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基于转录组测序的红树莓bHLH转录因子家族鉴定及分析

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广西植物 2024年

作者：贺志敏张峻鑫于丽平胡康姬凤岐黄体冉杨明峰马兰青农业农村部华北都市农业重点实验室北京农学院生物与资源环境学院

bHLH转录因子是植物中数量较大的一类转录因子家族，在植物的生长发育、次级代谢调控、激素响应等方面发挥着重要的作用。红树莓果实中含有丰富的树莓酮，为了深入探究bHLH转录因子在红树莓生长发育及树莓酮合成过程中的作用，该研究基... 详细信息

bHLH转录因子是植物中数量较大的一类转录因子家族，在植物的生长发育、次级代谢调控、激素响应等方面发挥着重要的作用。红树莓果实中含有丰富的树莓酮，为了深入探究bHLH转录因子在红树莓生长发育及树莓酮合成过程中的作用，该研究基于“波尔卡”和“橙色传奇”两种红树莓果实的转录组测序，鉴定了红树莓bHLH基因家族成员，并对这些基因进行生物信息学分析。结果表明：（1）红树莓果实中共鉴定到95个bHLH转录因子家族成员。（2）红树莓的bHLH转录因子家族成员多数为不稳定蛋白；超过半数成员定位于细胞核。（3）其bHLH转录因子N端包含保守的His5-Glu9-Arg13序列，C端包含保守的Leu序列。（4）系统发育树将该家族成员分为20个亚家族，其中R亚家族成员最多，有12个。（5）表达模式图表明bHLH转录因子在青果期表达量较高，成熟期表达量较低。该研究结果为筛选与树莓酮含量变化一致的bHLH转录因子提供依据，为进一步探究红树莓bHLH家族的功能提供参考。

关键词：红树莓转录组测序 bHLH转录因子基因家族树莓酮

基于水负荷模型的醋炙前后甘遂的泻水逐饮功效研究

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特产研究 2024年第1期46卷 1-8页

作者：贺志敏安石安杨晓旭哈尔滨商业大学药学院黑龙江哈尔滨150001

通过建立水负荷动物模型,研究醋炙前后甘遂泻水逐饮功效的改变,从而为甘遂临床治疗腹水疾病提供理论依据。采用代谢笼法,大鼠腹腔注射5 mL生理盐水,同时灌胃给予5 mL生理盐水造成水负荷模型,观察生、醋甘遂对水负荷大鼠在0~2h、2~4 h、4... 详细信息

通过建立水负荷动物模型,研究醋炙前后甘遂泻水逐饮功效的改变,从而为甘遂临床治疗腹水疾病提供理论依据。采用代谢笼法,大鼠腹腔注射5 mL生理盐水,同时灌胃给予5 mL生理盐水造成水负荷模型,观察生、醋甘遂对水负荷大鼠在0~2h、2~4 h、4~6h以及6h的总尿量的影响,检测血清中Na^(+)、K^(+)水平,肝脏中AQP9、肾脏中AQP2水平以及肾脏、十二指肠组织形态学观察。与空白组比较,水负荷模型组的大鼠尿量显著增高,肾脏指数、肝AQP9和肾AQP2水平也显著增加;与模型组比较,生甘遂高剂量(SH)可显著升高水负荷模型大鼠的4~6 h尿量和6 h总尿量;醋甘遂高剂量(CH)对2~4 h、4~6 h尿量有显著增加,表现为自水负荷2 h后即有持续利尿作用,且越到后期利尿作用越强。此外,SH组对肾脏球囊间隙增宽和管壁增厚有明显的改善,对十二指肠壁上皮血管扩张充血明显增加;CH组对肠壁化脓液渗出明显减少,且醋甘遂低剂量(CL)组形态与阳对药组极为相似。生、醋甘遂组对水负荷模型大鼠均有显著的利尿作用,后者效果更为持久缓慢。初步判断甘遂可能通过调控水负荷大鼠肾脏中水通道蛋白的下调而影响分泌相关体液,使水重吸收受到抑制,从而有助于发挥排尿作用。在考虑到生、醋甘遂逐水功效相近,对肠壁及肾脏组织副作用更低的角度,推荐临床应用醋炙甘遂。

关键词：甘遂泻水逐饮水负荷

毛叶悬钩子和云南悬钩子叶绿体基因组比较分析

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生物技术进展 2024年第2期14卷 237-247页

作者：胡康于丽平谷薇贺志敏张峻鑫刘子璇黄体冉杨明峰北京农学院生物与资源环境学院北京102206 北京农学院农业农村部华北都市农业重点实验室北京102206 中国科学院大学生命科学学院北京100049

毛叶悬钩子(Rubus poliophyllus)和云南悬钩子(Rubus yunanicus)隶属于蔷薇科(Rosaceae)悬钩子属(Rubus)的尖叶亚组(Subsect.Acuminati),二者的形态特征和地理分布较为相似,因此难以分辨。通过Illumina高通量测序技术得到了二者的叶绿... 详细信息

毛叶悬钩子(Rubus poliophyllus)和云南悬钩子(Rubus yunanicus)隶属于蔷薇科(Rosaceae)悬钩子属(Rubus)的尖叶亚组(Subsect.Acuminati),二者的形态特征和地理分布较为相似,因此难以分辨。通过Illumina高通量测序技术得到了二者的叶绿体基因组序列,并对序列进行过滤、组装、注释和分析,构建了基于叶绿体基因组序列的系统发育树。结果表明,毛叶悬钩子和云南悬钩子的基因组全长分别为156298 bp和156299 bp,基因组序列总GC含量均为37.2%。均检测到159个叶绿体基因,其中蛋白质编码基因104个,tRNA基因45个,rRNA基因10个。毛叶悬钩子和云南悬钩子均含有17个回文重复序列,正向重复序列个数分别为19、17,反向重复序列分别为4、3。二者的同义密码子使用度(relative synonymous codon usage,RSCU)>1.00的密码子均有32个,密码子偏好以A/U结尾,有效密码子数均大于45。根据叶绿体全基因组及筛选到的rpoC1-rpoB基因序列所构建的系统发育树显示,毛叶悬钩子和云南悬钩子均聚为同一个分支,表明二者具有较近的亲缘关系。研究结果可为毛叶悬钩子和云南悬钩子的物种分子鉴定、遗传多样性研究及其系统发育关系提供理论依据。

关键词：毛叶悬钩子云南悬钩子叶绿体基因组密码子偏好性系统发育

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甘遂醋炙减毒机制的主要途径及靶点预测

中国药房 2023年第4期34卷 423-428页

作者：杨晓旭贺志敏李文兰哈尔滨商业大学药学院哈尔滨150001

目的研究甘遂醋炙减毒机制的主要途径及靶点。方法取24只SPF级SD大鼠,随机分为空白组、生甘遂组(850 mg/kg)、醋甘遂组(850 mg/kg),每组8只。空白组灌胃0.5%羧甲基纤维素钠溶液,生甘遂组、醋甘遂组给予相应的供试品药液,连续给药20 d,... 详细信息

目的研究甘遂醋炙减毒机制的主要途径及靶点。方法取24只SPF级SD大鼠,随机分为空白组、生甘遂组(850 mg/kg)、醋甘遂组(850 mg/kg),每组8只。空白组灌胃0.5%羧甲基纤维素钠溶液,生甘遂组、醋甘遂组给予相应的供试品药液,连续给药20 d,第20天收集大鼠12 h尿液。采用超高效液相色谱串联四极杆静电场轨道阱高分辨质谱(UPLC-Q-Exactive-MS)技术分析尿液样本。经Compound Discoverer 3.0软件进行数据前处理,经BioCyc、HMDB等数据库进行代谢物结构鉴定,应用主成分分析(PCA)、正交偏最小二乘法-判别分析(OPLS-DA)等多种方法观察不同组别是否呈现各自聚类现象;基于MetaboAnalyst进行通路分析,对甘遂醋炙减毒机制潜在靶点进行预测。结果鉴定出20个有显著性差异的内源性代谢物,其中有N-乙酰基-L-天冬氨酸、3-磷酸羟基丙酮酸等10个目标生物标志物为醋甘遂减毒机制作用靶点,参与的主要代谢通路包括精氨酸生物合成,丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢,半胱氨酸和蛋氨酸代谢及精氨酸和D-鸟氨酸代谢。对通路中所有相关代谢物的生物学意义进行分析推测,甘遂醋炙后可能通过降低N-乙酰基-L-天冬氨酸水平缓解神经毒性,通过升高L-高精氨酸水平对心脑血管系统存在保护作用等。结论甘遂经醋炙后,可对机体的神经系统、心脑血管系统、免疫系统及能量代谢等方面的不利因素有明显改善,其发挥减毒机制的最集中相关的代谢通路为精氨酸生物合成。

关键词：甘遂炮制减毒代谢组学目标生物标志物代谢通路

定点突变提高虎杖聚酮合酶的苯亚甲基丙酮合酶活性

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生物工程学报 2023年第7期39卷 2806-2817页

作者：贺志敏马文瑞于丽平吕鹤书杨明峰北京农学院农业农村部华北都市农业重点实验室北京102206

虎杖(Polygonum cuspidatum)聚酮合酶(polyketide synthase 1,PcPKS1)同时具有查尔酮合酶(chalcone synthase,CHS)及苯亚甲基丙酮合酶(benzylidene acetone synthase,BAS)催化活性,能够催化生成聚酮类化合物柚皮素查尔酮和苯亚甲基丙酮,进而催化合成黄酮类或覆盆子酮等具有多种生物学活性的化合物。本研究通过分析虎杖PcPKS1与掌叶大黄(Rheum palmatum)BAS、拟南芥(Arabidopsis thaliana)CHS等家族成员的序列以及酶催化位点的构象,确定可能影响酶功能的3个氨基酸位点:Thr133、Ser134、Ser339。采用定点突变对PcPKS1进行分子修饰,成功获得2个突变体并进行相关体外酶促反应,高效液相色谱(high performance liquid chromatography,HPLC)产物分析结果表明,在pH 7.0和pH 9.0的体外酶促条件下,突变体T133LS134A和S339V维持BAS和CHS双功能活性,且BAS活性显著高于原PcPKS1。本研究为利用PcPKS1进行基因工程调节黄酮类和覆盆子酮化合物的生物合成提供理论依据。

关键词：查尔酮合酶定点突变苯亚甲基丙酮合酶高效液相色谱

川莓和峨眉悬钩子叶绿体比较基因组学及其系统发育关系分析

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分子植物育种 2022年

作者：于丽平孙孟涛贺志敏张峻鑫黄体冉马兰青农业农村部华北都市农业重点实验室中国科学院大学生命科学学院北京农学院林木分子设计育种高精尖创新中心

悬钩子属植物具有重要的食用价值和经济价值，研究该属属内系统演化关系对于种质资源的保护与利用和遗传育种有着重要的意义。川莓(Rubus setchuenensis)和峨眉悬钩子(R. faberi)是蔷薇科(Rosaceae)悬钩子属(Rubus L.)两个形态非常相似...

悬钩子属植物具有重要的食用价值和经济价值，研究该属属内系统演化关系对于种质资源的保护与利用和遗传育种有着重要的意义。川莓(Rubus setchuenensis)和峨眉悬钩子(R. faberi)是蔷薇科(Rosaceae)悬钩子属(Rubus L.)两个形态非常相似且地理分布区存在重叠的物种，特别是有关峨眉悬钩子的形态和分子数据鲜有报道，给分类鉴定带来一定困难。本研究利用分子系统学的研究方法，对川莓(R. setchuenensis)和峨眉悬钩子(R. faberi)进行了叶绿体比较基因组学分析，并构建了基于叶绿体全基因组序列的系统发育树。结果表明：川莓和峨眉悬钩子的叶绿体基因组大小分别为156 295 bp,156 226 bp，呈现典型的环状四分体结构，且叶绿体基因组均有159个基因，其中包含27个蛋白质编码基因，10个rRNA基因和45个tRNA基因，GC含量均为37.2%。从川莓和峨眉悬钩子叶绿体基因组中可检测到49对长重复序列，均包含有16个正向重复序列和1个互补重复序列，但回文重复序列和反向重复序列在数量上存在少量的差异，其数量分别为21、23和11、9。在基因编码区筛选到matK、rps12、rpoC2、atpB以及ycf2 5种易发生变异的基因有望成为种间系统发育关系的DNA条形码。系统发育树结果显示，川莓与峨眉悬钩子构成姐妹类群，具有较近的亲缘关系。该研究结果有望为后期深入研究川莓和峨眉悬钩子分类鉴定和系统发育关系提供数据支撑。

关键词：

两株多环芳烃降解菌协同对菲-镉污染的去除特性

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微生物学报 2023年第1期63卷 283-296页

作者：许晓毅崔佳豪白净王斌陈小宾贺志敏温妍苏州科技大学环境科学与工程学院江苏苏州215009 苏州科技大学化学与生命科学学院江苏苏州215009 贵州大学土木工程学院贵州贵阳550025

【目的】从污染土壤中分离筛选一株多环芳烃降解菌,并探究其与Pseudomonas aeruginosa B6-2构建的混菌体系对菲-镉复合污染的修复效能,以及微生物代谢特性对不同镉浓度赋存的响应特性,以期为复合污染的生物修复提供优良菌株资源及应用... 详细信息

【目的】从污染土壤中分离筛选一株多环芳烃降解菌,并探究其与Pseudomonas aeruginosa B6-2构建的混菌体系对菲-镉复合污染的修复效能,以及微生物代谢特性对不同镉浓度赋存的响应特性,以期为复合污染的生物修复提供优良菌株资源及应用技术参考。【方法】采用富集驯化、筛选纯化方法得到一株多环芳烃降解菌,通过生理生化特征和16S rRNA基因序列分析进行鉴定。利用高效液相色谱法和电感耦合等离子体质谱法评估不同镉浓度赋存下各反应体系对菲和镉的去除效能;通过菌体细胞形态的扫描电镜观测及菌株代谢活性检测,探讨镉胁迫对菲生物降解过程的影响机制。【结果】筛选得到一株具有重金属耐受性和多环芳烃高效降解菌SZ-3,经鉴定为节杆菌属;降解菌协同体系(M)具有良好的菲降解效能和抗镉胁迫优势。镉胁迫浓度为0.5、10 mg/L时,M对菲和镉的去除率分别高于85%、80%;镉胁迫浓度为25、50 mg/L时,2种污染物的去除率均大于65%。扫描电镜分析表明,镉胁迫导致菌体表面粗糙且出现不同程度变形,菌体间黏附性和聚集性提高。反应周期内,邻苯二酚1,2-双加氧酶活性与电子传递体系活性随镉浓度增加而降低,两者变化与菲降解速率变化一致。【结论】Arthrobacter sp.SZ-3是一株PAHs高效降解菌,能与Pseudomonas aeruginosa B6-2协同高效修复菲-镉复合污染,随着初始镉胁迫浓度增加,混菌协同对目标污染物去除的优势显著。

关键词：复合污染菲重金属协同去除微生物修复镉胁迫

啤酒糟生物炭吸附固定化功能菌强化去除多环芳烃特性

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环境科学与技术 2022年第12期45卷 9-18页

作者：许晓毅陈小宾崔佳豪白净王斌黄天寅贺志敏苏州科技大学环境科学与工程学院江苏苏州215009 贵州大学土木工程学院贵州贵阳550025

文章采用不同热解温度制备的啤酒糟生物炭载体吸附固定化特征降解菌(SZ-3),分析啤酒糟生物炭理化性质与形貌表征对功能菌固定化能力的影响,探究菲、荧蒽、芘3种多环芳烃化合物(PAHs)的微生物降解效能强化以及反应周期内功能菌的增殖与... 详细信息

文章采用不同热解温度制备的啤酒糟生物炭载体吸附固定化特征降解菌(SZ-3),分析啤酒糟生物炭理化性质与形貌表征对功能菌固定化能力的影响,探究菲、荧蒽、芘3种多环芳烃化合物(PAHs)的微生物降解效能强化以及反应周期内功能菌的增殖与酶活特性。结果表明,500℃热解温度制备的啤酒糟生物炭亲水性强,比表面积及孔径分别为2.505 m^(2)/g、23.928 nm,炭材料表面官能团以羧基、脂肪醚为主,电子传递性能优良,对功能菌的吸附量达到825.71 nmol P/g。批次实验条件下,优化制备的啤酒糟生物炭固定化功能菌对水中菲、荧蒽、芘的去除率分别为71%、38%和35%,相较于单独生物炭和游离功能菌体系,固定化降解菌对PAHs化合物去除率提升范围为8%~34%,且菲的生物降解效能强化最为显著。同时,啤酒糟生物炭固定化降解菌体系中的功能菌生长数量和邻苯二酚双加氧酶活性也较大提高。采用啤酒糟生物炭作为微生物固定化载体强化难降解有机物去除具有良好的实际意义。

关键词：生物炭啤酒糟固定化多环芳烃双加氧酶

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绩效管理伦理探论

绩效管理伦理探论

作者：贺志敏湖南师范大学

学位级别：硕士

企业组织的使命归根结底在于创造优秀的业绩和效益。绩效管理是整个企业运营的全部,为顾客创造价值,使员工走向卓越,为社会创造效益,这是企业价值的核心和根本的价值目标。现代绩效管理忽视了以人为本的管理变革要求,存在着重大的理论... 详细信息

企业组织的使命归根结底在于创造优秀的业绩和效益。绩效管理是整个企业运营的全部,为顾客创造价值,使员工走向卓越,为社会创造效益,这是企业价值的核心和根本的价值目标。现代绩效管理忽视了以人为本的管理变革要求,存在着重大的理论缺失:对绩效和绩效管理的内在实质认识模糊,只重经济绩效,忽视其他组织效应;绩效管理过程中缺乏战略愿景,战略短视,缺乏长远的伦理战略眼光;绩效考评过程中违背公平、诚信等伦理准则,管理过程缺乏双向交流;绩效考评重结果轻过程,考评代替绩效管理,只重奖惩不重发展等等,这些绩效管理中出现的伦理问题严重的制约了管理的有效性。为克服绩效管理理论的诸多缺失,我们应当注重发掘和提升绩效管理的伦理属性,加强研究绩效管理伦理。绩效管理伦理作为经济伦理学的分支,是从经济伦理学的视角审视和分析绩效管理,是对绩效管理应当具备的伦理规范和应遵守的伦理准则进行理论概括。通过对绩效管理的伦理目标的设定,剖析绩效管理的伦理内涵,探寻绩效管理伦理的本质、类型和特征,确立绩效管伦理的价值目标、原则和规范,并以此为价值标竿推行绩效管理的伦理策略,抓好绩效管理的伦理评估,使绩效管理既能注重效率,又能兼顾公平,既能满足组织生存的近期目的,又能实现规划发展的长期目标,实现功利与道义、明道与计功的有机统一。这样,也就对现代的绩效管理模式的缺失进行有针对性地矫治,有助于整体提高绩效管理的水平,取得理想化的伦理效益。

关键词：绩效管理伦理功利