检索结果-南通市图书馆

补中益气汤对高原应激性胃溃疡小鼠的作用效果及其机制的代谢组学分析

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

厦门大学学报(自然科学版) 2024年

作者：刘娜梁佳林李积良王芬祥奚胜艳赵成周王英杰青海大学医学部青海大学生态环境工程学院青海省中医院肛肠科青海大学藏医学院厦门大学医学院

[目的]分析补中益气汤对高原应激性胃溃疡小鼠胃黏膜损伤的作用，并基于代谢组学探究补中益气汤预防小鼠高原应激性胃溃疡的机制。[方法]使用低压氧舱构建小鼠高原应激性胃溃疡的模型，60只KM小鼠随机分为模型组、正常组、补中益气汤低... 详细信息

[目的]分析补中益气汤对高原应激性胃溃疡小鼠胃黏膜损伤的作用，并基于代谢组学探究补中益气汤预防小鼠高原应激性胃溃疡的机制。[方法]使用低压氧舱构建小鼠高原应激性胃溃疡的模型，60只KM小鼠随机分为模型组、正常组、补中益气汤低剂量组、补中益气汤高剂量组、阳性药物组；通过对比各组小鼠的体重变化、胃黏膜的表观形态、胃黏膜的苏木精-伊红染色分析补中益气汤对高原应激性胃溃疡胃黏膜损伤的影响；通过蛋白免疫印迹法检测各组葡萄糖-6-磷酸脱氢酶（G6PDH）、转录因子YY1蛋白的表达情况，验证补中益气汤是否会调节与低氧相关的G6PDH和YY1蛋白的表达；基于液相色谱-质谱联用技术对小鼠胃组织样本进行代谢物分析，统计分析出差异代谢物，进行代谢通路富集分析。[结果]与正常组相比，模型组的胃黏膜表观出现红肿，有大量出血点，出现腺体细胞脱落，细胞坏死，炎细胞浸润等现象，经过补中益气汤的预防，胃溃疡现象有较好的改善；模型组中G6PDH和YY1蛋白表达量增加，而补中益气汤处理后表达明显减少；小鼠胃组织样本代谢组学检测结果表明差异代谢物参与花生四烯酸代谢、5-羟色胺能突触以及环磷酸腺苷信号等通路。[结论]补中益气汤能够通过调节5-羟色胺能突触、组氨酸代谢、环磷腺苷信号通路、花生四烯酸代谢等通路以及调节G6PDH和YY1蛋白的表达缓解高原应激性胃溃疡的发生。

关键词：代谢组学高原应激性胃溃疡补中益气汤

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

直穗小檗叶绿体基因组特征及系统发育分析

福建农林大学学报（自然科学版） 2024年第1期53卷 29-38页

作者：李雪任玉玲赵艳李幸儿孙胜男赵成周李萍青海大学生态环境工程学院青海西宁810016 青海大学医学院青海西宁810163 青海大学藏医学院青海西宁810016

【目的】本研究旨在丰富小檗属植物的叶绿体基因组资料,为进一步研究直穗小檗的遗传资源、物种资源鉴定和系统发育分析提供依据。【方法】基于高通量测序技术,利用生物信息学方法获取直穗小檗完整叶绿体基因组序列,分析其简单重复序列... 详细信息

【目的】本研究旨在丰富小檗属植物的叶绿体基因组资料,为进一步研究直穗小檗的遗传资源、物种资源鉴定和系统发育分析提供依据。【方法】基于高通量测序技术,利用生物信息学方法获取直穗小檗完整叶绿体基因组序列,分析其简单重复序列、密码子偏好性和反向重复区的扩张与收缩情况,并对直穗小檗及其近缘类群进行系统进化分析。【结果】直穗小檗叶绿体基因组全长167036 bp,GC含量38.16%,共编码144个功能基因;直穗小檗叶绿体基因组序列中共发现109个微卫星位点,A/T碱基组成的单核苷酸重复序列占比最高(73.4%);系统发育分析表明,直穗小檗与朝鲜小檗、黄芦木以及威宁小檗的亲缘关系较近,同时与十大功劳属的阿里山十大功劳和阔叶十大功劳聚为一支。【结论】叶绿体全基因组序列分析在一定程度上支持了小檗科植物的系统发育关系。

关键词：直穗小檗叶绿体基因组重复序列密码子偏好性系统发育

同方期刊数据库

藏羊血红蛋白抗氧化肽模拟酶解筛选及活性验证

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

食品与发酵工业 2024年

作者：刘鑫罗唐君韩丽娟桂林生侯生珍孙胜男赵成周 1.青海大学医学部药学系 2.青海大学农牧学院 3.青海大学藏医学院青海大学藏医学院青海大学农牧学院青海大学医学部药学系

Based on the theoretical basis of bioinformatics， this paper used the computer to simulate the enzymatic digestion of Tibetan sheep hemoglobin， using online activity scoring， activity prediction， and molecular docking techniques to screen their antioxidant peptides and verify their antioxidant properties by DPPH free radical and ABTS cationic radical scavenging rate experiments. The amino acid sequences of Tibetan sheep hemoglobin were screened using the Uni Prot database to evaluate its potential bioactivities， ExPASy Peptide Cutter online tool was applied to enzymatically digest the screened peptide chains， Peptide Ranker was applied to score the bioactivity prediction， and the online tools Innovagen， ToxinPred， iBitter-SCM， A11erTOP， and AdmetSAR for solubility， toxicity， bitterness， sensitization and ADMET， molecular docking using Keap1 receptor for activity prediction， and finally validation of the screened antioxidant peptides of Tibetan sheep hemoglobin using DPPH free radical and ABTS cationic radical scavenging rate assay. Results showed that five Tibetan sheep hemoglobin chains contained 20 amino acids， and a total of 258 peptides （485 peptides） were obtained by enzymatic digestion， and 110 peptides （194 peptides） with ratings greater than 0.5 were screened out by the bioactivity scoring system， and 18 peptides with good solubility， non-toxicity， non-bitterness， and non-allergenicity were obtained through the prediction of their activities， and the molecular docking was carried out for the 10 peptides that had a better intestinal absorption， and the top three peptides with molecular docking scores， KRM， FPL， and FL， were subjected to in vitro antioxidant activity assay， and the results showed that the free radical scavenging ability of FPL and KRM exceeded that of the positive control， with IC50of 0.125 0±0.012 3， 0.339 1±0.031 4， 0.256 5±0.014 1，（0.374 6±0.047 1） mg/mL， respectively， and the free radical scavenging ability of FL reached 88.90% and 94.40%

关键词：藏羊血红蛋白虚拟酶解模拟筛选抗氧化肽分子对接

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

三味甘露对大鼠肝纤维化的改善作用及机制

中国药房 2024年第6期35卷 707-711页

作者：陈秀梅王英杰赵成周李真张文惠平罗唐君刘鑫孙胜男青海大学医学部药学系西宁810016 青海大学藏医学院西宁810016

目的探讨藏药三味甘露对大鼠肝纤维化的改善作用及机制。方法实验大鼠分为正常组、模型组、水飞蓟宾组(阳性对照,50mg/kg)和三味甘露低、中、高剂量组(80、250、800mg/kg),除正常组外,其余组以四氯化碳(CCl4)腹腔注射诱导大鼠肝纤维化... 详细信息

目的探讨藏药三味甘露对大鼠肝纤维化的改善作用及机制。方法实验大鼠分为正常组、模型组、水飞蓟宾组(阳性对照,50mg/kg)和三味甘露低、中、高剂量组(80、250、800mg/kg),除正常组外,其余组以四氯化碳(CCl4)腹腔注射诱导大鼠肝纤维化模型。造模给药第6周开始,各组大鼠分别灌胃生理盐水或相应药物。第9周实验结束,计算大鼠肝脏指数和脾脏指数;以苏木素-伊红、Masson及SirusRed染色观察肝组织病理结构和纤维化程度;检测血清中丙氨酸转氨酶(ALT)、天冬氨酸转氨酶(AST)、Ⅲ型前胶原(PCⅢ)、Ⅳ型胶原(COL-Ⅳ)、白细胞介素6(IL-6)、肿瘤坏死因子α(TNF-α)、IL-1β含量与肝组织中透明质酸(HA)、层粘连蛋白(LN)含量。结果与模型组相比,三味甘露各剂量组和水飞蓟宾组大鼠肝损伤和胶原纤维沉积均有不同程度改善,血清中ALT、AST、PCⅢ、COL-Ⅳ、IL-6、TNF-α、IL-1β含量以及肝组织中HA、LN含量均显著降低(P<0.05或P<0.01)。结论三味甘露能够通过抑制胶原纤维生成,降低转氨酶、HA、LN、PCⅢ和COL-Ⅳ含量,减轻炎症反应,从而缓解CCl4诱导的大鼠肝纤维化进程。

关键词：三味甘露肝纤维化炎症病理改变胶原蛋白

藏药尼泊尔黄堇HD-Zip基因家族的鉴定与分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

分子植物育种 2022年

作者：刘皎茹赵成周吴穹李萍兰天孙胜男青海大学青海省糖脂代谢疾病防控中医药重点实验室青海大学藏医药研究中心青海大学医学院青海大学生态环境工程学院

为了明确同源异型亮氨酸拉链蛋白(homeodomain-leucine zipper， HD-Zip)基因家族的生物功能以及对尼泊尔黄堇逆境应答、生长发育及生物碱积累机制的研究，本研究使用单分子实时(single molecular real time， SMRT)测序技术对尼泊尔黄... 详细信息

为了明确同源异型亮氨酸拉链蛋白(homeodomain-leucine zipper， HD-Zip)基因家族的生物功能以及对尼泊尔黄堇逆境应答、生长发育及生物碱积累机制的研究，本研究使用单分子实时(single molecular real time， SMRT)测序技术对尼泊尔黄堇进行测序后，使用生物信息学方法鉴定分析尼泊尔黄堇HD-Zip转录因子家族的序列特征、基因结构、保守基序、系统进化，并进行蛋白质三级结构和功能预测。结果显示，尼泊尔黄堇转录组中共鉴定出43个HD-Zip转录因子，包括I类亚家族基因23个，II类亚家族基因7个，III类亚家族基因3个，IV类亚家族基因10个。氨基酸数量为114～840 aa，分子质量为17 369.94～92 328.63 kD，平均理论等电点为5.85。亚家族I和II保守基序和蛋白质三级结构预测高度相似，亚家族III和IV的保守基序和蛋白质三级结构相似度较高，说明尼泊尔黄堇中HD-Zip同组家族成员基因在进化过程中结构上有较大的同源性。预测到27个尼泊尔黄堇HD-Zip家族基因具有顺式作用元件，包括参与水杨酸反应顺式作用元件、参与赤霉素反应顺式作用元件、参与光响应顺式作用元件、响应茉莉酸甲酯顺式作用元件等。推测HD-Zip家族不仅在高等植物的生长发育、形态建成、调控植物对生物或非生物胁迫等逆境应答中有重要作用，而且HD-Zip I在尼泊尔黄堇次生代谢物合成中也起到一定调节作用。

关键词：尼泊尔黄堇 HD-Zip基因家族生物信息学系统进化功能预测

多刺绿绒蒿WD40基因家族的鉴定及生物信息学分析

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

广西植物 2022年第9期42卷 1561-1571页

作者：任玉玲赵艳赵成周李萍青海大学生态环境工程学院西宁810016 青海大学藏医学院/青海大学藏医药研究中心西宁810016

WD40转录因子家族广泛参与调节植物生长、发育、次生代谢物积累和环境适应等过程。为了探究WD40家族在多刺绿绒蒿生长、发育和次生代谢物积累以及抗逆方面的作用,该研究基于全长转录组测序数据,鉴定了多刺绿绒蒿WD 40基因家族成员,并对... 详细信息

WD40转录因子家族广泛参与调节植物生长、发育、次生代谢物积累和环境适应等过程。为了探究WD40家族在多刺绿绒蒿生长、发育和次生代谢物积累以及抗逆方面的作用,该研究基于全长转录组测序数据,鉴定了多刺绿绒蒿WD 40基因家族成员,并对这些基因及其编码的蛋白进行了生物信息学分析。结果表明:(1)共鉴定到19个WD 40基因,编码的蛋白均具有WD40结构域,氨基酸数目为109~758 aa,分子量介于11830~84130 Da之间,预测大多数蛋白定位在细胞核中且都为亲水性蛋白;(2)系统进化树分析表明多刺绿绒蒿与罂粟、博落回亲缘关系较近;(3)WD 40基因启动子区域均存在数量不等的激素或逆境响应元件,表明该家族基因可能参与植物生长、发育和次生代谢物积累等多种生物学进程的调节;(4)蛋白三级结构显示这些蛋白在进化过程中发生了不同程度的进化。这些结果可为深入研究多刺绿绒蒿WD 40基因家族在其响应逆境胁迫和次生代谢物积累等方面的具体机制提供前期基础。

关键词：多刺绿绒蒿 WD40 生物信息学分析基因家族全长转录组

尼泊尔黄堇G6PD基因家族的鉴定及生物信息学分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

分子植物育种 2023年

作者：李雪马海梅任玉玲赵艳孙胜男赵成周李萍青海大学生态环境工程学院青海大学藏医学院青海大学医学院

葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(glucose-6-phosphate dehydrogenase， G6PD)是戊糖磷酸途径的关键酶，在植物抵御生物及非生物胁迫时发挥重要作用。为了探究G6PD基因家族对尼泊尔黄堇的生长调控和次生代谢产物积累的影响及其对各种环境胁迫的应... 详细信息

葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(glucose-6-phosphate dehydrogenase， G6PD)是戊糖磷酸途径的关键酶，在植物抵御生物及非生物胁迫时发挥重要作用。为了探究G6PD基因家族对尼泊尔黄堇的生长调控和次生代谢产物积累的影响及其对各种环境胁迫的应答作用，本研究基于尼泊尔黄堇的全长转录组数据，筛选尼泊尔黄堇G6PD基因家族CDS序列，并对G6PD基因家族成员的蛋白理化性质、基因结构、保守结构域、基因启动子顺式作用元件和蛋白进化关系等进行生物信息学分析。结果表明，在尼泊尔黄堇中共鉴定到10个G6PD基因，其对应蛋白编码的氨基酸数目在201～604之间，分子量大小为23 132.51～68 153.31 Da，理论等电点在5.45～7.63之间，二级结构以α-螺旋和无规卷曲为主；亚细胞定位预测显示这些蛋白主要分布在细胞质中，属于亲水性蛋白；系统发育树分析表明尼泊尔黄堇G6PD蛋白与唐松草、博落回和罂粟进化关系最近；基因启动子顺式作用元件分析表明尼泊尔黄堇G6PD可能受到光信号、激素信号和逆境信号途径的调节。本研究可为深入研究ChG6PD基因家族在尼泊尔黄堇响应逆境胁迫和次生代谢物积累等领域的具体机制提供初步依据。

关键词：尼泊尔黄堇 G6PD 次生代谢物生物信息学基因家族分析

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

组学技术在糖尿病研究中的应用

中国医院药学杂志 2023年第23期43卷 2707-2714页

作者：刘娜段国珍兰天赵成周樊光辉祁有朝青海大学农牧学院青海西宁810016 青海大学农林科学院青海西宁810016 青海大学藏医学院青海西宁810016 青海大学医学院青海西宁810016

随着高通量技术的发展,运用基因组学、转录组学、代谢组学、蛋白质组学、宏基因组学、表观遗传学等技术有利于对糖尿病的发病机制、生理变化进行深层次、多维度分析,为获得糖尿病治疗相关的分子标志物、药物潜在治疗靶点等提供新思路。... 详细信息

随着高通量技术的发展,运用基因组学、转录组学、代谢组学、蛋白质组学、宏基因组学、表观遗传学等技术有利于对糖尿病的发病机制、生理变化进行深层次、多维度分析,为获得糖尿病治疗相关的分子标志物、药物潜在治疗靶点等提供新思路。如与空腹血糖和糖尿病并发症相关的位点;与药物转运蛋白、靶点、代谢酶相关的风险基因;与脂肪生成、葡萄糖稳态、胰岛素分泌、细胞功能障碍等相关的基因位点;与糖脂代谢、氨基酸代谢、溶酶体相关过程、胰岛素信号通路、糖酵解途径和糖异生、抗氧化、胰岛素抵抗相关通路以及肠道菌群可作为治疗糖尿病的靶点。该文简要概述了单组学和多组学概念,讨论了组学技术在研究糖尿病中的应用现状,这些结果将为实现糖尿病个体化治疗提供理论参考。

关键词：多组学糖尿病应用综述

镉胁迫诱导的两种青稞叶片衰老差异的生理学比较

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

分子植物育种 2022年第22期20卷 7574-7583页

作者：任玉玲吴云赵艳孙胜男赵成周李萍青海大学生态环境工程学院西宁810016 青海大学医学院西宁810016 青海大学藏医学院西宁810016

青稞对青藏高原极端环境有极强的适应性。镉诱导的植物衰老会降低作物产量和质量,并严重威胁人类健康。本研究旨在探究镉胁迫下两种青稞叶片的衰老差异。将‘昆仑12’(晚衰型,late-stage senescing,LS)及‘肚里黄’(早衰型,early-stage ... 详细信息

青稞对青藏高原极端环境有极强的适应性。镉诱导的植物衰老会降低作物产量和质量,并严重威胁人类健康。本研究旨在探究镉胁迫下两种青稞叶片的衰老差异。将‘昆仑12’(晚衰型,late-stage senescing,LS)及‘肚里黄’(早衰型,early-stage senescing,ES)两种青稞进行液体培养后,用浓度为25、50、75、100、150μmol/L的氯化镉对其幼苗分别处理2 d,观察其生长情况,测定生理指标,比较其镉耐受性和衰老进程的差异。结果显示镉处理使二者表现出依赖Cd浓度增加的叶片发黄、叶尖卷曲、叶绿素含量降低、膜损伤增加、过氧化氢积累和镉积累等现象。镉处理引起两种品种中CAT活性的增加,不同的是在ES中CAT活性随镉浓度的增加先增加后降低,而在LS中呈持续增加的趋势,其余三种抗氧化酶SOD、POD和APX的活性变化为随Cd浓度的升高呈先升后降的趋势,且在ES中均显著高于LS。低浓度的Cd对LS的影响较小,而高浓度的Cd使LS和ES均表现出衰老,其衰老进程存在差异。镉浓度达75μmol/L时,对两种青稞的影响差异显著。说明镉诱导下,LS较ES表现出较强的镉耐受性,ES衰老进程明显被加快。本研究结果有助于后期深入研究镉诱导的青稞叶片衰老的具体机制。

关键词：青稞镉胁迫衰老生理指标