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应用拮抗和ISSR标记鉴定64个金针菇菌株的亲缘关系

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中南农业科技 2024年第1期45卷 16-20页

作者：陈珣肇莹龚娜刘国丽马晓颖肖军辽宁省农业科学院食用菌研究所沈阳110161

以16个野生金针菇(Flammulina velutipes)菌株和48个栽培金针菇菌株为材料,评价不同菌株间体细胞不亲和性,并利用ISSR分子标记检测,从细胞学水平和分子水平对金针菇种质资源进行鉴定和遗传多样性分析,明确其亲缘关系。结果表明,64个金... 详细信息

以16个野生金针菇(Flammulina velutipes)菌株和48个栽培金针菇菌株为材料,评价不同菌株间体细胞不亲和性,并利用ISSR分子标记检测,从细胞学水平和分子水平对金针菇种质资源进行鉴定和遗传多样性分析,明确其亲缘关系。结果表明,64个金针菇菌株基于拮抗试验划分为7个类群,基于ISSR聚类分析划分为5个类群;栽培金针菇菌株之间亲缘关系普遍较近,野生金针菇菌株与栽培金针菇菌株大多具有较远的亲缘性;32号栽培菌株和49号野生菌株可以优先选作金针菇杂交育种亲本。

关键词：金针菇(Flammulina velutipes) 体细胞不亲和性 ISSR分子标记拮抗试验聚类分析亲缘关系

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滑菇种质资源评价及遗传多样性分析

辽宁农业科学 2024年第2期 1-8页

作者：肇莹马晓颖陈珣龚娜刘国丽肖军辽宁省农业科学院辽宁沈阳110161

以26株滑菇菌株为试验材料,采用ISSR分子标记技术,利用筛选到的11条ISSR-PCR反应引物从细胞学水平和分子水平对滑菇的种质资源进行亲缘关系研究,同时对9种滑菇的表型性状进行了相关性分析、主成分分析及聚类分析。研究结果表明,26株供... 详细信息

以26株滑菇菌株为试验材料,采用ISSR分子标记技术,利用筛选到的11条ISSR-PCR反应引物从细胞学水平和分子水平对滑菇的种质资源进行亲缘关系研究,同时对9种滑菇的表型性状进行了相关性分析、主成分分析及聚类分析。研究结果表明,26株供试菌种相似水平在0.76时,聚类分析划分为5个类群。农艺学表型相关性分析表明,各表型性状间的相关系数中达到显著或极显著的性状有6组,说明大部分表型性状间相互影响。主成分分析结果表明,前5个主成分累计贡献率为87.366%,表明这5个主成分能够反映滑菇的9种表型性状的基本特征。从特征值和贡献率来看,菌柄长度、菌菇颜色、菇蕾数量、产量和菌盖厚度是引起滑菇种质表型差异的主要因素。种质资源表型性状分析结果表明,在遗传距离为10时,26份滑菇种质可聚为5个类群。研究结果将为进一步开发利用奠定基础,以期为滑菇菌株新品种选育、优质种源筛选提供依据。

关键词：滑菇 ISSR 聚类分析农艺学表型

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野生蛹虫草分化株子实体表型性状的分离

园艺学报 2022年第11期49卷 2449-2454页

作者：肖军陈珣肇莹马晓颖龚娜刘国丽辽宁省农业科学院食用菌研究所沈阳110161

对采集于辽宁西丰、辽宁大石桥的3株(C5、D1、D5)野生蛹虫草后代6个分化株(C5-1、C5-2、D1-1、D1-2、D5-1、D5-2)进行菌落形态、农艺性状、营养成分对比,并利用ISSR分子标记技术进行遗传差异性分析。结果表明,来源于同一株野生蛹虫草子... 详细信息

对采集于辽宁西丰、辽宁大石桥的3株(C5、D1、D5)野生蛹虫草后代6个分化株(C5-1、C5-2、D1-1、D1-2、D5-1、D5-2)进行菌落形态、农艺性状、营养成分对比,并利用ISSR分子标记技术进行遗传差异性分析。结果表明,来源于同一株野生蛹虫草子实体的分化株菌落生长速度、子实体高度、子实体密度多数有显著差异。ISSR标记分析表明同一株野生蛹虫草的分化株D1-1与D1-2、D5-1与D5-2基因型差异较大。来源于同一株野生蛹虫草的分化株虫草素、腺苷含量差异显著。

关键词：蛹虫草表型性状虫草素腺苷分化株

基于LPS炎症模型探究鲍姆纤孔菌(Sanghuangporus baumi)菌丝多糖对巨噬细胞RAW264.7的免疫调节作用

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食品工业科技 2023年第20期44卷 407-413页

作者：马晓颖肖军龚娜刘国丽陈珣杨涛姚澜李长田肇莹辽宁省农业科学院食用菌研究所辽宁省食用菌优质栽培重点实验室辽宁沈阳110161 吉林农业大学食药用菌教育部工程研究中心吉林长春130118

鲍姆纤孔菌(Sanghuangporus baumi)是一种药用真菌,具有很高的活性,本文研究在脂多糖(LPS)诱导下鲍姆纤孔菌菌丝多糖对巨噬细胞RAW264.7的免疫调节作用。以鲍姆纤孔菌菌丝多糖(SJ)为研究对象,利用脂多糖(LPS)诱导的巨噬细胞RAW264.7建... 详细信息

鲍姆纤孔菌(Sanghuangporus baumi)是一种药用真菌,具有很高的活性,本文研究在脂多糖(LPS)诱导下鲍姆纤孔菌菌丝多糖对巨噬细胞RAW264.7的免疫调节作用。以鲍姆纤孔菌菌丝多糖(SJ)为研究对象,利用脂多糖(LPS)诱导的巨噬细胞RAW264.7建立炎症模型,实验分为空白对照组,LPS模型组,SJ处理组(SJ+LPS),采用Cell Counting Kit-8(CCK8)法检测SJ对巨噬细胞RAW264.7的增殖作用;利用酶联免疫(ELISA)法测定SJ对巨噬细胞RAW264.7一氧化氮(NO)、白介素-6(IL-6)、白介素-1β(IL-1β)和肿瘤坏死因子-α(TNF-α)细胞因子分泌量的影响。此外,采用免疫印迹(Western-Blot)技术,研究SJ对RAW 264.7细胞生成IL-6、TNF-α、IL-1β和iNOS蛋白能力的影响。结果表明,不同浓度的SJ处理后巨噬细胞的活力与对照组相比分别增加了20.5%~50%;ELISA法结果表明:200μg/mL组的SJ极显著(P<0.001)抑制在炎症模型下巨噬细胞RAW264.7产NO的能力,比LPS模型组巨噬细胞NO、TNF-α、IL-6和IL-β分泌量分别降低了21.62%、29.99%、35.5%和50.03%。SJ呈剂量依赖的方式极显著(P<0.001)抑制由LPS诱导的促炎介质IL-6、TNF-α、IL-1β和iNOS表达,可减轻LPS引发的炎症反应,且与ELISA法检测到的细胞因子的分泌量变化结果相一致。综上,鲍姆纤孔菌多糖具有良好的免疫调节活性。

关键词：鲍姆纤孔菌脂多糖巨噬细胞细胞因子

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导数平方和准则与SVM参数优化

系统仿真学报 2008年第12期20卷 3150-3154,3159页

作者：肇莹刘红星高敦堂南京大学电了科学与工程系南京江苏210093

支持向量机(SVM)的性能与SVM参数的选择有关。SVM参数的优化需要一个准则。针对核函数选择RBF形式的情况,提出了一个新的SVM参数优化的准则,称作导数平方和准则。与著名的SVM参数优化方法如交叉验证或Radius/Margin Bound准则方法相比,... 详细信息

支持向量机(SVM)的性能与SVM参数的选择有关。SVM参数的优化需要一个准则。针对核函数选择RBF形式的情况,提出了一个新的SVM参数优化的准则,称作导数平方和准则。与著名的SVM参数优化方法如交叉验证或Radius/Margin Bound准则方法相比,利用提出的参数优化准则得到的分类面能够在原空间对样本集"平分秋色",体现了SVM分类器的结构风险最小化的原则,而且算法简单、计算量小、更易于实现。

关键词：准则参数优化支持向量机 RBF核函数

高效毛细管电泳法测定金针菇提取物中β-烟酰胺单核苷酸含量的初步研究

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中国农业科技导报 2023年第2期25卷 220-226页

作者：马晓颖肖军陈珣龚娜刘国丽杨涛肇莹辽宁省农业科学院食用菌研究所辽宁省食用菌优质栽培重点实验室沈阳110161

金针菇既是一种美味食品,又是较好的保健食品,营养成分十分丰富,建立了金针菇提取液中β-烟酰胺单核苷酸(β-nicotinamide mononucleotide,NMN)的高效毛细管电泳(high performance capillary electrophoresis,HPCE-DAD)含量测定方法。... 详细信息

金针菇既是一种美味食品,又是较好的保健食品,营养成分十分丰富,建立了金针菇提取液中β-烟酰胺单核苷酸(β-nicotinamide mononucleotide,NMN)的高效毛细管电泳(high performance capillary electrophoresis,HPCE-DAD)含量测定方法。试验结果表明,检测波长218 nm,运行缓冲液30 mmol·L^(-1)硼砂缓冲液和10 mmol·L^(-1)磷酸二氢钠缓冲液(pH 9.2),分离电压25 kV,进样时间为5 s时,该方法能够检测到金针菇提取液中的β-烟酰胺单核苷酸,检测限为0.17μg·mL^(-1),并在0.03~2.00 mg·mL^(-1)范围内呈较好的线性关系,利用标准曲线获得回归方程y=2E+6x-345.69,R2=0.9994,将金针菇图谱中的相应β-烟酰胺单核苷酸(NMN)峰面积带入回归方程,计算得β-烟酰胺单核苷酸含量为27.57μg·mL^(-1)。方法学考察结果表明β-烟酰胺单核苷酸标准品迁移时间和峰面积相对偏差为0.68%和1.44%;且样品8 h内的迁移时间和峰面积的相对偏差分别为1.26%和2.82%;β-烟酰胺单核苷酸在金针菇样品中的回收率为89%~94%。结果表明该方法适用于金针菇提取液中β-烟酰胺单核苷酸的测定,为食用菌中β-烟酰胺单核苷酸含量的测定提供了新的方法。

关键词：高效毛细管电泳 β-烟酰胺单核苷酸金针菇

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一种三角矩阵特征变换方法

模式识别与人工智能 2007年第5期20卷 619-623页

作者：肇莹刘红星高敦堂南京大学电子科学与工程系南京210093

从特征空间初始基底的优化出发,提出一种特征提取中确定变换矩阵 W_(dxD)的方法,称作三角矩阵特征变换方法.其变换矩阵中的参量个数只是现有方法中的一半左右,极大地减小了计算量.而且该方法支持各种特征变换准则,灵活性好.

关键词：特征提取准则变换矩阵

基于HPCE和多基因联合序列鉴定卵孢长根菇的分类研究

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北方园艺 2022年第18期 117-123页

作者：龚娜马晓颖陈珣刘国丽肇莹肖军辽宁省农业科学院食用菌研究所辽宁沈阳110161

以5株卵孢长根菇菌株为试材,采用ITS和nLSU序列的测定并综合分析,结合GenBank中相关物种序列及菌株的形态学特征,进行卵孢长根菇的分子生物学鉴定,并且采用高效毛细管电泳检测,研究了卵孢长根菇的高效毛细管指纹图谱,通过主成分分析、... 详细信息

以5株卵孢长根菇菌株为试材,采用ITS和nLSU序列的测定并综合分析,结合GenBank中相关物种序列及菌株的形态学特征,进行卵孢长根菇的分子生物学鉴定,并且采用高效毛细管电泳检测,研究了卵孢长根菇的高效毛细管指纹图谱,通过主成分分析、相似度分析和聚类分析,对其进行鉴定和评价,以期探究新的快速准确的鉴定方法解决卵孢长根菇种类繁多,种内分类难度大,命名混乱等问题。结果表明:参试菌株总体亲缘关系较近,均为卵孢长根菇(Oudemansiella raphanipes),Or2、Or5和Or1亲缘关系较近的菌株均不同程度的聚为一支,Or2、Or5和Or1相对于Or4、Or6亲缘关系更近,基于指纹图谱鉴别卵孢长根菇子实体形态的多样性,通过“W”形的三联差异峰作为鉴别卵孢长根菇不同子实体出菇表型的关键指示峰。卵孢长根菇具有丰富的物种多样性,采用HPCE和多基因联合序列的鉴定方法可有效区分不同形态种,为快速筛选优质卵孢长根菇菌株提供参考依据。

关键词：卵孢长根菇毛细管电泳多基因联合分析

转导芦苇总DNA耐盐变异水稻SSH文库的构建及部分基因特异表达

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江苏农业科学 2015年第3期43卷 13-16页

作者：肇莹肖军杨镇杨涛辽宁省农业科学院微生物工程中心辽宁沈阳110161

通过花粉管通道转导芦苇总DNA到水稻辽星1号中,以获得的2个耐盐变异水稻品系H1、H2为材料,对6张叶的水稻幼苗进行0.3%浓度的Na Cl溶液诱导处理24 h。提取经Na Cl溶液诱导后的叶片mRNA,经反转录成cDNA,经过酶解后加接头和2次杂交,构建差... 详细信息

通过花粉管通道转导芦苇总DNA到水稻辽星1号中,以获得的2个耐盐变异水稻品系H1、H2为材料,对6张叶的水稻幼苗进行0.3%浓度的Na Cl溶液诱导处理24 h。提取经Na Cl溶液诱导后的叶片mRNA,经反转录成cDNA,经过酶解后加接头和2次杂交,构建差异表达的抑制消减(SSH)cDNA文库。以Na Cl溶液诱导后的耐盐变异水稻H1、H2的cDNA为检测子(tester),以水稻辽星1号cDNA为驱动子(driver)。所构建的文库容量分别达到了240、281个,表明所构建的文库质量良好。对文库中克隆进行测序分析,在NCBI水稻数据库中进行BLAST比对,获得了15个没有同源性的EST序列,其中9个EST序列功能与植物的抗盐性有关,通过RT-PCR技术进一步验证了芦苇总DNA转导到水稻中,使水稻获得了抗盐性。

关键词：水稻芦苇抑制消减杂交 cDNA文库基因表达