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基于生物信息学构建肝癌免疫预后基因模型及初步验证

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华东师范大学学报(自然科学版) 2024年第4期 100-110页

作者：谢琳玎张远蔡亦红安徽医科大学公共卫生学院卫生检验与检疫学系安徽医科大学动物源性传染病安徽省重点实验室/人畜共患病安徽高校省级重点实验室苏州市吴江区儿童医院检验科

利用癌症基因组图谱(the Cancer Genome Atlas, TCGA)和国际肿瘤基因组协作组(International Cancer Genome Consortium, ICGC)数据库收集肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)患者的RNA测序信息.首先,通过非负矩阵分解(non-negative matrix factorization, NMF)聚类方法和加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis, WGCNA)筛选出参与HCC免疫反应机制的关键基因.利用套索(the least absolute shrinkage and selection operator, LASSO)回归分析构建预后基因模型,并用基因集富集分析(gene set enrichment analysis, GSEA)方法分析生物学功能.随后,对不同风险组患者使用单样本基因集富集分析(single sample genes set enrichment analysis, ssGSEA)评估两组间免疫浸润和相关功能差异.使用“RMS” R软件包结合独立危险因素构建列线图以预测患者的总体生存时间.最后,利用人类蛋白质图谱数据库(Human Protein Atlas, HPA)与实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR, RT-qPCR)进行临床初步验证.总之,本文在风险评分的基础上整合患者临床特征,构建了一个可验证、可重复的列线图,为临床肿瘤患者的精准治疗提供可靠的参考.

关键词：生物信息学加权基因共表达网络分析肝癌免疫相关基因预后模型

基于多源光谱融合的水质BOD5检测技术研究

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基于多源光谱融合的水质BOD5检测技术研究

作者：谢琳重庆理工大学

学位级别：硕士

青少年体内35种抗生素和4种β-受体激动剂的测定及暴露现状分析

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色谱 2024年第2期42卷 185-193页

作者：胡小键李振环谢琳娜付慧朱英中国疾病预防控制中心环境与人群健康重点实验室中国疾病预防控制中心环境与健康相关产品安全所北京100021

为了解我国青少年体内抗生素和β-受体激动剂的暴露水平,本研究采用同位素稀释-高通量全自动固相萃取-超高效液相色谱-串联质谱法测定某中学442名青少年(11~15岁)尿液中的7类共35种抗生素(5种大环内酯类、4种四环素类、10种喹诺酮类、3... 详细信息

为了解我国青少年体内抗生素和β-受体激动剂的暴露水平,本研究采用同位素稀释-高通量全自动固相萃取-超高效液相色谱-串联质谱法测定某中学442名青少年(11~15岁)尿液中的7类共35种抗生素(5种大环内酯类、4种四环素类、10种喹诺酮类、3种β-内酰胺类、11种磺胺类、1种喹噁啉类和1种林可酰胺类)和4种β-受体激动剂的水平。尿样测定结果采用尿肌酐进行校正,所得到的样品检出率用于统计分析。采用皮尔森卡方检验对目标物检出率与性别、年龄和体重等级间的相关性进行分析。在调整了混杂因素后,采用Logistic回归模型来评估目标物检出率与不同组别间的相关性。分析结果发现,442名青少年中有397名青少年的尿液中检出抗生素或β-受体激动剂,总体检出率为89.8%。除喹噁啉类抗生素未被检出外,实验中共有6类27种抗生素和2种β-受体激动剂被检出,检出率为0.2%~59.0%;其中强力霉素、土霉素和阿奇霉素的检出率最高,检出率分别为59.0%、56.1%和34.6%;四环素类和大环内酯类抗生素是主要检出的两类抗生素,检出率分别为81.9%和42.3%;优先作为兽用的抗生素检出率最高(85.1%),其次为人用抗生素(41.0%),β-受体激动剂的总体检出率为2.7%。统计分析发现,四环素类抗生素在男性青少年尿液中的检出率高于女性,男性检出风险是女性的2.17倍。大环内酯类抗生素在不同年龄组间的检出率存在差异,与11岁青少年组相比,12、13岁青少年组的检出风险更高。实验发现,大环内酯类抗生素的检出率与青少年的肥胖程度呈正相关;在调整了年龄和性别因素后,肥胖青少年尿液中大环内酯类抗生素的检出风险是正常体重者的2.35倍。研究结果表明,青少年普遍暴露于低剂量的抗生素,且食物和环境中的抗生素可能是青少年体内抗生素暴露的主要来源,大环内酯类抗生素的暴露可能与青少年的肥胖风险相关。

关键词：超高效液相色谱-串联质谱抗生素 β-受体激动剂青少年尿液暴露分析

新时代绿色低碳发展:实践逻辑、现实挑战与路径探赜

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马克思主义与现实 2024年第3期 110-117页

作者：陈明华谢琳霄山东财经大学经济学院

绿色低碳发展是解决生态环境问题的治本之策。新时代以来,绿色低碳发展呈现出以降碳为战略方向、以减污为基本主线、以扩绿为重要手段、以增长为有力支撑的特征和要义,是贯彻新发展理念、加快发展新质生产力、深化新旧动能转换的重要举... 详细信息

绿色低碳发展是解决生态环境问题的治本之策。新时代以来,绿色低碳发展呈现出以降碳为战略方向、以减污为基本主线、以扩绿为重要手段、以增长为有力支撑的特征和要义,是贯彻新发展理念、加快发展新质生产力、深化新旧动能转换的重要举措。当前在“碳达峰碳中和”目标约束下,能源转型存在复杂性、污染物区域协同治理机制尚不完善、生态产品价值实现面临瓶颈以及关键领域绿色低碳科技创新能力不足等现实问题,仍制约着新时代绿色低碳高质量发展。要在全面建设社会主义现代化国家新征程上继续推进绿色低碳发展,应稳步推进能源结构调整,积极构建清洁低碳能源体系;深入推进环境污染防治,持续加强污染物协同治理机制建设;逐步完善生态产品价值实现机制,不断拓宽生态产品价值实现路径;建立健全绿色低碳技术体系,加快发展新质生产力。

关键词：新时代绿色低碳发展生态文明建设新质生产力

新型神经梅毒诊断标志物UCH-L1、GFAP和NF-L与传统神经梅毒检测指标的诊断效能比较

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中华皮肤科杂志 2024年第3期57卷 224-232页

作者：谢琳陈锐牛建军杨天赐厦门大学附属中山医院临床检验中心厦门361004 厦门大学医学院传染病研究所厦门361004 厦门市临床检验质控中心厦门361004

目的评估泛素羧基末端水解酶L1(UCH-L1)、胶质纤维酸性蛋白(GFAP)和神经丝轻链蛋白(NF-L)作为新型神经梅毒检测指标的诊断效能。方法回顾收集2021年12月至2022年11月于厦门大学附属中山医院就诊的未经治疗的、HIV阴性神经梅毒住院患者5... 详细信息

目的评估泛素羧基末端水解酶L1(UCH-L1)、胶质纤维酸性蛋白(GFAP)和神经丝轻链蛋白(NF-L)作为新型神经梅毒检测指标的诊断效能。方法回顾收集2021年12月至2022年11月于厦门大学附属中山医院就诊的未经治疗的、HIV阴性神经梅毒住院患者51例。使用倾向评分匹配法调整年龄后,纳入同时期未经治疗的、HIV阴性非神经梅毒的梅毒(简称非神经梅毒)住院患者51例。所有纳入的研究对象均同时收集血清和脑脊液(CSF)样本,使用酶联免疫吸附试验检测血清和CSF中UCH-L1、GFAP和NF-L的水平。采用Spearman相关系数分析血清和CSF中3个新型神经梅毒检测指标UCH-L1、GFAP、NF-L与传统神经梅毒检测指标CSF快速血浆反应素环状卡片试验(RPR)、CSF梅毒螺旋体明胶颗粒凝集试验(TPPA)、CSF白细胞计数和CSF总蛋白浓度之间的相关性,采用Hanley&McNeil法比较血清和CSF中UCH-L1、GFAP和NF-L水平与4个传统实验室检测指标诊断神经梅毒的受试者工作特征曲线下面积(AUC),采用配对卡方检验比较神经梅毒检测指标间敏感性和特异性的差异。结果51例神经梅毒患者年龄[M(Q1,Q3)]为56.0(48.0,67.0)岁,男33例,女18例;51例非神经梅毒患者年龄为54.0(44.0,64.0)岁,男30例,女21例。神经梅毒患者血清RPR滴度和阳性比例、CSF RPR和TPPA滴度及阳性比例、CSF白细胞计数和升高比例、CSF总蛋白浓度和升高比例均显著高于非神经梅毒患者(均P0.05)。血清UCH-L1水平的AUC值(0.966)显著高于CSF RPR滴度、CSF TPPA滴度、CSF白细胞计数和CSF总蛋白浓度(AUC=0.745、0.894、0.845、0.765,均P0.05),血清NF-L水平的AUC值(0.903)显著高于CSF RPR滴度和CSF总蛋白浓度(均P0.05)。CSF UCH-L1的AUC值(0.958)显著高于CSF RPR滴度、CSF白细胞数和CSF总蛋白浓度(均P0.05);CSF NF-L的AUC值(0.828)与4种传统实验室检测指标的AUC值差异均无统计学意义(均P>0.05)。血清UCH-L1的诊断敏感性显著高于CSF RPR滴度、CSF白细胞计数和CSF总蛋白浓度(均P<0.05),血清UCH-L1的特异性显著高于CSF TPPA滴度(P=0.031),血清GFAP和NF-L的诊断敏感性均显著高于CSF RPR滴度和CSF总蛋白浓度(均P<0.05);CSF UCH-L1的诊断敏感性显著高于CSF RPR滴度、CSF白细胞计数和CSF总蛋白浓度(均P<0.05),其特异性显著高于CSF TPPA滴度(P=0.049),CSF GFAP的诊断敏感性显著高于CSF RPR滴度、CSF白细胞计数和CSF总蛋白浓度(均P<0.05),CSF NF-L的诊断敏感性显著高于CSF RPR滴度(P<0.001)。结论血清和CSF UCH-L1、GFAP和NF-L标志物均具有比传统实验室检测指标更好的神经梅毒诊断效能,具有潜在应用价值。

关键词：神经梅毒泛素羧基末端水解酶L1 胶质纤维酸性蛋白神经丝轻链蛋白诊断标志物诊断效能

热处理时间对电子束制造Ti6Al4V合金腐蚀性能的影响

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稀有金属材料与工程 2024年第2期53卷 357-364页

作者：黄俊媛张伟北京航空航天大学机械工程及自动化学院北京100191

通过1、3、5、7和9 h的热处理加工电子束制备的Ti6Al4V样品,进行Tafel和电化学阻抗谱实验,讨论样品电化学腐蚀行为及机理。通过分析腐蚀性能的变化机理,发现晶向越多,小角度晶界占比越大,晶粒直径越大,耐腐蚀性能越好。热处理5 h的样品... 详细信息

通过1、3、5、7和9 h的热处理加工电子束制备的Ti6Al4V样品,进行Tafel和电化学阻抗谱实验,讨论样品电化学腐蚀行为及机理。通过分析腐蚀性能的变化机理,发现晶向越多,小角度晶界占比越大,晶粒直径越大,耐腐蚀性能越好。热处理5 h的样品呈现最均匀的晶向,小角度晶界占比最大为56.2%,晶粒截距5.252μm,此时耐腐蚀性能最好,腐蚀电流为0.037μA/cm^(2)。

关键词： Ti6Al4V 电子束选区熔化耐腐蚀性能晶相晶体结构

梳理、阐释、探究:整本书阅读的进阶路径——以《儒林外史》为例

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当代学生 2024年第10期 4-9页

作者：谢琳上海市浦东教育发展研究院

整本书阅读对于提高我们的阅读速度、积累阅读经验、扩大阅读面、提升语文素养等有着至关重要的作用。本期“读写聚焦”继续为大家奉上“整本书阅读导读”的内容,“梳理、阐释、探究:整本书阅读的进阶路径——以《儒林外史》为例”。让... 详细信息

整本书阅读对于提高我们的阅读速度、积累阅读经验、扩大阅读面、提升语文素养等有着至关重要的作用。本期“读写聚焦”继续为大家奉上“整本书阅读导读”的内容,“梳理、阐释、探究:整本书阅读的进阶路径——以《儒林外史》为例”。让我们跟随谢琳老师的指导,一同学习如何走进这部深入剖析古代社会知识分子生活的文学经典。

关键词：整本书阅读《儒林外史》文学经典进阶路径提升语文素养阅读速度积累阅读扩大阅读面

球壳散射影响下的倾斜小尺度矢量阵三维波束形成

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声学学报 2024年第3期49卷 513-532页

作者：韩明潜郭俊媛哈尔滨工程大学水声技术全国重点实验室哈尔滨150001 工业和信息化部海洋信息获取与安全工信部重点实验室(哈尔滨工程大学) 哈尔滨150001 哈尔滨工程大学水声工程学院哈尔滨150001

在阵体倾斜、球壳散射引起的方位依赖幅相误差和固定幅相误差同时存在的情况下,建立了一种基于小尺度矢量平面阵的三维波束形成方法。首先使用球谐波函数展开统一了矢量阵各通道接收数据的表达式,再利用多个辅助声源求解出球谐波函数展... 详细信息

在阵体倾斜、球壳散射引起的方位依赖幅相误差和固定幅相误差同时存在的情况下,建立了一种基于小尺度矢量平面阵的三维波束形成方法。首先使用球谐波函数展开统一了矢量阵各通道接收数据的表达式,再利用多个辅助声源求解出球谐波函数展开系数,通过联立阵列波束输出与理想波束响应表达式,最终实现了三维波束形成并利用波束扫描实现了目标方位估计。理论和仿真结果验证了算法的可行性,该算法基于矢量阵实现,阵型相同时相比声压阵具有更高的稳健性,且辅助声源布放越分散,算法稳健性越高。

关键词：球壳散射方位估计波束形成倾斜阵

基于改进GAN的手绘特征草图虚拟地形生成方法

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遥感学报 2024年第5期28卷 1232-1241页

作者：张晓媛陈斌北京大学地球与空间科学学院北京100871

三维虚拟地形生成目前广泛应用于野外虚拟地理环境、数字孪生城市建设等,是实现地理元宇宙发展的重要组成部分。传统生成三维虚拟地形的方法存在生成地形真实度不够、重复地形块与网格伪影等问题。基于此,提出一种改进生成对抗网络的手... 详细信息

三维虚拟地形生成目前广泛应用于野外虚拟地理环境、数字孪生城市建设等,是实现地理元宇宙发展的重要组成部分。传统生成三维虚拟地形的方法存在生成地形真实度不够、重复地形块与网格伪影等问题。基于此,提出一种改进生成对抗网络的手绘特征草图虚拟地形生成方法。以条件生成对抗网络和pix2pix架构为参考,提出虚拟地形生成网络模型,通过改进生成器U-Net网络,增加随机噪声,替换损失函数,提高模型训练的效率及生成地形的真实性。同时,利用精度较高的黄土高原部分地区数字高程模型数据为样本,构建用于虚拟地形生成模型的地形特征数据集,提取真实地形特征开展虚拟地形生成网络训练。最后,完整构建从手绘特征草图到虚拟地形的模型推理流程。实验结果表明,利用黄土高原地形数据和改进后的虚拟地形生成模型,能够满足用户在输入手绘地形特征草图后获得符合地形特征描述、高真实感的虚拟地形,在三维地形建模与编辑方面具有良好的发展前景。

关键词：遥感三维虚拟地形生成对抗网络手绘特征草图数字高程模型