论了目前研究中存在的问题,并对未来的发展提出建议,可为进一步建立cfr基因检测网、新药研制和阻断cfr基因的传播提供参考和依据。

关键词： cfr基因革兰氏阳性菌革兰氏阴性菌耐药机制传播机制

南疆与北疆代表性规模化猪场沙门菌耐药性的比较分析

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中国兽医杂志 2022年第7期58卷 44-48页

作者：轩慧勇陈月月易海波徐琦琦秦蕾吴慧敏夏利宁新疆农业大学动物医学学院新疆乌鲁木齐830052 新疆霍城县职业技术学校新疆霍城835200 新疆昭苏县喀夏加尔镇畜牧兽医站新疆昭苏835618

为了解南疆与北疆代表性规模化猪场沙门菌的耐药性差异及相关耐药基因的流行情况,本试验采用琼脂稀释法测定81株北疆石河子市猪场和27株南疆焉耆县猪场分离的猪源沙门菌对12种抗菌药物的最小抑菌浓度(MIC),并通过PCR方法检测5类12种耐... 详细信息

为了解南疆与北疆代表性规模化猪场沙门菌的耐药性差异及相关耐药基因的流行情况,本试验采用琼脂稀释法测定81株北疆石河子市猪场和27株南疆焉耆县猪场分离的猪源沙门菌对12种抗菌药物的最小抑菌浓度(MIC),并通过PCR方法检测5类12种耐药基因在沙门菌中的分布情况。琼脂稀释法测定结果显示:石河子市猪源沙门菌对磺胺异噁唑(100.0%)、环丙沙星(84.0%)、氨苄西林(82.7%)、氟苯尼考(77.8%)和四环素(74.1%)的耐药率超过70.0%;焉耆县猪源沙门菌仅对磺胺异噁唑(100.0%)和氟苯尼考(55.6%)的耐药率超过50.0%;北疆地区石河子市猪源沙门菌耐药率显著高于南疆地区焉耆县猪源沙门菌(P<0.05)。石河子市猪源沙门菌多药耐药结果以5~6耐为主,占76.5%;焉耆县猪源沙门菌多药耐药以5耐为主,占14.8%。耐药基因检测结果显示,焉耆县猪源沙门菌中12种耐药基因均有检出,其中floR耐药基因检出率最高(40.7%),其他11种耐药基因检出率未超过40.0%;石河子市猪源沙门菌中除bla_(CMY-2)和tetA基因未检出外,其他10种耐药基因检出率均在49.0%以上。结果表明,两地不同猪场猪源沙门菌耐药率和携带的耐药基因存在差异,石河子市猪场猪源沙门菌耐药更为严重,耐药基因携带率也更高,临床中可结合药敏试验结果调整用药。本试验可为耐药菌的监测和制定公共卫生防控措施提供基础数据。

关键词：新疆猪场猪源沙门菌抗菌药物耐药耐药基因

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不同部位分离的猪源葡萄球菌的耐药情况分析

新疆农业科学 2016年第3期53卷 563-568页

作者：蔡建星轩慧勇夏利宁新疆农业大学动物医学学院乌鲁木齐830052

【目的】调查新疆昌吉州的某规模化猪场,生猪不同部位(鼻腔和直肠)分离的葡萄球菌耐药情况。【方法】采用微量肉汤稀释法,对不同部位分离出的葡萄球菌,进行临床9种常用抗菌药物的药敏试验;对耐药结果使用SPSS软件进行卡方检验,比较不同... 详细信息

【目的】调查新疆昌吉州的某规模化猪场,生猪不同部位(鼻腔和直肠)分离的葡萄球菌耐药情况。【方法】采用微量肉汤稀释法,对不同部位分离出的葡萄球菌,进行临床9种常用抗菌药物的药敏试验;对耐药结果使用SPSS软件进行卡方检验,比较不同部位分离出的葡萄球菌耐药的差异性。【结果】鼻腔分离的葡萄球菌主要对氧氟沙星(89.5%)和克林霉素(89.0%)的耐药率较高。直肠分离的葡萄球菌主要对克林霉素(84.5%)、氧氟沙星(81.0%)和阿米卡星(81.0%)耐药率较高。通过卡方检验分析发现,直肠分离的葡萄球菌对阿米卡星和庆大霉素的耐药率显著高于鼻腔分离的葡萄球菌的耐药率(P<0.05)。鼻腔分离的葡萄球菌仅对苯唑西林的耐药率显著高于直肠分离的葡萄球菌的耐药率(P<0.05)。多药耐药差异性结果显示:鼻腔分离的葡萄球菌以6耐(11.75%)和7耐(9.5%)为主,直肠分离的葡萄球菌以8耐(11.5%)为主。且在8耐和9耐中,直肠分离的葡萄球菌多药耐药率显著高于鼻腔分离的葡萄球菌多药耐药率(P<0.05)。【结论】直肠分离的葡萄球菌对大部分被检抗菌药物的耐药率比鼻腔分离的葡萄球菌耐药率更高,直肠分离的葡萄球菌耐药率比鼻腔分离的葡萄球菌多药耐药情况更加严重。抗菌药物在呼吸道和肠道两种不同感染途径中,肠道耐药率更加严重,在临床用药方面,可结合感染部位的不同,科学的更换抗菌药物。

关键词：猪不同部位葡萄球菌抗菌药物耐药率

新疆乌鲁木齐市宠物源葡萄球菌耐药性及其相关耐药基因的检测

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中国农业大学学报 2018年第6期23卷 85-91页

作者：轩慧勇郭菲夏利宁姚晓慧新疆农业大学动物医学学院乌鲁木齐830052

为了解新疆乌鲁木齐市宠物源葡萄球菌对临床常用抗菌药物的耐药情况及携带耐药基因的情况,采用琼脂稀释法对乌鲁木齐市某宠物医院分离鉴定的154株宠物源葡萄球菌进行临床常用10种抗菌药物耐药性检测,并用PCR方法检测葡萄球菌9种耐药基因... 详细信息

为了解新疆乌鲁木齐市宠物源葡萄球菌对临床常用抗菌药物的耐药情况及携带耐药基因的情况,采用琼脂稀释法对乌鲁木齐市某宠物医院分离鉴定的154株宠物源葡萄球菌进行临床常用10种抗菌药物耐药性检测,并用PCR方法检测葡萄球菌9种耐药基因:喹诺酮类(norA)、大环内酯-林可胺类(ermB)、四环素类(tetA、tetM)、β-内酰胺类(mecA、femA)和氟苯尼考类(cfr、fexA和fexB)。耐药性检查结果表明葡萄球菌对苯唑西林、四环素、左氧氟沙星和氟苯尼考的耐药率在50%以上,宠物源葡萄球菌多重耐药集中在4~5类,且耐药谱型多样化。基因检测结果显示fexA(31.2%)基因的检出率最高,其次是ermB(26.7%),未检出cfr、fexB和tetA基因。新疆乌鲁木齐市宠物源葡萄球菌普遍存在耐药和多重耐药情况,其中氟苯尼考耐药基因fexA检出率最高,揭示宠物源葡萄球菌耐药情况严重,应根据药敏试验及基因检测结果,合理选用抗菌药物,并加强对耐药菌的监测。

关键词：宠物源葡萄球菌抗菌药物耐药耐药基因乌鲁木齐

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万古霉素耐药肠球菌研究进展

动物医学进展 2021年第4期42卷 77-82页

作者：轩慧勇陈万昭夏利宁新疆农业大学动物医学学院新疆乌鲁木齐830052

自耐万古霉素肠球菌(VRE)被发现后,由VRE引发的耐多药感染率和持续定植率明显升高,而VRE基因操纵子具有独特的遗传变异性并持续进化,使VRE具有多种抗菌药物耐药表型,被世界卫生组织列入“急需新抗生素治疗的细菌”名单,极高的死亡率给... 详细信息

自耐万古霉素肠球菌(VRE)被发现后,由VRE引发的耐多药感染率和持续定植率明显升高,而VRE基因操纵子具有独特的遗传变异性并持续进化,使VRE具有多种抗菌药物耐药表型,被世界卫生组织列入“急需新抗生素治疗的细菌”名单,极高的死亡率给临床治疗带来巨大挑战。论文从VRE的起源、耐药机制、传播、流行现状以及VRE治疗的局限性和新型治疗方法探索等方面进行综述,为深入研究VRE传播和提高临床治疗效果提供参考。

关键词：耐万古霉素肠球菌耐药机制流行现状新型治疗方法

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猪源大肠杆菌耐药性及相关耐药基因检测

新疆农业科学 2021年第1期58卷 190-196页

作者：孙慧琴轩慧勇买占海杨紫嫣夏利宁新疆农业大学动物医学学院乌鲁木齐830052

【目的】研究新疆阿克苏地区某规模化猪场猪源大肠杆菌对临床常用抗菌药物的耐药情况及相关耐药基因携带情况,分析耐药表型与耐药基因之间的关系。【方法】采用琼脂稀释法,对分离鉴定的443株猪源大肠杆菌进行猪场常用6大类13种抗菌药物... 详细信息

【目的】研究新疆阿克苏地区某规模化猪场猪源大肠杆菌对临床常用抗菌药物的耐药情况及相关耐药基因携带情况,分析耐药表型与耐药基因之间的关系。【方法】采用琼脂稀释法,对分离鉴定的443株猪源大肠杆菌进行猪场常用6大类13种抗菌药物最小抑菌浓度的测定。采用PCR方法,检测13种抗菌药物相应的4大类10种耐药基因。【结果】该猪场猪源大肠杆菌对被检的8种抗菌药物耐药率超过70.0%,其中对恩诺沙星、链霉素、大观霉素、金霉素、土霉素的耐药率高达90.0%以上,对阿米卡星、安普霉素、头孢噻呋、多黏菌素E具有较好的敏感性,耐药率未超过25.0%;多药耐药结果以7~9耐为主,占63.6%。除tetK外,对被检的其他9种耐药基因均有检出,以携带floR(66.4%)和ant(3″)-Ia(66.4%)耐药基因为主。【结论】新疆阿克苏地区某规模化猪场猪源大肠杆菌至少对被检的1种抗菌药物表现为耐药,且多药耐药情况严重,耐药谱广,耐药基因携带率高,应从基因水平对耐药大肠杆菌进行传播机制的监测。

关键词：阿克苏大肠杆菌抗菌药物耐药耐药基因

MALDI-TOF质谱技术对猪肠道菌群中携带mcr-1细菌的鉴定与聚类分型

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中国动物传染病学报 2023年第3期31卷 127-133页

作者：高芸轩慧勇姚晓慧魏建超刘珂邵东华邱亚峰马志永李蓓蓓夏利宁新疆农业大学动物医学学院乌鲁木齐830052 中国农业科学院上海兽医研究所上海200241

为了解多粘菌素耐药基因mcr-1在猪肠道微生物群落中的分布特征,本研究采集分离同一猪肠道样品中的多粘菌素耐药菌,利用PCR进行mcr-1基因检测,采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术对mcr-1阳性菌株进行种属鉴定与亲... 详细信息

为了解多粘菌素耐药基因mcr-1在猪肠道微生物群落中的分布特征,本研究采集分离同一猪肠道样品中的多粘菌素耐药菌,利用PCR进行mcr-1基因检测,采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术对mcr-1阳性菌株进行种属鉴定与亲缘关系分析。结果显示,在收集获得的325株多粘菌素耐药菌中,136株(41.8%)含有mcr-1基因,包括大肠杆菌70株,肺炎克雷伯菌19株,放线杆菌47株。细菌蛋白指纹图谱进行聚类分析显示,70株mcr-1阳性大肠杆菌被划分为13个亚型,19株肺炎克雷伯菌被分为3个亚型,其中有17株菌属于同一亚型(占89.5%),47株放线杆菌均为同一克隆。上述结果表明mcr-1在肠道菌群中存在克隆传播现象,细菌指纹图谱的多样性也提示可能存在质粒或者其他转移元件介导的mcr-1水平传播。MALDI-TOF-MS作为一种新的技术,不仅能够实现细菌的快速鉴定,而且可基于细菌蛋白指纹图谱对菌株进行初步的亲缘关系分析。

关键词： mcr-1基因基质辅助激光解析电离飞行时间质谱聚类分型猪肠道菌群

自繁自养猪场中不同来源粪肠球菌与屎肠球菌的耐药性调查分析

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中国动物传染病学报 2022年第3期30卷 201-207页

作者：王舒丰轩慧勇姚晓慧魏建超刘珂邵东华邱亚峰马志永李蓓蓓夏利宁新疆农业大学动物医学学院乌鲁木齐830052 中国农业科学院上海兽医研究所上海200241

为了解新疆某自繁自养猪场中不同来源粪肠球菌和屎肠球菌的耐药情况,采集猪肛拭子和环境样品共计369份进行细菌分离,并利用琼脂稀释法测定最小抑菌浓度。结果表明:共分离到粪肠球菌100株和屎肠球菌88株;该养殖场粪肠球菌与屎肠球菌对红... 详细信息

为了解新疆某自繁自养猪场中不同来源粪肠球菌和屎肠球菌的耐药情况,采集猪肛拭子和环境样品共计369份进行细菌分离,并利用琼脂稀释法测定最小抑菌浓度。结果表明:共分离到粪肠球菌100株和屎肠球菌88株;该养殖场粪肠球菌与屎肠球菌对红霉素、氟苯尼考以及四环素的耐药率高于50%;粪肠球菌对利奈唑胺的耐药率高于屎肠球菌,而屎肠球菌对氨苄西林、庆大霉素以及环丙沙星的耐药率高于粪肠球菌,未发现万古霉素耐药株。该养殖场不同来源肠球菌耐药性存在差异,可能与不同生产阶段用药不同有关,建议根据耐药性分析进行合理用药,降低不合理用药导致细菌耐药的风险。

关键词：自繁自养猪场粪肠球菌屎肠球菌耐药性