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基于机器学习鉴定支气管肺发育不良相关基因及免疫浸润分析

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中华生物医学工程杂志 2024年第1期30卷 16-23页

作者：胡诤贇江军飞田坪娄泽圆赵志金李小东罗星王永丹徐礼贵上海市松江区中心医院儿科，上海201600 上海市松江区中心医院药剂科，上海201600 云南省昭通市昭阳区中医医院儿科，昭通657000

目的对支气管肺发育不良(BPD)密切相关的基因进行鉴定,为揭示BPD发病机制提供理论依据。方法从基因表达综合数据库(GEO)获取BPD患儿的血标本数据集GSE32472基因微阵列,筛选出差异表达基因并行CIBERSORT反卷积算法免疫浸润分析,再利用加... 详细信息

目的对支气管肺发育不良(BPD)密切相关的基因进行鉴定,为揭示BPD发病机制提供理论依据。方法从基因表达综合数据库(GEO)获取BPD患儿的血标本数据集GSE32472基因微阵列,筛选出差异表达基因并行CIBERSORT反卷积算法免疫浸润分析,再利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选出关键颜色模块基因集并与差异表达基因比对后得出交集基因。通过LASSO回归依据lambda惩罚值计算出每个基因系数,筛选出BPD相关的候选基因。基于风险评分中位值构建的高低分险组模型,利用受试者工作特征(ROC)曲线和多因素Logistic回归分析验证候选基因与BPD的关系,并在外部数据集GSE108756中验证诊断效能。结果共筛选出291个差异表达基因,免疫浸润分析揭示了BPD与中性粒细胞、激活CD8^(+)T细胞、效应记忆CD8^(+)T细胞、中央记忆CD4^(+)T细胞以及树突状细胞的激活密切相关。WGCNA分析确定GSE32472中与BPD最密切相关的品红色模块包含169个基因,这些与差异表达基因交集后获得的32个基因通过LASSO回归筛选并建模,最终得出的5个候选基因:UBASH3A、TCF7、CD3E、CD3D、CD6对诊断BPD具有较好的特异性和敏感性[曲线下面积(AUC)为0.825]。多因素Logistic回归分析结果显示,UBASH3A、TCF7、CD3E、CD6对诊断BPD的诊断差异具有统计学意义(均P0.7。结论通过机器学习算法筛选出的5个候选基因,可能成为潜在的BPD基因生物标志物,为深入探索BPD的发病机理和潜在治疗靶点提供了理论基础。

关键词：免疫浸润加权基因共表达网络 LASSO回归支气管肺发育不良候选基因

脐血微量元素及免疫功能指标与婴幼儿喘息性疾病关系的分析

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脐血微量元素及免疫功能指标与婴幼儿喘息性疾病关系的分析

作者：胡诤贇南京医科大学

学位级别：硕士

目的:分析脐血微量元素和免疫功能指标、IL18、IL13和IL4基因多态性与婴幼儿喘息性疾病的关系。方法:收集3岁左右喘息性疾病患儿96例与同期健康体检正常儿童96例,抽取外周静脉血采用聚合酶链反应及限制性片段长度多态性检测方法对IL18基... 详细信息

目的:分析脐血微量元素和免疫功能指标、IL18、IL13和IL4基因多态性与婴幼儿喘息性疾病的关系。方法:收集3岁左右喘息性疾病患儿96例与同期健康体检正常儿童96例,抽取外周静脉血采用聚合酶链反应及限制性片段长度多态性检测方法对IL18基因rs61667799位点和rs779823889位点,IL13基因rs20541位点和rs848位点,以及IL4基因rs2243250位点进行基因检测与基因分型。另在我院收集同意采集脐血(3mL)的新生儿128例,随访3年,其中发生喘息性疾病患儿50例(喘息病例组),未发生喘息性疾病的健康正常婴幼儿60例(正常对照组),测定两组脐血微量元素(钙、锌、铁、镁、铜)、体液及细胞免疫(IgA、IgG、IgM、IgE,CD3+、CD4+和CD8+)相关指标,统计两组微量元素缺乏率及总IgE升高率,检测免疫因子(IL-18和IL-4)。结果:通过基因位点检测发现,IL18基因rs61667799位点和rs779823889位点,IL13基因rs20541位点和rs848位点,以及IL4基因rs2243250位点均成功分型,上述5个位点均存在多态性,然而其多态性未见与喘息性疾病存在关联(P>0.05)。脐血检测发现,喘息病例组脐血微量元素Ca、Zn、Fe水平均显著低于正常对照组,脐血体液免疫指标IgA、IgG显著低于对照组(P<0.05),而总IgE显著高于对照组(P<0.05);细胞免疫指标CD8+显著低于对照组(P<0.05),而CD4+/CD8+显著高于对照组(P<0.05)。喘息病例组微量元素缺乏率、总IgE升高率分别为64.00%、54.00%,均显著高于正常对照组的16.67%、10.00%,差异有统计学意义(P<0.05)。喘息性病例组脐血IL-18和IL-4水平显著高于对照组(P<0.05)。结论:喘息性疾病患儿的脐血微量元素Ca、Fe和Zn缺乏,其总IgE、CD4+/CD8+水平升高,细胞因子IL-18和IL-4水平升高,说明生命早期营养素的缺乏及免疫偏倚可能参与婴幼儿喘息性疾病发生、发展过程。

关键词：微量元素 IgE水平喘息性疾病免疫功能基因多态性

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表皮葡萄球菌感染对不同日龄新生小鼠的影响

临床儿科杂志 2014年第4期32卷 364-367页

作者：乔丽丽胡诤赟申建伟上海市松江区中心医院儿科上海201600

目的探讨表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis,SE)感染对不同日龄新生小鼠的影响。方法出生后第1天(PND1)和第3天(PND3)新生小鼠共60只,分为SE组、生理盐水(NS)组、对照组,每组20只。SE组静脉注射108/ml的SE 50μl,NS组给予等量NS... 详细信息

目的探讨表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis,SE)感染对不同日龄新生小鼠的影响。方法出生后第1天(PND1)和第3天(PND3)新生小鼠共60只,分为SE组、生理盐水(NS)组、对照组,每组20只。SE组静脉注射108/ml的SE 50μl,NS组给予等量NS,对照组不作任何处理。第14天时取脑、肝、脾称重,脑组织石蜡包埋后连续切片,用于微管相关蛋白-2(microtubule associated protein-2,MAP-2)和髓鞘碱性蛋白(myelin basic protein,MBP)免疫组化染色,并计算脑灰质和白质面积和体积。结果 PND1小鼠SE组的死亡率为60.0%,NS组为40.0%,差异无统计学意义(P>0.05);PND3小鼠SE组的死亡率10.0%,NS组无死亡,差异无统计学意义(P>0.05)。PND1和PND3组的体质量,体质量增长,肝、脾重量及脏器系数的差异无统计学意义(P均>0.05)。PND1小鼠SE组的脑灰质面积和体积明显低于NS组,脑白质面积和体积也低于NS组,差异有统计学意义(P均0.05)。结论 SE感染可致PND1小鼠的脑组织损伤,而对PND3小鼠无明显影响。

关键词：表皮葡萄球菌脑组织新生小鼠

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淋巴毒素受体信号介导组织再生的研究进展

南京医科大学学报（自然科学版） 2022年第7期42卷 1036-1042页

作者：胡诤贇史建伟周国平南京医科大学第一附属医院儿科江苏南京210029 上海市松江区中心医院儿科上海201600 南京医科大学附属脑科医院神经外科江苏南京210024

淋巴毒素α、β及其受体(lymphotoxin alpha receptor、lymphotoxin beta receptor,LTAR、LTBR)属于肿瘤坏死因子超家族,LTBR信号在淋巴器官发育、维持完整的淋巴结构、诱导抗病原体的免疫反应、介导器官组织的再生和肿瘤发生发展的过... 详细信息

淋巴毒素α、β及其受体(lymphotoxin alpha receptor、lymphotoxin beta receptor,LTAR、LTBR)属于肿瘤坏死因子超家族,LTBR信号在淋巴器官发育、维持完整的淋巴结构、诱导抗病原体的免疫反应、介导器官组织的再生和肿瘤发生发展的过程中发挥了重要作用。LTBR信号主要通过非经典/经典核转录因子-κB(nuclear transcription factor-kappa B,NF-κB)通路的信号转导来诱导趋化因子和黏附分子的分泌,从而促进细胞增殖与分化。LTBR信号不仅在自身免疫系统疾病中发挥作用,而且通过不同模型展现了其抗癌与促癌的双重功效。本文将重点围绕LTBR信号在多种器官生长发育和组织受损后的再生中所发挥的作用进行综述,以期为再生医学研究提供新的视角。

关键词：淋巴毒素-β受体信号通路组织再生器官发育

双歧杆菌三联活菌散联合间歇蓝光治疗新生儿黄疸的探讨

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中文科技期刊数据库（全文版）医药卫生 2022年第10期 71-73页

作者：张丽斐胡诤赟松江区中心医院上海松江201600

分析新生儿黄疸采取双歧杆菌三联活菌散+间歇蓝光治疗的效果。方法选择2020年1月~2022年5月纳入的黄疸新生儿作为观察对象,随机数字法对患者分组,对照组、观察组分别采取间歇蓝光照射治疗及双歧杆菌三联活菌散+间歇蓝光治疗,对比患者... 详细信息

分析新生儿黄疸采取双歧杆菌三联活菌散+间歇蓝光治疗的效果。方法选择2020年1月~2022年5月纳入的黄疸新生儿作为观察对象,随机数字法对患者分组,对照组、观察组分别采取间歇蓝光照射治疗及双歧杆菌三联活菌散+间歇蓝光治疗,对比患者治疗后的不良反应及疾病治疗效果、临床指标水平。结果观察组有效率比对照组高,p0.05;治疗后,观察组患者胆红素水平虽低于对照组,但在考虑治疗前胆红素值的基线情况下p>0.05,观察组治疗前后及对照组治疗前后,组内对比,p0.05。结论新生儿黄疸采取蓝光+双歧杆菌三联活菌散治疗效果显著,新生儿病情康复速度快,不良反应发生率低,该治疗方法具有可行性。

关键词：双歧杆菌三联活菌散蓝光治疗新生儿黄疸不良反应

脐血炎症因子及IgE检测对婴幼儿喘息性疾病的诊断价值

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医学临床研究 2017年第9期34卷 1816-1818页

作者：胡诤贇洪建国南京医科大学江苏南京210029

【目的】探讨脐血中炎性因子及IgE水平在婴幼儿喘息性疾病诊断中的应用价值。【方法】随机选取2014年3～9月于本院出生的180例新生儿脐血标本，应用酶联免疫吸附实验（enzyme-linkedimmunosor-bentassay，ELlSA）法检测白介素-4（IL-4）... 详细信息

【目的】探讨脐血中炎性因子及IgE水平在婴幼儿喘息性疾病诊断中的应用价值。【方法】随机选取2014年3～9月于本院出生的180例新生儿脐血标本，应用酶联免疫吸附实验（enzyme-linkedimmunosor-bentassay，ELlSA）法检测白介素-4（IL-4）IL-18、IgE水平。婴儿出生后24个月随访，记录婴幼儿喘息性疾病发生情况。建立Logisitic回归模型，采用ROC曲线分析脐血IL-4、IL-18、IgE水平预测婴幼儿喘息性疾病的价值。[结果]180例患儿中9例失访，171例完成2年随访，其中27例出现婴幼儿喘息性疾病，占15．79％。以出现喘息性疾病患儿作为喘息性疾病组，其余作为对照组，喘息性疾病组IL-4、IL-18、IgE水平高于对照组，差异有统计学意义（P〈0．00i），且IgE与IL-4、IL-18均呈正相关关系（r=0．608、0．753，P〈0．05），IL-4与IL-18呈正相关关系（r=0．715，P〈0．05）。经Logistic回归分析，脐血IL-4、IL-18、IgE与婴幼儿喘息性疾病密切相关，ROC曲线显示脐血IL-4、IL-18、IgE联合诊断婴幼儿喘息性疾病时AUC值高于单-检测。【结论】婴幼儿喘息性疾病患儿脐血IL-4、IL-18、IgE水平升高，三者联合检测可用于预测婴幼儿喘息性疾病。

关键词：胎血喘证/诊断免疫球蛋白E 酶联免疫吸附测定

甲泼尼龙联合丙种球蛋白治疗川崎病的疗效及对冠状动脉的影响

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山西医药杂志 2020年第2期49卷 199-201页

作者：申建伟胡诤赟刘冲上海市松江区中心医院儿科

皮肤黏膜淋巴结综合征是一种急性发热出疹性疾病,临床上又被称之为川崎病,5岁以下的儿童是此病的主要发病群体。皮肤黏膜淋巴结综合征的主要表现为淋巴结肿大、黏膜受损、发热、全身性血管炎等[1];一旦患有此病,不但会对患儿的生长发育... 详细信息

皮肤黏膜淋巴结综合征是一种急性发热出疹性疾病,临床上又被称之为川崎病,5岁以下的儿童是此病的主要发病群体。皮肤黏膜淋巴结综合征的主要表现为淋巴结肿大、黏膜受损、发热、全身性血管炎等[1];一旦患有此病,不但会对患儿的生长发育、身体健康造成影响,病情严重者还可能危及患儿的生命。现今临床上对于皮肤黏膜淋巴结综合征,一般采取药物治疗的方式,虽然有较多的治疗方案,但对其疗效依然存在争议。为了解甲泼尼龙与丙种球蛋白在此病治疗中的运用效果,本案将对我院2008年1月至12月所收治的49例皮肤黏膜淋巴结综合征患者采取甲波尼龙与丙种球蛋白治疗,具体情况报告如下。

关键词：皮肤黏膜淋巴结综合征川崎病丙种球蛋白全身性血管炎甲泼尼龙淋巴结肿大冠状动脉药物治疗

复旦儿科医联体双向转诊在上海市松江区的实践与成效

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复旦学报（医学版） 2022年第3期49卷 384-389,410页

作者：侯佳张丽斐陈曦谢志玉胡诤贇刘冲陈国宏翟晓文黄国英复旦大学附属儿科医院临床免疫科上海201102 上海市松江区中心医院儿科上海201600 复旦大学附属儿科医院血液肿瘤科上海201102 复旦大学附属儿科医院心血管中心上海201102

目的建立并完善上海市松江区复旦儿科医联体双向转诊体系,提高儿科转诊效率和质量。方法以复旦儿科医联体为平台,采用横断面调查分析2019年3月至2020年12月松江区中心医院儿科转诊至复旦大学附属儿科医院的患儿基本特征、转诊类型以及... 详细信息

目的建立并完善上海市松江区复旦儿科医联体双向转诊体系,提高儿科转诊效率和质量。方法以复旦儿科医联体为平台,采用横断面调查分析2019年3月至2020年12月松江区中心医院儿科转诊至复旦大学附属儿科医院的患儿基本特征、转诊类型以及转诊至儿科各亚专科的病种情况。分析比较2020年与2019年转诊病例的病种分布特点、实际就诊数量、失访数量及有效转诊率。结果2019—2020年松江区中心医院儿科通过复旦儿科医联体平台共转诊306例患儿,年龄最小为出生后1小时,最大为14岁2个月,以1~6岁幼儿和大于6岁学龄期儿童为主,分别占36.9%和41.8%。依据患儿病情特点建立新生儿、危重症患儿、专科疾病三分类转诊流程,其中专科疾病转诊234例(76.5%)、危重症转诊44例(14.4%)、新生儿转诊28例(9.2%)。2020年与2019年转诊病例在性别、年龄分布、转诊类型方面无显著差异(P>0.05)。2019年转诊病例实际就诊101例,有效转诊率65.6%。改进转诊登记-随访-反馈一体化管理体系后,2020年转诊病例实际就诊122例,有效转诊率80.3%,较2019年有显著提升(P=0.004)。儿科转诊需求最多的亚专科前3位是:急诊内科、神经内科、感染科及儿外科(并列第三)。结论依据病情分类转诊可以为患儿提供最及时、最高效的优质医疗服务。通过“转诊登记-随访-反馈”一体化双向转诊体系显著提高了松江区中心医院儿科转诊率和质量。

关键词：儿科医联体双向转诊分级诊疗

LncRNA MEG3在病毒性毛细支气管炎患儿外周血单个核细胞和痰液中表达及意义

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河北医学 2020年第6期26卷 946-951页

作者：朱连海何长生申建伟杨丹平胡诤贇上海市松江区九亭医院儿科上海松江区201600 上海市松江区中心医院儿科上海松江区201600

目的:通过检测病毒性毛细支气管炎患儿外周血单个核细胞和痰液中LncRNA MEG3表达,分析其对疾病临床意义。方法:选取2017年2月至2019年1月上海市松江区九亭医院和上海市松江区中心医院收治的病毒性毛细支气管炎患儿103例,另选取同期体检... 详细信息

目的:通过检测病毒性毛细支气管炎患儿外周血单个核细胞和痰液中LncRNA MEG3表达,分析其对疾病临床意义。方法:选取2017年2月至2019年1月上海市松江区九亭医院和上海市松江区中心医院收治的病毒性毛细支气管炎患儿103例,另选取同期体检显示健康婴幼儿103例为对照组。采集或收集患儿外周血单个核细胞和痰液后用qRT-PCR法检测LncRNA MEG3表达,分析其与患儿临床病理特征及预后关系。结果:对照、轻度、中度和重度组患儿外周血单个核细胞和痰液中LncRNA MEG3表达水平依次显著降低,两两比较差异有统计学意义(P均<0.05);对照、轻度、中度和重度组患儿外周血单个核细胞和痰液中VEGF mRNA表达水平依次显著升高,两两比较差异有统计学意义(P均<0.05)。患儿外周血单个核细胞中及痰液中LncRNA MEG3表达水平与VEGF mRNA表达水平均呈负相关(P均<0.05)。有过敏史及治疗出院后并发哮喘患儿外周血单个核细胞及痰液中LncRNA MEG3表达水平均显著低于无过敏史及未并发哮喘患儿(P<0.05)。有过敏史、VEGF高表达、LncRNA MEG3低表达是影响病毒性毛细支气管炎患儿发生不良预后危险因素(P均<0.05)。结论:对照、轻度、中度和重度组患儿外周血单个核细胞和痰液中LncRNA MEG3表达水平依次显著降低,可能与病毒性毛细支气管炎发生发展及患儿预后有关。

关键词：长链非编码RNA母系表达基因3 病毒性毛细支气管炎外周血单个核细胞