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核酸条形码技术:扩展蛋白质-蛋白质相互作用检测通量的新方法

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中国生物化学与分子生物学报 2024年第3期40卷 281-294页

作者：李林鑫秦晓红米立志天津大学生命科学学院结构与分子生物学系天津300072

蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)几乎参与了机体内所有重要的生物学过程,在细胞的基本生命过程中扮演了至关重要的角色,开发高通量的PPI检测新方法具有重要的生物学意义。目前,下一代测序技术(next-generation ... 详细信息

蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)几乎参与了机体内所有重要的生物学过程,在细胞的基本生命过程中扮演了至关重要的角色,开发高通量的PPI检测新方法具有重要的生物学意义。目前,下一代测序技术(next-generation sequencing,NGS)发展快速,能在几天内测定超过10亿个模板的DNA序列。由于并行DNA测序技术所特有的敏感性、特异性、高通量和多路复用优势,其已被用作广谱分子计数器,应用于基因组测序和转录物组测序等领域。核酸条形码技术通过将寡核苷酸标签与目标蛋白质连接起来,从而标记编码蛋白质。之后,利用高通量的测序方法检测相互作用的蛋白质,实现了PPI的高通量检测。这一技术推动了PPI检测方法的飞速发展,提升了单次实验检测的通量,为构建PPI网络提供了强有力的技术支持。本文详细阐述了核酸条形码在PPI检测方法中的设计、生成和读取;通过分析核酸条形码技术在PPI研究中的应用范例,探讨了各自的优势和不足,并评估了数据的可靠性,讨论了基于核酸条形码技术的PPI检测方法未来的发展趋势。

关键词：蛋白质-蛋白质相互作用核酸条形码检测技术下一代测序技术

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新时代小学语文教学的优化途径

新潮电子 2024年第3期 241-243页

作者：秦晓红蓬溪县三凤镇金龙学校四川遂宁629100

小学语文课堂教学是语文教学的核心。在语文课堂教学中不只是进行知识技能的传授,更重要的是进行灵魂重塑。在课堂教学中要灵活地采用多种办法,以教师自身的努力,力争取得最佳的教育教学效果,使语文教学最优化。

关键词：小学语文教学优化途径

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学习任务群视域下的单元整体教学研究

语文世界 2024年第10期 10-11页

作者：秦晓红江苏省新苏师范学校附属小学

单元整体教学是紧扣单元主题要素，科学结合教材中的单元规划，设置教学目标，强调借助单元整体教学法强化小学高年级语文教学质量。在教学的过程中，教师应该重视单元重点知识及课与课之间的内在联系，科学设定单元教学目标，帮助学生...

单元整体教学是紧扣单元主题要素，科学结合教材中的单元规划，设置教学目标，强调借助单元整体教学法强化小学高年级语文教学质量。在教学的过程中，教师应该重视单元重点知识及课与课之间的内在联系，科学设定单元教学目标，帮助学生掌握语文知识，提高语文综合素养，进一步提升小学语文教学水平，改善语文教学整体效果，提高课堂活跃度。

关键词：

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学习任务群视域下的单元整体教学研究

语文世界（上旬刊） 2024年第4期 10-11页

作者：秦晓红江苏省新苏师范学校附属小学

单元整体教学是紧扣单元主题要素,科学结合教材中的单元规划,设置教学目标,强调借助单元整体教学法强化小学高年级语文教学质量。在教学的过程中,教师应该重视单元重点知识及课与课之间的内在联系,科学设定单元教学目标,帮助学生掌握语... 详细信息

单元整体教学是紧扣单元主题要素,科学结合教材中的单元规划,设置教学目标,强调借助单元整体教学法强化小学高年级语文教学质量。在教学的过程中,教师应该重视单元重点知识及课与课之间的内在联系,科学设定单元教学目标,帮助学生掌握语文知识,提高语文综合素养,进一步提升小学语文教学水平,改善语文教学整体效果,提高课堂活跃度。

关键词：单元主题语文综合素养单元整体教学语文教学语文知识结合教材单元教学目标科学设定

润肤剂在儿童与婴幼儿特应性皮炎中应用的研究进展

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护理研究 2024年第9期38卷 1610-1613页

作者：乔宁李莉カルデナス暁東秦瑶秦晓红张蓓王侠山西医科大学山西030001 山西医科大学第一医院日本赤十字豊田看護大学晋中市榆次区人民医院

综述不同类型、不同成分润肤剂在儿童及婴幼儿特应性皮炎中的使用时机、频率、剂量等,并对国内外指南进行总结,以期为国内特应性皮炎患儿治疗和护理提供研究新视角,并为进一步开展临床研究提供参考。

关键词：特应性皮炎润肤剂皮肤屏障综述

绿樟肖叶甲肠道细菌多样性分析及功能菌株的筛选

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宜宾学院学报 2024年第6期24卷 102-108页

作者：胡连清彭俊琪陈露刘雯雯冯瑞章周万海魏琴秦晓红查黎萍宜宾学院农林与食品工程学部四川宜宾644000 香料植物资源开发与利用四川省高校重点实验室四川宜宾644000

为分析绿樟肖叶甲肠道内生细菌群落结构及功能特点,采用高通量测序技术与纯培养技术相结合的方法分析绿樟肖叶甲肠道内生细菌多样性及群落结构,并通过选择培养基筛选其中的功能菌. Illumina MiSeq测序结果表明,绿樟肖叶甲肠道内生细菌... 详细信息

为分析绿樟肖叶甲肠道内生细菌群落结构及功能特点,采用高通量测序技术与纯培养技术相结合的方法分析绿樟肖叶甲肠道内生细菌多样性及群落结构,并通过选择培养基筛选其中的功能菌. Illumina MiSeq测序结果表明,绿樟肖叶甲肠道内生细菌隶属于15门、24纲、56目、97科、140属;通过COG功能分类统计发现,绿樟肖叶甲肠道中参与“碳水化合物运输和代谢”及“氨基酸转运与代谢”功能的菌群的相对丰度较高.纯培养结果显示,从绿樟肖叶甲肠道分离的37株内生细菌隶属于4门4纲4目4科9属;通过功能选择培养基筛选出23株产蛋白酶功能菌、6株产酯酶功能菌、3株产脂肪酶功能菌.这表明绿樟肖叶甲肠道内生细菌的群落多样且功能丰富.

关键词：绿樟肖叶甲肠道细菌多样性分析高通量测序技术纯培养

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蛋白质循环排列与新型生物传感器的开发

中国生物化学与分子生物学报 2023年第12期39卷 1673-1684页

作者：邢一莹秦晓红米立志天津大学生命科学学院结构与分子生物学系天津300072

循环排列(circular permutation,CP)是自然界中蛋白质进化中产生的一种氨基酸序列重排现象。重排后的某些突变体仍具有类似该野生型蛋白质的天然构象和活性。生物传感器由分子识别单元和信号报告单元2部分组成,其分子识别单元通过分子... 详细信息

循环排列(circular permutation,CP)是自然界中蛋白质进化中产生的一种氨基酸序列重排现象。重排后的某些突变体仍具有类似该野生型蛋白质的天然构象和活性。生物传感器由分子识别单元和信号报告单元2部分组成,其分子识别单元通过分子间相互作用,将生物体内的配体、离子浓度变化等微观过程转变成信号报告单元的可量化的可视化信号,从而实现生物学信号感知与检测。目前,蛋白质循环排列被广泛应用到生物传感器的设计中,成为近年来发展最为迅速的生物探针设计方法,已应用于生物分子的特异性识别和生命活动的实时监测,为病理研究、疾病预防和诊断提供了重要的手段。如何运用蛋白质循环排列,开发出新型可靠的生物传感器,是当前生物传感器设计中面临的1个重要科学问题。为此,本文总结并论述了以下3点工作。首先,本文简述了循环排列的发展历史,总结了循环排列的2种形成机制,通过实例详细阐述了循环排列对蛋白质结构的影响。其次,针对循环排列生物传感器的设计,本文主要以循环排列荧光蛋白(circular permutation fluorescent protein,cpFP)为例,总结了分子识别单元和信号报告单元两方面的设计策略,并汇总了循环排列蛋白质相关数据库。最后,本文总结了循环排列蛋白生物传感器的最新研究进展,展望了循环排列未来的发展方向,分析了目前循环排列生物传感器开发过程中存在的问题,以期为新型生物传感器的开发提供借鉴。

关键词：循环排列循环排列荧光蛋白生物传感器

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α-突触核蛋白的结构生物学研究

中国生物化学与分子生物学报 2023年第4期39卷 531-544页

作者：李冬青秦晓红米立志天津大学生命科学学院结构与分子生物学系天津300072

α-突触核蛋白(α-synuclein, α-syn)聚集形成纤维状结构,进而形成路易小体(Lewy bodies, LBs)。LBs是帕金森病(Parkinson’s disease, PD)、多系统萎缩(multiple system atrophy, MSA)和路易小体痴呆(dementia with Lewy bodies, DLB)等神经退行性疾病的典型细胞病变特征,也是发病的一个关键环节。近年来,冷冻电镜技术的进步使解析高分辨率α-突触核蛋白原纤维结构成为可能。对α-突触核蛋白不同聚集形态的深入探究,能为理解神经退行性病变的分子机制、α-突触核蛋白毒性形式的性质以及α-突触核蛋白聚集影响的信号途径等提供帮助。本文综述目前已知的不同形态α-突触核蛋白结构,阐述α-突触核蛋白单体、寡聚体和不同聚集形式原纤维的结构特征。α-突触核蛋白寡聚体由于其结构不稳定,目前尚无明确的结构信息。但目前已有多个α-突触核蛋白原纤维结构被解析,包括重组蛋白体外制备的和多系统萎缩(MSA)患者体内分离的原纤维。这些原纤维直径由5 nm的单股原纤维至10 nm的双股原纤维不等。不同的体外制备条件可生成不同构象与聚集形式的α-突触核蛋白原纤维,表现出结构异质性。部分家族性PD相关的α-突触核蛋白突变位点位于原纤丝间的相互作用界面。本文依据α-突触核蛋白原纤维中单体的结构和原纤维的组装形式,对α-突触核蛋白原纤维的结构进行分类归纳,以期为探索针对α-突触核蛋白结构的PD诊断与药物开发提供信息。

关键词： α-突触核蛋白帕金森病错误折叠蛋白质神经退行性疾病

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遇见食育课程体验面塑艺术

家长 2022年第2期 58-60页

作者：秦晓红东营经济技术开发区东凯幼儿园

《幼儿园教育指导纲要(试行)》中指出:"密切结合幼儿的生活进行安全、营养和保健教育,提高幼儿的自我保护意识和能力。"可见在生活中对幼儿施以饮食教育是幼儿园应关注的一项教育内容。本文以食育课程中有趣的面塑活动为例,阐述如何在...

《幼儿园教育指导纲要(试行)》中指出:"密切结合幼儿的生活进行安全、营养和保健教育,提高幼儿的自我保护意识和能力。"可见在生活中对幼儿施以饮食教育是幼儿园应关注的一项教育内容。本文以食育课程中有趣的面塑活动为例,阐述如何在食育活动中使幼儿更好地收获最直接的生活经验,体验最本真的活动经历。食育是根据幼儿的年龄特点,对幼儿开展生活中常见的食材及美食制作等相关内容的教育指导,引导幼儿养成良好的饮食习惯,丰富饮食文化,提升幼儿的动手操作、想象创造、合作交流等能力。在幼儿园实践活动中,

关键词：