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DMF降解菌的筛选及其应用研究

当代化工 2022年第5期51卷 1135-1138页

作者：张心青蔡倩倩马春峰车树刚郭南南张萧萧黄河三角洲京博化工研究院有限公司山东滨州256500

N,N-二甲基甲酰胺(DMF)是一种优良的工业溶剂和有机合成材料,它广泛应用于制革、化工、医药、农药等各个生产行业。含DMF的废水毒性大,对环境造成严重的危害。筛选分离得到能够高效降解DMF的菌株,为含DMF污水的处理提供专用菌剂,保证污... 详细信息

N,N-二甲基甲酰胺(DMF)是一种优良的工业溶剂和有机合成材料,它广泛应用于制革、化工、医药、农药等各个生产行业。含DMF的废水毒性大,对环境造成严重的危害。筛选分离得到能够高效降解DMF的菌株,为含DMF污水的处理提供专用菌剂,保证污水处理后达标排放。采用富集和选择培养的方法,以山东某环保公司的活性污泥为材料进行DMF降解菌的筛选,对降解菌的形态特征、生理生化特性和DMF降解率进行测定,并且采用16S rDNA对降解菌进行鉴定,分析其对DMF的降解特性,并对该菌株在相关水质方面的应用进行了研究。分离筛选到一株能以DMF为唯一碳源的降解菌,经16S rDNA鉴定,该菌株D1为惠氏副球菌(Paracoccuswyeth),其具有较强的DMF降解能力及耐受性,能够实现一定程度对DMF污染物的去除,这为今后此菌剂在不同水质中的应用奠定了基础。

关键词： DMF 生物降解惠氏副球菌应用

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生物酶法处理二元酸废水

环境科技 2019年第4期32卷 36-40页

作者：车树刚马娜娜傅英旬吴文雷韩立霞秦军刘文玉黄河三角洲京博化工研究院有限公司山东滨州256500 山东清远环保工程有限公司山东滨州256500

二元酸废水的生物处理方法所见报道不多,其中含有的硫酸根在厌氧环境下会被转化为硫化氢从而造成安全隐患,而大分子有机物在好氧体系中降解效率较低。实验针对此问题开发了一种脂肪酶法处理工艺,在脂肪酶作用下将大分子有机物转化为小... 详细信息

二元酸废水的生物处理方法所见报道不多,其中含有的硫酸根在厌氧环境下会被转化为硫化氢从而造成安全隐患,而大分子有机物在好氧体系中降解效率较低。实验针对此问题开发了一种脂肪酶法处理工艺,在脂肪酶作用下将大分子有机物转化为小分子被微生物吸收转化,试验表明加酶组最佳停留时间为3 d,加酶组出水氨氮和COD均达到CJ 343-2010排放标准,污泥浓度和体系生物量随着停留时间的缩短呈先上升后下降趋势,停留时间3d时达到峰值,体系污泥负荷变化平稳,出水颜色较清澈,液相检测结果表明出水中大分子有机物均在检测下限。

关键词：二元酸废水大分子有机物脂肪酶

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哺乳动物TRIM71蛋白RNA结合特性的分子机制研究

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Science Bulletin 2024年第1期69卷 72-81页

作者：时凡迪张坤程玘轩车世友支树馨郁珍瑜刘飞段菲菲汪阳明杨娜 State Key Laboratory of Medicinal Chemical Biology College of PharmacyNankai UniversityTianjin 300353China Institute of Molecular Medicine College of Future TechnologyPeking UniversityBeijing 100871China College of Chemistry Tianjin Normal UniversityTianjin 300387China National Laboratory of Biomacromolecules and Key Laboratory of Epigenetic Regulation and Intervention Institute of BiophysicsChinese Academy of SciencesBeijing 100101China

TRIM71 is an RNA-binding protein with ubiquitin ligase *** functions of mammalian TRIM71,including cell cycle regulation,embryonic stem cell(ESC)self-renewal,and reprogramming of pluripotent stem cells,are related to its RNA-binding *** previously reported that a long noncoding RNA(lnc RNA)Trincr1 interacts with mouse TRIM71(m TRIM71)to repress FGF/ERK pathway in mouse ESCs(m ESCs).Herein,we identify an RNA motif specifically recognized by m TRIM71 from Trincr1 RNA,and solve the crystal structure of the NHL domain of m TRIM71 complexed with the RNA *** to the zebrafish TRIM71,m TRIM71 binds to a stem-loop structured RNA fragment of Trincr1,and an adenosine base at the loop region is crucial for the m TRIM71 *** map similar hairpin RNAs preferably bound by TRIM71 in the m RNA UTRs of the cell-cycle related genes regulated by ***,we identify key residues of m TRIM71,conserved among mammalian TRIM71 proteins,required for the RNA-binding ***-site mutations of these residues significantly impair the binding of TRIM71 to hairpin RNAs in vitro and to m RNAs of Cdkn1a/p21 and Rbl2/p130 in m ***,congenital hydrocephalus(CH)specific mutation of m TRIM71 impair its binding to the RNA targets as *** results reveal molecular mechanism behind the recognition of RNA by mammalian TRIM71 and provide insights into TRIM71 related diseases.

关键词： RNA-binding protein Structure Recognition mechanism Disease-related mutant

胜利油田油气集输总厂:强势蓄能,探索市场化创效新路径

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基于机器学习的格陵兰冰盖长时间序列表面物质平衡研究

中国科技纵横 2024年第5期 6-7页

作者：车小敏王守华王天柱毛树亮

近来,中国石化胜利油田油气集输总厂运维项目部经理王天柱感觉每天时间都不够用,除了紧锣密鼓地协调日常运维工作,还要与部门探讨明年"设备设施预测性维护"细节,与外部单位对接专业合作方向.随着一件件计划的推进,他对项目部发展的路径...

近来,中国石化胜利油田油气集输总厂运维项目部经理王天柱感觉每天时间都不够用,除了紧锣密鼓地协调日常运维工作,还要与部门探讨明年"设备设施预测性维护"细节,与外部单位对接专业合作方向.随着一件件计划的推进,他对项目部发展的路径更加清晰、前景更有信心.

关键词：

来源：博看期刊评论

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基于机器学习的格陵兰冰盖长时间序列表面物质平衡研究

作者：车佳航山东师范大学

学位级别：硕士

在全球变暖的背景下,北极放大效应显著,格陵兰地区升温较快,这导致格陵兰冰盖的物质损失日益加剧,引发了广泛关注,大量研究表明这一现象主要由表面物质平衡(Surface mass balance,SMB)主导。但格陵兰冰盖表面物质平衡及其分量的观测数... 详细信息

在全球变暖的背景下,北极放大效应显著,格陵兰地区升温较快,这导致格陵兰冰盖的物质损失日益加剧,引发了广泛关注,大量研究表明这一现象主要由表面物质平衡(Surface mass balance,SMB)主导。但格陵兰冰盖表面物质平衡及其分量的观测数据相当匮乏,再分析资料在极地地区存在误差,由再分析资料驱动的区域气候模式(Regional Climate Model,RCM)的性能也会受到影响,国内利用卫星遥感手段针对格陵兰冰盖表面物质平衡的监测与模拟还较缺乏。因此,本文以格陵兰冰盖为研究区,利用第六次国际耦合模式比较计划(CMIP6)数据和三种机器学习方法(神经网络(NN)、高斯过程回归(GPR)、回归树(RT))模拟1950-2099年格陵兰冰盖表面物质平衡,使用单点观测数据和MAR(Modèle Atmosphérique Régional)模型对模拟结果进行评估,并分析表面物质平衡的时空变化,最后结合CMIP6近地面气温、降水等数据探究其变化的影响机制,主要结论如下:(1)三种机器学习方法模拟的格陵兰冰盖表面物质平衡与实测数据验证表明,神经网络(R=0.72)、高斯过程回归(R=0.71)和回归树(R=0.70)的模拟精度接近,且与MAR模型的模拟结果相似,均具有较高可信度。(2)时间上,通过分析格陵兰冰盖表面物质平衡的年内变化,发现格陵兰冰盖消融期延长,积累期缩短。1950-2099年消融期开始时间从5月底提前到5月初。同时,积累期开始时间从8月上旬推迟到9月初。积累期缩短导致积累量减少,物质亏损加剧。在年际变化上,21世纪50年代是较为明显的分界点,50年代前表面物质平衡总体是正值,而后表面物质平衡由正转负,物质亏损加剧,表面物质平衡快速下降。其中神经网络、高斯过程回归和回归树分别在2058年、2054年、2052年转为负值。(3)空间上,格陵兰冰盖表面物质平衡呈现明显的区域差异。冰盖边缘表面物质平衡表现为负值,以消融为主;冰盖内部表现为正值,以积累为主。主要积累区分布在冰盖东南部和西侧。冰盖物质亏损主要发生于夏季,春、秋、冬季以物质积累为主。春季和冬季的主要积累区是冰盖东南部,秋季积累区面积大于春季和冬季并延伸至冰盖西侧。从1950-2099年,格陵兰冰盖积累区逐渐萎缩,消融区面积扩大,冰盖物质积累区增加趋势远小于消融区增加趋势。尽管不同模式模拟结果存在一定的差异,但均能捕捉到格陵兰冰盖较为一致的表面物质平衡时空变化特征。(4)格陵兰冰盖表面物质平衡主要受近地面气温和降水的影响,与近地面气温(R=-0.96,p<0.05)和降水(R=-0.97,p<0.05)存在显著的负相关关系。反照率也会影响冰盖表面物质收支,反照率越低,物质损失越严重。冰盖上方云量和辐射共同作用于表面物质平衡,云量减少会加剧物质损失。夏季弱北大西洋涛动(NAO)和高格陵兰阻塞指数(GBI)导致格陵兰冰盖西部沿海地区的物质损失加剧。其他因素,如:地形、风速、高程、海冰等也会影响表面物质平衡的变化。

关键词：格陵兰冰盖表面物质平衡机器学习 CMIP6

哺乳动物TRIM71蛋白RNA结合特性的分子机制研究（英文）

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Science Bulletin 2024年第1期 72-81页

作者：时凡迪张坤程玘轩车世友支树馨郁珍瑜刘飞段菲菲汪阳明杨娜 State Key Laboratory of Medicinal Chemical Biology College of Pharmacy Nankai University Institute of Molecular Medicine College of Future Technology Peking University College of Chemistry Tianjin Normal University National Laboratory of Biomacromolecules and Key Laboratory of Epigenetic Regulation and Intervention Institute of Biophysics Chinese Academy of Sciences

TRIM71 is an RNA-binding protein with ubiquitin ligase activity. Numerous functions of mammalian TRIM71, including cell cycle regulation, embryonic stem cell(ESC) self-renewal, and reprogramming of pluripotent stem cells, are related to its RNA-binding property. We previously reported that a long noncoding RNA(lnc RNA) Trincr1 interacts with mouse TRIM71(m TRIM71) to repress FGF/ERK pathway in mouse ESCs(m ESCs). Herein, we identify an RNA motif specifically recognized by m TRIM71 from Trincr1 RNA, and solve the crystal structure of the NHL domain of m TRIM71 complexed with the RNA motif. Similar to the zebrafish TRIM71, m TRIM71 binds to a stem-loop structured RNA fragment of Trincr1, and an adenosine base at the loop region is crucial for the m TRIM71 interaction. We map similar hairpin RNAs preferably bound by TRIM71 in the m RNA UTRs of the cell-cycle related genes regulated by TRIM71. Furthermore, we identify key residues of m TRIM71, conserved among mammalian TRIM71 proteins, required for the RNA-binding property. Single-site mutations of these residues significantly impair the binding of TRIM71 to hairpin RNAs in vitro and to m RNAs of Cdkn1a/p21 and Rbl2/p130 in m ***, congenital hydrocephalus(CH) specific mutation of m TRIM71 impair its binding to the RNA targets as well. These results reveal molecular mechanism behind the recognition of RNA by mammalian TRIM71 and provide insights into TRIM71 related diseases.

关键词：

玉米乙烯响应因子亚家族的生物信息学鉴定与分析

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济南大学学报(自然科学版) 2024年

作者：李焰榕谭孝婷车荣会济南大学生物科学与技术学院

为了全面了解玉米APETALA2/乙烯响应因子（AP2/ERF）超家族中乙烯响应因子（ERF）亚家族成员在玉米生长发育和逆境过程中的作用，利用生物信息学手段对玉米（Zea mays L.）B73基因组ERF亚家族成员进行鉴定和分析。结果表明：共鉴定到87... 详细信息

为了全面了解玉米APETALA2/乙烯响应因子（AP2/ERF）超家族中乙烯响应因子（ERF）亚家族成员在玉米生长发育和逆境过程中的作用，利用生物信息学手段对玉米（Zea mays L.）B73基因组ERF亚家族成员进行鉴定和分析。结果表明：共鉴定到87个ERF基因且不均匀地分布在玉米的10条染色体上，蛋白长度为124 ～ 603 个氨基酸，蛋白分子质量为13.23 ～ 65.44 kDa，理论等电点为4.44 ～ 10.84，亚细胞定位于细胞核；进化树分析显示，ERF基因被分为5个组，各组内的基因结构和保守基序的数量、分布等相似，但各组之间存在较大的差异，多数没有内含子，有内含子的基因占比为20.69%；ERF家族成员共有10个保守基序，其中前2个保守基序最为保守，且通常以串联方式存在于多数ERF家族成员中；启动子分析显示ZmERF基因含有大量光响应、激素响应、胁迫响应和生长发育相关元件，表明玉米ERF家族成员在玉米生长发育及非生物胁迫、生物胁迫方面发挥作用。

关键词：生物信息学玉米乙烯响应因子转录因子

PSO-DF:基于高光谱的水稻叶片氮含量估测方法

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遥感技术与应用 2024年第2期39卷 280-289页

作者：车淼王海荣徐玺孙崇北方民族大学计算机科学与工程学院宁夏银川750021 国家民委图像图形智能处理重点实验室宁夏银川750021

水稻叶片氮含量的估测对实现田间施肥高效、水稻高产的目标具有重要意义。提出了一种基于粒子群深度森林的水稻叶片氮素估测方法(Particle Swarm Optimization-Deep Forest,PSODF),通过粒子群优化算法筛选深度森林模型(Deep Forest,DF)... 详细信息

水稻叶片氮含量的估测对实现田间施肥高效、水稻高产的目标具有重要意义。提出了一种基于粒子群深度森林的水稻叶片氮素估测方法(Particle Swarm Optimization-Deep Forest,PSODF),通过粒子群优化算法筛选深度森林模型(Deep Forest,DF)参数中最优的级联层估计器数量和估计器中的树数,从而提高深度森林模型在水稻氮素数据集上的回归精度。为验证PSO-DF的有效性,研究采用无人机搭载高光谱图像采集器获取宁夏粳稻高光谱图像,并对同期水稻叶片进行取样、测量、分析,并提取与水稻叶片氮含量相关系数最高的3个特征波段,将其作为光谱特征与水稻氮含量数据进行反演,对PSO-DF、原模型DF以及其他6种常见机器学习算法构建的水稻氮含量估测模型进行了对比。结果表明:PSO-DF算法构建的模型效果优于其他模型,其R2和RMSE指标均明显优于其他模型。

关键词：水稻氮素估测高光谱遥感粒子群优化的深度森林机器学习

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织密安全保障网，动态清零重大隐患

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