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白鲢与团头鲂遗传连锁图谱的构建

白鲢与团头鲂遗传连锁图谱的构建

作者：葛芹玉南京农业大学

学位级别：硕士

构建遗传图谱是当前生物学研究领域的一个热点，本研究利用单配子PCR分型和RAPD标记技术，通过直接检测杂交后代胚胎基因型的分布，获得各基因位点的遗传连锁信息，从而快速、简便地构建鱼类遗传图谱。为大规模开展鱼类遗传图谱构建、... 详细信息

构建遗传图谱是当前生物学研究领域的一个热点，本研究利用单配子PCR分型和RAPD标记技术，通过直接检测杂交后代胚胎基因型的分布，获得各基因位点的遗传连锁信息，从而快速、简便地构建鱼类遗传图谱。为大规模开展鱼类遗传图谱构建、基因定位、控制鱼类重要经济性状基因的寻找和克隆打下基础。白鲢和团头鲂在我国水产养殖业中均占有重要的地位，本文利用远缘杂交法建立的作图群体结合RAPD分子标记，构建了白鲢和团头鲂的遗传连锁框架图。实验过程中对100个随机寡核苷酸引物进行了筛选，共选出了23个引物用于作图群体(包括双亲共52个个体)的随机扩增，这23个随机引物共产生65个RAPD标记(多态性位点)，其中除了3个标记显著的偏离了孟德尔遗传规律外，其余的标记均符合“拟测交”1：1的分离和双亲中都为杂合位点的3：1分离。利用多点连锁分析，白鲢共形成5个连锁群，由25个标记组成，总图距为538.1cM，覆盖了白鲢基因组的61.7％，标记间平均距离为19.36cM，团头鲂共获得6个连锁群，由21个标记组成，总图距为438.8cM，覆盖了团头鲂基因组的44.5％，标记间平均距离为17.25cM。本研究获得了一个中等密度的白鲢和团头鲂的遗传连锁框架，它能与本实验室利用同一群体构建的遗传图谱相整合，为进一步构建高密度的白鲢与团头鲂的遗传图谱开辟了道路。为白鲢和团头鲂染色体上重要经济性状相关基因的定位提供了框架结构，为它们的分子标记辅助选择奠定了基础。同时也为其它鱼类遗传图谱的构建提供了理论和实践基础。

关键词：白鲢团头鲂远缘杂交遗传连锁图谱随机扩增多态性DNA(RAPD)

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微生态制剂与水产养殖

中国饲料 2001年第18期 27-27,29页

作者：葛芹玉中国水产科学院

随着我国水产养殖业的发展,养殖品种和规模日益扩大,与此同时生产中的病害问题也越来越严重.在防治病害中,大量使用抗生素取得了一定的效果,但也日益显露出其弊端.如耐药性的产生等使鱼消化道内有益菌群失衡,从而使鱼病的防治日益困难,... 详细信息

随着我国水产养殖业的发展,养殖品种和规模日益扩大,与此同时生产中的病害问题也越来越严重.在防治病害中,大量使用抗生素取得了一定的效果,但也日益显露出其弊端.如耐药性的产生等使鱼消化道内有益菌群失衡,从而使鱼病的防治日益困难,生态环境也受到了严重破坏.

关键词：微生态制剂水产养殖养鱼

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影响脉络膜厚度的因素（英文）

国际眼科杂志 2019年第12期19卷 2001-2006页

作者：周莹葛芹玉贾二腾中国江苏省南京市东南大学生物科学与医学工程学院

本文详细描述了脉络膜厚度的影响因素,眼科疾病中脉络膜厚度的变化以及血流与脉络膜厚度之间的关系。脉络膜厚度受许多因素影响,例如年龄,性别,眼压,屈光不正,轴长,收缩压,每日节律,身体位置,吸烟史等,脉络膜厚度异常与许多眼科疾病也... 详细信息

本文详细描述了脉络膜厚度的影响因素,眼科疾病中脉络膜厚度的变化以及血流与脉络膜厚度之间的关系。脉络膜厚度受许多因素影响,例如年龄,性别,眼压,屈光不正,轴长,收缩压,每日节律,身体位置,吸烟史等,脉络膜厚度异常与许多眼科疾病也显著相关。脉络膜厚度在眼科疾病的诊断和治疗中非常重要。

关键词：脉络膜厚度血流光学相干断层扫描血管造影

多巴胺受体基因DRD4与家庭亲密度或矛盾性对大学生亲社会倾向的交互作用

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科学通报 2020年第19期65卷 2032-2046页

作者：王云强顾伟伟邱逸鹭王志琳郭本禹葛芹玉南京师范大学道德教育研究所心理学院南京210097 南京医科大学马克思主义学院南京211166 东南大学生物科学与医学工程学院南京210009

多巴胺D4受体基因(DRD4)与人类社会行为之间存在密切关联.已有研究较多关注DRD4-7R而忽视亚洲人群出现频率最高的DRD4-4R.DRD4基因多态性与家庭亲密度或矛盾性对亲社会倾向是否具有交互作用、是否存在性别差异等问题尚未有定论.本研究... 详细信息

多巴胺D4受体基因(DRD4)与人类社会行为之间存在密切关联.已有研究较多关注DRD4-7R而忽视亚洲人群出现频率最高的DRD4-4R.DRD4基因多态性与家庭亲密度或矛盾性对亲社会倾向是否具有交互作用、是否存在性别差异等问题尚未有定论.本研究以中国大学生为被试,探究DRD4基因多态性与家庭亲密度或矛盾性对大学生亲社会倾向的交互作用,并采用显著性区域法和再参数化回归模型分析该交互作用是否符合差别易感性模型.结果发现,(1)DRD4-2R(7R)基因型与矛盾性对男性大学生利他的亲社会倾向、非DRD4-4R基因型与亲密度对男性大学生匿名的亲社会倾向、非DRD4-4R基因型与矛盾性对男性大学生利他的亲社会倾向、DRD4-3R(5R/6R)基因型与亲密度对男性大学生匿名的亲社会倾向具有显著的交互作用.即对男性大学生而言,与非携带者相比,家庭亲密度或矛盾性更能显著预测DRD4-2R(7R)、非DRD4-4R以及DRD4-3R(5R/6R)基因型携带者的亲社会倾向.(2)显著性区域法(Ros)和再参数化回归模型分析均表明,上述4个交互作用均符合差别易感性模型.

关键词：多巴胺受体基因亲密度矛盾性亲社会倾向差别易感性模型

三维聚丙烯酰胺凝胶DNA芯片用于大样本单核苷酸多态分型的方法研究

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中华医学遗传学杂志 2009年第3期26卷 293-297页

作者：程璐肖鹏峰孙蓓丽葛芹玉陆祖宏东南大学生物科学与医学工程学院生物电子学国家重点实验室南京210096 学习科学中心儿童发展与学习科学教育部重点实验室

目的建立三维聚丙烯酰胺凝胶DNA芯片用于大样本单核苷酸多态（single nucleotide polymorphisms，SNP）分型的方法。方法丙烯酰胺基团修饰的PCR产物与丙烯酰胺单体混合后，在丙烯酰胺基团修饰的玻片上点样进行共聚合，建成三维凝胶DNA... 详细信息

目的建立三维聚丙烯酰胺凝胶DNA芯片用于大样本单核苷酸多态（single nucleotide polymorphisms，SNP）分型的方法。方法丙烯酰胺基团修饰的PCR产物与丙烯酰胺单体混合后，在丙烯酰胺基团修饰的玻片上点样进行共聚合，建成三维凝胶DNA阵列；芯片与一对特异探针和一对分别标记了Cy3或Cy5的通用序列标签（Tag1和Tag2）进行杂交；杂交后用施加电场的方法去除非特异吸附和错配，最后通过双色荧光共聚焦扫描进行SNP分型。结果3-D凝胶芯片不但具有很高的固定效率，而且可以提供高效的杂交环境；通用序列标签的使用不需对每个位点都标记荧光，使检测成本大幅降低；外加电场使得单碱基错配容易识别，且能显著降低芯片的信噪比。结论基于3-D凝胶的基因芯片技术用于大样本SNPs分型简单易操作，且高通量、高特异性、低成本，该方法将可以更广泛地应用于不同需求的DNA检测中。

关键词： DNA芯片单核苷酸多态丙烯酰胺修饰的核酸 OLR1基因

用于管盖基因芯片荧光图像信息的采集及数据分析系统

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科学通报 2006年第3期51卷 272-277页

作者：刘全俊周庆白云飞葛芹玉陆祖宏东南大学生物电子学国家重点实验室南京210096

管盖基因芯片是将基因探针固定在特制的Eppendorf管盖内表面,与内置杂交缓冲液贮液池的Eppendorf管一起构建的基因检测器件.在这个全封闭的系统内,可以完成基因扩增、荧光标记、芯片杂交及检测等一系列生物化学操作,实现多基因高通量并... 详细信息

管盖基因芯片是将基因探针固定在特制的Eppendorf管盖内表面,与内置杂交缓冲液贮液池的Eppendorf管一起构建的基因检测器件.在这个全封闭的系统内,可以完成基因扩增、荧光标记、芯片杂交及检测等一系列生物化学操作,实现多基因高通量并行检测.报道了用于管盖基因芯片的检测分析系统,它包括光学检测平台、图像采集系统、图像分析系统及结果报告系统.光学检测平台利用NIKON显微镜光学系统,通过电荷耦合器件(CCD)进行图像的采集.管盖基因芯片杂交后,经过荧光信号被CCD捕获,经通用串行总线(USB)传递给计算机.图像经过旋转、去噪声点、图像分色、杂交信号计算、结果判定、有效性判定及结果输出.用该系统成功地对呼吸道的10种病毒杂交结果进行了检测.

关键词：管盖基因芯片图像处理检测系统

高选择性和高灵敏度的microRNA检测技术的研究进展

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生物技术通报 2016年第4期32卷 39-47页

作者：陈珍珠李蕊田飞沈彦婷葛芹玉东南大学学习科学研究中心南京210096

micro RNA(mi RNA)是一类内源性的具有调控功能的非编码RNA,在多种细胞过程中起重要的调节作用,如细胞发育、脂肪代谢、器官生成、细胞分化及细胞凋亡等。研究表明,mi RNA的表达水平变化与肿瘤、糖尿病等多种疾病的发生发展密切相关,因... 详细信息

micro RNA(mi RNA)是一类内源性的具有调控功能的非编码RNA,在多种细胞过程中起重要的调节作用,如细胞发育、脂肪代谢、器官生成、细胞分化及细胞凋亡等。研究表明,mi RNA的表达水平变化与肿瘤、糖尿病等多种疾病的发生发展密切相关,因此对于mi RNA表达水平进行准确快速的检测是对其进行深入研究的前提。目前mi RNA的检测分析技术众多,但是对于mi RNA多态性和突变的检测技术还不甚成熟,而且生物样本中微量mi RNA检测技术的灵敏度亦需要进一步的发展与突破。就近年来mi RNA的高选择性和高灵敏度的检测方法进行了综述,旨为相关的检测技术进一步研究提供重要帮助。

关键词： mi RNA 检测方法高选择性高灵敏度基因调控

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抑郁症相关基因甲基化的研究进展

生命的化学 2016年第2期36卷 219-224页

作者：李蕊陈珍珠沈彦婷田飞葛芹玉东南大学学习科学中心南京210096

抑郁症的病因学研究已久,但目前仍无法确切阐述其病理生理学机制。目前抑郁症相关的发病机制主要有炎症反应学说、单胺类神经递质及其受体学说、HPA轴功能失调等学说。近年来随着DNA甲基化的深入研究,发现DNA甲基化与抑郁症的发生、发... 详细信息

抑郁症的病因学研究已久,但目前仍无法确切阐述其病理生理学机制。目前抑郁症相关的发病机制主要有炎症反应学说、单胺类神经递质及其受体学说、HPA轴功能失调等学说。近年来随着DNA甲基化的深入研究,发现DNA甲基化与抑郁症的发生、发展之间存在一定的相关性,一些相关基因的甲基化水平在抑郁症的发病中可能发挥着重要的作用,对抑郁症的诊治具有重要意义。本文就一些抑郁症相关基因DNA甲基化的研究进展进行了综述。

关键词：抑郁症 DNA甲基化研究进展

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基于分子标记的藻类鉴定研究进展

湖泊科学 2021年第6期33卷 1607-1625页

作者：张军毅孙蓓丽朱冰川石浚哲周克茹吕学研葛芹玉张咏陆祖宏张虎军江苏省无锡环境监测中心无锡214121 东南大学无锡分校无锡市生物芯片重点实验室无锡214135 江苏宏众百德生物科技有限公司无锡214028 江苏省环境监测中心南京210019

藻类鉴定被广泛应用于藻类遗传学、生理学、生态学和应用藻类学,尤其是藻类调查和评估.然而,基于形态学的鉴定往往因为分类特征未出现或不典型、设备限制和人员经验欠缺等原因带来较大误差.随着测序技术的不断发展,分子标记已成为藻类... 详细信息

藻类鉴定被广泛应用于藻类遗传学、生理学、生态学和应用藻类学,尤其是藻类调查和评估.然而,基于形态学的鉴定往往因为分类特征未出现或不典型、设备限制和人员经验欠缺等原因带来较大误差.随着测序技术的不断发展,分子标记已成为藻类鉴定的一个通用工具.由于藻类类群众多且差异很大,分子标记的选择成为藻类鉴定的关键.本文综述了蓝藻、硅藻、绿藻、甲藻、裸藻、隐藻、金藻、黄藻、红藻和褐藻等主要门类分子标记的选择及应用进展,包括分子标记选择原则、常用标记和相应序列数据库,以及各个分子标记在不同类群应用中的优缺点等.藻类分子鉴定源于编码核糖体RNA的基因(rDNA),发展于细胞核、线粒体、叶绿体DNA等.然而,当前藻类分子鉴定逐渐细化和完善,单一的核糖体DNA、内转录间隔区(ITS)和保守蛋白编码基因等短序列分子标记已经很难满足藻类鉴定的需求,多标记组合成为一种必然选择.同时,线粒体基因组、叶绿体基因组、核基因组、转录组和宏基因组等提供了更多遗传进化信息,弥补了短序列分子标记在系统分类应用中的不足.对于藻类鉴定,单纯依赖分子标记或形态学都不足以保证鉴定的准确性,采用将分子生物学、形态学、生理生化学等结合的多相学方法,才能准确地完成鉴定工作.此外,藻类分子数据库的建立和完善是未来分子鉴定的重要工作,快速鉴定方法也必将在未来获得广泛的应用和发展.

关键词：藻类鉴定分子标记数据库 SSU LSU ITS COI rbcL