检索结果-南通市图书馆

保存液类型及56℃灭活前处理对呼吸道病毒荧光PCR检测结果的影响

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

当代医药论丛 2022年第8期20卷 143-146页

作者：林艳艳邢子伟伦雪恩刘梓航谢英俊谭翰清肇庆市医学高等专科学校广东肇庆526020 肇庆市疾病预防控制中心广东肇庆526060 广州医科大学附属第三临床学院广东广州510150 广东省产科重大疾病重点实验室广州医科大学附属第三医院妇产科广东广州510150 广东省普通高校生殖与遗传重点实验室广州医科大学附属第三医院广东广州510150

目的:探讨保存液类型及56℃灭活前处理30~60 min对经磁珠法提取的呼吸道病毒荧光PCR检测结果的影响。方法:将灭活的呼吸道病毒作为质控品,分别以非灭活型病毒保存液和含胍盐的灭活型病毒保存液为基质,制备成两种不同保存液类型的中、低... 详细信息

目的:探讨保存液类型及56℃灭活前处理30~60 min对经磁珠法提取的呼吸道病毒荧光PCR检测结果的影响。方法:将灭活的呼吸道病毒作为质控品,分别以非灭活型病毒保存液和含胍盐的灭活型病毒保存液为基质,制备成两种不同保存液类型的中、低、较低浓度的临床模拟样本。分别在常温与56℃下对样本进行30~60 min的灭活前处理,然后统一采用核酸提取试剂盒(磁珠法)和呼吸道病毒核酸检测试剂盒(荧光PCR法)对样本进行检测,并采用SPSS18.0软件分别对三个稀释梯度样本的ORF1ab、N基因Ct值进行统计学分析。结果:两种病毒保存液经磁珠法提取核酸,呼吸道病毒核酸检测的Ct值相比有统计学差异(ORF1ab基因:P0.05)。结论:含胍盐的灭活型病毒保存液可提高经磁珠法提取的呼吸道病毒荧光PCR检测结果的灵敏度,56℃灭活前处理30~60 min未对经磁珠法提取的呼吸道病毒荧光PCR检测结果产生影响。

关键词：非灭活型病毒保存液胍盐灭活型病毒保存液呼吸道病毒灭活前处理荧光PCR 磁珠法核酸提取

TaqMan-MGB探针实时荧光定量PCR检测克罗诺杆菌MMS基因方法的建立

维普期刊数据库评论

在线全文

维普期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

中国食品卫生杂志 2014年第1期26卷 40-44页

作者：谭翰清蔡建生谭海芳林凤程洁萍广东省肇庆市疾病预防控制中心广东肇庆526060

目的建立克罗诺杆菌的特异、灵敏的TaqMan-MGB探针实时荧光定量PCR检测方法。方法根据GenBank公布的克罗诺杆菌MMS基因高保守序列,设计特异引物和TaqMan-MGB探针,建立和优化反应体系,用25种其他常见致病菌评价反应体系的特异性,用克罗... 详细信息

目的建立克罗诺杆菌的特异、灵敏的TaqMan-MGB探针实时荧光定量PCR检测方法。方法根据GenBank公布的克罗诺杆菌MMS基因高保守序列,设计特异引物和TaqMan-MGB探针,建立和优化反应体系,用25种其他常见致病菌评价反应体系的特异性,用克罗诺杆菌MMS基因重组质粒构建实时荧光定量PCR标准曲线,对重组质粒、纯菌和人工模拟污染样本进行灵敏度试验,并与FDA推荐的TaqMan探针实时荧光PCR比较,配对t检验分析两种方法对Ct值和荧光强度的差异。结果采用TaqMan-MGB探针实时荧光定量PCR检测克罗诺杆菌MMS基因仅需40 min,与25种非目标菌无交叉反应,仅对克罗诺杆菌有特异性扩增;所构建方法线性关系良好,相关系数r2=0.999,扩增效率为99.972%,对重组质粒、纯菌、人工模拟污染样品标本的灵敏度分别达10拷贝/反应、3.8和38 cfu/ml;与FDA推荐的TaqMan探针实时荧光PCR相比,TaqMan-MGB探针实时荧光定量PCR的Ct值更小、△Rn值更高,灵敏度和分辨率差异均有统计学意义(Ct:t=-14.406,P﹤0.01;△Rn:t=14.230,P﹤0.01)。结论本研究建立的TaqMan-MGB探针实时荧光定量PCR反应体系能够快速、特异、灵敏地检测克罗诺杆菌MMS基因,可用于婴幼儿奶粉中克罗诺杆菌的快速筛查和鉴定,具有较大的的应用价值和推广价值。

关键词：克罗诺杆菌(原阪崎肠杆菌) 实时荧光定量PCR TaqMan—MGB探针局部大分子合成操作子 MMS基因食源性致病菌食品安全

广东省肇庆市2015—2018年禽类市场环境禽流感病毒监测

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国热带医学 2020年第6期20卷 514-518页

作者：赵婉莎谭翰清程洁萍伦雪恩肇庆市疾病预防控制中心广东肇庆526060

目的了解肇庆市2015—2018年禽类市场环境中禽流感病毒的动态分布情况,为肇庆市禽流感预警和防控工作提供参考依据。方法采集2015—2018年肇庆市9个县(市、区)的禽类市场环境标本,用实时荧光PCR法进行A型流感病毒(FluA)核酸检测,FluA阳... 详细信息

目的了解肇庆市2015—2018年禽类市场环境中禽流感病毒的动态分布情况,为肇庆市禽流感预警和防控工作提供参考依据。方法采集2015—2018年肇庆市9个县(市、区)的禽类市场环境标本,用实时荧光PCR法进行A型流感病毒(FluA)核酸检测,FluA阳性标本进行H5、H7、H9亚型流感病毒分型。结果共采集禽类市场环境标本4508份,其中FluA核酸阳性标本共1154份,总阳性检出率为25.60%;H5、H7、H9和A型未分型阳性检出率分别为5.72%、2.75%、17.48%和4.44%。FluA阳性检出率在肇庆市9个县(市、区)之间差异有统计学意义(P<0.05),其中阳性检出率最高是鼎湖区。FluA阳性检出率及其他亚型阳性检出率在1、2月份明显高于其他月份,冬春季为禽流感病毒的感染高峰期。FluA阳性检出率在5种类型监测标本之间差异具有统计学意义(P<0.05),其中宰杀或摆放禽肉案板表面的擦拭标本(简称案板)阳性检出率最高(33.04%),笼具表面擦拭标本(简称笼具)次之(27.22%)。结论肇庆市禽类市场环境中存在H5、H7、H9及多种亚型混合的致病性禽流感病毒潜在传播风险,尤其在冬春季,需结合人感染高致病性禽流感的流行状况,加强禽类从业人群的健康教育与禽类市场环境禽流感病毒监测,对人感染禽流感发生的预警和风险评估有重要意义。

关键词：禽类市场环境禽流感病毒监测

副溶血性弧菌tdh基因的分子信标PCR技术检测

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国公共卫生 2006年第12期22卷 1475-1477页

作者：万成松谭翰清温文川南方医科大学公共卫生与热带医学学院微生物学系广州510515 广州出入境检验检疫局食品检验中心

目的采用分子信标PCR技术进行副溶血性弧菌tdh基因检测。方法在反应体系中加入分子信标探针。对13株副溶血性弧菌和其他细菌分别进行tdh基因实时和终点法荧光检测。结果2株副溶血性弧菌和阳性质粒的终点法检测荧光值分别为114．9，95．2... 详细信息

目的采用分子信标PCR技术进行副溶血性弧菌tdh基因检测。方法在反应体系中加入分子信标探针。对13株副溶血性弧菌和其他细菌分别进行tdh基因实时和终点法荧光检测。结果2株副溶血性弧菌和阳性质粒的终点法检测荧光值分别为114．9，95．2，90．0。实时PCR检测的CT值分别为26．2，26．8，32．0。其他肠道细菌终点法检测荧光值为47．0～69．1；CT值〉32．0或无值，与琼脂糖电泳分析结果一致。结论分子信标PCR技术可以准确、快速、实时、简便地进行副溶血性弧菌tdh基因检测。

关键词：副溶血性弧菌(VP) 分子信标 tdh基因实时PCR

荧光PCR方法检测金黄色葡萄球菌nuc基因及其在消毒监测中的初步应用

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国消毒学杂志 2014年第5期31卷 467-469,472页

作者：谭国浩谭翰清程洁萍林凤广东省广宁县疾病预防控制中心广东广宁526300 广东省肇庆市疾病预防控制中心

目的建立金黄色葡萄球菌实时荧光PCR反应体系,用于消毒监测的快速检测。方法利用金黄色葡萄球菌耐热核酸酶nuc基因高保守序列,建立实时荧光PCR体系,评价其在消毒监测中的应用效果。结果建立的金黄色葡萄球菌实时荧光PCR反应体系检测时限... 详细信息

目的建立金黄色葡萄球菌实时荧光PCR反应体系,用于消毒监测的快速检测。方法利用金黄色葡萄球菌耐热核酸酶nuc基因高保守序列,建立实时荧光PCR体系,评价其在消毒监测中的应用效果。结果建立的金黄色葡萄球菌实时荧光PCR反应体系检测时限短,全程1.5 h即可完成检测。该反应体系与其他细菌无交叉反应,重组阳性质粒和纯菌培养物检测下限分别为10拷贝/反应和35 cfu/ml。在1 880份消毒监测中所得阳性结果与细菌培养法结果一致。结论所建立的金黄色葡萄球菌nuc基因实时荧光PCR反应体系能准确检出标本中金黄色葡萄球菌,该方法快速、特异、灵敏。

关键词：金黄色葡萄球菌实时荧光PCR 消毒监测基因

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

医院不同来源金黄色葡萄球菌耐药性比较

中国消毒学杂志 2010年第3期27卷 288-289页

作者：林凤谭翰清广东省肇庆市疾病预防控制中心肇庆526020

目的了解医院不同来源的金黄色葡萄球菌耐药性,为有效控制医院感染和临床用药提供依据。方法采用纸片扩散法,对本医院临床分离与医院环境中分离的金黄色葡萄球菌的耐药性进行了检测和比较。结果医院环境中分离与临床分离的金黄色葡萄球... 详细信息

目的了解医院不同来源的金黄色葡萄球菌耐药性,为有效控制医院感染和临床用药提供依据。方法采用纸片扩散法,对本医院临床分离与医院环境中分离的金黄色葡萄球菌的耐药性进行了检测和比较。结果医院环境中分离与临床分离的金黄色葡萄球菌对万古霉素均100%敏感。医院环境中分离的25株金黄色葡萄球菌对头孢西丁、氯霉素、环氧沙星、克林霉素、红霉素、庆大霉素、青霉素、四环素、甲氧苄啶、利福平等10抗生素耐药率均低于临床病人标本分离的30株金黄色葡萄球菌。结论医院环境中和病人标本分离的金黄色葡萄球菌对临床常用抗生素的耐药性存在差别,病人标本分离菌株耐药性更强。

关键词：金黄色葡萄球菌环境分离株临床分离株耐药性

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

乙型脑炎病毒检测技术研究进展

中国卫生检验杂志 2006年第11期16卷 1402-1404页

作者：谭翰清陈华谭海芳广东省肇庆市疾病预防控制中心广东肇庆526020

乙型脑炎病毒(japanese encephalitis virus,JEV),属于黄病毒科黄病毒属,有包膜的单正链RNA病毒,结构蛋白有3种:C、M和E,分为4个基因型(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ型)[1,2].

关键词：乙型脑炎病毒 ELISA RT—PCR 实时荧光PCR 基因芯片

H5N6禽流感病毒双重实时荧光RT-PCR的建立与应用

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

H5N6禽流感病毒双重实时荧光RT-PCR的建立与应用

柯萨奇A组6型病毒TaqMan探针实时荧光RT-PCR的建立

2018新发传染病研究热点研讨会

作者：谭翰清程洁萍朱颖梅肇庆市疾病预防控制中心

目的建立人感染高致病性H5N6禽流感病毒TaqMan-MGB探针双重实时荧光RT-PCR反应体系,用于疑似病例快速诊断及活禽交易市场外环境污染状况监测。方法根据GenBank中H5N6禽流感病毒HA和NA高保守基因序列设计特异引物对和TaqMan-MGB探针,建... 详细信息

目的建立人感染高致病性H5N6禽流感病毒TaqMan-MGB探针双重实时荧光RT-PCR反应体系,用于疑似病例快速诊断及活禽交易市场外环境污染状况监测。方法根据GenBank中H5N6禽流感病毒HA和NA高保守基因序列设计特异引物对和TaqMan-MGB探针,建立和优化针对H5和N6基因的双重实时荧光RT-PCR反应体系,进行特异性、灵敏度、重复性试验评估,并在临床应用中与商品化试剂盒进行比较。结果本研究建立的H5N6双重实时荧光RT-PCR体系可在80min内完成检测,与其他亚型流感病毒及常见呼吸道病原体均无交叉反应,对阳性克隆质粒的灵敏度可达到10拷贝/反应,H5和N6靶基因实时荧光定量RT-PCR标准曲线的相关系数R2分别为0.999和0.993,对3个不同浓度的核酸RNA样本10次平行检测Ct值的变异系数分别为0.151%～0.549%和0.213%～0.575%,在临床应用验证试验中与主流商品化试剂盒的阳性和阴性符合率均一致。结论 H5N6禽流感病毒TaqMan-MGB探针双重实时荧光RT-PCR特异、灵敏、稳定,在疑似病例的早期快速应急检测及活禽交易市场外环境污染状况持续性监测方面具有较好的应用价值。

关键词： H5N6禽流感病毒实时荧光RT-PCR TaqMan-MGB探针血凝素基因神经氨酸酶基因

来源： cnki会议评论

在线全文

cnki会议

学校读者我要写书评

暂无评论

热带医学杂志 2017年第7期17卷 908-911页

作者：程洁萍谭翰清肇庆市疾病预防控制中心广东肇庆526060

目的建立柯萨奇A组6型病毒TaqMan探针实时荧光RT-PCR,用于手足口病例快速诊断及监测。方法根据GenBank中柯萨奇A组6型病毒VP1高保守序列设计引物和探针,建立和优化实时荧光RT-PCR反应体系,评估其特异性、灵敏度、稳定性,在手足口病监测... 详细信息

目的建立柯萨奇A组6型病毒TaqMan探针实时荧光RT-PCR,用于手足口病例快速诊断及监测。方法根据GenBank中柯萨奇A组6型病毒VP1高保守序列设计引物和探针,建立和优化实时荧光RT-PCR反应体系,评估其特异性、灵敏度、稳定性,在手足口病监测中应用,并与商品化试剂比较,抽取部分阳性标本测序验证。结果本研究建立的柯萨奇A组6型病毒实时荧光RT-PCR可在60 min内完成检测,与其它型别的肠道病毒和病原体无交叉反应,灵敏度可达10~0 copies/μL梯度,对两个不同核酸浓度样本Ct值的变异系数分别为0.29%、0.38%。280份非EV71、CA16的标本中检出142份CA6阳性标本,与商品化试剂检测结果一致。随机抽取15份阳性标本产物测序,与CA6靶基因序列同源性99.8%以上。结论建立的柯萨奇A组6型病毒实时荧光RT-PCR方法特异、灵敏、稳定,可用于非EV71、非CA16的其它肠道病毒标本分型。

关键词：手足口病柯萨奇A组6型病毒实时荧光RT-PCR