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花生AT-hook家族基因的生物信息学分析

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热带作物学报 2021年第3期42卷 649-659页

作者：胡冬秀刘浩梁炫强吴自明方加海江西农业大学作物生理生态与遗传育种教育部重点实验室江西南昌330045 广东省农业科学院作物研究所/国家油料作物改良中心南方分中心/广东省农作物遗传改良重点实验室广东广州510640

AT-hook蛋白不仅在植物生长发育、器官构建、胁迫和激素信号应答中起重要作用,而且还作为染色质重塑的转录因子和辅助因子,调节基因的转录活性。为全面了解花生AT-hook基因家族的结构特征,利用生物信息学技术比对花生基因组数据库,分析A... 详细信息

AT-hook蛋白不仅在植物生长发育、器官构建、胁迫和激素信号应答中起重要作用,而且还作为染色质重塑的转录因子和辅助因子,调节基因的转录活性。为全面了解花生AT-hook基因家族的结构特征,利用生物信息学技术比对花生基因组数据库,分析AT-hook基因家族成员的理化性质、基因结构、保守结构域和系统发育关系以及在12个组织中的表达特异性。结果表明:在花生基因组数据库中鉴定得到64个AT-hook基因,染色体定位显示这些基因在染色体上呈不均匀分布。系统发育树分析表明花生AT-hook基因可分为8个亚群,多数基因都含有5ʹ-UTR和3ʹ-UTR。MEME数据库显示,花生AT-hook基因编码的蛋白质包含6个保守的结构域,大多数AT-hook蛋白含有RGRP和PPC的基序。表达热图显示,AT-hook基因在不同花生组织中呈现特定的表达模式,如***3IUC、***6V、arahy.8MM6DT、***96U和arahy.T2XHT6在根中高度表达,但***3BSR和***13分别在雌蕊和叶片中高丰度均匀转录。本研究结果为进一步阐明花生基因组中AT-hook基因的潜在分子功能提供理论参考。

关键词：花生 AT-hook 生物信息学基因家族

花生荚果发育过程中的microRNA鉴定与表达分析

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作物学报 2021年第4期47卷 613-625页

作者：胡冬秀刘浩洪彦彬梁炫强陈小平广东省农作物遗传改良重点实验室/国家油料作物改良中心南方分中心/广东省农业科学院作物研究所广东广州510640

花生(Arachis hypogaea L.)是典型“地上开花、地下结果”的作物,为从转录后调控水平解析此独特的果实发育现象,本文应用small RNA测序技术研究荚果发育11个时期果壳及种子中的microRNA及其靶基因。通过测序分别获得212个已知的microRNA... 详细信息

花生(Arachis hypogaea L.)是典型“地上开花、地下结果”的作物,为从转录后调控水平解析此独特的果实发育现象,本文应用small RNA测序技术研究荚果发育11个时期果壳及种子中的microRNA及其靶基因。通过测序分别获得212个已知的microRNA和112个新microRNA,其中,已知microRNA包括197个保守microRNA和15个花生特异microRNA,新microRNA来自62个新的microRNA前体序列。表达分析发现,67个microRNA及其靶基因在荚果发育的11个时期存在时空特异性表达,部分microRNA的表达量积累阶段性调节果壳与种子的发育,表明microRNA参与了花生荚果暗发育的整个过程。此外,对28个microRNA与30个靶基因进行荧光定量PCR验证发现,microRNA和靶基因的表达趋势与测序结果基本一致。本研究通过对花生荚果不同发育时期的果壳和种子进行small RNA测序,鉴定参与调控花生荚果膨大相关的microRNA,为研究黑暗条件下植物果实发育的调控机制与花生遗传改良奠定理论基础。

关键词：花生荚果发育 small RNA测序 microRNA 靶基因

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中医中药治疗糖尿病200例疗效观察

实用医技杂志 2000年第8期7卷 588-589页

作者：胡冬秀新绛县糖尿病医院 043100

1994年10月至1999年8月,我院采用中药综合治疗糖尿病肢端坏疽,进行了3个月疗效观察,现总结如下。 1.临床资料 30例中,男11例,女19例;年龄最大69岁,最小26岁,平均50岁;糖尿病史10年以上者23例,不足10年者7例;属1型糖尿病者21例。

关键词：糖尿病中医药疗法疗效

花生CONSTANS-Like(COL)家族基因的克隆与表达分析

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中国油料作物学报 2020年第5期42卷 778-786页

作者：胡冬秀刘浩鲁清李海芬方加海梁炫强广东省农业科学院作物研究所国家油料作物改良中心南方分中心广东省农作物遗传改良重点实验室广东广州510640 江西农业大学作物生理生态与遗传育种教育部重点实验室江西南昌330045

开花是植物从营养生长到生殖生长的重要过程,CONSTANS-Like(COL)基因是植物光周期诱导开花途径中的关键转录因子,但是在花生中的具体功能尚不清楚。本研究通过生物信息学的方法对花生COL基因家族成员序列特征、系统进化关系、基因结构... 详细信息

开花是植物从营养生长到生殖生长的重要过程,CONSTANS-Like(COL)基因是植物光周期诱导开花途径中的关键转录因子,但是在花生中的具体功能尚不清楚。本研究通过生物信息学的方法对花生COL基因家族成员序列特征、系统进化关系、基因结构、保守结构域及表达模式进行分析,最终克隆了17个AhCOL基因(AhCOL1-Ah⁃COL17)。花生17个AhCOL基因氨基酸长度范围为327aa^617aa,等电点(pI)均小于7,在蛋白质序列的氮端与碳端均含有保守的BBX和CCT结构域。此外,不同组织中的基因表达模式分析,表明多数AhCOL基因在叶片中的表达量显著高于其他组织。不同时期的表达量分析表明多数AhCOL基因的表达量从苗期到开花期呈现递增。本研究为研究花生AhCOL基因的潜在功能奠定了重要基础。

关键词：花生 CONSTANS-Like 生物信息学基因表达

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倍他乐克对冠心病心力衰竭的治疗观察

湖南师范大学学报（医学版） 2003年第4期5卷 11-12,55页

作者：刘勋秦文勇胡冬秀长沙市芙蓉区医院长沙市曙光医院长沙市410001

目的探讨β-受体阻滞剂在治疗冠心病心力衰竭中的疗效。方法选择冠心病心力衰竭患者36例,在常规应用强心、利尿、扩血管药物治疗基础上,加用β-受体阻滞剂倍他乐克12.5～50mg/d6周,用自身对照比较治疗前后患者心率、血压、心胸比率,左... 详细信息

目的探讨β-受体阻滞剂在治疗冠心病心力衰竭中的疗效。方法选择冠心病心力衰竭患者36例,在常规应用强心、利尿、扩血管药物治疗基础上,加用β-受体阻滞剂倍他乐克12.5～50mg/d6周,用自身对照比较治疗前后患者心率、血压、心胸比率,左心室射血分数的变化,评估其有效性和安全性。结果患者心率减慢、血压降低、心胸比率缩小,左室射血分数增加P<0.01,心功能明显改善。结论在常规抗心衰药物基础上加用β-受体阻滞剂倍他乐克不仅能有效地改善心功能状态,而且能逆转心脏扩大。

关键词：冠心病心力衰竭倍他乐克

花生紫色酸性磷酸酶基因家族的鉴定及表达分析

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中国油料作物学报 2022年第3期44卷 522-531页

作者：杜普旋刘浩胡冬秀陈小平洪彦彬李友国华中农业大学农业微生物学国家重点实验室湖北武汉430070 广东省农业科学院作物研究所国家油料作物改良中心南方分中心广东省农作物遗传改良重点实验室广东广州510640

紫色酸性磷酸酶(purple acid phosphatase,PAP)是一类金属磷酸酯酶,参与植物的磷素利用、碳代谢、细胞壁合成等多种生理功能,尤其是对磷缺乏的适应。本研究利用生物信息学手段在花生(Arachis hypogaea L.)全基因组水平上对PAP基因家族... 详细信息

紫色酸性磷酸酶(purple acid phosphatase,PAP)是一类金属磷酸酯酶,参与植物的磷素利用、碳代谢、细胞壁合成等多种生理功能,尤其是对磷缺乏的适应。本研究利用生物信息学手段在花生(Arachis hypogaea L.)全基因组水平上对PAP基因家族进行了鉴定,并对其系统进化关系、保守结构域、基因结构以及它们在22个组织中的表达模式进行了分析。结果表明:花生基因组中有39个AhPAP基因,氨基酸序列长度为205~905,等电点大多数都小于7,蛋白质C端均含有金属磷酸酶结构域。以花生、拟南芥、水稻、苜蓿共74个PAP蛋白构建的系统发育树可分为四组,每组中都含有来自不同物种的PAP,并没有因为物种差异而各自聚为一类。AhPAP基因家族中部分成员的表达具有组织特异性,arahy.P03NME、***6C在根瘤中表达量最高,而它们在其他组织中表达量较低或未检测到表达。本研究为揭示AhPAP基因家族在花生中的生物学功能奠定了基础。

关键词：花生紫色酸性磷酸酶生物信息学基因家族

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建设“最美图书馆”:学校图书馆的价值重塑与深度应用

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中小学管理 2024年第4期 17-21页

作者：胡冬梅安徽省合肥市望湖小学安徽合肥230051

中小学需要重新发现图书馆的价值,在此基础上建好、用好图书馆。安徽省合肥市望湖小学在十余年的实践中,通过重新确认图书馆的使命、规划图书馆的建设、审视图书馆的应用,将学校图书馆建设成为“最美基层图书馆”。一是明晰学校图书馆... 详细信息

中小学需要重新发现图书馆的价值,在此基础上建好、用好图书馆。安徽省合肥市望湖小学在十余年的实践中,通过重新确认图书馆的使命、规划图书馆的建设、审视图书馆的应用,将学校图书馆建设成为“最美基层图书馆”。一是明晰学校图书馆要为教育教学、学校文化建设和师生生命成长服务的价值使命;二是聚焦空间、馆藏、设备、馆员、义工、服务和推广七个要素,归纳出“七好”图书馆建设模型;三是通过“全阅读课程”的开发实施促进图书馆的深度应用,实现图书馆建设与教书育人的深度融合。

关键词：学校图书馆图书馆建设智慧图书馆全阅读课程图书馆课程

亚洲玉米螟细胞因子生长阻滞肽GBP的免疫调控功能研究

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作者：胡冬春扬州大学

学位级别：硕士

基于注意力感知和模态融合的药物-靶点相互作用预测方法

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太原理工大学学报 2024年

作者：彭杨朱小飞胡冬冬重庆理工大学计算机科学与工程学院

预测药物-靶点相互作用是药物发现的关键步骤。现有的基于图神经网络的预测方法取得了较好的效果，但是仍然存在两方面挑战：一是如何更高效地提取药物和靶点中深层次的特征和丰富的语义信息，二是如何明确地建模并学习药物和靶点之间... 详细信息

预测药物-靶点相互作用是药物发现的关键步骤。现有的基于图神经网络的预测方法取得了较好的效果，但是仍然存在两方面挑战：一是如何更高效地提取药物和靶点中深层次的特征和丰富的语义信息，二是如何明确地建模并学习药物和靶点之间的相互作用，以便更好地预测和解释。为了解决以上问题，本文提出了基于注意力感知和模态融合的药物-靶点相互作用预测方法。对于药物分支，利用Graph Transformer和图卷积神经网络来联合表征药物分子的全局结构和生化信息。对于蛋白质分支，采用了一个独立的编码模块来提取蛋白质的全局和局部特征。为了更准确的建模和学习药物和靶点之间的作用关系，设计了一个基于Transformer的模块来融合药物和靶点特征。最后，在三个公开数据集上的实验结果表明，在主要评价指标上均有所提升，该方法能够更加准确的预测药物和靶点的相互作用。

关键词：药物发现图神经网络模态融合注意力机制