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甘草GuWOX基因家族的鉴定与表达分析

西北植物学报 2022年第3期42卷 398-409页

作者：葛甜甜王楠高静张岗颜永刚沈雨璇陕西中医药大学药学院/陕西省中医药管理局秦药研发重点实验室西安712046 陕西中医药大学陕西中药资源产业化省部共建协同创新中心/秦药特色资源研究与开发国家重点实验室(培育) 陕西咸阳712083

WUSCHEL-related homeobox(WOX)转录因子是植物特有的转录因子,具有调控植物生长发育和非生物胁迫响应的作用。该研究通过生物信息学的方法对GuWOX基因家族进行分析,并利用qRT-PCR方法检测该基因家族在不同组织和非生物胁迫下的表达情况... 详细信息

WUSCHEL-related homeobox(WOX)转录因子是植物特有的转录因子,具有调控植物生长发育和非生物胁迫响应的作用。该研究通过生物信息学的方法对GuWOX基因家族进行分析,并利用qRT-PCR方法检测该基因家族在不同组织和非生物胁迫下的表达情况,利用RT-PCR方法克隆得到4个GuWOX基因。结果显示,(1)GuWOX基因家族共有16个成员,均含有保守的HD,为亲水性不稳定蛋白质;系统进化分析表明,GuWOX基因家族分为3个进化支(远古支、中间支和现代支);启动子序列中包括响应多种逆境和激素的顺式作用元件。(2)qRT-PCR结果显示,在侧根中GuWOX1的表达量最高,在茎中GuWOX15的表达量最高;GuWOX在盐、无磷和GA_(3)处理后不同时间段都有表达;干旱和ABA处理GuWOX15的表达模式相近,且在处理12 h时均上调表达。(3)成功克隆得到GuWOX1、GuWOX5、GuWOX6、GuWOX12基因,其长度分别为557 bp、707 bp、716 bp和578 bp,分别编码184、237、237和191个氨基酸。该研究结果表明,GuWOX基因参与甘草发育、对逆境胁迫的响应以及植物激素调节,为进一步分析GuWOX基因功能奠定了基础。

关键词： WOX转录因子生物信息学实时荧光定量基因克隆

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甘草GuSOD基因家族的鉴定及表达分析

分子植物育种 2022年

作者：葛甜甜王楠高静张岗颜永刚张亚丽谢丰璞李瑞高莹陕西中医药大学药学院陕西省中医药管理局“秦药”研发重点实验室陕西中医药大学陕西中药资源产业化省部共建协同创新中心秦药特色资源研究与开发国家重点实验室(培育)

超氧化物歧化酶(SOD)是抵御氧化损伤的第一道防线，在植物生长发育和各种非生物胁迫反应中起着关键作用。为了进一步研究甘草GuSOD基因家族的特点，本研究通过生物信息学方法对GuSOD基因家族进行鉴定和特征分析，并且利用转录组数据分析... 详细信息

超氧化物歧化酶(SOD)是抵御氧化损伤的第一道防线，在植物生长发育和各种非生物胁迫反应中起着关键作用。为了进一步研究甘草GuSOD基因家族的特点，本研究通过生物信息学方法对GuSOD基因家族进行鉴定和特征分析，并且利用转录组数据分析7个GuSOD基因在盐、低磷和干旱处理下的表达情况。结果显示：GuSOD基因家族共有7个成员，其中有4个Cu/ZnSOD (GuCSD1～GuCSD4)、2个FeSOD (GuFSD1， GuFSD2)和1个GuMSD，并且4个Cu/ZnSOD成员均具有Sod-Fe-Cu结构域，Fe-MnSOD成员具有Sod-Fe-C和Sod-Fe-N结构域。GuSOD基因家族氨基酸数目在129～441 aa之间，蛋白分子量在13.69～49.23 kD之间，等电点分布在5.68～9.23之间。亚细胞定位分析显示所有Cu/ZnSOD成员及GuFSD1位于叶绿体，GuFSD2和GuMSD位于线粒体。GuSOD基因启动子区分布与胁迫响应、激素调节、光响应等相关顺式作用元件。转录组数据分析显示，7个GuSOD基因在盐、低磷和干旱处理下大部分被诱导上调。上述结果显示GuSOD基因家族在逆境胁迫中起调控作用，该研究结果为甘草SOD基因家族的功能验证提供理论基础。

关键词：甘草(Glycyrrhiza uralensis) 超氧化物歧化酶(SOD) 非生物胁迫转录组分析

基于转移概率的Markov跳变系统鲁棒预测控制

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基于转移概率的Markov跳变系统鲁棒预测控制

作者：葛甜甜鲁东大学

学位级别：硕士

Markov跳变系统是一类重要的混杂系统，其动态按离散Markov过程规律随机切换。在工程实际问题中，许多系统由于测量或建模的误差、各种物理条件的限制、外界环境的突变等因素，不确定性参数、约束条件、随机干扰等是不可避免的，因此，... 详细信息

Markov跳变系统是一类重要的混杂系统，其动态按离散Markov过程规律随机切换。在工程实际问题中，许多系统由于测量或建模的误差、各种物理条件的限制、外界环境的突变等因素，不确定性参数、约束条件、随机干扰等是不可避免的，因此，鲁棒性成为控制系统的必然要求。鲁棒预测控制融合了鲁棒控制对不确定性的处理方法和预测控制的滚动优化原理，取二者之长，形成了一类具有良好的鲁棒性、可行性和跟踪性能的控制算法。本文针对Markov跳变系统，运用线性矩阵不等式方法（LMI）、不变集原理、Lyapunov稳定性理论，研究鲁棒预测控制综合问题，提出具有随机稳定性保证的控制器的设计方法。具体内容如下：（1）针对多胞描述的齐次Markov跳变系统，提出一种鲁棒预测控制器的综合算法。采用参数依赖的随机Lyapunov函数设计预测控制器，降低了控制器设计时的保守性。并将求取控制器的优化问题，转化为SDP问题，减少了在线计算量。（2）讨论了一类带有随机干扰的齐次Markov跳变系统的鲁棒预测控制问题。考虑状态概率约束，采用Tube技术，将概率约束转化为递推可行的概率Tubes，基于概率Tubes设计的控制器，保证了闭环系统的随机稳定性。（3）研究了一类多胞不确定非齐次Markov跳变系统的观测器型鲁棒预测控制器的设计方法。基于转移概率矩阵的最大后验估计，得到相应的齐次系统，构造增广随机Lyapunov函数，将二次规划问题转化为正定规划问题，得到LMI形式的优化问题的解，以及控制器存在的充分条件和参数表达式。

关键词： Markov跳变系统鲁棒预测控制随机Lyapunov函数概率Tubes LMI

淋巴瘤患者血浆中miR-21、miR-155、miR-210的表达及临床意义

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淋巴瘤患者血浆中miR-21、miR-155、miR-210的表达及临床意义

作者：葛甜甜天津医科大学

学位级别：硕士

目的：本研究旨在通过检测淋巴瘤患者血浆中miR-21、miR-155、miR-210的表达情况,分析其与淋巴瘤临床特征及实验室指标的相关性,初步探讨该三者miRNA在淋巴瘤诊断、评价疗效及预后方面的作用。方法：研究对象为天津医科大学总医院... 详细信息

目的：本研究旨在通过检测淋巴瘤患者血浆中miR-21、miR-155、miR-210的表达情况,分析其与淋巴瘤临床特征及实验室指标的相关性,初步探讨该三者miRNA在淋巴瘤诊断、评价疗效及预后方面的作用。方法：研究对象为天津医科大学总医院血液科2010年7月-2011年10月收治的淋巴瘤患者,均经淋巴结组织病理学检查确诊,以及淋巴结炎性肿大患者、正常对照。提取淋巴瘤患者、淋巴结炎性肿大患者及正常对照外周血血浆中的miRNA,运用反转录-聚合酶链式反应（RT-PCR）方法检测血浆中miR-21、miR-155、 miR-210的表达,Quantity one软件分析PCR图像,检测目的基因与内参的相对亮度表示该miRNA的相对表达量。利用SPSS17.0统计软件进行分析miR-21、miR-155、miR-210在淋巴瘤患者血浆中的表达情况,与正常对照及淋巴结炎性肿大对照患者进行对比,并分析与淋巴瘤患者血浆LDH水平、β2-MG水平、分期、是否伴有全身症状的相关性,比较化疗前后的表达水平动态变化,初步探讨该三者miRNA在淋巴瘤诊断、评价疗效及预后方面的作用。结果：1.本研究中55例淋巴瘤患者血浆中miR-21的表达量、52例淋巴瘤患者血浆中miR-155的表达量及44例淋巴瘤患者血浆中miR-210的表达量均明显高于正常对照及淋巴结炎性肿大患者（p0.05）,miR-155在正常对照血浆中的表达量高于淋巴结炎性肿大患者（p0.05）。miR-21、miR-155、miR-210在非霍奇金淋巴瘤（Non-hodgkin lymphoma, NHL）组血浆中的表达量与霍奇金淋巴瘤（Hodgkin lymphoma, HL）组相比无差异（P>0.05） 3.血浆中miR-21、miR-155、miR-210的表达量对淋巴瘤的诊断率分别为56.4%、65.4%、47.7%,miR-21联合miR-155的诊断率60.7%,miR-21联合miR-210的诊断率52.5%,miR-155联合miR-210的诊断率57.3%,三者的联合诊断率为83%。 4.淋巴瘤患者血浆中miR-21的表达随LDH增高而增高,呈正相关（r=0.291,p=0.031）。 5.初治淋巴瘤血浆中miR-21、miR-210的表达量明显高于治疗6个疗程以上患者的表达量（p<0.05）。结论：淋巴瘤血浆中miR-21、miR-155、miR-210的表达量增高,检测三者在血浆中的表达量有助于临床淋巴瘤的诊断及疗效、预后的判断。

关键词：淋巴瘤血浆 miR-21 miR-155 miR-210 PCR

旱、盐胁迫对不同海拔、生长年限与贮藏条件的药用大黄种子萌发特性的影响

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生态学杂志 2023年第1期42卷 18-28页

作者：谢丰璞王楠高静张岗葛甜甜张亚丽成世强宋忠兴唐志书陕西中医药大学陕西中药资源产业化省部共建协同创新中心/秦药特色资源研究与开发国家重点实验室(培育)陕西咸阳712083 陕西中医药大学药学院/陕西省中医药管理局“秦药”研发重点实验室西安712046 镇巴县科技进步促进中心陕西汉中723000 中国中医科学院北京100700

为探讨旱、盐胁迫对不同海拔、生长年限和贮藏时间的药用大黄种子萌发和幼苗生长的影响,以采自陕西汉中镇巴县的药用大黄种子为研究对象,纯净水(CK)为对照组,置于用以模拟干旱和盐胁迫的不同渗透势水平(-0.3和-0.5 MPa)的PEG和NaCl处理... 详细信息

为探讨旱、盐胁迫对不同海拔、生长年限和贮藏时间的药用大黄种子萌发和幼苗生长的影响,以采自陕西汉中镇巴县的药用大黄种子为研究对象,纯净水(CK)为对照组,置于用以模拟干旱和盐胁迫的不同渗透势水平(-0.3和-0.5 MPa)的PEG和NaCl处理下,每日记录种子萌发个数并观察幼苗生长情况。结果表明:相比低和高海拔的种子,中海拔1650 m处采集的种子萌发率更高,且海拔1650和1300 m处的种子对干旱和盐胁迫的耐受力强;随着胁迫浓度的增加,干旱胁迫对药用大黄幼苗生长的抑制作用极其显著,在-0.5 MPa PEG处理下所有幼苗均死亡;不同海拔、不同生长年限及不同贮藏期的种子内源赤霉素含量无明显差异,而赤霉素浸种后种子活力和内源赤霉素浓度显著升高;室温贮藏1年的大黄种子发芽率、活力、耐盐性显著低于新采集的种子,而3年生植株种子发芽率、活力、耐盐性均高于2年生且耐旱性更强。综上可知,药用大黄种子不适宜长期室温贮藏,中海拔以及轻度盐胁迫有助于药用大黄种子萌发及幼苗生长,且3年生药用大黄种子质量高于2年生。

关键词：渗透胁迫海拔生长年限贮藏期种子萌发幼苗生长赤霉素

盐、低磷以及干旱胁迫下乌拉尔甘草根转录组分析

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分子植物育种 2023年第5期21卷 1496-1509页

作者：关思静葛甜甜徐蓉蓉王楠高静张岗彭亮张亚丽谢丰璞陕西中医药大学药学院陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心西安712046 陕西中医药大学陕西中药资源产业化省部共建协同创新中心秦药特色资源研究与开发国家重点实验室(培育)咸阳712083

对乌拉尔甘草根进行转录组测序分析,挖掘响应盐、低磷和干旱胁迫的相关基因,探讨甘草抵御逆境胁迫的分子机制。以150 mmol/L NaCl模拟盐胁迫、10μmol/L KH_(2)PO_(4)模拟低磷胁迫和15%聚乙二醇(PEG-6000)模拟干旱胁迫处理下的乌拉尔甘... 详细信息

对乌拉尔甘草根进行转录组测序分析,挖掘响应盐、低磷和干旱胁迫的相关基因,探讨甘草抵御逆境胁迫的分子机制。以150 mmol/L NaCl模拟盐胁迫、10μmol/L KH_(2)PO_(4)模拟低磷胁迫和15%聚乙二醇(PEG-6000)模拟干旱胁迫处理下的乌拉尔甘草根作为研究材料,应用Illumina HiSeq 2000测序平台对根进行转录组测序,对测序结果进行基因功能注释分析和差异表达基因(DEGs)筛选。分别获得盐、低磷和干旱胁迫处理下甘草根中4 294、3 201和4 719个DEGs。GO富集结果表明,3种逆境胁迫下甘草根中的DEGs均显著富集到细胞过程、代谢过程、刺激响应、细胞、细胞器、催化活性等功能过程中;KEGG途径富集分析表明,3种胁迫处理下的DEGs显著富集的代谢途径主要涉及基因表达调控、生物合成及代谢、信号转导等。转录因子鉴定结果显示3种胁迫处理下差异表达数量最多的转录因子主要来自ERF、bHLH、MYB-related、WRKY、Dof、NAC等转录因子家族;基因表达水平分析显示,参与植物激素代谢及信号转导相关的DEGs在盐胁迫处理下多数表达水平下降,在低磷与干旱胁迫处理下多数DEGs呈上调表达。通过高通量转录组测序,初步获取了乌拉尔甘草根响应盐、低磷和干旱胁迫的基因表达特征,为深入研究甘草抗逆机制提供理论依据。

关键词：甘草(Glycyrrhiza uralensis) 非生物胁迫转录组分析转录因子植物激素信号

注射用黄芪多糖联合AP方案治疗晚期非小细胞肺癌的临床研究

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现代药物与临床 2022年第11期37卷 2562-2567页

作者：王素芬葛甜甜张冬梅李国忠天津市第五中心医院血液肿瘤科天津300450

目的探讨注射用黄芪多糖联合AP方案治疗晚期非小细胞肺癌的有效性与安全性。方法选择2020年1月—2021年12月天津市第五中心医院收治的124例晚期非小细胞肺癌患者,按随机数字表法将分为对照组和治疗组,每组各62例。对照组采取AP方案治... 详细信息

目的探讨注射用黄芪多糖联合AP方案治疗晚期非小细胞肺癌的有效性与安全性。方法选择2020年1月—2021年12月天津市第五中心医院收治的124例晚期非小细胞肺癌患者,按随机数字表法将分为对照组和治疗组,每组各62例。对照组采取AP方案治疗,即第1天静脉滴注注射用培美曲塞二钠,500 mg/m~2溶于100 mL生理盐水;滴注完30 min后再静脉滴注注射用顺铂注射用顺铂,75 mg/m~2溶于500 mL生理盐水。在对照组基础上,治疗组第1~14天静滴滴注注射用黄芪多糖,250 mg加入500 mL生理盐水,1次/d。所有患者均以21 d为1个疗程,连续治疗4个疗程。观察两组患者临床疗效,比较治疗前后两组患者血清细胞角蛋白片段19(CYFRA21-1)、鳞状上皮细胞癌抗原(SCC-Ag)、癌胚抗原(CEA)、白细胞介素-8(IL-8)和转化生长因子-β1(TGF-β1)水平,FACT-L评分,及外周血CD3~+、CD4~+水平和CD4~+/CD8~+和不良反应。结果治疗后,治疗组疾病控制率(DCR)比对照组(88.71%vs 70.97%)、客观缓解率(ORR)比对照组(51.61%vs33.87%)均显著升高(P<0.05)。治疗后,两组血清肺癌标志物CYFRA21-1、SCC-Ag、CEA、IL-8和TGF-β1水平均显著低于治疗前(P<0.05),且以治疗组的下降更显著(P<0.05)。治疗后,两组FACT-L中评分及其总分比治疗前均显著增加(P<0.05),且以治疗组的升高更显著(P<0.05)。治疗后,对照组外周血CD3~+、CD4~+水平和CD4~+/CD8~+比值治疗前均显著下降,而治疗组治疗后CD3~+、CD4~+水平和CD4~+/CD8~+比值显著升高(P<0.05);且治疗后治疗组患者外周血CD3~+、CD4~+水平和CD4~+/CD8~+比值高于对照组(P<0.05)。治疗组白细胞减少发生率(12.90%vs 32.26%)、胃肠道反应发生率(12.90%vs 29.03%)、血小板减少发生率(11.29%vs 25.81%)均较对照组显著下降(P<0.05)。结论注射用黄芪多糖对AP方案具有增效减毒的功效,有望成为晚期非小细胞肺癌治疗方案的重要组成部分。

关键词：注射用黄芪多糖注射用培美曲塞二钠注射用顺铂非小细胞肺癌减毒增效免疫功能白细胞介素-8

γ-氨基丁酸对盐碱胁迫下甘草种子萌发的影响

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中国野生植物资源 2022年第3期41卷 1-7页

作者：葛甜甜王楠高静关思静徐蓉蓉张亚丽谢丰璞李瑞严加坤颜永刚张岗陕西中医药大学药学院陕西西安712046 陕西中医药大学陕西中药资源产业化省部共建协同创新中心/秦药特色资源研究与开发国家重点实验室(培育) 陕西咸阳712083 榆林学院生命科学学院陕西榆林719000

为提高甘草种子及幼苗的耐盐碱性,本实验采用培养皿纸上发芽法,以甘草种子(Glycyrrhiza uralensis Fisch.)为试验材料,研究γ-氨基丁酸(GABA)对盐、碱和盐碱胁迫下甘草种子萌发特性和抗氧化酶活性的影响。结果表明,0.1 mmol·L^(-1)的G... 详细信息

为提高甘草种子及幼苗的耐盐碱性,本实验采用培养皿纸上发芽法,以甘草种子(Glycyrrhiza uralensis Fisch.)为试验材料,研究γ-氨基丁酸(GABA)对盐、碱和盐碱胁迫下甘草种子萌发特性和抗氧化酶活性的影响。结果表明,0.1 mmol·L^(-1)的GABA显著提高盐胁迫下种子的活力指数,促进胚轴长度;0.2 mmol·L^(-1)的GABA可有效提高碱胁迫下种子的发芽势,0.5 mmol·L^(-1)的GABA提高胚根长;盐碱胁迫下,胚根和鲜重在0.3 mmol·L^(-1)的GABA处理下显著增加。GABA也可显著提高3种胁迫下的抗氧化酶活性,其中,0.05 mmol·L^(-1)的GABA可显著提高3种胁迫下的过氧化物酶(POD)活性。0.2 mmol·L^(-1)的GABA提高盐胁迫下超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化氢酶(CAT)活性。0.3 mmol·L^(-1)的GABA提高碱和盐碱胁迫下的CAT活性,0.5 mmol·L^(-1)的GABA可提高其SOD活性。综上,GABA可通过提高种子发芽势、活力指数和抗氧化酶活性来缓解盐碱胁迫对甘草种子萌发的影响,提高甘草幼苗的耐盐碱能力。

关键词：盐碱胁迫 γ-氨基丁酸种子萌发抗氧化酶活性

糖尿病足患者溃疡愈合后5年复发和死亡的随访结果及其危险因素分析

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中华糖尿病杂志 2021年第3期13卷 227-232页

作者：王美君许洪梅葛甜甜邢秋玲宋振强丁敏天津医科大学朱宪彝纪念医院足病科糖尿病足诊疗中心天津市内分泌研究所国家卫健委激素与发育重点实验室天津市代谢性疾病重点实验室 300134 天津医科大学朱宪彝纪念医院护理部天津市内分泌研究所国家卫健委激素与发育重点实验室天津市代谢性疾病重点实验室 300134 天津医科大学朱宪彝纪念医院病案统计科天津市内分泌研究所国家卫健委激素与发育重点实验室天津市代谢性疾病重点实验室 300134

目的探讨糖尿病足患者溃疡愈合后5年复发和死亡结局,并对其危险因素进行分析。方法采用前瞻性队列研究的方法,选择2013年1月至2014年12月在天津医科大学朱宪彝纪念医院足病科住院的糖尿病足溃疡愈合的317例患者为研究对象,随访5年后记... 详细信息

目的探讨糖尿病足患者溃疡愈合后5年复发和死亡结局,并对其危险因素进行分析。方法采用前瞻性队列研究的方法,选择2013年1月至2014年12月在天津医科大学朱宪彝纪念医院足病科住院的糖尿病足溃疡愈合的317例患者为研究对象,随访5年后记录患者足溃疡复发和死亡的情况,并分别采用二元logistic回归法和Cox比例风险回归模型进行危险因素分析。结果317例患者中完成随访者292例,随访率92.1%。随访患者5年累计复发率为71.2%(208/292)。5年间同一部位复发率29.8%(62/208),多次复发率41.3%(86/208),前足部位的复发率最高为32.7%(68/208),具有骨髓炎的122例患者中溃疡复发率为73.8%(90/122)。5年累计死亡率为39.7%(116/292),复发患者的死亡率高于未复发患者[分别为44.2%(92/208)和28.6%(24/84)],差异具有统计学意义(P<0.05)。多因素logistic回归分析结果显示:年龄、骨髓炎、足部护理行为、照顾者反应、糖化血红蛋白、下肢动脉粥样硬化性病变(LEAD)分期、终末期肾病为糖尿病足患者溃疡复发的独立影响因素(P<0.05)。Bathel指数、照顾者反应、糖化血红蛋白、LEAD分期、终末期肾病、心脏事件为死亡的独立影响因素(P<0.05)。结论糖尿病足溃疡复发的危险因素主要是年龄、骨髓炎、足部护理行为;患者死亡的危险因素是Bathel指数、心脏事件;照顾者反应、糖化血红蛋白、LEADⅣ期、肾病5期同时是患者溃疡复发和死亡的危险因素。

关键词：糖尿病足溃疡愈合复发死亡