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基于通路分析的全基因组甲基化水平与视觉记忆的相关性研究

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中华医学遗传学杂志 2015年第5期32卷 625-628页

作者：谷晓楚倪培艳向波赵连生韦锦学王英成马小红李涛四川大学华西医院精神医学研究室、心理卫生中心生物治疗国家重点实验室成都610041 江苏省苏州市广济医院检验科

目的通过对全基因组启动子甲基化程度与视觉记忆强相关的基因进行生物信息学分析，寻找与记忆功能相关的基因所在信号通路。方法对9名正常人外周血单核细胞DNA样本进行甲基化DNA免疫共沉淀芯片分析。将基因的启动子区域甲基化水平与即... 详细信息

目的通过对全基因组启动子甲基化程度与视觉记忆强相关的基因进行生物信息学分析，寻找与记忆功能相关的基因所在信号通路。方法对9名正常人外周血单核细胞DNA样本进行甲基化DNA免疫共沉淀芯片分析。将基因的启动子区域甲基化水平与即刻及延迟视觉记忆功能进行相关性分析，筛选出与两者都强相关的基因并进一步进行通路和物理交互作用分析。结果与即刻及延迟视觉记忆都强相关的基因有69个，这些基因的通路及物理交互作用分析共涉及42条通路，其中22条通路的Q值小于0．05，包括了与能量代谢、突触功能、酪氨酸激酶活性、白细胞功能相关的通路。结论本研究首次利用甲基化组学数据与数量性状进行相关性及通路分析，揭示了可能与记忆相关并受甲基化调控的信号通路。

关键词：基因组甲基化视觉记忆相关性研究

利培酮在U251细胞中调节PI3K-Akt-GSK3β信号通路的研究

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中华医学遗传学杂志 2014年第6期31卷 693-697页

作者：粱林辉王英成韦锦学谷晓楚向波马小红李涛四川大学生物治疗国家重点实验室精神医学研究室成都610041 华西医院心理卫生中心

目的探讨抗精神病药物利培酮对蛋白激酶B（protein kinase B，Akt）-糖原合成酶激酶3p（glycogen synthase kinase 3β，GSK3β）信号通路的影响以及磷脂酰肌醇-3-羟激酶（phosphoinositide 3-kinase，PI3K）在多巴胺D2受体基因（dopami... 详细信息

目的探讨抗精神病药物利培酮对蛋白激酶B（protein kinase B，Akt）-糖原合成酶激酶3p（glycogen synthase kinase 3β，GSK3β）信号通路的影响以及磷脂酰肌醇-3-羟激酶（phosphoinositide 3-kinase，PI3K）在多巴胺D2受体基因（dopaminereceptorD2，DRD2）表达和Akt-GSK3β信号通路中的作用。方法正常培养人胶质瘤细胞（U251），以未经任何处理的细胞为对照，应用Western印迹检测利培酮以及P13K抑制剂LY294002对U251细胞中Akt（Thr308和Ser473）和GSK3β（Ser9）磷酸化蛋白表达水平的影响，应用实时PCR检测利培酮以及PI3K抑制剂LY294002对U251细胞中DRD2表达的影响。结果利培酮能够增加U251细胞中Akt和GSK3β磷酸化蛋白的表达水平（P〈0．05），但DRD2表达水平无明显变化。利培酮介导的Akt和GSK313磷酸化蛋白的表达升高可以被LY294002抑制（P〈0．01，P％0．05），且LY294002可抑制DRD2的表达（P〈0．05）。结论利培酮能激活U251细胞中Akt-GSK3β信号通路，P13K是Akt-aSK3β信号通路和DRD2表达共同的调节位点。

关键词：利培酮蛋白激酶B 糖原合成酶激酶3B 多巴胺D2受体磷脂酰肌醇-3-羟激酶

肾素基因启动子区域甲基化水平与精神分裂症患者认知损害的关联

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南通大学学报（医学版） 2020年第2期40卷 117-121页

作者：谷晓楚倪培艳李涛四川大学华西医院精神医学研究室成都610041 苏州大学附属广济医院临床检验科四川大学华西医院心理卫生中心四川大学华西医院脑科学研究中心

目的:探索肾素基因启动子甲基化水平与精神分裂症可能的相关性及潜在的生物学作用。方法:利用外周血单个核细胞基因组,采用Massarray飞行时间质谱法,测定肾素基因启动子CpG位点的甲基化水平。采用剑桥神经心理自动化成套测试中的快速视... 详细信息

目的:探索肾素基因启动子甲基化水平与精神分裂症可能的相关性及潜在的生物学作用。方法:利用外周血单个核细胞基因组,采用Massarray飞行时间质谱法,测定肾素基因启动子CpG位点的甲基化水平。采用剑桥神经心理自动化成套测试中的快速视觉信息处理(rapid visual information processing,RVP)和延迟匹配(delayed matching to sample,DMS)评估受试者注意力及视觉记忆。结果:发现两组间肾素基因启动子甲基化水平差异无统计学意义(P>0.05)。以性别、年龄、患病状态作协变量,CpG位点[chr1:204166158(hg38)]的甲基化比例与RVP总正确反应数(r=-0.68,P=2.42×10^-7),RVP A’(r=-0.61,P=6.94×10^-6),DMS总正确数(r=-0.55,P=1.02×10^-4),DMS延迟正确数(r=-0.54,P=1.52×10^-4)显著相关。结论:肾素基因可能通过启动子甲基化在精神分裂症病理中发挥一定的作用。

关键词：精神分裂症肾素 DNA甲基化基因启动子认知功能

首发精神分裂症患者认知功能和临床特征与脑源性生长因子基因Va166Met多态性的相关性

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中华医学遗传学杂志 2017年第4期34卷 592-596页

作者：张程程谷晓楚王强李名立邓伟郭万军赵连生马小红李涛四川大学华西心理卫生中心成都610041

目的探讨首发精神分裂症患者的认知功能损害和临床特征与脑源性生长因子（brain-derivedneurotrophicfactor，BDNF）基因Va166Met多态性的相关性。方法采用TaqMan荧光探针技术对87例首发精神分裂症患者和76名对照者BDNF基因的Va166Met（... 详细信息

目的探讨首发精神分裂症患者的认知功能损害和临床特征与脑源性生长因子（brain-derivedneurotrophicfactor，BDNF）基因Va166Met多态性的相关性。方法采用TaqMan荧光探针技术对87例首发精神分裂症患者和76名对照者BDNF基因的Va166Met（rs6265）多态性进行检测，采用韦氏智力成人版测试进行认知功能评估，分析诊断和基因多态性对智商交互影响，并对患者异常的智商与临床症状严重程度进行相关性分析。结果患者组总智商、言语智商和操作智商和对照组比较出现显著下降。总智商（F=4．59，P=0．01）和言语智商（F=4．44，P=0．01）下降受基因和诊断交互作用的影响，Val／Val基因型患者言语智商低于Val／Met和Met／Met基因型患者，而Met／Met基因型对照者言语智商低于Val／Met基因型，Met／Met基因型对照者总智商小于Val／Met和Val／Val基因型对照者。精神分裂症Val／Val基因型者总智商与阳性症状分（r=-0．65，P=0．03）和思维紊乱（r==0．61，P=0．02）症状呈负相关。结论首发精神分裂症患者认知功能损害、临床特征与BDNF基因Va166Met多态性相关，BDNFVa166等位基因是精神分裂症易感基因。

关键词：精神分裂症脑源性生长因子认知功能

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精神分裂症COMT基因Val158Met多态性与注意力及执行功能缺乏关联

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中华医学遗传学杂志 2014年第5期31卷 650-653页

作者：王强杨振兴梁林辉谷晓楚黄朝华李名立邓伟马小红王英成赵连生向波李涛四川大学华西医院心理卫生中心成都610041 四川大学华西医院精神医学研究室成都610041 苏州大学附属广济医院检验科

目的探讨COMT基因Val158Met多态性与执行功能以及注意力之间的相关性。方法采用连线测验评估103例精神分裂症患者（患者组）和99名正常对照（对照组）的注意力和执行功能；采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR—RFLP）方法检测C... 详细信息

目的探讨COMT基因Val158Met多态性与执行功能以及注意力之间的相关性。方法采用连线测验评估103例精神分裂症患者（患者组）和99名正常对照（对照组）的注意力和执行功能；采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR—RFLP）方法检测COMTVal158met各突变点的基因多态性并进行基因分型，用SPSS13．0软件的一般线性模型分析COMTVal158Met多态性和执行功能以及注意力之间的相关性。结果执行功能以及注意力在患者组和对照组中差异有统计学意义，而在三组基因型之间的差异无统计学意义。结论COMTVall58Met多态性和执行功能以及注意力无相关性，主要原因可能是人群的异质性。

关键词：精神分裂症 COMTVal158Met多态性注意力及执行功能

血清白细胞介素-8水平与抑郁障碍患者疲劳症状的相关性研究

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国际检验医学杂志 2022年第11期43卷 1290-1294页

作者：谷晓楚叶刚汤臻徐晓文贾秋放惠李苏州大学附属广济医院临床检验科江苏苏州215137 苏州大学附属广济医院临床心理科江苏苏州215137 苏州大学附属广济医院生物精神病学研究中心江苏苏州215137

目的研究血清白细胞介素-8(IL-8)与抑郁障碍及其临床症状之间可能的关联性。方法选择2019年在该院住院的抑郁障碍患者34例作为抑郁障碍组,选择同期正常对照者30例作为对照组。采用酶联免疫吸附试验检测所有受试者血清IL-8水平,采用9... 详细信息

目的研究血清白细胞介素-8(IL-8)与抑郁障碍及其临床症状之间可能的关联性。方法选择2019年在该院住院的抑郁障碍患者34例作为抑郁障碍组,选择同期正常对照者30例作为对照组。采用酶联免疫吸附试验检测所有受试者血清IL-8水平,采用9条目患者健康问卷(PHQ-9)评估所有受试者的抑郁症状。结果抑郁障碍组血清IL-8水平高于对照组,差异有统计学意义(t=2.82,P<0.01)。血清IL-8水平与抑郁障碍患者的PHQ-9总分(r=0.26,P=0.04)及疲劳程度(r=0.36,P<0.01)呈正相关。通过受试者工作特征曲线分析,血清IL-8水平判断抑郁障碍患者是否“几乎每天都感觉疲劳或没有活力”的效能较高(AUC=0.80,P<0.01)。结论 IL-8可能在抑郁障碍的病理过程中发挥了一定的作用,并可能可以作为抑郁障碍患者疲劳的生物学标记物。

关键词：抑郁障碍白细胞介素-8 疲劳

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纤维蛋白支架移植对大鼠脊髓损伤后神经再生和胶质瘢痕形成的影响

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神经解剖学杂志 2009年第2期25卷 121-128页

作者：崔颜宏王穆彬陈静龚爱华步雪峰孙湘兰谷晓楚庄琴钱雷敏姜平张志坚江苏大学基础医学研究所镇江212013 江苏大学科学研究院镇江212013

观察纤维蛋白-纤粘连蛋白-层粘连蛋白复合支架移植对大鼠脊髓损伤后神经再生和胶质瘢痕形成的影响,评价该支架移植修复脊髓损伤的可行性。本研究将圆柱状复合支架移植入大鼠脊髓完全横断缺损部位,同时以该模型动物作为对照组。分别于术... 详细信息

观察纤维蛋白-纤粘连蛋白-层粘连蛋白复合支架移植对大鼠脊髓损伤后神经再生和胶质瘢痕形成的影响,评价该支架移植修复脊髓损伤的可行性。本研究将圆柱状复合支架移植入大鼠脊髓完全横断缺损部位,同时以该模型动物作为对照组。分别于术后4w、8w、12w对动物下肢运动功能进行BBB评分。然后取出支架/脊髓组织,用免疫荧光双标和免疫印迹技术分析损伤部位神经纤维再生和胶质细胞增生情况;并用透射电镜观察支架移植部位的组织学结构。结果显示:术后4～12w支架移植组动物BBB评分明显高于对照组(P<0.05)。于术后4w,移植组可见支架内有少量神经纤维,此后神经纤维逐渐增多,而胶质细胞增生不明显;对照组脊髓损伤局部可见坏死空洞,空洞周边胶质细胞增生明显。免疫印迹检测结果表明,移植组神经丝蛋白(NF-200)相对含量高于对照组;对照组胶质纤维酸性蛋白(GFAP)的相对含量高于实验组。以上结果提示:纤维蛋白支架移植可促进大鼠脊髓损伤后神经再生,并抑制胶质瘢痕形成。纤维蛋白(原)作为生物材料用于构建修复脊髓损伤的组织工程支架具有良好的应用前景。

关键词：纤维蛋白纤粘连蛋白层粘连蛋白组织工程支架组织相容性脊髓损伤神经丝胶质纤维酸性蛋白

IL-10在脊髓损伤SD大鼠脊髓神经组织中的表达及其动态变化

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中国现代药物应用 2008年第24期2卷 1-3页

作者：孙湘兰许燕龚爱华刘锦波崔颜红王穆彬谷晓楚张志坚江苏大学科学研究院 212013 江苏大学医学院常州市第二人民医院骨三科

目的探讨内源性IL-10在脊髓损伤SD大鼠脊髓神经组织中表达的动态变化及其意义。方法采用成年SD大鼠脊髓横断损伤(SCI)模型,经ELISA方法检测脊髓损伤急性期内IL-10在脊髓神经组织中表达的动态变化。采用免疫荧光双标记技术,于荧光显微镜... 详细信息

目的探讨内源性IL-10在脊髓损伤SD大鼠脊髓神经组织中表达的动态变化及其意义。方法采用成年SD大鼠脊髓横断损伤(SCI)模型,经ELISA方法检测脊髓损伤急性期内IL-10在脊髓神经组织中表达的动态变化。采用免疫荧光双标记技术,于荧光显微镜下观察IL-10在脊髓神经细胞和胶质细胞内的表达,及其与神经丝蛋白(NF)和神经胶质细胞标志蛋白(GFAP)的共定位情况。结果①免疫荧光结果显示:正常对照组IL-10在脊髓神经细胞和胶质细胞表达较弱;脊髓损伤后IL-10在脊髓神经细胞和胶质细胞的表达明显增强,且中央管的室管膜细胞亦有较强表达;②定量检测结果表明:IL-10在损伤大鼠脊髓中的表达,从脊髓损伤后第3天呈上升趋势,至第5天出现最大峰值,至第7天有所下降,14 d接近正常水平。结论在脊髓损伤急性期内,脊髓神经细胞和胶质细胞均可表达大量的炎症抑制因子IL-10,根据其动态变化规律,笔者推测IL-10表达上调可能与中枢神经系统内固有免疫反应相关,IL-10可抑制炎症因子的过度表达,从而保护中枢神经系统免受继发性炎症反应造成的损伤。

关键词：脊髓损伤神经细胞胶质细胞 IL-10

与多形性胶质母细胞瘤患者生存期相关的权重基因共表达网络构建

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中国医药科学 2019年第24期9卷 287-289,293页

作者：徐晓文何玉琪张露潘名志杨旭娜惠李谷晓楚江苏省苏州市广济医院临床检验科江苏苏州215008 江苏省苏州市广济医院医务部江苏苏州215008 江苏省苏州市广济医院科教部江苏苏州215008

目的构建与多形性胶质母细胞瘤患者生存期相关的权重基因共表达网络。方法采用R软件平台下的权重基因共表达网络构建多形性胶质母细胞瘤组织表达谱共表达网络,与患者生存期进行相关性分析,并对与生存期显著相关的共表达网络中的基因集... 详细信息

目的构建与多形性胶质母细胞瘤患者生存期相关的权重基因共表达网络。方法采用R软件平台下的权重基因共表达网络构建多形性胶质母细胞瘤组织表达谱共表达网络,与患者生存期进行相关性分析,并对与生存期显著相关的共表达网络中的基因集进行通路富集。结果权重基因共表达网络共构建了31个共表达模块,其中有一个包含199个基因的模块与患者生存期显著相关(r=0.35,P<0.01)。通路分析发现,这199个基因显著富集于整合素、胶原蛋白、硫酸软骨素等细胞外基质相关通路以及Wnt、表皮生长因子受体(EGFR)、血管内皮生长因子(VEGF)、尿激酶型纤溶酶原激活因子(uPA)和伊立替康等代谢相关通路中。结论成功构建了与多形性胶质母细胞瘤患者生存期相关的权重基因共表达网络,应用该网络分析发现了与多形性胶质母细胞瘤患者生存期相关的信号通路。

关键词：多形性胶质母细胞瘤生存期权重基因共表达网络相关性研究