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单细胞转录组测序和肿瘤精准医疗

中国肿瘤生物治疗杂志 2021年第11期28卷 1053-1060页

作者：杨梅唐乐怡訾晓渊中国药科大学江苏南京210009 新格元生物科技有限公司江苏南京210044

单细胞测序技术是指以单个细胞为单位,通过高通量测序技术全方位分析单个细胞内的遗传信息,其已成为现代生物学深度研究的一种强有力工具,使生物医药领域研究和临床应用转化研究达到了传统测序方法难以实现的极高精确度和灵敏度。目前,... 详细信息

单细胞测序技术是指以单个细胞为单位,通过高通量测序技术全方位分析单个细胞内的遗传信息,其已成为现代生物学深度研究的一种强有力工具,使生物医药领域研究和临床应用转化研究达到了传统测序方法难以实现的极高精确度和灵敏度。目前,单细胞转录组测序(又称“单细胞RNA测序”,scRNA-seq)已成为最广泛应用的单细胞测序技术。简要介绍scRNA-seq技术的发展历程、技术原理和方法,系统阐述其应用在肿瘤异质性、肿瘤转移、肿瘤免疫、肿瘤耐药等基础领域的研究成果及其在肿瘤精准医疗的临床转化与应用中的研究进展,单细胞测序技术的发展和应用必将推动肿瘤精准医疗迈向更高水平。

关键词：单细胞转录组测序精准医疗肿瘤异质性肿瘤微环境肿瘤免疫肿瘤耐药

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肝星形细胞具有干细胞样特性

解剖学杂志 2012年第2期35卷 242-244页

作者：是长峰郭栋訾晓渊胡以平解放军102医院普外科常州213003 解放军71332部队卫生队三门峡472400 第二军医大学细胞生物学教研室上海200433

肝星形细胞（hepatic stellate cells，HSC），又称Ito细胞、维生素A储存细胞、脂细胞（1ipocyte）、窦周细胞（perisinusoidalcell）等，在肝纤维化的发生发展过程中处于中心地位。作为肝的一种间质细胞，HSC同时兼有成纤维细胞、脂肪... 详细信息

肝星形细胞（hepatic stellate cells，HSC），又称Ito细胞、维生素A储存细胞、脂细胞（1ipocyte）、窦周细胞（perisinusoidalcell）等，在肝纤维化的发生发展过程中处于中心地位。作为肝的一种间质细胞，HSC同时兼有成纤维细胞、脂肪细胞和肌细胞的特征，能产生多种细胞外基质（extracellular matrix，ECM）组分。既往研究过于重视HSC在肝纤维化形成中的生物学效应，忽略了其他方面的特征。近来很多研究显示HSC与干细胞（stemcells，SC）在多个方面有着惊人的相似。于是干细胞与HSC的关系以及肝纤维化形成中的干细胞机制开始受到人们的关注，现就近年国内外的相关研究进展做以下综述。

关键词：肝星形细胞细胞样肝纤维化形成 matrix cells Ito细胞成纤维细胞细胞外基质

CRISPR-Cas基因编辑技术在泌尿系统肿瘤研究中的应用

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中国肿瘤生物治疗杂志 2018年第1期25卷 9-16页

作者：杨悦訾晓渊孙颖浩第二军医大学附属长海医院泌尿外科上海200433

基于成簇规律间隔短回文重复系统(clustered regularly interspaced short palindromic repeat-clustered regularly interspaced short palindromic repeats associated system,CRISPR-Cas)的基因编辑技术是一种新兴的基因编辑技术,它能精准完成外源DNA的识别与编辑,为基因工程提供了革命性的分子工具。CRIPSR-Cas基因编辑技术具有操作简便、易于设计等特点,将其运用于泌尿系统肿瘤研究中,可为泌尿系肿瘤相关基因的功能学研究提供新方法,进而更好地服务临床诊疗。本文将对CRISPRCas基因编辑技术分子结构与工作原理、在泌尿系肿瘤研究中的应用现状、最新进展及存在的问题进行综述。

关键词：成簇规律间隔短回文重复序列系统泌尿系统肿瘤基因编辑

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环状RNA研究进展及临床应用

第二军医大学学报 2016年第3期37卷 330-335页

作者：孔德沛訾晓渊孙颖浩第二军医大学长海医院泌尿外科上海200433

环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类产生于RNA剪切过程的封闭环形RNA分子,主要由外显子和(或)内含子构成,广泛存在于真核细胞内,具有稳定性、物种保守性以及细胞、组织特异性。环状RNA参与细胞内RNA调控网络,与疾病的发生和发展密切相... 详细信息

环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类产生于RNA剪切过程的封闭环形RNA分子,主要由外显子和(或)内含子构成,广泛存在于真核细胞内,具有稳定性、物种保守性以及细胞、组织特异性。环状RNA参与细胞内RNA调控网络,与疾病的发生和发展密切相关,可能成为新型的生物标记物及治疗靶点。近年来,关于环状RNA产生、调控、生物学特性、功能及其与疾病的关系等均取得了较大的研究进展。本文综述了真核细胞内源性环状RNA的研究进展及其与疾病的关联。

关键词：环状RNA 生成特性疾病生物学标记

乙肝全基因组转基因小鼠肝组织病理及部分免疫学特征

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武汉大学学报（医学版） 2012年第4期33卷 462-465,502页

作者：胡新根訾晓渊张红霞胡以平第二军医大学基础医学部细胞生物学教研室上海200433

目的:研究C57-TgN(HBVadr2.0)SMMU"3号"品系乙型肝炎转基因小鼠肝脏的组织病理学及部分免疫学特征。方法:通过对130例SPF级乙型肝炎转基因小鼠和30例同龄正常C57BL/6小鼠肝组织进行免疫组织化学染色、HE染色和浸银染色分析,研究转基因小... 详细信息

目的:研究C57-TgN(HBVadr2.0)SMMU"3号"品系乙型肝炎转基因小鼠肝脏的组织病理学及部分免疫学特征。方法:通过对130例SPF级乙型肝炎转基因小鼠和30例同龄正常C57BL/6小鼠肝组织进行免疫组织化学染色、HE染色和浸银染色分析,研究转基因小鼠HBsAg的表达以及病理改变情况。选取15例肝组织有单个核细胞浸润的转基因小鼠检测白细胞分化抗原的表达情况。结果:60.77%(79/130)的转基因小鼠肝脏组织中出现了不同程度的肝组织病理性改变,包括肝细胞变性、单个核细胞浸润和纤维组织增生,且与月龄正相关,而与性别、病毒蛋白的表达无相关性。选取出现单个核细胞浸润的肝组织进行免疫组织化学检测发现,肝组织中浸润的单个核细胞大多为CD3+、CD4+T细胞。结论:C57-TgN(HBVadr2.0)SMMU"3号"品系乙肝全基因组转基因小鼠肝脏产生类似慢性无症状HBV携带者的病理学变化,病理改变与病毒蛋白表达无相关性,与小鼠月龄呈正相关性。

关键词：乙型肝炎病毒转基因小鼠病理学免疫组织化学

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缺氧诱导因子在肿瘤中的作用研究进展

中国肿瘤生物治疗杂志 2017年第1期24卷 97-102页

作者：张春雷訾晓渊孙颖浩第二军医大学长海医院泌尿外科上海200433

维持适当的氧含量对机体的生存至关重要,但是在许多病理情况下,细胞和组织器官经常会处于一种缺氧的状态,此时细胞需要通过缺氧诱导因子(hypoxia-inducible factors,HIF)途径来适应缺氧的环境。肿瘤细胞的过度生长会限制肿瘤内的氧气弥... 详细信息

维持适当的氧含量对机体的生存至关重要,但是在许多病理情况下,细胞和组织器官经常会处于一种缺氧的状态,此时细胞需要通过缺氧诱导因子(hypoxia-inducible factors,HIF)途径来适应缺氧的环境。肿瘤细胞的过度生长会限制肿瘤内的氧气弥散,导致肿瘤内血液供应不足,产生缺氧的微环境,进而促进HIF的表达。HIF具有广泛的下游基因,与多种信号通路有关,参与肿瘤血管的形成、维持肿瘤干细胞的稳定、促进肿瘤转移,并与肿瘤的预后相关,在肿瘤的发生发展中起到至关重要的作用,有望为肿瘤的精准治疗提供新的靶点和思路。

关键词：缺氧诱导因子肿瘤肿瘤干细胞肿瘤转移

干扰素诱导Mx-Cre转基因小鼠表达的重组酶活性的体外检测

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Acta Genetica Sinica 2001年第9期28卷 822-826,T001页

作者：訾晓渊姚玉成熊俊李建秀颜永碧余宏余胡以平第二军医大学细胞生物学教研室上海200433 第二军医大学长征医院病理科上海200433

利用ＰＣＲ、Ｗｅｓｔｅｒｎｂｌｏｔ、免疫组化、免疫金标电镜、Ｓｏｕｔｈｅｒｎｂｌｏｔ从ＤＮＡ水平、蛋白水平分析干扰素诱导后Ｍｘ－Ｃｒｅ转基因小鼠肝组织中Ｃｒｅ重组酶的表达及其表达产物的活性。在对Ｍｘ－ｃｒｅ转基因小... 详细信息

利用ＰＣＲ、Ｗｅｓｔｅｒｎｂｌｏｔ、免疫组化、免疫金标电镜、Ｓｏｕｔｈｅｒｎｂｌｏｔ从ＤＮＡ水平、蛋白水平分析干扰素诱导后Ｍｘ－Ｃｒｅ转基因小鼠肝组织中Ｃｒｅ重组酶的表达及其表达产物的活性。在对Ｍｘ－ｃｒｅ转基因小鼠基因组中整合有ｃｒｅ基因进行确定后，通过干扰素诱导Ｍｘ－ｃｒｅ转基因小鼠表达Ｃｒｅ重组酶，结果表明转基因小鼠肝细胞核和细胞质中均有Ｃｒｅ重组酶的表达，并在超微水平进一步证实。将含表达的Ｃｒｅ重组酶的肝细胞核抽提液加入到带有ｌｏｘＰ位点的ＤＮＡ中进行重组，分析证明Ｍｘ－Ｃｒｅ转基因小鼠表达的Ｃｒｅ重组酶具有重组活性，从而建立了体外检测Ｍｘ－Ｃｒｅ转基因小鼠表达的Ｃｒｅ重组酶活性的方法。

关键词：位点特异性重组重组酶转基因小鼠体外检测

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IL-1和肿瘤转移

中国肿瘤生物治疗杂志 1998年第1期5卷 72-74页

作者：訾晓渊第二军医大学生物教研室上海200433

IL-l在不同的细胞中有多种不同的生物学作用,在肿瘤转移中.IL-l通过促进内皮细胞表达与粘附有关的因子如细胞间粘附分子1(ICAM-1)、E-选择素、血小板激活因子(PAF)、整合蛋白VLA-4、甘露糖受体等特异性受体的表达,促进肿瘤细胞与内皮细... 详细信息

IL-l在不同的细胞中有多种不同的生物学作用,在肿瘤转移中.IL-l通过促进内皮细胞表达与粘附有关的因子如细胞间粘附分子1(ICAM-1)、E-选择素、血小板激活因子(PAF)、整合蛋白VLA-4、甘露糖受体等特异性受体的表达,促进肿瘤细胞与内皮细胞粘附,从而促进肿瘤转移;同时IL-1通过调节肿瘤生长,影响瘤细胞在继发部位的滞留和最初从血管移出而促进肿瘤转移,IL-1受体拮拉剂(IL-1ra)通过拮抗IL-1,抑制瘤细胞与内皮细胞的粘附而抑制IL-1引起的肿瘤转移.当IL-1与IL-1ra失衡时可促使肿瘤转移.

关键词：肿瘤转移拮抗剂白细胞介素1 IL-1ra

《细胞骨架》讲课评比授课内容:细胞骨架-概述

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