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济宁市一起学校聚集感染乙型流感病毒Victoria系全基因组测序分析

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中国预防医学杂志 2022年第7期23卷 503-508页

作者：刘甜甜吴长静孔政张崇江亚娟窦慧馨焦伯延济宁市疾病预防控制中心学校卫生科山东济宁272000 济宁市疾病预防控制中心检验科曲阜市疾病预防控制中心传染病防治科

目的分析2021年5月济宁市一起学校聚集感染乙型流感病毒(Influenza B virus,FluB)Victoria系(BV系)聚集疫情的流行病学特点和全基因组特征,为疫情防控提供参考依据。方法对病例进行现场流行病学调查,采集咽拭子样本进行病毒核酸检测和... 详细信息

目的分析2021年5月济宁市一起学校聚集感染乙型流感病毒(Influenza B virus,FluB)Victoria系(BV系)聚集疫情的流行病学特点和全基因组特征,为疫情防控提供参考依据。方法对病例进行现场流行病学调查,采集咽拭子样本进行病毒核酸检测和细胞培养,对培养毒株进行全基因组测序,利用生物信息学软件分析进化变异特征。结果本次学校流感聚集疫情报告病例29例,班级罹患率为69.05%(29/42);核酸检测BV系阳性率为77.78%(14/18),培养毒株9株。同疫苗株B/Washington/02/2019相比,9株毒株8个节段核苷酸相似性为98.33%~99.74%。9株毒株HA基因序列在进化树上属于1A分支。血凝素抗原决定簇3个氨基酸发生置换,神经氨酸酶抑制剂耐药位点和酸性聚合酶抑制剂耐药位点均未发生变异。HA丢失位于抗原决定簇的N197糖基化位点,NS1丢失N107糖基化位点。多个蛋白的磷酸化位点发生改变。结论引起本次学校聚集疫情的病原体是BV系,应加强对学校流感样病例聚集疫情监测。

关键词：乙型流感病毒 Victoria系聚集疫情全基因组学校

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酒精性肝病分子发病机制研究进展

基因组学与应用生物学 2016年第7期35卷 1643-1647页

作者：窦慧馨张得钧青海大学省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室西宁810016 青海大学生态环境工程学院西宁810016

在历史悠久的中国酒文化的熏陶下,我国作为酒精的消费大国,消费人群多年居高不下,研究表明适量摄入酒精对健康没有损害,但长期大量的饮酒会造成神经系统、消化系统的严重损害。有研究显示超过4年,肝硬化叠加酒精性肝炎患者死亡率大于60%... 详细信息

在历史悠久的中国酒文化的熏陶下,我国作为酒精的消费大国,消费人群多年居高不下,研究表明适量摄入酒精对健康没有损害,但长期大量的饮酒会造成神经系统、消化系统的严重损害。有研究显示超过4年,肝硬化叠加酒精性肝炎患者死亡率大于60%,且在患病的第一个月发生大部分死亡。因此,我们可以预见这种疾病是比许多常见类型的癌症(例如:乳腺癌,前列腺癌和结肠癌)更不祥。此外,ALD患者承担着医疗费用的经济负担。不幸的是,食品和药物管理局批准仍没有对ALD的任何阶段的或广泛有效的药物疗法。因此,我们迫切需要更详细的了解肝损伤的机制。酒精性肝病的发病机制十分复杂,多种器官系统、物质代谢、反应过程、信号转导通路、细胞因子参与其中。本研究对ALD分子发病机制进行综述。

关键词：酒精性肝病氧化应激脂质过氧化细胞因子发病机制

一例境外输入新型冠状病毒奥密克戎BA.2.3突变株的全基因组特征分析

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口岸卫生控制 2023年第2期28卷 10-13,19页

作者：张杨江亚娟王小羽窦慧馨焦伯延济宁市兖州区疾病预防控制中心山东济宁272100 济宁市疾病预防控制中心山东济宁272000

目的分析1例境外输入新型冠状病毒(SARS-CoV-2)奥密克戎BA.2.3突变株的全基因组序列分子特征。方法对1例境外输入SARS-CoV-2感染者进行核酸检测和全基因组测序,利用生物信息学软件进行分型、同源性分析、氨基酸位点变异分析、磷酸化位... 详细信息

目的分析1例境外输入新型冠状病毒(SARS-CoV-2)奥密克戎BA.2.3突变株的全基因组序列分子特征。方法对1例境外输入SARS-CoV-2感染者进行核酸检测和全基因组测序,利用生物信息学软件进行分型、同源性分析、氨基酸位点变异分析、磷酸化位点分析和构建进化树等。结果获得1条长29609 bp的SARS-CoV-2全基因序列,在进化树上位于B.1.1.529进化分支BA.2.3进化小枝。与wuhan-hu-1相比,共发生71个核苷酸位点变异和27个核苷酸位点缺失;62个氨基酸位点发生变异或缺失,其中S蛋白和N蛋白变异或缺失位点最多,分别发生31个和7个。结论加强境外归国人员SARS-CoV-2的核酸检测和全基因组测序,有利于防控由境外输入引起的新型冠状病毒感染暴发。

关键词：境外输入新型冠状病毒奥密克戎全基因序列新型冠状病毒感染

济宁市2021年第一季度流感样病例病原谱特征分析

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中国卫生检验杂志 2022年第7期32卷 811-814页

作者：王玉宁江亚娟窦慧馨范莹莹尹强焦伯延济宁市疾病预防控制中心山东济宁272000

目的了解济宁市2021年第一季度流感样病例中呼吸道病原体分布情况,为临床诊断和治疗提供参考依据。方法采集济宁市2021年第一季度208例流感样病例咽拭子标本,利用QIAstat-Dx全自动多重病原体检测平台检测23种常见呼吸道病原体。结果呼... 详细信息

目的了解济宁市2021年第一季度流感样病例中呼吸道病原体分布情况,为临床诊断和治疗提供参考依据。方法采集济宁市2021年第一季度208例流感样病例咽拭子标本,利用QIAstat-Dx全自动多重病原体检测平台检测23种常见呼吸道病原体。结果呼吸道病原体总检出率为20.67%(43/208),其中混合感染占6.98%(3/43)。病原体以病毒为主,占比97.67%(42/43),其中腺病毒(ADV)、肠道病毒(EV)、副流感病毒1(PIV1)、冠状病毒NL63(NL63)占比最高。不同月份和不同年龄组总检出率不同,其中1月份总检出率最高,为32.00%(24/75);0岁~5岁年龄组总检出率最高,为35.06%(27/77);而不同性别总检出率差异无统计学意义(χ^(2)=1.804,P=0.18)。结论2021年第一季度济宁市呼吸道病原体以ADV、EV、PIV1和NL63为主,应加强呼吸道病原体监测和防控力度,特别是低年龄组人群应当是监测的重点。

关键词：流感样病例呼吸道病原体病毒多重病原体检测

2020年—2021年济宁市禽流感外环境监测结果分析

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中国卫生检验杂志 2022年第23期32卷 2928-2931页

作者：王宪龙江亚娟窦慧馨贾勇健王小羽焦伯延金乡县疾病预防控制中心山东272200 济宁市疾病预防控制中心

目的了解济宁市外环境禽流感病毒分布情况,为禽流感防控提供科学依据。方法 2020年—2021年采集禽流感外环境标本320份,使用实时荧光定量PCR法进行甲型流感病毒检测,阳性标本再进行H5、H7和H9亚型禽流感病毒分型。结果 2020年—2021年... 详细信息

目的了解济宁市外环境禽流感病毒分布情况,为禽流感防控提供科学依据。方法 2020年—2021年采集禽流感外环境标本320份,使用实时荧光定量PCR法进行甲型流感病毒检测,阳性标本再进行H5、H7和H9亚型禽流感病毒分型。结果 2020年—2021年济宁市外环境禽流感病毒的阳性率为14.69%(47/320),其中H5、H7和H9亚型的阳性率分别为3.44%(11/320)、0.31%(1/320)和10.94%(35/320)。不同监测场所中城乡活禽市场禽流感病毒阳性率最高,为17.92%(43/240)。不同标本类型中案板擦拭标本和禽类饮水阳性率较高,分别为24.49%(12/49)和24.07%(13/54)。结论济宁市外环境中存在禽流感病毒污染,存在人感染禽流感风险,应加强禽流感监测。

关键词：禽流感病毒外环境活禽市场

小檗果实中酚类化合物含量测定及其抗氧化活性研究

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基因组学与应用生物学 2017年第1期36卷 395-401页

作者：元王涛窦慧馨冶英马雪莲张得钧青海大学生态环境工程学院西宁810016

本试验采用UV法和HPLC法测定小檗果实中酚类化合物的含量,通过DPPH自由基清除率对酚类化合物进行抗氧化活性研究。UV法测得小檗果实总酚含量为3.858 mg/g,HPLC法测得小檗果实中绿原酸、芦丁、槲皮素、山奈酚平均含量分别为0.980 22%、0.... 详细信息

本试验采用UV法和HPLC法测定小檗果实中酚类化合物的含量,通过DPPH自由基清除率对酚类化合物进行抗氧化活性研究。UV法测得小檗果实总酚含量为3.858 mg/g,HPLC法测得小檗果实中绿原酸、芦丁、槲皮素、山奈酚平均含量分别为0.980 22%、0.006 23%、0.000 44%、0.001 51%;测得DPPH自由基清除率K为85.59%。HPLC法分析速度快,重复性好,能较准确测定小檗果实中总酚含量,且其中酚类化合物具有较强的抗氧化活性,小檗果实可作为天然抗氧化原料开发应用研究。

关键词：小檗果实酚类化合物 HPLC法抗氧化活性

一起季节性H3N2流感引起的学校聚集疫情全基因特征分析

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中国口岸科学技术 2022年第11期4卷 47-53页

作者：张杨郭培全岳营江亚娟窦慧馨贾勇健王小羽焦伯延兖州区疾病预防控制中心兖州272100 金乡县疾病预防控制中心金乡272200 济宁市疾病预防控制中心济宁272000

分析一起学校季节性H3N2流感聚集疫情的流行特点和全基因组特征,为学校流感防控提供研究数据。对一起学校流感聚集疫情进行流行病学调查,采集咽拭子标本17份进行流感病毒核酸检测、病毒培养和全基因组测序,利用生物信息学软件分析基因... 详细信息

分析一起学校季节性H3N2流感聚集疫情的流行特点和全基因组特征,为学校流感防控提供研究数据。对一起学校流感聚集疫情进行流行病学调查,采集咽拭子标本17份进行流感病毒核酸检测、病毒培养和全基因组测序,利用生物信息学软件分析基因进化变异特征。4份咽拭子标本季节性H3N2流感病毒核酸检测阳性,培养流感病毒毒株2株。2株毒株序列同源。同疫苗株A/Kansas/14/2017相比,8个基因节段的一致性范围是96.71%~98.88%。在进化树上,2条序列与疫苗株不在同一进化分支,亲缘性较远。HA蛋白信号肽发生2个氨基酸变异,抗原表位和受体结合位点分别发生5处和2处氨基酸变异。2条序列均发生金刚烷胺耐药位点变异,均未发生神经氨酸酶抑制剂耐药位点变异。2条序列的PA均发生K158R变异,PB2均发生K340R变异。该起学校聚集疫情由季节性H3N2流感病毒引起,病毒抗原已经发生漂移,应加强学校流感疫情监测和防控。

关键词：季节性H3N2流感病毒全基因组特征学校聚集疫情

一起学校聚集甲型流感的流行特点和全基因组特征分析

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口岸卫生控制 2023年第4期28卷 40-45页

作者：丁一王小羽窦慧馨王艳勤董燕岳营贾勇健焦伯延江亚娟济宁市疾病预防控制中心山东济宁272000 泗水县疾病预防控制中心山东泗水273200

目的分析2023年3月发生的甲型H_(1)N_(1)流感病毒和季节性H3N2流感病毒共同引起的一起学校聚集流感疫情的流行特点和全基因组特征。方法对聚集疫情开展流行病学调查并采集10份病例咽拭子标本,利用实时荧光定量PCR法进行流感病毒核酸检测... 详细信息

目的分析2023年3月发生的甲型H_(1)N_(1)流感病毒和季节性H3N2流感病毒共同引起的一起学校聚集流感疫情的流行特点和全基因组特征。方法对聚集疫情开展流行病学调查并采集10份病例咽拭子标本,利用实时荧光定量PCR法进行流感病毒核酸检测,利用MDCK细胞培养流感病毒,利用NEXTSEQ 2000高通量测序仪进行流感病毒全基因组测序,利用生物信息学软件进行序列分析。结果9日内3个班级共报告病例32例;采集的10份标本中甲型H_(1)N_(1)流感病毒阳性2份,季节性H_(3)N_(2)流感病毒阳性3份;培养流感病毒毒株2株。两条序列与疫苗株相比,8个基因节段核苷酸相似性分别为98.44%~98.68%和97.95%~99.34%;两条序列的血凝素(HA)抗原表位未发生漂移,受体结合位点未发生变异,神经氨酸酶(NA)抑制剂耐药位点未发生变异;但发生多个糖基化和磷酸化位点的改变。结论本次学校聚集流感疫情由甲型H1N1流感病毒和季节性H3N2流感病毒共同引起,应加大学校流感防控力度,提升学生流感疫苗接种率。

关键词：甲型 H1N1流感病毒季节性 H_(3)N_(2)流感病毒学校全基因组

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卷积神经网络的可解释性研究综述

软件学报 2024年第1期35卷 159-184页

作者：窦慧张凌茗韩峰申富饶赵健计算机软件新技术国家重点实验室(南京大学) 江苏南京210023 南京大学计算机科学与技术系江苏南京210023 南京大学人工智能学院江苏南京210023 南京大学电子科学与工程学院江苏南京210023

神经网络模型性能日益强大,被广泛应用于解决各类计算机相关任务,并表现出非常优秀的能力,但人类对神经网络模型的运行机制却并不完全理解.针对神经网络可解释性的研究进行了梳理和汇总,就模型可解释性研究的定义、必要性、分类、评估... 详细信息

神经网络模型性能日益强大,被广泛应用于解决各类计算机相关任务,并表现出非常优秀的能力,但人类对神经网络模型的运行机制却并不完全理解.针对神经网络可解释性的研究进行了梳理和汇总,就模型可解释性研究的定义、必要性、分类、评估等方面进行了详细的讨论.从解释算法的关注点出发,提出一种神经网络可解释算法的新型分类方法,为理解神经网络提供一个全新的视角.根据提出的新型分类方法对当前卷积神经网络的可解释方法进行梳理,并对不同类别解释算法的特点进行分析和比较.同时,介绍了常见可解释算法的评估原则和评估方法.对可解释神经网络的研究方向与应用进行概述.就可解释神经网络面临的挑战进行阐述,并针对这些挑战给出可能的解决方向.

关键词：神经网络可解释性分类深度学习