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A novel salt-tolerant Micrococcus sp. DUT_AHX capable of degrading nitrobenzene

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Journal of Central South University 2009年第2期16卷 230-235页

作者：艾海新周集体吕红 School of Life Science Liaoning University School of Environment and Biological Science and Technology Dalian University of Technology

A novel strain of Micrococcus ***_AHX,which was isolated from the sludge of a nitrobenzene(NB)-manufacturing plant and could utilize NB as the sole carbon source,was identified on the basis of physiological and biochemical tests and 16S ribosomal DNA(rDNA)sequence *** can grow at the temperature up to 40℃or in the presence of NaCl concentration up to 12 g/L in Luria-Bertani(LB)*** optimal degradation conditions are as follows:temperature 37℃,pH 7.0,and shaking speed 150 r/*** strain involves a partial reductive pathway due to the release of ammonia and can also utilize 2-aminophenol as the sole carbon ***,the enzyme activity tests show that crude extracts of NB-grown strain DUT_AHX mainly contain 2-aminophenol 1,6-dioxygenase *** exploitation of salt-tolerant bacteria will be a remarkable improvement in NB bioremediation and wastewater treatment at high salinity and high temperature.

关键词： Micrococcus 16S rDNA nitrobenzene degradation salt-tolerant

食品中甲型肝炎病毒RNA提取方法的比较及应用

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食品科学 2019年第6期40卷 325-330页

作者：冯华炜闫平平艾海新李思嘉麻丽丹刘宏生辽宁大学生命科学院辽宁沈阳110036 大连出入境检验检疫局辽宁大连116400 辽宁省生物大分子模拟计算与信息处理工程研究中心辽宁沈阳110036 东港市农业综合执法大队辽宁丹东118000 丹东出入境检验检疫局辽宁丹东118000

目的:对食品中甲型肝炎病毒的3种RNA提取方法进行综合比较,以优选出最佳的核酸提取方法,为各级实验室开展食源性甲型肝炎病毒核酸检验提供技术参考。方法:分别采用ABI AM1836、QIAGEN 74104和ROCHE11858882001三种商业化核酸提取试剂盒... 详细信息

目的:对食品中甲型肝炎病毒的3种RNA提取方法进行综合比较,以优选出最佳的核酸提取方法,为各级实验室开展食源性甲型肝炎病毒核酸检验提供技术参考。方法:分别采用ABI AM1836、QIAGEN 74104和ROCHE11858882001三种商业化核酸提取试剂盒对人工污染甲型肝炎病毒的食品样品进行核酸提取,根据3种核酸提取方法的提取效率、抑制剂去除效率、检测灵敏度、综合应用指标进行病毒RNA的优化,且采用优化后的提取方法进行实际样品的检测。结果:综合病毒各项评价指标显示,ROCHE 11858882001在食品中提取甲型肝炎病毒RNA效果最优,其次为QIAGEN 74104和ABI AM1836。101份样品的检测结果显示,一份蓝靛果样品为甲型肝炎病毒核酸阳性,其余样品均为阴性。结论:ROCHE 11858882001是一种快捷有效的病毒RNA提取方法,适用于食品中甲型肝炎病毒的日常检测工作。

关键词：甲型肝炎病毒 RNA提取方法实时荧光RT-PCR 食品样品

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栉孔扇贝急性病毒性坏死症病原人工感染研究

中国水产科学 2003年第5期10卷 386-391页

作者：艾海新王崇明王秀华刘英杰李赟贺桂珍宋微波中国水产科学研究院渔业资源环境保护中心中国水产科学研究院黄海水产研究所农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室中国海洋大学教育部海水养殖重点实验室中国海洋大学教育部海水养殖重点实验室山东青岛　266071中国海洋大学北京　100039 山东青岛　 2 6 6 0 0 3 山东青岛　266003 山东青岛　266071

从发病疫区栉孔扇贝(Chlamysfarreri)组织中分离出病毒和立克次体(Rickettsiaorganism,RO),对健康栉孔扇贝进行人工感染。结果显示,病毒注射组死亡率为75%,病毒浸浴组死亡率为68.7%;RO注射组死亡率仅为18.7%;灭活RO注射组死亡率为31%;... 详细信息

从发病疫区栉孔扇贝(Chlamysfarreri)组织中分离出病毒和立克次体(Rickettsiaorganism,RO),对健康栉孔扇贝进行人工感染。结果显示,病毒注射组死亡率为75%,病毒浸浴组死亡率为68.7%;RO注射组死亡率仅为18.7%;灭活RO注射组死亡率为31%;灭活病毒注射和空白对照组死亡率皆为12.5%;病毒注射、浸浴组与灭活病毒注射组、空白对照组死亡率有显著差异。而RO注射组与灭活RO注射组、空白对照组死亡率没有显著差异。电镜复检结果显示,发病扇贝的外套膜、鳃、消化腺组织中分布有大量病毒粒子,该病毒粒子的形态特征、病理学特征与自然海区发病扇贝中的病毒粒子特征完全一致。人工感染实验结果证明,栉孔扇贝急性病毒性坏死病毒(A cuteVirusNecrobioticVirus,AVNV)是栉孔扇贝大规模死亡的直接病原。

关键词：栉孔扇贝病毒立克次体人工感染实验

小浆果中食源性甲型肝炎病毒和诺如病毒流行状况及检测方法的研究进展

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食品科学 2019年第19期40卷 307-317页

作者：冯华炜艾海新杨天舟齐梦园谭燕妮麻丽丹刘宏生辽宁大学生命科学院辽宁沈阳110036 辽宁省生物大分子模拟计算与信息处理工程研究中心辽宁沈阳110036 丹东出入境检验检疫局辽宁丹东118000

小浆果是食源性甲型肝炎病毒(hepatitis A virus,HAV)和诺如病毒(norovirus,NoV)感染爆发的重要传播载体,受到全世界的广泛关注。为及时了解小浆果产品的病毒污染情况,需要对不同类型小浆果中的食源性病毒进行准确检测。由于受污染的小... 详细信息

小浆果是食源性甲型肝炎病毒(hepatitis A virus,HAV)和诺如病毒(norovirus,NoV)感染爆发的重要传播载体,受到全世界的广泛关注。为及时了解小浆果产品的病毒污染情况,需要对不同类型小浆果中的食源性病毒进行准确检测。由于受污染的小浆果携带病毒含量较低,且自身质地脆弱并含有大量果胶、多酚、多糖、色素等反转录聚合酶链式反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)抑制物,容易产生大量的"假阴性"结果,给食源性病毒的监测带来困难。在广泛查阅文献的基础上,本文综述了HAV和NoV在小浆果中的流行状况,指出了小浆果中食源性病毒检测的改进方向,阐述了全程过程控制、分子过程控制和RT-PCR过程控制在食源性HAV和NoV检测中的应用情况,为加强HAV和NoV在小浆果中的防控能力提供方法学参考。

关键词：小浆果诺如病毒甲型肝炎病毒流行状况检测方法过程控制

基于随机森林和特征选择方法的蛋白质热稳定性影响因素预测

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现代食品科技 2016年第7期32卷 103-108页

作者：张力艾海新张吉宽胡桓刘宏生马树才辽宁大学生命科学院辽宁沈阳110036 辽宁省生物大分子计算模拟与信息处理工程技术研究中心辽宁沈阳110036 辽宁大学信息学院辽宁沈阳110036 辽宁大学经济学院辽宁沈阳110036

酶的耐热性对其在食品工业中实现应用至关重要。本文以随机森林算法通过蛋白质序列预测酶的热稳定性,并对影响热稳定性的重要特征进行了分析。计算了从Swiss-Prot数据库获得的1600个包含热稳定性信息的酶的430个特征。采用重复欠抽样法... 详细信息

酶的耐热性对其在食品工业中实现应用至关重要。本文以随机森林算法通过蛋白质序列预测酶的热稳定性,并对影响热稳定性的重要特征进行了分析。计算了从Swiss-Prot数据库获得的1600个包含热稳定性信息的酶的430个特征。采用重复欠抽样法处理数据不平衡问题,采用向后递归特征消去法优选出30个最重要的特征。通过交叉验证和独立测试比较以各特征子集构建的模型,发现仅以氨基酸组成为特征集构建的模型获得了最佳预测效果,模型的总体预测准确率为85.83%、敏感性为89.16%、特异性为73.33%、精度为77.00%、F1度量为74.87%。结果表明氨基酸组成对酶热稳定性的影响最大,嗜热酶中含有更多的谷氨酸、异亮氨酸和赖氨酸,而常温酶中含有更多的谷氨酰胺、丝氨酸和苏氨酸。研究为蛋白质工程改造食品工业用酶的热稳定性提供了一定的理论和方法。

关键词：酶热稳定性随机森林特征选择氨基酸组成

栉孔扇贝急性病毒性坏死症病毒cDNA文库的构建及部分序列分析

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中国水产科学 2006年第3期13卷 421-425页

作者：王崇明艾海新刘英杰王秀华李赟中国水产科学研究院黄海水产研究所中国水产科学研究院中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室

急性病毒性坏死症病毒(Acute Virus Necrobiotic Virus,AVNV)已被证实是一种对养殖栉孔扇贝(Chlamys farreri)危害极大的致病病原。本研究应用基因克隆技术对AVNV基因组进行cDNA合成、克隆,并对部分克隆进行序列分析。采用差速和蔗糖密... 详细信息

急性病毒性坏死症病毒(Acute Virus Necrobiotic Virus,AVNV)已被证实是一种对养殖栉孔扇贝(Chlamys farreri)危害极大的致病病原。本研究应用基因克隆技术对AVNV基因组进行cDNA合成、克隆,并对部分克隆进行序列分析。采用差速和蔗糖密度梯度离心法,分离纯化AVNV。用Trizol试剂抽提病毒RNA,采用随机引物和Oligo(dT)双引物法,SuperScriptⅡ反转录酶合成cDNA,并克隆于pUC118质粒上,利用蓝白斑筛选阳性克隆子,PCR法快速鉴定重组质粒。经筛选得到2个阳性克隆23#、52#,插入片段大小约为1 200 bp和800 bp。测序结果与GenBank的比对分析显示,尚未有类似的序列报道,提示该病毒可能为一种新发现的病毒。

关键词：栉孔扇贝急性病毒性坏死病毒 cDNA文库克隆序列分析

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海洋贝类病毒病研究进展

海洋水产研究 2004年第2期25卷 77-82页

作者：艾海新王崇明王秀华李赟教育部海水养殖重点实验室中国海洋大学青岛266003 农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所青岛266071

概述目前已报道的海洋贝类病毒病的病原生物学、组织病理学、细胞病理学和流行病学等方面的进展 ,提出了目前国内外海洋贝类病毒学研究中存在的问题并进行了展望。

关键词：海洋贝类病毒疾病进展

核酸杂交技术在海水养殖动物疾病诊断中的应用

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海洋水产研究 2006年第4期27卷 96-100页

作者：艾海新王崇明任伟成王秀华李赟中国水产科学研究院黄海水产研究所青岛266071 中国海洋大学青岛266003

介绍了核酸杂交技术的发展历史背景、基本原理、杂交方法、标记方法、技术特点,概述了目前已报道的海水养殖动物病害的病原核酸杂交检测技术的进展,并对核酸杂交技术进行了展望。

关键词：核酸杂交探针海水养殖病害应用

与阿尔茨海默病发病机制相关的microRNA的研究现状及进展

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辽宁大学学报（自然科学版） 2015年第3期42卷 263-269页

作者：艾海新邓芳博刘宏生辽宁大学生命科学院辽宁沈阳110036 辽宁省生物大分子计算模拟与信息处理工程技术研究中心辽宁沈阳110036

阿尔茨海默病(Alzheimer’s Disease,AD)是一种复杂的慢性神经系统退行性疾病,病因和发病机制迄今尚未明确,可能与多种因素有关,如基因突变、氧化应激、线粒体功能障碍、胶质细胞活化、细胞凋亡等.MicroRNA(miRNA)是神经细胞分化、生长... 详细信息

阿尔茨海默病(Alzheimer’s Disease,AD)是一种复杂的慢性神经系统退行性疾病,病因和发病机制迄今尚未明确,可能与多种因素有关,如基因突变、氧化应激、线粒体功能障碍、胶质细胞活化、细胞凋亡等.MicroRNA(miRNA)是神经细胞分化、生长以及神经系统可塑性调节的关键因子,miRNA的异常表达与AD的发病机制密切相关.综述了近年来miRNA在调节β淀粉样前体蛋白(APP)表达、调节淀粉样前体蛋白β位分解酶1(BACE1)表达、调节微管相关蛋白Tau表达以及调节其他非特异性致病因子等与AD发病机制相关因素等方面的研究现状和进展,将为深入系统研究阿尔茨海默病的发病机制提供参考.

关键词：阿尔茨海默病 miRNA 发病机制研究进展