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作者：穆原南京医科大学

学位级别：硕士

背景在世界范围内,肺癌均已成为癌症死亡的主要原因,尽管手术对非小细胞肺癌(NSCLC)仍是有效治疗手段,但50%0%的患者于术后2年内复发,90%5%的患者于术后5年内复发。目前,对NSCLC患者术后复发缺乏有效的评估手段,主要依靠定期随访和影... 详细信息

背景在世界范围内,肺癌均已成为癌症死亡的主要原因,尽管手术对非小细胞肺癌(NSCLC)仍是有效治疗手段,但50%0%的患者于术后2年内复发,90%5%的患者于术后5年内复发。目前,对NSCLC患者术后复发缺乏有效的评估手段,主要依靠定期随访和影像学检查。如果能对经肺癌根治术的患者中存在复发高风险的部分加以准确的预测,通过尽早制定相应的个体化治疗方案,就可能改善肺癌患者的预后。因此,建立有效的NSCLC复发预测手段,对于肺癌患者的临床治疗就显得尤为重要。鉴于从单个肿瘤细胞生长成临床可检出肿瘤实体(目前临床上能最早发现大约直径在1 cm左右的肿瘤),需要经历相当长的一段时间,然而肿瘤在生长过程中,通过凋亡、坏死、自主释放等多种方式释放核酸至细胞外,最终被吸收进入外周血中,使得对循环核酸的测定能成为一种新的肿瘤诊断及预后评估手段。目的对ⅠA期NSCLC患者手术前后血浆中的DNA及其APC、RASSF1A基因甲基化进行定量检测,以探讨其对术后复发的预测价值。方法 54名NSCLC患者(ⅠA期)来自2007年11月至2008年8月南京医科大学第一附属医院胸心外科,男38名,女16名,年龄389岁(中位年龄:63岁),分别于术前24 d(中位天数:6 d)及术后67 d(中位天数:8 d),采集肘静脉血,EDTA-K2抗凝,于室温1 600×g离心10min,上层血浆再于4℃16 000×g离心10min获得无细胞血浆,磁珠法提取血浆DNA,采用含内参照双重荧光定量PCR进行血浆DNA定量检测,以双重荧光定量MSP对APC及RASSF1A甲基化进行定量检测。所有患者于术后第6个月复查CT和体格检查,以确认复发情况。本院门诊体检健康者50名为对照,男30名,女20名,年龄367岁(中位年龄:58.5岁)。结果所有计量资料均为偏态分布,以中位数(四分位数区间)形式表示,54名患者有15名复发。对照组血浆DNA为18.3 (16.127.2) ng/ml,与性别及年龄均无关(P = 0.593,P = 0.270)。NSCLC患者血浆DNA术前为64.1 (46.49.3) ng/ml,术后为56.1 (41.90.6) ng/ml,较术前无显著变化,但均显著高于对照组(P < 0.001)。术前血浆DNA含量与年龄、肿瘤大小、淋巴结侵犯、AJCC分期、病理分型及分级均无关,而在性别间存在差异(P = 0.027),术后血浆DNA含量只与复发有关。 APC甲基化水平在手术前后分别为401.8 (0 038.2)拷贝/ml和101.3 (0 060.0)拷贝/ml,术后显著低于术前(P = 0.016);RASSF1A甲基化水平术前为377.8 (0 283.9)拷贝/ml,术后有所降低,为0 (0 062.8)拷贝/ml,但未达到统计学差异(P = 0.060)。50例对照中共检出3例甲基化阳性,其中1例APC阳性(211.4拷贝/ml)、2例RASSF1A阳性(1例为218.0拷贝/ml,1例为338.5拷贝/ml),其甲基化水平远低于NSCLC患者(APC:P < 0.001;RASSF1A:P < 0.001)。血浆APC和RASSF1A甲基化水平在手术前后均显示与复发有关(术前APC:P = 0.001;术后APC:P < 0.001;术前RASSF1A:P < 0.001;术后RASSF1A:P < 0.001),而与年龄、性别、淋巴结侵犯、病理分型及分化级别均无关,其术后水平在不同AJCC分期间存在差异(APC:P = 0.020;RASSF1A:P = 0.022)。血浆DNA及其APC、RASSF1A甲基化水平在患者手术前后均显示出相同的变化模式,即未复发患者在术后降低而复发患者手术前后无显著改变,且术后此3项指标在复发患者均显著高于未复发患者。经ROC曲线分析,此3项指标对患者术后复发的预测效能,在术后显著优于术前(血浆DNA定量:P < 0.001;血浆APC甲基化定量:P = 0.011;血浆RASSF1A甲基化定量:P = 0.033)。分别以术后的血浆DNA≥73.3 ng/ml(敏感度:80.0%,特异度:82.0%)、APC甲基化≥810.7拷贝/ml(敏感度:86.7%,特异度:87.2%)及RASSF1A甲基化≥698.7拷贝/ml(敏感度:93.3%,特异度:89.7%)作为临界值,经logistic多因素分析,发现术后血浆RASSF1A甲基化水平是对NSCLC患者术后复发起显著作用的独立因素。结论术后67天的血浆DNA及其APC、RASSF1A甲基化定量检测,可对NSCLC患者术后6个月的早期复发进行预测,其预测价值显著优于术前血浆样本,远早于目前常用的临床检测手段,并以其较高的敏感度和特

关键词：非小细胞肺癌复发血浆DNA DNA甲基化抑癌基因

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氟伐他汀抑制抗β_2GPI/β_2GPI复合物诱导的THP-1细胞活化

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药学学报 2013年第10期48卷 1550-1556页

作者：王婷周红解鸿翔夏龙飞穆原江苏大学基础医学与医学技术学院江苏镇江212013

为了探讨氟伐他汀对抗β2GPI/β2GPI复合物诱导THP-1细胞活化的干预作用及机制,采用脂多糖(LPS,500μg·L-1)、抗β2GPI/β2GPI复合物(100 mg·L-1)等活化单核细胞株THP-1并用氟伐他汀(0、1、5、10及50 mg·L-1)对细胞进行预处理。采用... 详细信息

为了探讨氟伐他汀对抗β2GPI/β2GPI复合物诱导THP-1细胞活化的干预作用及机制,采用脂多糖(LPS,500μg·L-1)、抗β2GPI/β2GPI复合物(100 mg·L-1)等活化单核细胞株THP-1并用氟伐他汀(0、1、5、10及50 mg·L-1)对细胞进行预处理。采用实时定量PCR(RT-qPCR)检测细胞组织因子(TF)及肿瘤坏死因子-α(TNF-α)mRNA表达,发色底物法检测TF活性,ELISA方法测定TNF-α蛋白的表达,蛋白印迹检测细胞NF-κB抑制蛋白(IκB-α)和磷酸化NF-κB p65的蛋白水平变化。结果显示,抗β2GPI/β2GPI复合物(100 mg·L-1)能诱导THP-1细胞活化以及TF和TNF-α表达上调。氟伐他汀(50 mg·L-1)能抑制复合物诱导的THP-1细胞TF(mRNA和活性)及TNF-α(mRNA和蛋白)的表达(P<0.05),上调IκB-α表达及抑制NF-κB p65磷酸化。结果表明,氟伐他汀通过干预信号分子IκB-α和磷酸化NF-κB p65的表达,抑制抗β2GPI/β2GPI复合物诱导的细胞TF及TNF-α的表达,抑制THP-1细胞活化。

关键词：氟伐他汀抗β2GPI β2GPI 组织因子肿瘤坏死因子-α

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机器学习助力检验医学发展

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中华检验医学杂志 2018年第8期41卷 627-630页

作者：穆原陈红兵南京医科大学附属儿童医院检验科 210008

医疗数据结构混杂、特征高维,传统数据仓储策略已难以满足大数据分析需求.以数据中产生模型的算法为主要研究内容的机器学习,迅即成为计算机模拟人类学习过程中智能数据分析技术的创新源泉.本文对机器学习的发展及其现处的医疗大数据背... 详细信息

医疗数据结构混杂、特征高维,传统数据仓储策略已难以满足大数据分析需求.以数据中产生模型的算法为主要研究内容的机器学习,迅即成为计算机模拟人类学习过程中智能数据分析技术的创新源泉.本文对机器学习的发展及其现处的医疗大数据背景作以简介,着重介绍其在检验医学图像识别、报告自动审核、中文医学语言处理及计算机辅助诊断中的应用,并思考其对检验医学发展带来的机遇与挑战.

关键词：机器学习医学检验科学医学信息学应用模式识别自动

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机器学习在检验医学中的应用进展与挑战

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中华检验医学杂志 2022年第12期45卷 1288-1292页

作者：魏佳蒋理穆原徐建苏州大学附属儿童医院检验科苏州215025 南京医科大学第一附属医院检验学部南京210029

机器学习(ML)的临床应用是智能化检验医学发展的重要方向。近年来,随着开源软件的广泛使用和许多公共数据库资源的公开,研究人员所需的ML专业知识门槛降低,ML在检验医学领域的研究报道激增;但研究结果的严谨性、可解释性和可复现性仍存... 详细信息

机器学习(ML)的临床应用是智能化检验医学发展的重要方向。近年来,随着开源软件的广泛使用和许多公共数据库资源的公开,研究人员所需的ML专业知识门槛降低,ML在检验医学领域的研究报道激增;但研究结果的严谨性、可解释性和可复现性仍存在疑问。为应对上述挑战,须严格把关数据质量,提高模型适用性,建立切实的模型评估和优化策略,增强模型的可解释性和透明度等。ML技术有助于突破检验大数据的临床转化瓶颈,提升检验诊断服务的质量。

关键词：检验医学机器学习神经网络可解释性

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基于通用质粒标准品的实时荧光定量PCR检测组织因子剪接异构体F3tv1及F3tv2

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临床检验杂志 2012年第7期30卷 485-488页

作者：穆原周红胥亚张晓蕾王婷江苏大学基础医学与医学技术学院江苏镇江212013

目的建立基于通用质粒标准品的实时荧光定量PCR(qPCR)法检测人组织因子(TF)两种剪接异构体(F3tv1和F3tv2)。方法设计基因特异性上游引物与通用下游引物,通过引物末端延伸法将2种扩增产物进行序列简并,用于构建通用质粒标准品。用qPCR法... 详细信息

目的建立基于通用质粒标准品的实时荧光定量PCR(qPCR)法检测人组织因子(TF)两种剪接异构体(F3tv1和F3tv2)。方法设计基因特异性上游引物与通用下游引物,通过引物末端延伸法将2种扩增产物进行序列简并,用于构建通用质粒标准品。用qPCR法检测人白血病细胞株THP-1、Jurkat及外周血单核细胞中F3tv1与F3tv2的表达,分析该法的线性范围与特异性。结果所建qPCR方法对F3tv1与F3tv2扩增特异,线性范围均为108～101copies/μL。THP-1与外周血单核细胞中F3tv1相对表达量分别为(5.70×10-4)±(2.62×10-5)与(1.79×10-4)±(4.37×10-5);F3tv2分别为(4.94×10-5)±(2.19×10-6)与(2.98±2.18)×10-6,Jurkat细胞株F3tv1与F3tv2均未检出。结论建立的qPCR方法可对TF两种剪接异构体同时进行精确、定量地检测,为深入研究TF的选择性剪接调控机制提供实验依据。

关键词：组织因子选择性剪接引物末端延伸实时荧光定量PCR

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幽门螺杆菌对人胃上皮细胞β-catenin蛋白信号途径影响意义的研究

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中华肿瘤防治杂志 2014年第2期21卷 100-104页

作者：吴莺艾宽宽沈琰李翔贺明洁穆原周红江苏大学附属医院消化内科江苏镇江212001 江苏大学临床医学院江苏镇江212001 东台市人民医院消化内科江苏东台224200 江苏大学医学基础与医学技术学院江苏镇江212001

目的:探讨幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,***)裂解液对人胃上皮GES-1细胞β-catenin蛋白信号途径及其下游靶基因Cyclin D1和c-myc表达,以及对细胞增殖的影响。方法:用***超声裂解液处理GES-1,免疫荧光法和蛋白质印迹法检测β-catenin... 详细信息

目的:探讨幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,***)裂解液对人胃上皮GES-1细胞β-catenin蛋白信号途径及其下游靶基因Cyclin D1和c-myc表达,以及对细胞增殖的影响。方法:用***超声裂解液处理GES-1,免疫荧光法和蛋白质印迹法检测β-catenin蛋白亚细胞定位以及核内蛋白表达量的变化;荧光定量聚合酶链反应(quantitative polymerase chain reaction,QRT-PCR)检测Wnt/β-catenin蛋白信号下游靶基因Cyclin D1和c-myc基因mRNA表达水平的变化;MTT法检测细胞的增殖。结果:***裂解液处理人胃上皮GES-1细胞后,***处理组引起了β-catenin蛋白从细胞膜至细胞质以及细胞核内的移位,呈时间依赖性。蛋白质印迹法检测结果证实,与对照组相比,***处理组在12、24h分别引起了细胞核内β-catenin蛋白表达量的增加,分别为0.31±0.05和0.55±0.04,P值均0.05;而24h的表达量明显增高,F=39.290,P<0.01;***处理组12hCyclin D1基因表达量明显增高,F=72.567,P<0.01;而24h的表达量虽然增高,但是差异无统计学意义,F=2.368,P=0.175;且明显低于12h的表达量,F=37.468,P<0.01。MTT法检测显示,5μL的***裂解液处理细胞12、24和36h的增殖抑制率分别为-13.3%、-28.5%和-62.5%;10μL的分别为-24.1%、-58.0%和-87.9%;20μL的分别为-39.8%、-131.3%和-165.2%。结论:***裂解液异常激活了β-catenin蛋白信号途径,促进β-catenin蛋白向细胞核内移位,通过上调其下游靶基因cyclin D1和c-myc的mRNA表达,促进细胞增殖,其效应呈时间以及浓度依赖。

关键词：幽门螺杆菌 β-catenin Cyclin D1基因 c-myc基因细胞增殖

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群体病例管理数据库的开发研究--含样品管理的新型医学病例信息管理系统

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生物医学工程学杂志 2010年第2期27卷 302-306,319页

作者：潘世扬穆原王虹王彤黄珮珺马建锋蒋理张杰顾兵衣鲁江南京医科大学第一附属医院医学检验科南京210029

针对当前病例临床信息与样品管理存在交叉需求的空缺,开发一种将临床信息与样品管理相结合的医学病例信息管理系统。以MS SQL Server 2000建立数据库,以Visual C++6.0开发基于Client/Server模式的客户端应用程序,以实现对病例资料及相... 详细信息

针对当前病例临床信息与样品管理存在交叉需求的空缺,开发一种将临床信息与样品管理相结合的医学病例信息管理系统。以MS SQL Server 2000建立数据库,以Visual C++6.0开发基于Client/Server模式的客户端应用程序,以实现对病例资料及相关样品信息的录入、浏览、查询选择、分级统计、样品管理及自动生成病例信息综合文档等功能,从而达到按科研所需对群体病例资料及其样品的管理。该系统有助于提高临床科研工作的效率、质量及管理水平,为医学病例及样品信息的综合动态管理提供了新的技术平台。

关键词：医学病例生物样品信息管理系统

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办公室里“坐”运动

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中国体育（中英文版） 2006年第2期 108-110页

作者：穆原

电脑是便捷之源,同时也是懒惰之源。想想你一天当中有多少时间是陪着电脑度过的?一天下来几乎就是一种状态——四平八稳地做着,百无聊赖地敲着……这使我们身体的局部肌肉越变越紧,有时还会引起疼痛,以及身姿的变形。现在我们要传授的... 详细信息

电脑是便捷之源,同时也是懒惰之源。想想你一天当中有多少时间是陪着电脑度过的?一天下来几乎就是一种状态——四平八稳地做着,百无聊赖地敲着……这使我们身体的局部肌肉越变越紧,有时还会引起疼痛,以及身姿的变形。现在我们要传授的、是一些简单易行的普拉提动作,改善你的身体,当然也改变你的状态。这些动作每天可以做很多次,只要你有地方坐就ok。

关键词：局部肌肉普拉提起始位置三头肌髋部中立位一只手深层肌肉后倾髓关节

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草木含情,唐诗有意

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新作文(高中版) 2010年第5期 7-9页

作者：穆原

阅读导航对那些情感细腻的人来说,世界上的很多事物都会在他的内心不经意间荡起一波涟漪,在他的精神穹宇中留下流星一般的轨迹。这种情怀是诗性的,正如广为流传的一句话:"诗意地栖居在大地上。"这种情怀的抒发,最终通过语言来实现,靠的... 详细信息

阅读导航对那些情感细腻的人来说,世界上的很多事物都会在他的内心不经意间荡起一波涟漪,在他的精神穹宇中留下流星一般的轨迹。这种情怀是诗性的,正如广为流传的一句话:"诗意地栖居在大地上。"这种情怀的抒发,最终通过语言来实现,靠的是措辞与造句、意象与修辞等

关键词：唐诗人类生命

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邀你共舞冰上芭蕾

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中国体育（中英文版） 2006年第1期 100-101页

作者：穆原

每当严寒将往日飞流直下的瀑布都凝固时,我们就可以让这几十米高的冰雕成为运动的新乐土。登上冰靴,配上冰爪,穿上安全带,扣上保护绳,手持冰镐,踩着冰锥攀上悬崖。在一座纯净的自然冰雕上攀行,或者是在晶莹的冰瀑上跳芭蕾,有什么不可能?... 详细信息

每当严寒将往日飞流直下的瀑布都凝固时,我们就可以让这几十米高的冰雕成为运动的新乐土。登上冰靴,配上冰爪,穿上安全带,扣上保护绳,手持冰镐,踩着冰锥攀上悬崖。在一座纯净的自然冰雕上攀行,或者是在晶莹的冰瀑上跳芭蕾,有什么不可能? 攀冰是由攀岩运动发展而来的,同时也是攀登高山、雪山的必修科目,更是登山运动的基本技能之一。在上世纪70年代以前,冰壁攀登一直是登山探险中难以逾越的障碍,许多登山家就因为在攀登过程中遇到冰壁而功亏一篑。一些欧洲登山者针对这一难题,根据多年积累的经验发明了附带锯齿状的镐头,以及带坚硬前刺的冰爪,使得攀冰时遇到的巨大难度变成了充满刺激的乐趣所在。许多登山者使用这些改进的新装备后。

关键词：攀岩运动冰壁登山者前刺飞流直下上跳必修科目冰瀑锯齿状攀爬

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