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基于生物信息学分析纤连蛋白-1与甲状腺乳头状癌的相关性研究

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基于生物信息学分析纤连蛋白-1与甲状腺乳头状癌的相关性研究

作者：谢鋆晖南昌大学

学位级别：硕士

目的:甲状腺乳头状癌(Papillary thyroid carcinoma,PTC)是内分泌系统最常见的恶性肿瘤。虽然大部分PTC恶性程度较低,但仍存在较高的复发率和转移率及年轻化发展的趋势。目前PTC的具体发病机制尚不清楚,本次研究拟根据生物信息学方法分... 详细信息

目的:甲状腺乳头状癌(Papillary thyroid carcinoma,PTC)是内分泌系统最常见的恶性肿瘤。虽然大部分PTC恶性程度较低,但仍存在较高的复发率和转移率及年轻化发展的趋势。目前PTC的具体发病机制尚不清楚,本次研究拟根据生物信息学方法分析PTC的差异表达基因,进一步了解其潜在的分子机制,为探索新的诊断标志物和治疗靶点提供理论依据。方法:1.从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库中搜索PTC及对照组甲状腺组织样本的转录组测序结果,通过多种在线网站及R软件对PTC样本的测序数据进行分析,并筛选出差异表达的基因,通过功能富集分析及蛋白互作分析,寻找潜在的调控分子。2.免疫组化分析核心基因在PTC及正常甲状腺组织中的表达水平。进一步研究核心基因FN1与PTC的无疾病复发生存图及其与自噬基因表达的相关性。3.培养人PTC细胞(乳头状B-CPAP细胞系),分析敲减FN1(甲状腺癌中纤连蛋白-1)基因后对PTC细胞侵袭和迁移影响。4.为进一步实验证明FN1基因与自噬的关系,使用雷帕霉素(Rapa-mycin,RAPA)做为促噬剂,将乳头状B-CPAP细胞系分为四组,分别为NC组,RAPA组,RAPA+si-NC 组和 RAPA+si-FN1 组。采用 RT-qPCR 和 Western Blot 检测这四组的相关自噬蛋白LC3-Ⅰ、LC3-Ⅱ、Beclin1和P62的表达。结果:1.共筛选了 160个差异表达的基因,包括100上调和60下调的基因。GO分析表明这些基因主要富集于肿瘤中细胞外基质、细胞连接组织、突触组织的调节、蛋白激酶活性调节、GTP酶活性调节等信号通路。随后本文筛选出10个关键基因 FN1、SerpinA1、PLAU、APOE、TOP2A、CDH2、BUB1、ASPM、MKI67、APOC1。经过转录组测序数据验证和免疫组化分析,Top10核心基因中有4个为差异表达,分别为FN1、SerpinA1、PLAU、CDH2。2.选取FN1(甲状腺癌中纤连蛋白-1)为代表。利用Logrank统计分析和在线数据库GEPIA2分析FN1与PTC不良预后的影响因素,且其在PTC中负向调控自噬功能。3.敲降FN1后可明显抑制PTC的侵袭和迁移能力。***组自噬相关蛋白LC3-I、LC3-Ⅱ和Beclin1的表达明显高于NC组,而P62表达降低(P0.05)。RAPA+si-FN1 组的 LC3-Ⅰ、LC3-Ⅱ和Beclin1 的表达明显高于RAPA+si-NC组,而P62表达降低(P<0.05)。这表明FN1在PTC中可负向调控自噬基因的表达。结论:FN1基因在人PTC组织中是高度表达,其可通过抑制自噬相关基因和蛋白来抑制PTC细胞的自噬。FN1的表达可以作为PTC的一个重要的预测分子和治疗靶点。

关键词：甲状腺癌甲状腺乳头状癌 FN1 自噬转录组测序

数字科技创新引领物流业绿色低碳转型的机制与路径——基于京东物流的案例研究

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经济与管理研究 2024年第5期45卷 21-40页

作者：汪旭晖谢寻东北财经大学大连116025 东北财经大学工商管理学院

新发展格局下的物流业肩负着实现“双碳”目标的重要使命,必须加快绿色低碳转型。数字科技作为推动第四次工业革命的核心力量之一,将推动全球产业链供应链加速重构,世界经济、产业竞争格局加快重塑。通过创新研发和应用数字科技,能有效... 详细信息

新发展格局下的物流业肩负着实现“双碳”目标的重要使命,必须加快绿色低碳转型。数字科技作为推动第四次工业革命的核心力量之一,将推动全球产业链供应链加速重构,世界经济、产业竞争格局加快重塑。通过创新研发和应用数字科技,能有效提升物流企业绿色技术的投入水平,推进绿色创新,进而引领物流业绿色低碳转型。本文应用扎根理论开展案例研究,结合京东物流绿色低碳转型实践,探讨数字科技创新引领物流业绿色低碳转型的作用机制和实现路径。研究结果表明,物流业绿色低碳转型受到企业内部发展压力和外部环境压力的交互影响;围绕基础研究创新、核心技术创新和服务体系创新三个维度,数字科技创新能够聚集要素、整合资源、形成区域产业集聚,通过规模效应和溢出效应助力物流业绿色发展。对应作用机制,数字科技创新引领物流业绿色低碳转型有三条主要路径,分别是能力提升路径、技术升级路径、产业联合发展路径。本文提出的数字科技创新引领物流业绿色低碳转型理论模型揭示了数字科技创新引领物流业绿色低碳转型的逻辑过程,为物流业绿色发展提供了重要的管理启示。

关键词：数字科技创新绿色低碳转型物流业 “双碳”目标扎根理论京东物流

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扁桃体原发神经内分泌癌1例

临床耳鼻咽喉头颈外科杂志 2018年第17期32卷 1354-1356页

作者：曾汶田克强潘宜云罗克勍谢鋆晖张相民赣州市肿瘤医院头颈外科江西赣州341000

1病例报告患者,男,60岁,2017年3月初无明显诱因发现右颈部肿物,约＂板栗＂大小,无耳鸣、鼻塞、鼻出血、流涕、声嘶等不适,当时未予重视,2017年4月初肿物增大,伴咳嗽、咳痰及吞咽不适,于当地医院就诊,予抗感染等对症治疗,疗效不佳,肿物... 详细信息

1病例报告患者,男,60岁,2017年3月初无明显诱因发现右颈部肿物,约＂板栗＂大小,无耳鸣、鼻塞、鼻出血、流涕、声嘶等不适,当时未予重视,2017年4月初肿物增大,伴咳嗽、咳痰及吞咽不适,于当地医院就诊,予抗感染等对症治疗,疗效不佳,肿物呈进行性增大,于2017年7月入我院。

关键词：神经内分泌癌小细胞癌扁桃体免疫组织化学

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基于残差网络模型的速溶全脂奶粉分散性与堆积密度检测方法

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食品科学 2024年第10期45卷 9-18页

作者：丁浩晗沈嵩谢祯奇崔晓晖王震宇江南大学未来食品科学中心江苏无锡214122 江南大学人工智能与计算机学院江苏无锡214122 武汉大学国家网络安全学院湖北武汉430072 嘉兴未来食品研究院浙江嘉兴314005

针对传统的奶粉品质国际标准检测方法中存在的主观性和滞后性等问题,本研究提出了一种基于残差网络(residual network,ResNet)的奶粉分散性和堆积密度的快速分类检测方法。在本研究中,使用的数据集包括499张在10倍光学显微镜下拍摄的速... 详细信息

针对传统的奶粉品质国际标准检测方法中存在的主观性和滞后性等问题,本研究提出了一种基于残差网络(residual network,ResNet)的奶粉分散性和堆积密度的快速分类检测方法。在本研究中,使用的数据集包括499张在10倍光学显微镜下拍摄的速溶全脂奶粉颗粒微观分布图像,这些图像来自10个不同的样本组。首先,按照国际标准方法检测这10组样本的分散性和堆积密度,进而基于测试结果划分不同的分散性和堆积密度级别。随后,利用这些微观图像对ResNet模型进行训练,以实现对不同样本的有效分类。最终,通过分类结果预测速溶全脂奶粉的分散性、松散密度和振实密度。此外,本研究还对比了ResNet、EfficientNetV2和SwinTransformer等不同深度学习模型的预测效果。结果表明,基于ResNet152的深度学习模型在预测速溶全脂奶粉的分散性、松散密度和振实密度方面表现最佳,其在测试集上的准确率分别达到97.50%、98.75%和95.00%。这些深度学习模型在奶粉品质检测中的出色性能不仅证明了该方法能够实时、准确地预测奶粉的分散性和堆积密度,同时也为奶粉品质的在线检测提供了新的技术途径。

关键词：速溶全脂奶粉分散性堆积密度深度学习残差网络

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甲状腺乳头状癌相关基因的生物信息学分析

赣南医学院学报 2021年第7期41卷 653-659页

作者：谢鋆晖余济春南昌大学第二附属医院江西南昌330000 赣州市肿瘤医院头颈科江西赣州341000

目的:通过对基因表达综合数据库(Gene expression omnibus,GEO)中甲状腺乳头状癌(Papillary thyroid carcinoma,PTC)样本的测序数据进行生物信息学分析,筛选出PTC新的潜在调控分子靶标,促进PTC的机制研究。方法:从GEO中搜索PTC及正常甲... 详细信息

目的:通过对基因表达综合数据库(Gene expression omnibus,GEO)中甲状腺乳头状癌(Papillary thyroid carcinoma,PTC)样本的测序数据进行生物信息学分析,筛选出PTC新的潜在调控分子靶标,促进PTC的机制研究。方法:从GEO中搜索PTC及正常甲状腺组织样本的转录组测序数据,通过多种在线网站及R软件筛选出差异表达基因,进行功能富集分析及蛋白相互作用关系分析,寻找可能影响PTC发生发展的潜在核心基因。结果:共筛选出100个差异上调和60个差异下调基因,功能富集分析结果显示差异基因主要富集在蛋白质细胞外基质、钙离子结合、基底膜、细胞表面、胶原蛋白结合、肝素结合、兴奋性突触、细胞粘附等功能中。构建蛋白互作网络图提示FN1、SerpinA1、PLAU、APOE、TOP2A、CDH2、BUB1、ASPM、MKI67、APOC1等为互作网络的核心基因。经过肿瘤基因组图谱(The cancer genome atlas,TGCA)数据及人蛋白质数据分析,Top10核心基因中有3个为显著差异表达基因,即FN1、SerpinA1和CDH2。结论:甲状腺乳头状癌患者与健康人群的甲状腺组织的整体基因表达存在明显差异,差异基因FN1、SerpinA1、CDH2有望作为PTC机制研究、诊断的可靠分子标记物。

关键词：甲状腺乳头状癌转录组测序差异表达

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磁过滤电弧离子镀TiN与N离子注入性能研究

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表面技术 2024年第14期53卷 139-145页

作者：付天佐赵红田振刚李晓其谢宛鋆中核四〇四科学技术研究院兰州732850 中核四〇四有限公司兰州732850

目的研究磁过滤电弧离子镀TiN与N离子注入对金属基体的保护效果。方法采用磁过滤电弧离子镀和离子注入在不锈钢表面分别制备了TiN薄膜与N注入改性层,以及二者的复合膜层。对薄膜的相结构、微观形貌进行了表征,对薄膜进行了极化曲线测试... 详细信息

目的研究磁过滤电弧离子镀TiN与N离子注入对金属基体的保护效果。方法采用磁过滤电弧离子镀和离子注入在不锈钢表面分别制备了TiN薄膜与N注入改性层,以及二者的复合膜层。对薄膜的相结构、微观形貌进行了表征,对薄膜进行了极化曲线测试,同时在半球样品表面制备涂层并进行盐雾测试。结果所制备的TiN涂层为(111)晶面择优取向,离子注N预处理后沉积的TiN薄膜,仍保持(111)面的择优取向;电化学测试结果显示,TiN和N离子注入能够使不锈钢基体自腐蚀电位分别提高0.64、0.25 V,TiN薄膜具有最低的维钝电流密度4.9×10^(-6) A/cm^(2),N离子注入+TiN复合薄膜的维钝电流密度与N离子注入样品接近;盐雾试验结果表明,TiN以及N离子注入+TiN复合薄膜样品能够保证铜半球在12h的中性盐雾试验中无明显腐蚀痕迹。结论N离子注入预处理对MFAIPTiN涂层耐蚀性能的提升效果有限,单一的MFAIP TiN涂层便可应用于复杂形状的工程材料表面镀膜,可以增强其抗腐蚀能力,延长使用寿命。

关键词： TiN 磁过滤电弧离子镀 N离子注入腐蚀防护

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基于ResNet网络模型的速溶全脂奶粉分散性与堆积密度检测方法

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食品科学 2024年

作者：丁浩晗沈嵩谢祯奇崔晓晖王震宇江南大学人工智能与计算机学院武汉大学国家网络安全学院江南大学未来食品科学中心嘉兴未来食品研究院

针对传统的奶粉品质国际标准检测方法中存在的主观性和滞后性等问题，本研究提出了一种基于ResNet（残差神经网络）的奶粉分散性和堆积密度的快速分类检测方法。在本研究中，使用的数据集包括499张在10倍光学显微镜下拍摄的速溶全脂奶... 详细信息

针对传统的奶粉品质国际标准检测方法中存在的主观性和滞后性等问题，本研究提出了一种基于ResNet（残差神经网络）的奶粉分散性和堆积密度的快速分类检测方法。在本研究中，使用的数据集包括499张在10倍光学显微镜下拍摄的速溶全脂奶粉颗粒微观分布图像，这些图像来自10个不同的样本组。首先，按照国际标准方法检测这10组样本的分散性和堆积密度，进而基于测试结果划分不同的分散性和堆积密度级别。随后，利用这些微观图像对ResNet网络进行训练，以实现对不同样本的有效分类。最终，通过分类结果预测出速溶全脂奶粉的分散性、松散密度和振实密度。此外，本研究还对比了ResNet、EfficientNet V2和Swin Transformer等不同深度学习模型的预测效果。结果表明，基于ResNet 152的深度学习模型在预测速溶全脂奶粉的分散性、松散密度和振实密度方面表现最佳，其在测试集上的准确率分别达到97.50%、98.75%和95.00%。这些深度学习模型在奶粉品质检测中的出色性能不仅证明了该方法能够实时、准确的预测奶粉的分散性和堆积密度，同时也为奶粉品质的在线检测提供了新的技术途径。

关键词：速溶全脂奶粉分散性堆积密度深度学习 ResNet

使用传声器阵列的涡旋声束旋转多普勒分析及其解复用

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声学学报 2024年

作者：刘联鋆褚志刚重庆大学机械与运载工程院

为了解决现有单旋转传声器解复用方法存在的低频响应不足和串扰问题，提出基于圆形传声器阵列的涡旋声束旋转多普勒分析和解复用方法。采用圆形传声器阵列提取旋转观察者接收的声压时域信号，并获得该声信号的旋转多普勒频移特性，然后... 详细信息

为了解决现有单旋转传声器解复用方法存在的低频响应不足和串扰问题，提出基于圆形传声器阵列的涡旋声束旋转多普勒分析和解复用方法。采用圆形传声器阵列提取旋转观察者接收的声压时域信号，并获得该声信号的旋转多普勒频移特性，然后分别根据某转速下单频谱和一定转速范围内多频谱的特性实现对涡旋声束的解复用。结果表明，单频谱解复用方法存在由极限多普勒效应和频移相同导致的解复用失效问题，而基于多频谱平均值的涡旋声束解复用方法可有效地解决低频响应不足和串扰等问题。

关键词：涡旋声束旋转多普勒效应传声器阵列解复用

低共熔溶剂提取绿茶中茶多酚工艺优化及茶多酚提取液的抗氧化活性分析

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江苏农业学报 2024年第07期 1330-1342页

作者：高子文贾智彤王利晖刘羽妍谢子菁刘洋滕杰江西农业大学农学院

低共熔溶剂(Deep eutectic solvents, DES)作为一种绿色环保、高效无毒溶剂而被广泛应用在生物提取和化学制备领域。本研究拟采用DES提取绿茶中多酚类物质，首先合成5种不同类型的DES,进行傅里叶变换红外光谱(FT-IR)与黏度值的物理表征... 详细信息

低共熔溶剂(Deep eutectic solvents, DES)作为一种绿色环保、高效无毒溶剂而被广泛应用在生物提取和化学制备领域。本研究拟采用DES提取绿茶中多酚类物质，首先合成5种不同类型的DES,进行傅里叶变换红外光谱(FT-IR)与黏度值的物理表征，并与以传统水溶液、70%甲醇作为溶剂所得茶多酚提取率进行比较，获得最佳DES类型。然后，通过单因素试验、响应面Box-Behnken设计试验优化用DES提取绿茶中茶多酚的工艺，并对提取前后的绿茶粉进行结构分析。结果显示，在提取过程中，当氯化胆碱与乳酸(DES-2)的含水率为30%、提取温度为75℃、提取时间29 min、料液比为1 g∶35 mL时，茶多酚提取率达25.16%,与模型预测结果相符。扫描电子显微镜(SEM)和X射线衍射(XRD)结果显示，在提取过程中茶粉的晶体结构无明显变化，但DES使茶粉表面形貌发生改变，使褶皱面增多，从而使茶粉与溶剂有更多接触面积，有利于多酚类物质的溶出。此外，将DES提取法与常用的超声波乙醇提取法、微波水提取法、热回流水提取法的结果进行比较发现，DES提取法在茶多酚提取率、部分儿茶素组分提取率上均具有显著优势(P<0.05)。用不同提取方法所得茶多酚提取液进行体外还原能力、1,1-二苯基-2-三硝基苯肼(DPPH)自由基清除活性试验，发现不同方法所得茶多酚提取液均表现出抗氧化活性并且其抗氧化活性呈现剂量依赖关系，以DES法获得的茶多酚提取液的抗氧化性最强，研究结果可为茶多酚提取及开发利用提供理论依据。

关键词：低共熔溶剂茶多酚提取工艺响应面法抗氧化活性