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高邮鸭MyoD1 SNP位点变异与胸肌发育性状的关联分析

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华北农学报 2016年第S1期31卷 470-474页

作者：朱春红陶志云宋卫涛徐文娟章双杰刘宏祥李慧芳江苏省家禽科学研究所江苏扬州225125

为筛选重要地方鸭品种——高邮鸭早期肌肉生长标记,利用连接酶检测反应,以高邮鸭群体为研究对象,筛选肌分化因子基因Myo D1第一内含子区域的SNP位点,以期获得高邮鸭早期生长分子标记。筛选获得Myo D1基因第一内含子区的位点突变T→A,检... 详细信息

为筛选重要地方鸭品种——高邮鸭早期肌肉生长标记,利用连接酶检测反应,以高邮鸭群体为研究对象,筛选肌分化因子基因Myo D1第一内含子区域的SNP位点,以期获得高邮鸭早期生长分子标记。筛选获得Myo D1基因第一内含子区的位点突变T→A,检测到AA,TA和TT 3种基因型,其中AA和TA是优势基因型,处于Hardy-Weinberg平衡状态。关联分析结果表明TA基因型群体在49日龄的体重、胸肌重、胸肌横截面积、胸肌纤维直径以及胸肌纤维密度均显著高于AA、TT基因型群体(P0.05)。相较于传统育种,分子标记辅助育种具有快速、精准的优点。结果预示TA基因型可作为高邮鸭胸肌早期选择的分子标记。

关键词：高邮鸭 Myo D1基因多态性胸肌

鸭胚胎发育中后期胸肌发育阻滞的RNA-seq分析

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中国农业科学 2018年第22期51卷 4373-4386页

作者：刘宏祥徐文娟朱春红陶志云宋卫涛章双杰李慧芳江苏省家禽科学研究所

【目的】选择两个中国地方品种高邮鸭和金定鸭,对鸭胚胎发育中后期胸肌进行转录组分析研究,旨在探明胸肌发育阻滞的分子变化机制,为鸭骨骼肌调控机理研究打下基础。【方法】在21胚龄和27胚龄两个时间点,分别解剖高邮鸭、金定鸭各3只,采... 详细信息

【目的】选择两个中国地方品种高邮鸭和金定鸭,对鸭胚胎发育中后期胸肌进行转录组分析研究,旨在探明胸肌发育阻滞的分子变化机制,为鸭骨骼肌调控机理研究打下基础。【方法】在21胚龄和27胚龄两个时间点,分别解剖高邮鸭、金定鸭各3只,采集胸大肌,提取总RNA构建文库,利用Illumina的HiseqTM2000进行高通量测序,并利用生物信息学方法进行差异表达基因挖掘、基因功能注释等分析,探讨21胚龄和27胚龄两个时间点之间胸肌发育阻滞的分子机制。【结果】高邮鸭、金定鸭21胚龄和27胚龄胸大肌组织RNA-seq质量Q20均在94%以上,Q30均在89%以上,测序得到的结果可靠,可用于后续分析。RNA水平相关性检查和基因mRNA表达量聚类图结果都表明,21胚龄(27胚龄)高邮鸭和金定鸭之间表达模式的相关性高于高邮鸭(金定鸭)21胚龄和27胚龄之间的表达模式。不同品种内时间点之间的差异基因数量(高邮鸭6 128个,金定鸭6 452个)远多于同一时间点不同品种间的差异基因数量(21胚龄522个,27胚龄299个)。qRT-PCR验证试验结果与RNA-seq分析结果相关性较强。通过GO和KEGG富集分析发现,高邮鸭、金定鸭胸肌在21胚龄到27胚龄阶段,能量代谢相关基因(主要为辅酶Q相关基因、ATP酶合成相关基因和细胞色素C相关基因)均显著上调,DNA复制和细胞周期相关基因(主要为微型染色体维持蛋白(MCM)相关基因、复制因子C(RFC)相关基因)均显著下调。相关基因表达的变化可能与此阶段成肌细胞增殖速度减慢,逐渐退出细胞周期开始准备下一阶段融合成多核肌管并形成肌纤维有关。对肌肉生长发育相关的关键基因分析发现,促进肌肉生长的IGF1和诱导成肌细胞末端分化的MyoG显著下调,促进肌纤维分化融合的MUSTN1基因、诱导肌祖细胞向成肌细胞转化的MyoD1基因显著上调。【结论】鸭胚胎中后期胸肌发育过程中大量基因差异表达。其中能量代谢相关基因的上调和DNA复制、细胞周期相关基因的下调,以及肌肉发育相关基因MUSTN1显著上调,IGF1、MyoG等显著下调,可能与鸭胚胎中后期胸肌发育阻滞现象密切相关。

关键词：鸭胸肌发育转录组测序差异表达基因

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漳州斗鸡群体遗传多样性研究

中国家禽 2004年第Z1期26卷 155-157页

作者：汤青萍陈宽维章双杰李慧芳屠云洁赵东伟中国农科院家禽研究所江苏扬州225003

漳州斗鸡为中国斗鸡种的名品,由于长期缺乏有效的保种措施,已面临退化和血缘混杂的危险。为摸清现存漳州斗鸡的遗传结构,我们选用30个微卫星位点,结合聚丙烯酰胺凝胶电泳进行遗传多样性分析,结果表明,共检测到135个等位基因,平均达4.633... 详细信息

漳州斗鸡为中国斗鸡种的名品,由于长期缺乏有效的保种措施,已面临退化和血缘混杂的危险。为摸清现存漳州斗鸡的遗传结构,我们选用30个微卫星位点,结合聚丙烯酰胺凝胶电泳进行遗传多样性分析,结果表明,共检测到135个等位基因,平均达4.633个,基因杂合度为0.953,非常高,说明该品种的遗传一致性很差,平均多态信息含量为0.586,说明漳州斗鸡微卫星位点多态性丰富,变异程度高,也解释了漳州斗鸡体型外貌多样,生产性能不均的群体遗传特性。漳州斗鸡的保护已刻不容缓。

关键词：漳州斗鸡微卫星遗传

江西4个地方鹅品种遗传多样性的微卫星标记分析

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扬州大学学报（农业与生命科学版） 2006年第1期27卷 33-37页

作者：屠云洁陈宽维汤青萍章双杰高玉时中国农业科学院家禽研究所江苏扬州225003

通过选用31个多态性较好的微卫星标记，检测江西4个地方鹅品种的遗传多样性。利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度（H）、多态信息含量（PIC）和群体间的遗传距离（DA）。结果表明：31个微卫星位点中有25个微卫星位点在4个鹅... 详细信息

通过选用31个多态性较好的微卫星标记，检测江西4个地方鹅品种的遗传多样性。利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度（H）、多态信息含量（PIC）和群体间的遗传距离（DA）。结果表明：31个微卫星位点中有25个微卫星位点在4个鹅群体中的多态信息含量均为中度多态，可作为有效的遗传标记用于各鹅品种的遗传多样性和系统发生关系的分析；4个鹅品种的杂合度都较高，平均杂合度为0．5846～0．6434，其中最高的是广丰白翎鹅（06434），最低的是莲花白鹅。而且杂合度的高低与PIC值的大小表现出较高的一致性。用Dh的UPGMA法进行聚类分析，结果4个鹅品种被聚为3类，莲花白鹅与丰城灰鹅聚为第1类，广丰白翎鹅自聚为第2类，兴国灰鹅自聚为第3类。

关键词：鹅微卫星遗传多样性

应用微卫星标记对12个中国地方乌骨鸡品种遗传多样性的研究

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畜牧兽医学报 2005年第8期36卷 755-760页

作者：汤青萍陈宽维李慧芳章双杰赵东伟中国农业科学院家禽研究所扬州225003

利用27个微卫星DNA标记对12个地方乌骨鸡品种进行遗传多样性分析,通过计算等位基因频率、多态信息含量、杂合度、有效等位基因数和遗传距离,评估各品种内遗传变异和各品种间遗传相关,并根据遗传距离对12个鸡品种进行了聚类分析。结果表... 详细信息

利用27个微卫星DNA标记对12个地方乌骨鸡品种进行遗传多样性分析,通过计算等位基因频率、多态信息含量、杂合度、有效等位基因数和遗传距离,评估各品种内遗传变异和各品种间遗传相关,并根据遗传距离对12个鸡品种进行了聚类分析。结果表明,各乌骨鸡群体的遗传多样性较为丰富,并具有较高的选择潜力。平均杂合度最高的是竹乡鸡,为0.670;最低的是江山乌骨鸡,为0.581。27个微卫星标记中4个为中度多态座位,1个低度多态座位,22个为高度多态座位;LEI0234与LEI0192分别检测到了10.3与12.2个等位基因。以标准遗传距离为准,遗传距离最近的为沐川乌骨鸡与略阳鸡,为0.1002,而乌蒙乌骨鸡与略阳鸡最远,为0.2546。通过UPG-MA法聚类后,略阳鸡、沐川乌骨鸡、兴文乌骨鸡、盐津乌骨鸡、竹乡鸡首先聚为1类,江山乌骨鸡、郧阳白羽乌鸡、余干乌骨鸡聚为1类;金湖乌凤鸡、丝绒乌骨鸡和丝毛乌骨鸡聚为第3类;乌蒙乌骨鸡独为一类。

关键词：乌骨鸡微卫星遗传多样性聚类分析

笼养和平养条件下鹅蛋表面微生物的检测与分析

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中国家禽 2016年第2期38卷 50-52页

作者：陶志云胡艳陆火林谈为忠徐国银章双杰汤青萍江苏省家禽科学研究所江苏扬州225125 太湖鹅资源国家级保种场江苏苏州215111

为探索种鹅笼养的可行性,以菌落总数、乳酸菌数、肠杆菌数及沙门菌数为主要检测指标,分别对笼养和平养条件下种鹅所产鲜鹅蛋表面微生物进行测定,以评价种鹅笼养和平养条件下种蛋表面微生物污染情况。结果表明:笼养组和平养组的菌落总数... 详细信息

为探索种鹅笼养的可行性,以菌落总数、乳酸菌数、肠杆菌数及沙门菌数为主要检测指标,分别对笼养和平养条件下种鹅所产鲜鹅蛋表面微生物进行测定,以评价种鹅笼养和平养条件下种蛋表面微生物污染情况。结果表明:笼养组和平养组的菌落总数、乳酸菌数、肠杆菌数及沙门菌数差异不显著。两组鹅蛋表面微生物的污染率均为100%,污染程度均为8个数量级,其中约40%左右为乳酸菌;肠杆菌的污染程度为6个数量级,两组肠杆菌的带菌率分别为92%和96%,占总菌落数的0.3%左右;在两组中均未检测到沙门菌。

关键词：鹅蛋笼养平养菌落总数乳酸菌数肠杆菌沙门菌

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禽蛋中胆固醇含量快速测定方法研究

中国家禽 2008年第21期30卷 13-15页

作者：章双杰陆俊贤高玉时施祖灏刘学贤陈宽维中国农业科学院家禽研究所江苏扬州225003

本文建立了一种禽蛋中胆固醇含量快速测定方法——酶催化分光光度法。禽蛋匀浆液由直接皂化法处理,经酶工作液催化后,照分光光度法于500nm测定其含量。该方法回收率均在90%以上,变异系数均低于4%,线性范围20～600mg/mL,具有良好的准确... 详细信息

本文建立了一种禽蛋中胆固醇含量快速测定方法——酶催化分光光度法。禽蛋匀浆液由直接皂化法处理,经酶工作液催化后,照分光光度法于500nm测定其含量。该方法回收率均在90%以上,变异系数均低于4%,线性范围20～600mg/mL,具有良好的准确度与精密度。适合禽蛋中胆固醇含量的快速测定。

关键词：酶催化分光光度法胆固醇禽蛋

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笼养应激对鹅血液生化指标的影响

中国家禽 2015年第16期37卷 54-56页

作者：汤青萍章双杰陆火林谈为忠徐国银胡艳邹剑敏江苏省家禽科学研究所江苏扬州225003 太湖鹅资源国家级保种场江苏苏州215111

为评价笼养应激对鹅产生的影响,选取160日龄太湖鹅100只随机分为两组,笼养为试验组,水面平养为对照组,观察其行为和血液生化指标的变化。结果显示:种鹅上笼后表现出极度的恐惧与不安,饮水采食减少;笼养组谷草转氨酶(AST)、乳酸脱氢酶(L... 详细信息

为评价笼养应激对鹅产生的影响,选取160日龄太湖鹅100只随机分为两组,笼养为试验组,水面平养为对照组,观察其行为和血液生化指标的变化。结果显示:种鹅上笼后表现出极度的恐惧与不安,饮水采食减少;笼养组谷草转氨酶(AST)、乳酸脱氢酶(LDH)、Ca2+水平显著高于平养组,肌酸激酶(CK)活性极显著高于平养组,而谷丙转氨酸(ALT)活性显著低于平养组,其余指标没有显著差异,提示笼养应激对鹅心肌、肝脏造成了损伤。蛋白代谢未观察到明显的变化。笼养公鹅的总蛋白(TP)、白蛋白(ALB)含量显著低于母鹅,而尿素(UREA)含量显著高于母鹅;笼养组公鹅LDH活性显著高于平养组公鹅(P=0.020),笼养组母鹅UREA含量显著低于平养组母鹅(P=0.022);提示笼养对公鹅的刺激要比母鹅强,公鹅蛋白质代谢强于母鹅,肝脏受损可能比母鹅严重。

关键词：笼养应激血液指标鹅

肌肉生成抑制素基因多态性与鹅肌内脂肪沉积的相关性浅析

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肌肉生成抑制素基因多态性与鹅肌内脂肪沉积的相关性浅析