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基于深度学习的蛋白质二级结构预测研究

基于深度学习的蛋白质二级结构预测研究

作者：赵君研西安工业大学

学位级别：硕士

蛋白质二级结构作为生命科学领域的重要组成部分,揭示了蛋白质的局部构象,指导和确认了蛋白质的功能,为改造现有蛋白质和进一步设计新型药物分子提供了可靠依据。在深度学习算法的不断发展和输入进化信息的丰富下,利用计算的方法构建氨... 详细信息

蛋白质二级结构作为生命科学领域的重要组成部分,揭示了蛋白质的局部构象,指导和确认了蛋白质的功能,为改造现有蛋白质和进一步设计新型药物分子提供了可靠依据。在深度学习算法的不断发展和输入进化信息的丰富下,利用计算的方法构建氨基酸序列与蛋白质二级结构间的复杂映射关系,已逐渐取代实验测定的方法。为进一步提升预测精度,本文对已有方法进行归纳分析,深入探究基于深度学习的蛋白质二级结构预测方法并构建相关预测模型,主要研究内容如下:(1)丰富氨基酸编码方式。在常用PSSM编码的基础上,又引入三种编码方式:HMM编码、氨基酸理化性质编码和生物大语言模型编码,以全面考虑蛋白质二级结构形成过程中的可能影响因素,并通过实验验证每种编码方式的有效性,得出最优的编码组合。(2)提出基于ShuffleNet和注意力机制的蛋白质二级结构预测模型。将氨基酸序列的PSSM、HMM及理化性质特征融合作为模型的输入,利用堆叠的Shuffle Net获取非局部序列特征。其中,针对特征提取过程中填充位置影响非填充位置特征生成的问题,引入掩码矩阵改进网络的批归一化层以保证特征生成的准确性。针对标准通道洗牌在网络堆叠时无法实现所有通道组间信息交互的问题,利用填充和剪裁操作改进标准通道洗牌以增加各通道组间的信息交流。为了丰富特征,通过多尺度卷积和注意力机制构建特征细化模块,获取区域内的重要特征。最后,引入标签分布感知边际(Label Distribution Aware Margin,LDAM)损失函数来训练模型,缓解细粒度二级结构中存在的类不平衡问题。通过实验验证,所提模型能够提升二级结构的预测精度,特别是罕见类二级结构的精度。(3)提出基于TCN(Temporal Convolutional Network,TCN)和DML(Deep Metric Learning,DML)的蛋白质二级结构预测模型。该模型将生物语言模型编码作为输入,通过嵌入网络和多尺度距离度量模块完成蛋白质二级结构预测。其中,针对孤儿序列通过MSA(Multiple Sequence Alignment,MSA)技术得到的编码质量较低导致二级结构难以预测的问题,利用生物语言模型Prot T5对训练集编码,提高输入矩阵进化信息含量。嵌入网络根据深层抽象特征能够引导选择浅层特征的特点,利用具有不同扩张率的TCN和注意力机制构建分层多尺度注意力网络,获取序列的局部细节特征及全局信息。多尺度距离度量模块融合余弦距离和欧氏距离的优点,将变换后的特征与各类二级结构的质心向量进行相似性度量。为了训练稳定性,将嵌入空间限制在一个单位球内,联合优化模型参数及质心向量,从而实现蛋白质二级结构预测。通过实验验证,所提模型在蛋白质二级结构预测任务上表现优异。

关键词：深度学习蛋白质二级结构预测类不平衡时间卷积网络注意力机制

中华优秀传统文化融入高校校园文化建设的路径研究

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中华优秀传统文化融入高校校园文化建设的路径研究

作者：赵君瑜哈尔滨商业大学

学位级别：硕士

中华优秀传统文化是中华民族集体智慧的结晶,将其有效融入高校校园文化建设中,有利于提升大学生的文化素养与综合素质,有利于增强大学生的文化自觉与文化自信。习近平总书记也多次在重要场合强调中华优秀传统文化的重要性。基于此背景,... 详细信息

中华优秀传统文化是中华民族集体智慧的结晶,将其有效融入高校校园文化建设中,有利于提升大学生的文化素养与综合素质,有利于增强大学生的文化自觉与文化自信。习近平总书记也多次在重要场合强调中华优秀传统文化的重要性。基于此背景,本文从校园文化建设视角,探寻中华优秀传统文化融入高校校园文化建设的路径,培养大学生学习中华优秀传统文化意识,争做堪当民族复兴重任的时代新人。本文以高校校园文化建设为主要研究对象,系统梳理了国内外中华优秀传统文化及高校校园文化建设的相关研究成果,并强调中华优秀传统文化融入高校校园文化建设的价值。发现目前中华优秀传统文化融入高校校园文化建设虽然已经取得了一定成效,但总体来看仍有一些问题和不足,主要包括中华优秀传统文化与高校校园文化的融入机制不健全、高校对中华优秀传统文化融入校园文化的创新性转化不够、高校师生对中华优秀传统文化的基本精神探索不够明晰。对此,本文从高校对中华优秀传统文化融入高校校园文化的重视程度不够、高校在中华优秀传统文化创新性转化中科技应用不足以及高校大学生对于中华优秀传统文化的主动学习意识不强三个角度分析原因。本文以《关于实施中华优秀传统文化传承发展工程的意见》为基本遵循,围绕提高高校对中华优秀传统文化的重要性认识、完善高校教学课程体系、完善高校校园网络平台体系、打造良好的校园环境并营造学习氛围、开展高校校园文化活动以及完善校园文化建设保障机制等多方面着手,探寻中华优秀传统文化融入高校校园文化建设的路径。

关键词：中华优秀传统文化大学生高校校园文化建设

多模态翻译理论指导下的图片翻译实践报告 ——以《中国现代设计思想—生活、启蒙、变迁》（第8、9章）为例

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多模态翻译理论指导下的图片翻译实践报告 ——以《中国现代设计...

作者：赵君兰齐鲁工业大学

学位级别：硕士

多模态理论自20世纪90年代兴起以来就受到各界的广泛关注,文本和图像作为视觉模态的主要构成部分,又使图文关系的研究日益成为多模态研究领域的重点之一。如今,利用多种符号资源进行意义表述的语篇不断增多,对多模态语篇的分析要求充分... 详细信息

多模态理论自20世纪90年代兴起以来就受到各界的广泛关注,文本和图像作为视觉模态的主要构成部分,又使图文关系的研究日益成为多模态研究领域的重点之一。如今,利用多种符号资源进行意义表述的语篇不断增多,对多模态语篇的分析要求充分考虑各模态。设计类文本凭借其中包含大量的图像和文字,成为多模态语篇的典型代表。《中国现代设计思想——生活、启蒙、变迁》(Chinese Modern Design Thinking:Life,Enlightenment and Change)一书由曹小鸥著,山东美术出版社出版,整本书以图文并茂的方式生动反映了中国设计创意的演变过程。其中第8章和第9章包含数百张图片和丰富的文本内容,涵盖时代图像、工艺和美术设计作品来辅助文字说明,反映出中国设计的创造。这两章介绍的主要内容是:设计的话语方式与“全球化”下的设计,讨论“现代设计”在中国的语言方式,并指出了在短短几十年间,当代中国设计师从学习、模仿、消化到本土意识的觉醒,并形成“东方设计”自觉追求的历程。本翻译实践以该书这两章为研究对象,应用了多模态翻译理论体系中的视觉语法理论。在实践部分,报告首先利用克雷斯和勒文的视觉语法理论,深入分析原文中图像的构成、布局和色彩等视觉元素,以及它们如何表达特定的文化含义。这一理论指导下,报告提出了针对性的翻译策略,旨在保留图像的视觉信息和文化内涵。同时,报告运用该理论,在案例分析中特别讨论了通过增加注释探讨了文本和图像间的互动关系,分析了如何在目标语言中保持这种动态关联,确保翻译后的文本和图像在新的文化背景下仍能有效传达原始信息。最后,报告还讨论了理论指导下遇到的具体挑战,如文化差异带来的解释困难,以及采用的解决策略。

关键词：多模态翻译视觉语法图片翻译现代设计

葡萄糖对Starmerella bacillaris香草醛耐受能力的影响

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食品科学 2024年第4期45卷 96-107页

作者：张清燕赵君张哲陈雄姚兰湖北工业大学生命科学与健康工程学院湖北武汉430068 中国轻工武汉设计工程有限责任公司湖北武汉430060

分析典型酚类抑制剂香草醛对酵母Starmerella bacillaris R5生长和产乙醇的影响,同时分析改变葡萄糖的质量分数对其生长和发酵性能的影响。结果表明在3 g/L香草醛质量浓度下,将培养基中的葡萄糖质量分数从2%提高至6%可将延滞期缩短25.9... 详细信息

分析典型酚类抑制剂香草醛对酵母Starmerella bacillaris R5生长和产乙醇的影响,同时分析改变葡萄糖的质量分数对其生长和发酵性能的影响。结果表明在3 g/L香草醛质量浓度下,将培养基中的葡萄糖质量分数从2%提高至6%可将延滞期缩短25.92%,比生长速率提高82.1%,乙醇转化率提高17.88%。进一步分析表明葡萄糖质量分数的提高还使含有活性氧的细胞比例增加、膜渗透率及胞内H2O2含量降低。过氧化氢酶、超氧化物歧化酶、谷胱甘肽过氧化物酶的活性分别提高58%、35.5%和2.3倍,胞内甘油质量浓度提高1.82倍。另外与糖代谢相关的丙酮酸激酶活性降低54.5%,己糖激酶和6-磷酸葡萄糖脱氢酶活性提高4.16倍和11.8倍,NADPH浓度提高19.4%,己糖激酶、6-磷酸果糖激酶、异柠檬酸脱氢酶、6-磷酸葡萄糖脱氢酶、乙醇脱氢酶、丙酮酸脱羧酶、醛酮还原酶基因水平分别上调4.6、2.5、13.9、12.2、17.5、34.8、34.9倍。葡萄糖质量分数的增加主要是通过提高细胞内抗氧化酶的活性,减弱氧化损伤,为酵母提供更多的腺苷三磷酸以及还原力以应对胁迫环境,从而提高乙醇的转化速率。本研究结果可为进一步利用S. bacillaris产纤维素乙醇提供新思路。

关键词：纤维素乙醇葡萄糖香草醛氧化应激 Starmerella bacillaris

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“双减”背景下初中英语分层作业实践研究

“双减”背景下初中英语分层作业实践研究

作者：赵君艳沈阳师范大学

学位级别：硕士

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新荣记基层员工离职问题研究

新荣记基层员工离职问题研究

作者：赵君利兰州财经大学

学位级别：硕士

餐饮行业是我国经济发展的重要基础产业之一,近几年发展形势良好,而且增速再次高于社会消费品零售总额增速,在带动经济增长,拉动消费方面发挥了明显的作用。餐饮业在迅速发展的同时,对人力资源需求也提出了更高的要求,但是作为服务行业... 详细信息

餐饮行业是我国经济发展的重要基础产业之一,近几年发展形势良好,而且增速再次高于社会消费品零售总额增速,在带动经济增长,拉动消费方面发挥了明显的作用。餐饮业在迅速发展的同时,对人力资源需求也提出了更高的要求,但是作为服务行业的餐饮企业却面临着“招工难、用工荒、留工难”的问题,如何破解“招工难、用工荒、留工难”成为餐饮行业急需解决的问题。新荣记作为餐饮企业的一员,同样面临着以上问题,本文以新荣记为研究对象,探索新荣记基层员工离职问题的影响因素,提出解决问题的对策,帮助新荣记及解决“留人难”的问题。文章第一章内容主要分析了研究背景,提出了研究的目的和意义,阐述了研究的内容和方法,并对国内外研究现状进行了阐述。文章第二章内容主要对研究的概念问题进行了界定,并对使用的理论基础进行了概述。文章的第三章内容首先对新荣记基层员工现状进行了分析,通过数据分析展示了新荣记基层员工的性别、工龄、学历、婚姻、薪酬等基本状况,客观的展示了企业基层员工的实际情况。随后对新荣记近五年离职的基层员工的学历、性别、婚姻、年龄、工龄、离职去向等数据进行分析,展示了已离职基层员工的具体情况。文章第四章主要根据Price-Mueller模型设计调查问卷,针对新荣记离职基层员工开展问卷调查,从离职影响因素的环境变量、个人因素、结构化变量和中介变量四个维度进行量化分析,探寻影响新荣记基层员工离职的影响因素。在第四章内容基础上,文章第五章内容对影响新荣记基层员工离职的两个重要影响因素进行了线下访谈,从企业管理者角度深入分析离职影响因素,了解企业已有的应对对策。文章第六章内容根据新荣记基层员工离职影响因素提出降低基层员工离职率的对策,降低新荣记在人力资源开发、员工招聘、员工培训等环节中所付出的物质成本和时间成本,同时降低基层员工离职对业务开展、绩效达成、企业战略达成带来的负面影响。餐饮行业人力资源管理体系有一定的相似性,本文为新荣记提出的降低基层员工离职率的策略可以为其他餐饮企业提供一定的参考依据,为餐饮行业提供降低基层员工离职率的参考方案,解决餐饮行业“留人难”的问题。

关键词：基层员工离职影响因素策略

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横向磁通永磁直线电机电磁振动特性分析

电工技术学报 2024年第1期39卷 168-181页

作者：赵玫赵君左思承禹国栋张华强哈尔滨工业大学电气工程及自动化学院哈尔滨150001 特种电机与高压电器教育部重点实验室(沈阳工业大学) 沈阳110023 国网江西省电力有限公司超高压分公司南昌330096

横向磁通永磁直线电机的电负荷与磁负荷相互解耦,且各相之间相互解耦,易于实现模块化和多相化,因此在石油开采领域有着良好的应用前景。首先,该文基于磁场调制原理,对横向磁通永磁直线电机的径向电磁力波进行了推导计算,得出对径向电磁... 详细信息

横向磁通永磁直线电机的电负荷与磁负荷相互解耦,且各相之间相互解耦,易于实现模块化和多相化,因此在石油开采领域有着良好的应用前景。首先,该文基于磁场调制原理,对横向磁通永磁直线电机的径向电磁力波进行了推导计算,得出对径向电磁力波影响最大的因素为轴向气隙磁通密度分量与径向气隙磁通密度分量,在此基础上对径向电磁力波的时空特性与频谱特性进行仿真计算,得出电枢磁通密度对电机径向电磁力波的频谱特性的影响;然后,考虑到电机实际运行中可能出现的次级偏心问题,揭示偏心度的大小对径向电磁力波幅值的影响,并对比不同偏心度下的电机径向磁拉力与轴向磁拉力,定量分析偏心度对不平衡磁拉力的影响;最后,为避免共振,利用有限元软件对电机的初级进行了模态分析与谐响应分析,结果表明低速状态下横向磁通永磁直线电机的额定运行频率较低,不会引起初级的共振,适合用作往复式潜油电泵的驱动电机。

关键词：横向磁通永磁直线电机径向电磁力波电磁振动偏心度