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乌头属药用植物叶绿体基因组密码子特征和系统发育分析

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分子植物育种 2022年

作者：樊东昌穆赢通贾俊英吕丽娟张晓明内蒙古农业大学草原与资源环境学院内蒙古民族大学农学院内蒙古农业大学植物学国家级实验教学示范中心

为明确乌头属药用植物密码子使用特征及其系统发育关系。本研究以乌头属9种药用植物叶绿体基因组为材料，采用分析软件CondoW，在线软件CUSP，R软件对叶绿体基因进行密码子特征分析，同时采用MAFFT软件，MEGA软件进行系统发育分析。结...

为明确乌头属药用植物密码子使用特征及其系统发育关系。本研究以乌头属9种药用植物叶绿体基因组为材料，采用分析软件CondoW，在线软件CUSP，R软件对叶绿体基因进行密码子特征分析，同时采用MAFFT软件，MEGA软件进行系统发育分析。结果显示，乌头属9种植物密码子偏好性形成主要受自然选择影响，乌头属9种植物叶绿体基因组高频密码子和最优密码子偏好相同，偏向于A/U结尾。9种植物共有13个最优密码子，叶绿体基因组CDS序列密码子第1位和第2位碱基组成相似，第3位碱基组成对密码子偏好影响较大。基于叶绿体全基因组和CDS序列构建的系统进化关系符合中国植物志亚属的分类关系，且二者都不支持狭盔高乌头作为高乌头的变种。本研究结果可以为乌头属植物的系统进化和遗传育种提供一些参考。

关键词：

红三叶个体水平异黄酮含量的差异及其形态特征和草产量比较研究

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草地学报 2023年第1期31卷 196-201页

作者：郝宁张晓明穆赢通李晓杰奥运王俊杰内蒙古农业大学草原与资源环境学院内蒙古呼和浩特010018

为探索选育高异黄酮含量红三叶(Trifolium pratense L.)新种质材料的可行途径,本研究测定和林格尔县实验地中300株红三叶地上部分的异黄酮含量,采用K-means聚类分析方法,将不同异黄酮含量红三叶聚类为4个类群(T1~T4),同时对4个红三叶类... 详细信息

为探索选育高异黄酮含量红三叶(Trifolium pratense L.)新种质材料的可行途径,本研究测定和林格尔县实验地中300株红三叶地上部分的异黄酮含量,采用K-means聚类分析方法,将不同异黄酮含量红三叶聚类为4个类群(T1~T4),同时对4个红三叶类群进行形态特征进行观测,以及对各农艺性状和产量指标进行测定。结果表明:300株红三叶异黄酮含量介于15.65~34.16 mg·g^(-1),平均含量为24.88 mg·g^(-1)。不同异黄酮含量的红三叶类群在形态特征、农艺性状、草产量等方面具有显著性差异,其中高异黄酮含量红三叶群体占300株的18.67%,平均含量为29.61 mg·g^(-1),具有绝对株高和自然株高差值大于15 cm(平卧型)和叶片面积小于350 mm 2的形态特征;同时绝对株高、草产量也显著更高(P<0.05)。本研究为红三叶高产优质栽培和品种选育奠定了基础。

关键词：红三叶异黄酮农艺性状营养品质产量

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内蒙古不同产地蒙古黄芪种苗质量研究

中药材 2021年第12期44卷 2764-2768页

作者：李晓杰张晓明穆赢通段晓洁王俊杰内蒙古农业大学草原与资源环境学院/内蒙古自治区中蒙药材良种繁育工程技术研究中心内蒙古呼和浩特010011

目的:对内蒙古不同产地蒙古黄芪种苗质量、合格率进行评价,为蒙古黄芪药材的规范化种植提供依据。方法:以不同产地种植一年的蒙古黄芪种苗为材料,对20份不同产地的蒙古黄芪种苗主根长、主根粗、休眠芽长、休眠芽数、单位面积鲜重等性状... 详细信息

目的:对内蒙古不同产地蒙古黄芪种苗质量、合格率进行评价,为蒙古黄芪药材的规范化种植提供依据。方法:以不同产地种植一年的蒙古黄芪种苗为材料,对20份不同产地的蒙古黄芪种苗主根长、主根粗、休眠芽长、休眠芽数、单位面积鲜重等性状进行测定。结果:内蒙古蒙古黄芪种苗合格率均达到70%以上,且一级、二级种苗占比≥30%,其中内蒙古赤峰市(赤峰市区、喀喇沁旗、克什克腾旗)、通辽市(奈曼旗、科尔沁区)人工种植的种苗根长≥30.00 cm,根粗4.36~8.31 mm,单位面积鲜重≥1.13 kg/m^(2)。结论:赤峰市、通辽市种苗整体质量较好,其种植模式及田间管理方式值得各蒙古黄芪药材产地借鉴。

关键词：蒙古黄芪种苗不同产地质量评价

毛茛科和芍药科叶绿体基因组密码子特征和系统发育比较

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植物研究 2022年第6期42卷 964-975页

作者：穆赢通樊东昌吕丽娟李晓杰路景诗张晓明内蒙古农业大学草原与资源环境学院呼和浩特010019

为研究和比较毛茛科和芍药科叶绿体基因组密码子使用模式和系统进化关系,以完成测序的毛茛科33种植物、芍药科7种植物叶绿体基因组为材料,采用分析软件CodonW在线软件CUSP和R软件对叶绿体基因进行密码子特征分析。用MAFFT软件,MEGA软件... 详细信息

为研究和比较毛茛科和芍药科叶绿体基因组密码子使用模式和系统进化关系,以完成测序的毛茛科33种植物、芍药科7种植物叶绿体基因组为材料,采用分析软件CodonW在线软件CUSP和R软件对叶绿体基因进行密码子特征分析。用MAFFT软件,MEGA软件进行系统发育分析。研究结果表明芍药科植物叶绿体基因组和毛茛科植物(耧斗菜属除外)叶绿体基因组高频密码子一致性高,具有29个高频密码子,基本偏向与于A/U结尾,但最优密码子存在差异。毛茛科和芍药科叶绿体基因组密码子偏好性的形成因素主要受自然选择的影响,且芍药科叶绿体基因组密码子偏好性受自然选择的影响大于毛茛科。基于叶绿体基因组全序列和基于叶绿体基因组CDS序列的系统进化关系表明,芍药科基于叶绿体基因组全序列和基于叶绿体基因组CDS序列的系统进化关系虽然部分不同,但都可以被划分为芍药组和牡丹组。毛茛科基于叶绿体基因组的系统进化关系不符合中国植物志分类关系,但支持把毛茛科划分为4亚科14族。系统进化分析结果也支持芍药科独立于毛茛科和毛茛目,被划分到虎耳草目,同时证明了叶绿体基因组作为超级DNA条形码的可行性。

关键词：毛茛科芍药科叶绿体基因组密码子系统进化

UPLC-MS快速测定蒙古黄芪中毛蕊异黄酮葡萄糖苷含量方法的建立

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黑龙江农业科学 2021年第11期 65-69页

作者：李晓杰魏鹏穆赢通王俊杰内蒙古农业大学草原与资源环境学院内蒙古呼和浩特010018

为了促进蒙古黄芪药材质量的快速测定,采用超高效液相色谱-串联三重四极杆质谱法(UPLC-MS)对不同产地当年移栽蒙古黄芪中毛蕊异黄酮葡萄糖苷的含量进行测定。利用超声法辅助甲醇法提取目标产物,Thenmo-C18(Hypersil GOLDaO,100 mm×2.1 ... 详细信息

为了促进蒙古黄芪药材质量的快速测定,采用超高效液相色谱-串联三重四极杆质谱法(UPLC-MS)对不同产地当年移栽蒙古黄芪中毛蕊异黄酮葡萄糖苷的含量进行测定。利用超声法辅助甲醇法提取目标产物,Thenmo-C18(Hypersil GOLDaO,100 mm×2.1 mm,1.9μm)色谱柱检测,在多反应监测(MRM)模式下,以447/142.98 m/z和447/284.64 m/z为定性离子对,447/142.98 m/z为定量离子对,用外标法进行定量。结果表明:毛蕊异黄酮葡萄糖苷在0.01875~0.60000μg·mL^(-1)浓度范围内有良好的线性关系(r=0.992),平均加样回收率为96.6%,RSD为2.701%。不同产地药材中毛蕊异黄酮葡萄糖苷含量测定结果显示,通辽市奈曼旗产的含量为0.031%,赤峰市林西县产的含量为0.033%,呼和浩特市产的含量为0.065%,呼和浩特市显著高于通辽市和赤峰市。可见,超声波辅助甲醇UPLC-MS法具有操作简单、灵敏、快捷,结果稳定可靠的特点,适合蒙古黄芪药材中毛蕊异黄酮葡萄糖苷含量的快速测定。

关键词：蒙古黄芪超高效液相色谱-串联三重四极杆质谱法(HPLC-MS) 多反应监测毛蕊异黄酮葡萄糖苷

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不同产地蓝盆花种子质量分析研究

种子科技 2021年第22期39卷 12-14页

作者：吕丽娟张晓明穆赢通樊东昌王俊杰内蒙古农业大学草原与资源环境学院内蒙古呼和浩特010019

为了规范中药材种子市场、保证种子质量以及提供蓝盆花种子质量标准依据,对不同产地蓝盆花种子的真实性、净度、千粒重、含水量、发芽率、发芽势和生活力等指标进行质量分析。结果表明:蓝盆花种子的平均千粒重为3.128 g,种子平均净度为7... 详细信息

为了规范中药材种子市场、保证种子质量以及提供蓝盆花种子质量标准依据,对不同产地蓝盆花种子的真实性、净度、千粒重、含水量、发芽率、发芽势和生活力等指标进行质量分析。结果表明:蓝盆花种子的平均千粒重为3.128 g,种子平均净度为73.3%,种子平均含水量6.83%;蓝盆花种子第4天开始发芽,第10天停止发芽;3地发芽率平均值为76.2%,发芽势平均值为48.3%,生活力平均值为77.8%。

关键词：蓝盆花种子质量检验

基于转录组数据的红三叶密码子使用偏好性分析

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草地学报 2024年第6期 1752-1759页

作者：花梅吕丽娟穆赢通张晓明郝宁王俊杰刘媛内蒙古农业大学草原与资源环境学院内蒙古自治区中蒙药材良种育繁工程技术研究中心呼和浩特市林业和草原局

研究红三叶(Trifolium pratense L.)叶片的密码子使用偏好性，可为优化密码子组成奠定基础。研究通过CodonW,R,CUSP等软件对红三叶叶片转录组中5 513条编码序列进行密码子使用模式和偏好性分析。研究发现，GC3与GC12相关性较弱，表明选... 详细信息

研究红三叶(Trifolium pratense L.)叶片的密码子使用偏好性，可为优化密码子组成奠定基础。研究通过CodonW,R,CUSP等软件对红三叶叶片转录组中5 513条编码序列进行密码子使用模式和偏好性分析。研究发现，GC3与GC12相关性较弱，表明选择压力对其密码子偏好性的选择有一定的作用；ENC-plot分析中，大多数密码子偏好性相对较弱，表明选择压力是偏好性的主要来源，少数的基因在期望曲线两侧均衡散布，表明部分基因受突变压力的作用；密码子适应度值(Codon adaptation index, CAI)分析可知，基因表达水平对密码子偏好性产生过程具有一定影响作用，CAI为0.201,表明密码子偏好性比较弱。偏倚性分析进一步证实红三叶叶片密码子偏好性重点受突变压力的影响。最优密码子分析表明，红三叶叶片转录组序列的最优密码子更偏好以G或C结尾。结果有利于红三叶基因工程研究中密码子优化，对红三叶的系统进化研究具有重要意义。

关键词：红三叶叶片密码子偏好性转录组编码序列

来源：博看期刊

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窄叶蓝盆花种子生活力检验方法比较

草原与草业 2022年第1期34卷 51-55页

作者：吕丽娟张晓明穆赢通樊东昌王俊杰内蒙古农业大学草原与资源环境学院呼和浩特010018

利用纸上荧光法、红墨水法、溴麝香草酚蓝(BTB)法、氯化三苯基四氮唑(TTC)法四4种方法对窄叶蓝盆花种子生活力进行测定。结果表明:测定窄叶蓝盆花种子生活力最适方法为TTC法,在35℃下浸种90 min,用浓度为0.1%的TTC在35℃温箱中避光染色9... 详细信息

利用纸上荧光法、红墨水法、溴麝香草酚蓝(BTB)法、氯化三苯基四氮唑(TTC)法四4种方法对窄叶蓝盆花种子生活力进行测定。结果表明:测定窄叶蓝盆花种子生活力最适方法为TTC法,在35℃下浸种90 min,用浓度为0.1%的TTC在35℃温箱中避光染色90 min,染色效果最佳。

关键词：种子发芽率生活力 TTC法

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赤芍种子休眠解除方法的优化

耕作与栽培 2022年第1期42卷 27-29页

作者：穆赢通张晓明樊东昌吕丽娟李晓杰王俊杰内蒙古农业大学草原与资源环境学院呼和浩特010019

以呼伦贝尔野生赤芍种子为研究材料,采用不同处理打破赤芍种子上下胚轴休,探讨沙藏环境、化学试剂浸泡、种子大小对赤芍种子下胚轴休眠的影响,以及根长、赤霉素浸种时间对上胚轴休眠解除的影响。结果表明,打破赤芍种子下胚轴休眠的最适... 详细信息

以呼伦贝尔野生赤芍种子为研究材料,采用不同处理打破赤芍种子上下胚轴休,探讨沙藏环境、化学试剂浸泡、种子大小对赤芍种子下胚轴休眠的影响,以及根长、赤霉素浸种时间对上胚轴休眠解除的影响。结果表明,打破赤芍种子下胚轴休眠的最适沙藏环境为温度20℃,沙子含水量16.5%种子单粒重量低于0.067 g时赤芍种子生根率显著下降。根长大于4 cm时用300 mg/L浓度的赤霉素浸泡12 h能完全打破赤芍种子的上胚轴休眠,出苗率为100%。

关键词：赤芍沙藏赤霉素休眠