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2020~2022年度上海及其他省市临床实验室HPV6与HPV11型核酸检测室间质量评价结果分析

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现代检验医学杂志 2024年第1期39卷 179-185页

作者：徐幸王国飞杨依绡肖艳群周靖上海市临床检验中心分子生物学室上海200126

目的通过开展人乳头瘤病毒(human papillomavirus,HPV)6型、11型核酸检测室间质量评价(external quality assessment,EQA)计划,来评估实验室检测能力,分析其存在问题,提高检测质量。方法 EQA计划一年两次,样本盘含阳性样本4支,包括HPV6... 详细信息

目的通过开展人乳头瘤病毒(human papillomavirus,HPV)6型、11型核酸检测室间质量评价(external quality assessment,EQA)计划,来评估实验室检测能力,分析其存在问题,提高检测质量。方法 EQA计划一年两次,样本盘含阳性样本4支,包括HPV6,HPV11强阳性、弱阳性各1支,由具有尖锐湿疣(condyloma acuminata,CA)临床表现,HPV6或HPV11阳性患者的宫颈分泌物(上海市第一妇婴保健院提供)制成。阴性样本1支,由C-33A细胞株(中科院购入)培养制成。样本冷链寄送至各参评实验室,要求其在规定时间内检测并上传结果。上海市临床检验中心(以下简称中心)依据回报结果计算各实验室的成绩。结果 6轮EQA活动共计发出样本盘163份,收到有效报告140份。实验室合格率96.43%(135/140),样本符合率97.86%(685/700)。假阴性13个,假阳性2个,弱阳性样本占假阴性结果的76.92%(10/13)。结论实验室HPV6/11型核酸检测准确率比较高,个别实验室弱阳性样本的检出能力有待提高,通过参加EQA计划可及时发现问题并提高检测质量。

关键词：人乳头瘤病毒尖锐湿疣室间质量评价

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高通量测序技术的临床应用及质量管理

中华检验医学杂志 2022年第11期45卷 1099-1103页

作者：鲍芸肖艳群王华梁上海市临床检验中心上海市实验医学研究院上海200126

近年来,随着测序技术、生物信息学分析的迅猛发展,高通量测序(NGS)技术在精准医学中的应用不断深化,主要体现在遗传性疾病诊断、肿瘤基因检测及伴随诊断、感染性疾病检测等方面。相对于传统的临床检验技术,NGS检测步骤繁琐、流程复杂,... 详细信息

近年来,随着测序技术、生物信息学分析的迅猛发展,高通量测序(NGS)技术在精准医学中的应用不断深化,主要体现在遗传性疾病诊断、肿瘤基因检测及伴随诊断、感染性疾病检测等方面。相对于传统的临床检验技术,NGS检测步骤繁琐、流程复杂,对结果分析解读要求高。本文介绍了NGS在遗传病诊断、肿瘤检测及感染性疾病检测方面的临床应用,分析了目前临床应用中存在的问题,对实验室的质量管理提出了一些建议.

关键词：高通量测序临床应用质量管理

11种灭活型样本保存液对病毒核酸保护效果的比较

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病毒学报 2023年第2期39卷 477-483页

作者：史春丽黄中强范晓瑜肖艳群王雪亮上海市临床检验中心分子生物学室上海200126

收集11种不同厂家的灭活型样本保存液,将甲型流感病毒加入保存液和生理盐水中,在4℃、25℃和37℃条件下保存0 h、2 h、4 h、6 h和24 h后,分别提取各组的病毒核酸,并通过逆转录实时荧光PCR检测病毒载量变化,以探究不同样本保存液对病毒... 详细信息

收集11种不同厂家的灭活型样本保存液,将甲型流感病毒加入保存液和生理盐水中,在4℃、25℃和37℃条件下保存0 h、2 h、4 h、6 h和24 h后,分别提取各组的病毒核酸,并通过逆转录实时荧光PCR检测病毒载量变化,以探究不同样本保存液对病毒核酸保护效果是否存在差异。结果发现不同样本保存液中的病毒载量随保存时间和温度变化存在显著差异。据此可将11种灭活型样本保存液的保存效果分为四类:(1)优秀产品:在任一温度(4℃、25℃、37℃)条件下,即使保存24h时病毒核酸都未发生明显降解,占比27.2%(3/11);(2)良好产品:低温(4℃)和室温(25℃)情况下核酸未出现降解,但在高温(37℃)条件下6 h后保存效果明显下降,占比27.2%(3/11);(3)合格产品:低温(4℃)条件下对病毒核酸具有较好的保护效果,但在室温(25℃)和高温(37℃)情况下随保存时间延长其保护效果显著下降,占比18.1%(2/11);(4)不合格产品:任一保存条件下对病毒核酸的保护效果都较差,甚至加入病毒后立即导致病毒核酸发生快速降解,占比27.2%(3/11)。以上结果说明不同厂家样本保存液对病毒核酸的保护效果存在显著差异,可能会导致病毒核酸检测出现假阴性结果。因此,需重点加强对样本保存液的质量监管,以有效保障病毒核酸检测,尤其是新冠核酸检测质量,以更好地做好疫情防控工作。

关键词：样本保存液保护效果甲型流感病毒逆转录实时荧光PCR 新型冠状病毒

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人类基因组结构变异检测方法及其临床应用

临床检验杂志 2023年第5期41卷 355-358页

作者：鲍芸权静肖艳群上海市临床检验中心上海200126

人类基因组结构变异在人类多样性和疾病发生中起着重要作用,许多遗传病都是由染色体结构变异所致。目前临床上对于结构变异检测主要有染色体核型分析、荧光原位杂交等细胞遗传学方法以及拷贝数变异微阵列芯片和拷贝数变异高通量测序等... 详细信息

人类基因组结构变异在人类多样性和疾病发生中起着重要作用,许多遗传病都是由染色体结构变异所致。目前临床上对于结构变异检测主要有染色体核型分析、荧光原位杂交等细胞遗传学方法以及拷贝数变异微阵列芯片和拷贝数变异高通量测序等分子遗传学方法等。该文旨在介绍几种人类基因组结构变异检测方法在临床上的应用进展,分析其局限性,并对未来结构变异的临床检测方向进行了展望。

关键词：基因组结构变异检测方法临床应用

载脂蛋白E基因分型检测室间质量评价计划制定与实施

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检验医学 2022年第10期37卷 989-992页

作者：鲍芸权静张芃胤肖艳群上海市临床检验中心临床细胞分子遗传学研究室上海200126

目的制定并实施载脂蛋白E(ApoE)基因分型检测室间质量评价计划(简称室间质评),评估临床实验室该项目检测水平,提高临床实验室相关项目的检测质量。方法针对ApoE基因的2个单核苷酸多态性(SNP)位点rs429358和rs7412检测制定室间质评(1年2... 详细信息

目的制定并实施载脂蛋白E(ApoE)基因分型检测室间质量评价计划(简称室间质评),评估临床实验室该项目检测水平,提高临床实验室相关项目的检测质量。方法针对ApoE基因的2个单核苷酸多态性(SNP)位点rs429358和rs7412检测制定室间质评(1年2次)计划。将5支室间质评物品随机编号,经冷链运送至各参评实验室,各参评实验室根据SNP检测结果报告ApoE分型结果。对回报结果进行统计分析。结果2次室间质评回报结果全部正确的实验室分别占93.75%(30/32)和100.00%(31/31);室间质评物品检测的总体符合率分别为99.38%(318/320)和100.00%(310/310);基因分型总体符合率分别为97.5%(156/160)和100.00%(155/155)。回报错误结果中包括2例SNP检测错误和4例分型结果判定错误。结论ApoE基因分型检测总体准确率较高,但实验室相关遗传学分析能力有待提高。

关键词：载脂蛋白E 基因检测室间质量评价

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临床分子诊断质量管理问题及思考

中华检验医学杂志 2018年第2期41卷 85-87页

作者：肖艳群王华梁上海市临床检验中心 200126

随着精准医学概念的提出，涉及肿瘤靶向治疗、药物基因组学、出生缺陷等的基因检测在医学实验室普遍开展，下一代测序技术、数字PCR技术也得到及时应用，临床医疗决策对分子诊断的依赖度高，对分子检测结果准确性的要求也达到空前的高... 详细信息

随着精准医学概念的提出，涉及肿瘤靶向治疗、药物基因组学、出生缺陷等的基因检测在医学实验室普遍开展，下一代测序技术、数字PCR技术也得到及时应用，临床医疗决策对分子诊断的依赖度高，对分子检测结果准确性的要求也达到空前的高度。然而随着分子诊断技术不断发展及行业快速扩张，分子诊断的质量问题也随之凸显，其质量管理也面临新的挑战，值得医学实验室及监管部门重视。

关键词：分子诊断技术全面质量管理基因检测

舍曲林联合家庭治疗青少年抑郁障碍的临床研究

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中国当代医药 2022年第1期29卷 95-97页

作者：谢根英肖艳群黄百花江西省吉安市第三人民医院精神科江西吉安343000

目的探讨舍曲林联合家庭治疗青少年抑郁障碍的临床效果。方法选取2020年1月至10月吉安市第三人民医院收治的80例青少年抑郁障碍患者作为研究对象,采用数字奇偶法将其分为联合组和单一组,每组各40例。联合组患者采用舍曲林+家庭治疗方式... 详细信息

目的探讨舍曲林联合家庭治疗青少年抑郁障碍的临床效果。方法选取2020年1月至10月吉安市第三人民医院收治的80例青少年抑郁障碍患者作为研究对象,采用数字奇偶法将其分为联合组和单一组,每组各40例。联合组患者采用舍曲林+家庭治疗方式干预,单一组患者采用舍曲林药物干预。比较两组患者的简易应对方式问卷(SCSQ)评分、汉密顿抑郁量表(HAMD)评分。结果治疗前,联合组患者的积极应对方式评分[(1.75±0.61)分]、消极应对方式评分[(2.70±0.56)分]与单一组[(1.77±0.63)、(2.75±0.57)分]比较,差异无统计学意义(P>0.05);治疗后,联合组患者的积极应对方式评分[(2.25±0.45)分]高于单一组[(1.95±0.53)分],消极应对方式评分[(1.85±0.61)分]低于单一组[(2.71±0.43)分],差异有统计学意义(P0.05);治疗后,联合组患者的HAMD评分[(8.52±1.11)分]低于单一组[(13.45±1.99)分],差异有统计学意义(P<0.05)。结论舍曲林+家庭治疗方式联合运用,可显著改善青少年抑郁障碍患者的积极应对方式以及消极应对方式,改善抑郁。

关键词：舍曲林家庭治疗青少年抑郁障碍简易应对方式问卷评分汉密顿抑郁量表评分

上海地区血液EGFR基因突变检测室间质量评价回顾分析

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分子诊断与治疗杂志 2022年第12期14卷 2031-2035页

作者：范晓瑜史春丽肖艳群王雪亮上海市临床检验中心分子生物学室上海200126

目的利用室间质量评价(EQA)分析上海地区临床实验室血液表皮生长因子受体(EGFR)基因突变项目的检测能力。方法选用含有特定EGFR突变位点的肿瘤细胞系,通过超声断裂基因组DNA制备可人工模拟游离DNA(cell⁃free DNA,cfDNA)的基因片段,经片... 详细信息

目的利用室间质量评价(EQA)分析上海地区临床实验室血液表皮生长因子受体(EGFR)基因突变项目的检测能力。方法选用含有特定EGFR突变位点的肿瘤细胞系,通过超声断裂基因组DNA制备可人工模拟游离DNA(cell⁃free DNA,cfDNA)的基因片段,经片段长度鉴定及突变频率检测后作为EQA样本。选取5份样本随机编号后发送至参评实验室,要求其在规定时间内进行检测并上传结果,依据回报结果综合评价其检测能力。结果2019年至2021年分别收到有效回报结果33、29和27份。参评实验室最常用的方法为ARMS法,分别为66.7%(22/33)、75.9%(22/29)和74.1%(20/27),其次为dPCR法和NGS法,分别为12.1%(4/33)、13.8%(4/29)、14.8%(4/27)和21.2%(7/33)、10.3%(3/29)、11.1%(3/27)。回报结果完全正确的实验室分别为78.8%(26/33)、89.7%(26/29)和96.3%(26/27),成绩不合格实验室分别为9.1%(3/33)、3.4%(1/29)和3.7%(1/27)。样本的整体符合率分别为92.7%(153/165)、97.2%(141/145)和98.5%(133/135)。不符合样本中,假阳性率分别为1.8%(3/165)、1.4%(2/145)和0%(0/135),假阴性率分别为5.5%(9/165)、1.4%(2/145)和1.5%(2/135)。结论上海地区临床实验室血液EGFR基因突变检测整体符合率较高,但个别实验室检测能力尚待提高。此外,临床实验室应通过参加EQA活动以持续改进其检测质量。

关键词：表皮生长因子受体基因突变检测室间质量评价质量改进

上海市及其他地区临床实验室B族链球菌核酸检测室间质量评价分析

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现代检验医学杂志 2023年第3期38卷 204-206,212页

作者：杨依绡肖艳群黄中强鲍芸上海市临床检验中心上海200126

目的通过开展B族链球菌(group B Streptococcus,GBS)核酸检测室间质量评价计划(简称室间质评),评价参评实验室检测能力,分析存在的问题,提高检测质量。方法2021年GBS核酸检测室间质评计划为一年两次,每次质评计划样本盘包含4支由灭活的... 详细信息

目的通过开展B族链球菌(group B Streptococcus,GBS)核酸检测室间质量评价计划(简称室间质评),评价参评实验室检测能力,分析存在的问题,提高检测质量。方法2021年GBS核酸检测室间质评计划为一年两次,每次质评计划样本盘包含4支由灭活的GBS培养液稀释而成的不同浓度阳性样本和1支阴性样本。样本冷链寄送至各参评实验室,并要求其在规定时间内按要求检测并回报结果,依据回报结果计算各实验室成绩,汇总不同样本的总体符合率。结果2021年两次室间质评分别有33家实验室报名参加,收到有效报告31份和32份。所有实验室室间质评成绩均合格,两次结果完全正确的实验室分别有87.10%(27/31)和96.88%(31/32),样本的总体符合率为97.42%(151/155)和99.38%(159/160)。结果汇总中共出现检测错误5例,错误类型集中表现为假阴性。结论各参评实验室GBS核酸检测能力总体较高,个别实验室检测能力尤其是弱阳性样本检测能力有待提高。通过参加室间质评计划能帮助实验室及时发现问题并持续改进以提高检测质量。

关键词： B族链球菌核酸检测室间质量评价