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后基因组时代的蜜蜂QTL研究

昆虫学报 2007年第9期50卷 950-956页

作者：罗阿蓉张彦周丁亮朱朝东中国科学院动物研究所

继果蝇、按蚊和家蚕之后,意大利蜜蜂Apis mellifera(膜翅目:蜜蜂科)成为又一种被完整测得基因组序列的昆虫。从此,蜜蜂研究进入后基因组时代。作为一种典型的社会性昆虫,许多和蜜蜂社会生活紧密相关的性状都是数量性状。这些性状研究中... 详细信息

继果蝇、按蚊和家蚕之后,意大利蜜蜂Apis mellifera(膜翅目:蜜蜂科)成为又一种被完整测得基因组序列的昆虫。从此,蜜蜂研究进入后基因组时代。作为一种典型的社会性昆虫,许多和蜜蜂社会生活紧密相关的性状都是数量性状。这些性状研究中广泛涉及到了数量性状位点(quantitative traits loci,QTL)定位研究。本文综述了应用QTL对蜜蜂取食行为、自卫行为、体长、逆转学习等的研究现状,同时结合国内外最新研究进展,总结并展望了后基因组时代蜜蜂QTL的研究方向。

关键词：蜜蜂基因组 QTL 数量性状基因芯片

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木蜂的巢内行为和交配策略

昆虫学报 2013年第9期56卷 1047-1054页

作者：贺春玲牛泽清罗阿蓉朱朝东吴燕如河南科技大学林学院河南洛阳471003 中国科学院动物研究所动物进化和系统学院重点实验室北京100101

木蜂Xylocopa作为蜜蜂科的一个重要类群,用来研究昆虫社会进化早期阶段具有重要意义。本文综述了近年来木蜂的营巢习性、社会性行为和交配策略的研究进展。木蜂巢的建筑与巢内巢室的分布、巢室的大小、贮备蜂粮的效率和被寄生的敏感性... 详细信息

木蜂Xylocopa作为蜜蜂科的一个重要类群,用来研究昆虫社会进化早期阶段具有重要意义。本文综述了近年来木蜂的营巢习性、社会性行为和交配策略的研究进展。木蜂巢的建筑与巢内巢室的分布、巢室的大小、贮备蜂粮的效率和被寄生的敏感性等均有一定的关系。在筑巢地点,随着木蜂种群数量的增加,同种雌蜂之间的资源存在着竞争,木蜂对巢室的守卫加强,更多地表现为对同种雌蜂的守卫以及防御其他的天敌入侵。其社会多态性由独栖性向社会性演化,主要表现为独栖性、亚社会性、半社会性、共生性和准社会性等方式,甚至同一种群内会出现不同的社会性行为。在交配策略上,木蜂的雄蜂在外部形态特征上具有适应交配和寻找雌蜂的进化特征,并且具有复杂的领地行为。这些研究理论对于我们深刻理解木蜂的行为生物学具有重要意义,同时也有助于进行更深层次的社会性蜂类演化进程的探索。

关键词：木蜂社会性行为巢内行为社会多态性交配策略领地行为

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蛋白质折叠结构中所蕴涵的热力学原理

陕西师范大学继续教育学报 2005年第3期22卷 111-113页

作者：张颖罗阿蓉陕西师范大学化学与材料科学学院陕西师范大学生命科学学院西安710062

蛋白质折叠是生命科学领域的前沿课题之一.本文从热力学原理来分析蛋白质折叠结构中的能量和稳定性的因素,利用熵效应和吉布斯自由能的变化初步预测蛋白质可能的折叠结构.

关键词：蛋白质折叠熵效应吉布斯自由能变化

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蛋白质折叠结构中所蕴涵的热力学原理

当代教师教育 2005年第3期 111-113页

作者：张颖,罗阿蓉陕西师范大学化学与材料科学学院陕西师范大学生命科学学院副教授、博士西安710062

蛋白质折叠是生命科学领域的前沿课题之一。本文从热力学原理来分析蛋白质折叠结构中的能量和稳定性的因素,利用熵效应和吉布斯自由能的变化初步预测蛋白质可能的折叠结构。

关键词：蛋白质折叠熵效应吉布斯自由能变化

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DNA条形码在膜翅目昆虫中的应用分析

应用昆虫学报 2013年第1期50卷 19-28页

作者：周青松张同心于芳罗阿蓉牛泽清朱朝东张彦周中国科学院动物研究所动物进化与系统学院重点实验室北京100101 安徽大学生命科学学院合肥230039 宁波市林特科技推广中心宁波315012

DNA条形码的提出,实现了分类学的一次质的飞跃,简便、快捷以及精确的优点使其被广泛应用在物种的分类工作中。膜翅目为昆虫纲的第3大目,其物种具有高度的多样性,种类鉴定工作复杂艰巨。DNA条形码在膜翅目中得到广泛应用。本文针对DNA条... 详细信息

DNA条形码的提出,实现了分类学的一次质的飞跃,简便、快捷以及精确的优点使其被广泛应用在物种的分类工作中。膜翅目为昆虫纲的第3大目,其物种具有高度的多样性,种类鉴定工作复杂艰巨。DNA条形码在膜翅目中得到广泛应用。本文针对DNA条形码在膜翅目昆虫的物种分类鉴定、物种发现和隐存种、食物网与生物多样性等方面研究情况予以综述。

关键词：膜翅目 DNA条形码物种鉴定物种多样性

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壁蜂授粉存在的问题与展望

应用昆虫学报 2022年第6期59卷 1215-1222页

作者：石晓宇邹怡罗阿蓉牛泽清朱朝东中国科学院动物研究所动物进化与系统学院重点实验室北京100101 中国科学院大学生命科学学院北京100049 西交利物浦大学苏州215123

壁蜂Osmia spp.的授粉服务功能在全球农作物生产中发挥着重要的作用,但我们对其授粉效率和应用过程中的影响因素的基础研究仍然十分有限。农业景观会影响壁蜂授粉的表现。在不同的农业景观内,当地与目标作物同时开花的野生植物、当地传... 详细信息

壁蜂Osmia spp.的授粉服务功能在全球农作物生产中发挥着重要的作用,但我们对其授粉效率和应用过程中的影响因素的基础研究仍然十分有限。农业景观会影响壁蜂授粉的表现。在不同的农业景观内,当地与目标作物同时开花的野生植物、当地传粉昆虫群落、捕食者、拟寄生者和病原体可以增强/削弱壁蜂的授粉表现及壁蜂蜂茧的回收。我们需要评估从壁蜂引入到对当地农业生态系统的潜在影响。引入的壁蜂有可能与本土野生蜂物种竞争筑巢栖息地、筑巢材料和食物,并可能通过帮助入侵植物授粉来促进其扩散。本文综述了利用壁蜂进行授粉存在的潜在问题,并基于四个方面讨论壁蜂应用成本与效益:1)将农业景观纳入壁蜂授粉应用的评估;2)评估壁蜂对当地生态系统的潜在影响;3)评估壁蜂的授粉价值;4)对比壁蜂与蜜蜂的授粉效果,旨在指导农民在不同的农业景观内使用壁蜂进行授粉。

关键词：壁蜂农作物授粉罩笼实验农业景观蜜蜂授粉

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大黄鱼Cspg4基因的表达调控

集美大学学报:自然科学版 2023年第4期28卷 298-308页

作者：罗阿蓉李完波王志勇集美大学水产学院、农业农村部东海海水健康养殖重点实验室福建厦门361021

从大黄鱼脾脏eQTL数据库中,筛选出调控免疫相关靶基因Cspg4的顺式作用区eQTL,通过Sanger测序验证了该eQTL区域中最显著的SNP位点的基因型。在此基础上,通过构建候选启动子区不同长度缺失片段的重组质粒测定活性,确定了Cspg4基因启动子... 详细信息

从大黄鱼脾脏eQTL数据库中,筛选出调控免疫相关靶基因Cspg4的顺式作用区eQTL,通过Sanger测序验证了该eQTL区域中最显著的SNP位点的基因型。在此基础上,通过构建候选启动子区不同长度缺失片段的重组质粒测定活性,确定了Cspg4基因启动子核心区为-1202~-762和-190~+20,而携带Chr17_13952653突变位点的两种单倍型调控序列的活性均显著低于对照组,提示该调控序列可能为沉默子。

关键词：大黄鱼 Cspg4 表达调控沉默子

BLASTALIGN在同源基因片段检索中的应用

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动物分类学报 2007年第4期32卷 861-864页

作者：罗阿蓉史卫峰张彦周周宏宇乔慧杰朱朝东中国科学院动物研究所泰山医学院山东泰安271000

多序列比对程序的开发在生物信息学中是一个很活跃的研究领域。作为一种新诞生的多序列比对程序,BlastAlign利用blastn算法进行序列比对,并且采用空位替代比对结果中的高变区。目前,该程序主要用于多条基因序列的比对研究。本文则以获... 详细信息

多序列比对程序的开发在生物信息学中是一个很活跃的研究领域。作为一种新诞生的多序列比对程序,BlastAlign利用blastn算法进行序列比对,并且采用空位替代比对结果中的高变区。目前,该程序主要用于多条基因序列的比对研究。本文则以获取膜翅目小蜂总科28SrDNAD2区基因片段为例,通过应用BlastAlign的序列比对过程,提供一种较为简便和有效的方法,实现从GenBank数据库中检索并筛选特定的同源基因序列,从而克服目前利用关键词或检索式进行检索所存在的局限性。

关键词： BlastAlign GenBank 小蜂总科 28S rDNA D2区

不同试剂盒对传粉昆虫携带混合花粉DNA提取效果比较

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应用昆虫学报 2022年第6期59卷 1336-1346页

作者：李月魏玮刘文平赵凯旋周泽扬朱朝东罗阿蓉黄敦元农业农村部长江上游传粉昆虫资源保护与利用重点实验室(部省共建) 重庆师范大学生命科学学院重庆401331 中国科学院动物研究所北京100101

【目的】传粉昆虫所携带花粉的准确鉴定是构建传粉网络的重要环节。本研究通过比较不同植物试剂盒在微量混合花粉DNA提取中的差异,以阐明不同试剂盒的提取效果,并明确满足DNA提取的混合花粉最低需求量。【方法】将不同地区中华蜜蜂Apis ... 详细信息

【目的】传粉昆虫所携带花粉的准确鉴定是构建传粉网络的重要环节。本研究通过比较不同植物试剂盒在微量混合花粉DNA提取中的差异,以阐明不同试剂盒的提取效果,并明确满足DNA提取的混合花粉最低需求量。【方法】将不同地区中华蜜蜂Apis cerana cerana、凹唇壁蜂Osmia excavata和白斑切叶蜂Amegachilestrupigera体表携带的花粉进行混合。利用上海生工磁珠法植物基因组DNA抽提试剂盒(CZ)、北京BioTeke(百泰克)离心柱型微量样品基因组DNA提取试剂盒(BT)、美国Omega E.Z.N.A.?MicroElute基因组DNA提取试剂盒(EZ)、北京天根微量样品基因组DNA提取试剂盒(TG)及江苏吉锐Genloci?TNA抽提试剂盒(GL)提取混合花粉DNA。基于ITS2宏条形码技术获取测序数据,通过方差、线性判别和层次聚类分析,比较5种试剂盒提取效果。最后,调整试剂盒BT的提取方法,降低混合花粉的需求量。【结果】试剂盒TG与GL提取混合花粉DNA浓度较高,试剂盒CZ、BT和EZ提取混合花粉DNA浓度较低,前者浓度约为后者的5-15倍。试剂盒EZ和TG提取混合花粉样品的DNA纯度与其它试剂盒存在显著差异。5种试剂盒检测到植物种类分别为(143±12)(CZ)、(167±8)(BT)、(160±10)(EZ)、(160±6)(TG)和(161±16)种(GL),且不同试剂盒在目、科和属水平上具有显著提取优势的植物,部分植物只能由特定试剂盒提取到DNA模板。此外,试剂盒BT通过花粉所鉴定的植物种类最多,且能提取到合格DNA模板的最低混合花粉质量为0.02mg。【结论】不同试剂盒提取微量混合花粉效果不同且各有优势,混合花粉质量最低可以降至0.02 mg。本研究为选择提取微量混合花粉DNA试剂盒继而用于传粉网络研究提供参考。

关键词：传粉昆虫混合花粉粉源植物 DNA试剂盒 DNA宏条形码