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2株猪繁殖与呼吸综合征病毒海南株的ORF5基因分析

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新疆农业科学 2023年第12期60卷 3049-3056页

作者：马佳镁钟植文范悦轩黄春媛郑佳馨曹芳芳王金泉刘光亮曹宗喜新疆农业大学动物医学学院乌鲁木齐830052 海南省农业科学院畜牧兽医研究所/海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室/国家动物疫病数据中心海口观测实验点海口571100 广东永顺生物制药股份有限公司广州511536 海南省农业科学院畜牧兽医研究所海南省院士团队创新中心海口571100

【目的】鉴定我国海南省新发现的2株猪繁殖与呼吸综合征病毒株HNHK1-2021和HNLG1-2021的进化关系。【方法】采用PCR方法对ORF5基因进行扩增和序列测定,利用MegAlign软件进行多重序列比对,利用MEGA X软件邻接法构建进化树。【结果】PRRSV... 详细信息

【目的】鉴定我国海南省新发现的2株猪繁殖与呼吸综合征病毒株HNHK1-2021和HNLG1-2021的进化关系。【方法】采用PCR方法对ORF5基因进行扩增和序列测定,利用MegAlign软件进行多重序列比对,利用MEGA X软件邻接法构建进化树。【结果】PRRSV HNHK1-2021和HNLG1-2021毒株核苷酸相似性为82.9%,推导氨基酸相似性为82.6%。HNHK1-2021毒株和NADC30类PRRSV、QYYZ类PRRSV、VR-2332类PRRSV以及JXA1类PRRSV序列比对,80.8%~82.8%、90.2%~92.0%、82.1%~83.4%、81.9%~84.4%,推导氨基酸相似性分别为82.1%~84.6%、91.5%~94.5%、80.1%~83.1%、82.6%~84.6%;HNLG1-2021毒株和NADC30类PRRSV、QYYZ类PRRSV、VR2332类PRRSV以及JXA1类PRRSV序列比对,核苷酸相似性分别为83.7%~84.6%、81.8%~83.6%、97.7%~99.5%、85.6%~90.4%,推导氨基酸相似性为83.6%~85.1%、81.1%~82.6%、96.0%~98.5%,86.1%~90.5%。【结论】2株病毒株均属于北美型PRRSV,HNHK1-2021毒株属于QYYZ类PRRSV(谱系3)。HNLG1-2021毒株属于VR-2332类PRRSV(谱系5)。

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒 ORF5基因多重序列比对同源性

基于猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF2a基因的RT-RAA-LF检测方法的建立

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中国兽医科学 2023年第10期53卷 1249-1253页

作者：陈素贞马佳镁黄春媛范悦轩郑佳馨刘光亮曹宗喜新疆农业大学动物医学学院新疆乌鲁木齐830000 海南省农业科学院畜牧兽医研究所海南省热带繁育与疫病研究重点实验室海南海口571100

本研究针对猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF2a基因序列,设计特异性RAA引物和标记探针,通过反转录酶与重组酶扩增结合,旨在建立一种高效检测PRRSV的基于侧流层析试纸条的可视化RT-RAA方法。结果,建立的RT-RAA-LF方法的最佳反应条件是39℃恒温... 详细信息

本研究针对猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF2a基因序列,设计特异性RAA引物和标记探针,通过反转录酶与重组酶扩增结合,旨在建立一种高效检测PRRSV的基于侧流层析试纸条的可视化RT-RAA方法。结果,建立的RT-RAA-LF方法的最佳反应条件是39℃恒温扩增10 min,可在2 min内实现对检测结果的可视化判定;该方法特异性强,仅对PRRSV出现阳性扩增,对本研究中其他病原均无交叉反应;以含PRRSV ORF2a基因全段序列的重组质粒作为模板,RT-RAA-LF的检出限为160 copies/μL。应用建立的RT-RAA-LF方法对临床采集的160份样本进行检测,与PCR方法进行比较,两种方法的符合率为96.8%(65/68),一致性检验为χ2<3.84,在95%的置信区间内没有显著性差异,当中3份临床样品在PCR检测中为阴性。综上,基于PRRSV ORF2a建立的RT-RAA-LF方法操作简单,对仪器设备要求不高,能够高效且直观的实现临床检测,满足现场检测的要求,对猪养殖场快速诊断和防控PRRSV具有重要意义。

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒 ORF2a 侧流层析试纸条重组酶介导扩增法(RAA) 临床检测

基于ORF7基因的猪繁殖与呼吸综合征病毒RT-RAA检测方法的建立

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动物医学进展 2024年第8期45卷 117-119页

作者：于娜马佳镁张紫薇黄春媛范悦轩郑佳馨张艳刘光亮曹宗喜海南省农业科学院畜牧兽医研究所、海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室海南海口571100 塔里木大学动物科学与技术学院、新疆生产建设兵团塔里木动物疫病诊断与防控工程实验室新疆阿拉尔843300 新疆农业大学动物医学学院新疆乌鲁木齐830000 苏州天隆生物科技有限公司江苏苏州215021

根据GenBank公布的ORF7基因保守序列设计了特异性引物,建立了PRRSVORF7基因反转录-重组酶介导等温扩增(RT-RAA)荧光法快速检测方法。结果表明,RT-RAA荧光法在42℃、20min内即可检测到PRRSV特异性扩增曲线,最低检测浓度为9.9×10^(6)copi... 详细信息

根据GenBank公布的ORF7基因保守序列设计了特异性引物,建立了PRRSVORF7基因反转录-重组酶介导等温扩增(RT-RAA)荧光法快速检测方法。结果表明,RT-RAA荧光法在42℃、20min内即可检测到PRRSV特异性扩增曲线,最低检测浓度为9.9×10^(6)copies/μL;与PRVBartha-K61、PCV、CSFV、PRRSVGD、PRRSVXH-GD、PRRSVGM2、PRRSVCH-1a病毒均无交叉反应。分别对157份样品进行荧光RT-RAA法与PCR方法的检测进行比对,结果显示,荧光RT-RAA法敏感性为94.0%,特异性为100%。建立的PRRSV荧光RT-RAA法操作简便,特异性强,灵敏度高。

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒 ORF7基因反转录-重组酶介导等温扩增特异性灵敏度

基于局地气候区的校园室外热舒适影响因素及优化策略研究

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世界建筑 2024年第9期 68-73页

作者：钟鸿峰何玥儿范悦张琼郑如轩深圳大学深圳大学建筑与城市规划学院 Archimaera建筑事务所

气候变化背景下校园室外热环境的重要性凸显,迫切需要科学的设计指引以提升校园热环境。然而,当前研究多局限于单一空间或室内环境,缺乏多空间的对比研究,忽略了室外热环境多要素相互影响的复杂特性。基于此,研究基于局地气候区理论,选... 详细信息

气候变化背景下校园室外热环境的重要性凸显,迫切需要科学的设计指引以提升校园热环境。然而,当前研究多局限于单一空间或室内环境,缺乏多空间的对比研究,忽略了室外热环境多要素相互影响的复杂特性。基于此,研究基于局地气候区理论,选取了3类开放空间和3类建成环境,结合实测和问卷调研探究校园室外热舒适关键影响因素,进而提出针对性的优化策略,以期为夏热冬暖地区校园室外热环境营造提供设计指引。

关键词：室外热舒适局地气候区空间形态校园热环境优化策略