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油茶基因组SMRT数据的统计分析

南方林业科学 2018年第2期46卷 1-3页

作者：赵松子江西省林业科学院江西南昌330013

利用PacBio SMRT技术对普通油茶(Camellia oleifera)良种"赣无1号"进行全基因组测序,获得40.1 G的酶读段数据,共计3 862 324条酶读段。亚读段的数据量为40.06 G,共计4 730 681条亚读段。对亚读段数据及茶树(***)基因组进行比对分析,结... 详细信息

利用PacBio SMRT技术对普通油茶(Camellia oleifera)良种"赣无1号"进行全基因组测序,获得40.1 G的酶读段数据,共计3 862 324条酶读段。亚读段的数据量为40.06 G,共计4 730 681条亚读段。对亚读段数据及茶树(***)基因组进行比对分析,结果表明,测序正确率为91.41%,普通油茶与茶树基因组序列的相似度为93.38%。

关键词：油茶单分子实时测序基因组茶树

普通油茶INDEHISCENT同源基因的鉴别

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南方林业科学 2020年第1期48卷 32-34页

作者：赵松子江西省林业科学院·江西省油茶种质资源保护与利用实验室

拟南芥(Arabidopsis thaliana)INDEHISCENT基因(At4g00120)是一个参与果荚开裂的基因。以普通油茶(Camellia oleifera)花蕾为材料进行转录组分析,得到一条INDEHISCENT基因同源片段;从普通油茶基因组三代测序数据中鉴别出一条含有该片段... 详细信息

拟南芥(Arabidopsis thaliana)INDEHISCENT基因(At4g00120)是一个参与果荚开裂的基因。以普通油茶(Camellia oleifera)花蕾为材料进行转录组分析,得到一条INDEHISCENT基因同源片段;从普通油茶基因组三代测序数据中鉴别出一条含有该片段的基因组DNA序列;最后,得到油茶INDEHISCENT同源基因全长CDS序列,命名为CoIND。用拟南芥bHLH基因家族的18条蛋白质及CoIND的保守序列构建进化树,结果表明,CoIND与At4g00120在一个分支,表明其为At4g00120的同源基因。CoIND基因的的鉴别,为培育蒴果不裂果、适应机械化采收的油茶新品种奠定了基础。

关键词：普通油茶拟南芥不裂果同源基因蒴果

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油茶CLE基因家族的鉴定

南方林业科学 2023年第1期51卷 7-11页

作者：赵松子江西省林业科学院·江西省油茶种质资源保护与利用实验室江西南昌330013

CLE基因家族编码小分泌蛋白,参与调节植物的生长与发育;CLAVATA3(CLV3)是该家族中与作物产量相关的基因,其序列短、相似度低,鉴定该基因比较困难。本研究利用生物信息学的方法对油茶(Camellia oleifera)基因组数据进行了分析,从注释的... 详细信息

CLE基因家族编码小分泌蛋白,参与调节植物的生长与发育;CLAVATA3(CLV3)是该家族中与作物产量相关的基因,其序列短、相似度低,鉴定该基因比较困难。本研究利用生物信息学的方法对油茶(Camellia oleifera)基因组数据进行了分析,从注释的蛋白质数据中鉴别出11个油茶CLE基因;开发了一套从基因组序列中预测CLV3基因的方法,鉴别出1个油茶CLV3基因;基因表达分析表明,CoCLV3在种仁、柱头、叶等部位的表达水平较高;利用CLE基因家族蛋白质序列的CLE基序进行比对分析并构建进化树,结果表明,CoCLV3是AtCLV3的同源基因。

关键词：油茶 CLE 产量 CLAVATA3 小分泌蛋白

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山茶属植物转录组文献分析

南方林业科学 2016年第4期44卷 13-16页

作者：赵松子江西省林业科学院江西南昌330013

以科学引文数据库、美国国家生物技术信息中心、中国知识资源总库收录的山茶属植物转录组文献为依据,采用文献计量学的方法,对文献的年份分布、第一完成单位分布、来源期刊分布、研究物种、转录组测序方法、数据共享性等方面进行统计分... 详细信息

以科学引文数据库、美国国家生物技术信息中心、中国知识资源总库收录的山茶属植物转录组文献为依据,采用文献计量学的方法,对文献的年份分布、第一完成单位分布、来源期刊分布、研究物种、转录组测序方法、数据共享性等方面进行统计分析,从文献计量学角度反映山茶属植物转录组研究的现状和发展趋势。

关键词：山茶属转录组文献分析文献计量学

油茶CYP78A10同源基因及其SSR位点

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南方林业科学 2021年第2期49卷 12-16页

作者：赵松子江西省林业科学院·江西省油茶种质资源保护与利用实验室江西南昌330013

拟南芥(Arabidopsis thaliana)CYP78A亚基因家族基因参与种子大小的遗传控制。对普通油茶(Camellia oleifera)转录组数据进行挖掘,从花蕾和根转录组数据中分别得到1条CYP78A10的同源基因,再从油茶基因组三代测序数据中鉴别出其基因组DN... 详细信息

拟南芥(Arabidopsis thaliana)CYP78A亚基因家族基因参与种子大小的遗传控制。对普通油茶(Camellia oleifera)转录组数据进行挖掘,从花蕾和根转录组数据中分别得到1条CYP78A10的同源基因,再从油茶基因组三代测序数据中鉴别出其基因组DNA序列,最后,得到2条油茶CYP78A10同源基因全长CDS序列,分别命名为CoCYP78A10a、CoCYP78A10b。用植物CYP78A亚基因家族基因的蛋白质序列构建进化树,结果表明,CoCYP78A10a、CoCYP78A10b与CYP78A10、GmCYP78A10在一个分支,可能参与油茶种子大小的调控。通过SSR位点信息分析,在CoCYP78A10a第1外显子5’端非翻译区、CoCYP78A10b的启动子区分别发现1个适宜进行SSR分子标记开发的多态性位点。

关键词：普通油茶 CYP78A10 SSR 种子大小同源基因

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夏旱期不同管理措施下高产油茶的光合特性

南京林业大学学报（自然科学版） 2013年第2期37卷 33-38页

作者：左继林龚春黄建建周文才赵松子高捍东南京林业大学森林资源与环境学院江苏南京210037 江西省林业科学院经济林研究所江西南昌330032

为了研究夏旱期间灌溉、覆膜与盖草不同管理措施对盛产期油茶光合作用的影响,利用Li-6400XT便携式光合测定仪对赣无系列2个无性系的净光合速率(Pn)、蒸腾速率(Tr)等日变化参数进行测定。研究表明:灌溉、覆膜与盖草措施可以不同程度地提... 详细信息

为了研究夏旱期间灌溉、覆膜与盖草不同管理措施对盛产期油茶光合作用的影响,利用Li-6400XT便携式光合测定仪对赣无系列2个无性系的净光合速率(Pn)、蒸腾速率(Tr)等日变化参数进行测定。研究表明:灌溉、覆膜与盖草措施可以不同程度地提高油茶的净光合速率、蒸腾速率、水分利用效率(EWUE)、气孔导度与胞间二氧化碳浓度,其中不同管理措施下的赣84-8与赣71的Pn日均值从大到小均表现为灌溉B、覆膜、灌溉A、盖草;赣84-8的Tr日均值从大到小表现为灌溉B、灌溉A、覆膜、盖草;赣71的则从大到小表现为灌溉B、覆膜、灌溉A、盖草;赣84-8的EWUE日均值从大到小表现为灌溉B、覆膜、灌溉A、盖草;而赣71的从大到小则为盖草、覆膜、灌溉B、灌溉A。说明采取上述措施能有效缓解夏季高温干旱对油茶林的水分胁迫,促进高产油茶夏旱期水分利用效率与光合作用,此外,还可提高油茶叶片中叶绿素含量。

关键词：油茶夏旱期管理措施光合特性

国家治理的困境与路径选择——基于对“全景式”和“共景式”治理理论的分析

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探求 2016年第5期 73-80页

作者：张国栋赵松子南开大学周恩来政府管理学院天津300350 南开大学外国语学院天津300071

基于现代国家治理理论和中国社会现状,探讨当下国家治理实践的困境,并对如何走出治理困境做出尝试性回答。从全景式理论审视国家治理方式,国家治理具有治理成本较低,自由度高等特征;而随着科学技术发展,在共景式理论审视下,无论是对过... 详细信息

基于现代国家治理理论和中国社会现状,探讨当下国家治理实践的困境,并对如何走出治理困境做出尝试性回答。从全景式理论审视国家治理方式,国家治理具有治理成本较低,自由度高等特征;而随着科学技术发展,在共景式理论审视下,无论是对过往还是对现有的国家治理模式都提出了空前的挑战。由此看到,全景式理论描述的社会构成已开始解体,共景式理论所描述的社会构成为国家治理提出了更高的要求。因此必须面对社会转型的各种困境,探讨中国的国家治理的体系与能力的现代化的具体途径,包括国家治理的价值体理念建设,以人为本的国家治理体系建设和提升党和政府的执政能力,以体现国家治理体系的现代性。

关键词：国家治理全景式共景式国家治理路

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心皮及胚珠数量对油茶果实大小的影响

南方林业科学 2023年第3期51卷 15-20页

作者：赵松子幸伟年江西省林业科学院·江西省油茶种质资源保护与利用实验室江西南昌330013

心皮数、胚珠数是与植物产量相关的数量性状,但其对油茶果实大小的影响还缺乏深入研究。本研究对普通油茶(Camellia oleifera)、小果油茶(***)、短柱茶(***)等3个物种的果实进行考种,分别观测每个果实的鲜果重、鲜籽重、心皮数、可育心... 详细信息

心皮数、胚珠数是与植物产量相关的数量性状,但其对油茶果实大小的影响还缺乏深入研究。本研究对普通油茶(Camellia oleifera)、小果油茶(***)、短柱茶(***)等3个物种的果实进行考种,分别观测每个果实的鲜果重、鲜籽重、心皮数、可育心室数、种子数、败育胚珠数、胚珠数等性状,对观测数据进行统计分析,结果表明:心皮数的增加能提高鲜果重、鲜籽重,可育心室数的增加也能提高鲜果重、鲜籽重;胚珠数与胚珠败育率通过改变不同可育心室数果实的比例间接、协同地影响油茶的果实大小;用观测数据建立了心皮数、胚珠数及胚珠败育率与果实大小关系模型,该模型适用于对普通油茶进行分析。油茶育种应加强基础研究,挖掘心皮数多、胚珠数多、胚珠败育率低的种质资源,为高产油茶的选育提供优良的育种材料。

关键词：油茶心皮数胚珠数胚珠败育率果实大小

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油茶的驯化及面临的问题

南方林业科学 2019年第6期47卷 54-58页

作者：赵松子赵攀江西省林业科学院·江西省油茶种质资源保护与利用实验室

油茶的驯化从南宋开始,其果实大小和成熟期受到驯化的影响,使得现有良种具有较大的果实,并且成熟期集中在霜降前后。经过八百余年的人工选择与自然选择,普通油茶发展成我国主要的油茶物种。油茶的驯化面临机械化采收、更高的产量、茶麸... 详细信息

油茶的驯化从南宋开始,其果实大小和成熟期受到驯化的影响,使得现有良种具有较大的果实,并且成熟期集中在霜降前后。经过八百余年的人工选择与自然选择,普通油茶发展成我国主要的油茶物种。油茶的驯化面临机械化采收、更高的产量、茶麸高效利用等三个问题,应该加强油茶遗传育种的基础研究,通过基因编辑及分子标记辅助育种培育出优质、高产、适应机械化采收的油茶良种。

关键词：油茶驯化采收育种机械化