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深圳市2016年至2018年猩红热A族链球菌emm基因型及基因组多态性分析

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中华实用儿科临床杂志 2022年第21期37卷 1655-1659页

作者：高外外禹定乐王文建中国医科大学深圳市儿童医院呼吸科深圳518038

目的明确导致猩红热的A族链球菌(GAS)流行型别,比较不同emm型别GAS的基因结构及基因变异性,阐明猩红热病原学的流行、进化规律。方法回顾性研究。收集2016年1月1日至2018年5月31日深圳市儿童医院诊断为猩红热的儿童咽拭子标本,保存GAS菌... 详细信息

目的明确导致猩红热的A族链球菌(GAS)流行型别,比较不同emm型别GAS的基因结构及基因变异性,阐明猩红热病原学的流行、进化规律。方法回顾性研究。收集2016年1月1日至2018年5月31日深圳市儿童医院诊断为猩红热的儿童咽拭子标本,保存GAS菌株,进行emm基因分型,选取在分型上具有代表性的菌株进行全基因组测序,通过比较基因组学分析,描述GAS菌株基因组多态性,并基于单核苷酸多态性(SNP)位点分析构建遗传进化树,阐明菌株之间的进化关系。2组比较采用秩和检验。结果在导致儿童猩红热的176株GAS分离株中,共检测到8种emm型别,emm12.0及其亚型(108/176株,61.4%)占比最高,其次为emm1.0及其亚型(53/176株,30.1%),两者共占91.5%。以GCA-900984775为参考序列进行比较基因组分析显示,GAS菌株基因组之间存在丰富的SNP和插入或缺失(InDel)多态性,emm12.0型菌株SNP数[183(163,213)个]大于emm1.0型菌株SNP数[63(54,75)个],差异有统计学意义(P<0.05);InDel分析中,emm12.0型菌株基因序列插入数[4(3,6)个]和缺失数[8(6,10)个]大于emm1.0型菌株[1(0,2)个,5(3,7)个]。以MGAS5005参考序列,基于SNP的分析结果构建进化树得出18株菌株及参考菌株处于2个分支。结论引起儿童猩红热的GAS菌株型别以emm12.0型、emm 1.0型多见,不同型别菌株基因组组成之间存在差异,emm12.0型菌株存在较高的遗传多样性。

关键词：猩红热 A族链球菌 emm分型基因组多态性儿童

emm簇分组系统在A族链球菌相关研究中的应用

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中华实用儿科临床杂志 2022年第21期37卷 1677-1680页

作者：高外外禹定乐王文建中国医科大学深圳市儿童医院呼吸科深圳518038

A族链球菌(GAS)是造成全球儿童死亡的重要病原之一。细菌分型是研究病原微生物流行特征最常用的手段,emm分型是研究GAS常用的分型方法。近些年新提出的emm簇分组系统是基于M蛋白氨基酸序列同源性和与宿主血清蛋白结合能力进行分型,在国... 详细信息

A族链球菌(GAS)是造成全球儿童死亡的重要病原之一。细菌分型是研究病原微生物流行特征最常用的手段,emm分型是研究GAS常用的分型方法。近些年新提出的emm簇分组系统是基于M蛋白氨基酸序列同源性和与宿主血清蛋白结合能力进行分型,在国外已被广泛用于流行病学调查、菌株选择及疫苗开发等,但在国内目前尚未被应用。emm分型是基于emm基因的一个小的可变区域,而emm簇分组系统根据emm基因的几乎完整序列定义GAS类型,且emm簇分组系统可直接由emm分型比对获得,简单易行。因此,emm簇分组系统可提供有关GAS不同emm型中M蛋白的功能和结构特性的更多信息,现就emm簇分组系统的方法、原理及目前在GAS相关研究中的应用等作一综述,以便于在国内推广应用。

关键词： A族链球菌 emm簇分型 emm分组 M蛋白

《中国儿童A族链球菌感染相关疾病的诊断、治疗与预防专家共识》解读

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中华实用儿科临床杂志 2023年第5期38卷 327-330页

作者：禹定乐郑跃杰申昆玲杨永弘深圳市儿童医院呼吸科深圳518038 国家儿童医学中心国家呼吸系统疾病临床医学研究中心首都医科大学附属北京儿童医院呼吸一科北京100045 国家儿童医学中心首都医科大学附属北京儿童医院北京市儿科研究所微生物研究室北京100045

A族链球菌(GroupAStreptococcus,GAS)是一种非常重要的致病菌,尤其对于儿童。《中国儿童A族链球菌感染相关疾病的诊断、治疗与预防专家共识》是由国内呼吸、感染、免疫、检验、心血管、肾脏、危重症及预防等领域的儿科专家于2022年11月... 详细信息

A族链球菌(GroupAStreptococcus,GAS)是一种非常重要的致病菌,尤其对于儿童。《中国儿童A族链球菌感染相关疾病的诊断、治疗与预防专家共识》是由国内呼吸、感染、免疫、检验、心血管、肾脏、危重症及预防等领域的儿科专家于2022年11月共同制定的,旨在进一步规范GAS感染相关疾病的防治,促进和维护儿童健康。现对其主要内容进行解读,包括疾病负担、预防、诊断、抗菌药物耐药等。

关键词：儿童 A族链球菌共识解读

风湿热和风湿性心脏病的流行病学及防控策略研究进展

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中华医学杂志 2023年第37期103卷 2989-2992页

作者：禹定乐梁云梅郑跃杰杨永弘深圳市儿童医院呼吸科深圳518038 首都医科大学附属北京朝阳医院儿科北京100043 首都医科大学附属北京儿童医院微生物实验室北京100045

急性风湿热(ARF)是由未经治疗的A族链球菌(GAS)感染在遗传易感的宿主中引起的一种自身免疫反应性疾病,风湿性心脏病(RHD)是由严重的或多次反复发作的ARF导致慢性心脏瓣膜损伤引起。引起ARF和RHD的疾病有急性咽炎、脓疱病和猩红热等。随... 详细信息

急性风湿热(ARF)是由未经治疗的A族链球菌(GAS)感染在遗传易感的宿主中引起的一种自身免疫反应性疾病,风湿性心脏病(RHD)是由严重的或多次反复发作的ARF导致慢性心脏瓣膜损伤引起。引起ARF和RHD的疾病有急性咽炎、脓疱病和猩红热等。随着GAS感染发病率明显降低,ARF和RHD的发病率也明显下降。但近年来相关研究显示ARF和RHD的疾病负担仍很重。ARF和RHD是潜在的致命性疾病,但可通过四级预防和控制策略来预防和根除。本文将综述ARF和RHD的流行病学、致病因素、防控策略的研究进展,以引起国内临床医生的重视。

关键词：风湿热风湿性心脏病 A族链球菌猩红热

重视A群链球菌对β内酰胺类抗生素敏感性降低的问题

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中国感染与化疗杂志 2022年第3期22卷 371-374页

作者：禹定乐郑跃杰杨永弘深圳市儿童医院呼吸科广东深圳518038 国家儿童医学中心首都医科大学附属北京儿童医院北京市儿科研究所

抗生素的大量使用导致老年患者中出现耐药病原体,包括耐甲氧西林金黄色葡萄球菌、耐青霉素肺炎链球菌、耐万古霉素肠球菌等阳性菌和多重耐药的革兰阴性杆菌。除非尽快制定预防策略、加快新药物开发,否则临床医师将会面临与“前抗生素时... 详细信息

抗生素的大量使用导致老年患者中出现耐药病原体,包括耐甲氧西林金黄色葡萄球菌、耐青霉素肺炎链球菌、耐万古霉素肠球菌等阳性菌和多重耐药的革兰阴性杆菌。除非尽快制定预防策略、加快新药物开发,否则临床医师将会面临与“前抗生素时代”一样无法有效控制感染的挫败感[1]。

关键词： A群链球菌 β内酰胺类抗生素抗生素敏感性

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A族链球菌的基因组流行病学研究进展

中华传染病杂志 2022年第2期40卷 125-128页

作者：禹定乐郑跃杰杨永弘深圳市儿童医院呼吸科深圳518038 国家儿童医学中心首都医科大学附属北京儿童医院北京市儿科研究所北京100045

A族链球菌(group AStreptococcus,GAS)是世界十大人类感染性疾病的病原体之一。近些年,GAS所引起的猩红热在全球出现"再现"现象。随着基因测序技术的快速发展,在全球范围内,基因组技术已逐渐被应用于疾病监测和暴发调查之中。本研究在大... 详细信息

A族链球菌(group AStreptococcus,GAS)是世界十大人类感染性疾病的病原体之一。近些年,GAS所引起的猩红热在全球出现"再现"现象。随着基因测序技术的快速发展,在全球范围内,基因组技术已逐渐被应用于疾病监测和暴发调查之中。本研究在大量GAS分子流行病学文献的基础上,借助解决GAS种群基因组学问题的全球框架,以加深对GAS全球基因组关系、疾病关联和进化流行特点等的理解。

关键词：酿脓链球菌猩红热基因组流行病学

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A族链球菌感染的传染病学及防控策略

中华实用儿科临床杂志 2022年第21期37卷 1637-1640页

作者：禹定乐高外外卢清华王文建杨永弘郑跃杰深圳市儿童医院呼吸科深圳518038 国家儿童医学中心首都医科大学附属北京儿童医院北京市儿科研究所微生物研究室北京100045

A族链球菌(GAS)是一种具有公共卫生意义的病原体,每年在全球感染1810万人,导致50万人死亡。GAS常通过呼吸道飞沫、接触破损的皮肤等传播。儿童、老年人和免疫功能低下者是感染GAS的高危人群,学校、幼儿园、医院和养老院等人群密集地区是... 详细信息

A族链球菌(GAS)是一种具有公共卫生意义的病原体,每年在全球感染1810万人,导致50万人死亡。GAS常通过呼吸道飞沫、接触破损的皮肤等传播。儿童、老年人和免疫功能低下者是感染GAS的高危人群,学校、幼儿园、医院和养老院等人群密集地区是GAS传播的高发区域。预防和控制措施应关注改善生活条件及个人手卫生。在高风险环境中应强调遵守感染预防和控制措施。现总结GAS感染的传染病学要点及防控策略,旨在为GAS的防控提供依据。

关键词： A族链球菌传染病预防感染控制

呼吸道感染住院患儿痰细菌培养阳性率及与病情严重度相关性分析

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呼吸道感染住院患儿痰细菌培养阳性率及与病情严重度相关性分析

作者：禹定乐重庆医科大学

学位级别：硕士

目的：呼吸道感染是儿科常见病、多发病,已有研究明确证实病毒与细菌是引起儿童呼吸道感染的主要病原,本文拟探讨重庆地区呼吸道感染住院患儿病原学特点,明确痰培养阳性时是否对由病毒引起的呼吸道感染的病情、病程产生影响,从而为临床... 详细信息

目的：呼吸道感染是儿科常见病、多发病,已有研究明确证实病毒与细菌是引起儿童呼吸道感染的主要病原,本文拟探讨重庆地区呼吸道感染住院患儿病原学特点,明确痰培养阳性时是否对由病毒引起的呼吸道感染的病情、病程产生影响,从而为临床防治提供依据。方法：收集自2009年6月至2011年6月在本院呼吸科住院的1745例患儿,从中筛选出做过痰细菌培养的住院患儿1157例,回顾性分析其痰细菌培养结果、呼吸道常见病毒检测结果及其临床特征。结果：1157例痰细菌培养标本中,分离出致病菌677株,平均阳性检出率为58.5%,其中G-菌构成比大于45.3%,检出率最高者为肺炎链球菌,其次为副流感嗜血杆菌、流感嗜血杆菌和大肠埃希氏菌;痰培养检出细菌阳性例数多集中于年幼儿童,尤其是3岁内的婴幼儿最多见,不同细菌在不同年龄分布上无统计学差异;除大肠埃希氏菌以外,各种细菌检出均以冬春季多见;痰培养检出细菌阳性在临床表现如咳嗽、发热、呼吸困难、肺部听诊哮鸣音、病情严重度上,以及对WBC及中性粒细胞比例的影响上,总体均无差异,但在引起住院时间的长短上有差异;肺炎克雷伯杆菌在引起肺炎严重程度上,其OR值为2.933;RSV、ADV合并呼吸道常见细菌阳性时在导致肺炎严重程度的差异上无统计学意义;但RSV感染合并痰检出肺炎链球菌阳性与阴性比较,对患儿肺部出现哮鸣音的体征上,其OR值为1.700。结论：呼吸道感染住院患儿痰培养中以革兰阴性菌检出为主;痰培养检出细菌阳性的患儿,其住院时间较痰检出阴性者长;痰培养出肺炎克雷伯菌阳性更易引起重症肺炎;痰培养细菌检出阳性对RSV、ADV引起的肺炎严重程度无显著影响,但RSV感染合并痰检出肺炎链球菌阳性患儿的肺部更易出现哮鸣音。

关键词：细菌培养呼吸道感染儿童

同方学位论文库评论

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同方学位论文库

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深圳儿童酿脓链球菌分离株多基因序列分型

中华实用儿科临床杂志 2022年第4期37卷 295-298页

作者：禹定乐梁云梅卢清华赵瑞珍陈运生郑跃杰杨永弘深圳市儿童医院呼吸科深圳518038 首都医科大学附属北京朝阳医院儿科北京100043 深圳市儿童医院检验科深圳518038 首都医科大学附属北京儿童医院微生物实验室北京100045

目的探讨酿脓链球菌,即β溶血性A族链球菌(GAS)在深圳的流行病学特征。方法对2016年1月至2018年12月深圳市儿童医院分离的GAS流行克隆群进行多基因序列分型(MLST)回顾性分析。本研究中32株分属于7个不同emm分型的GAS菌株分别来自32例患... 详细信息

目的探讨酿脓链球菌,即β溶血性A族链球菌(GAS)在深圳的流行病学特征。方法对2016年1月至2018年12月深圳市儿童医院分离的GAS流行克隆群进行多基因序列分型(MLST)回顾性分析。本研究中32株分属于7个不同emm分型的GAS菌株分别来自32例患有脓疱病、蜂窝组织炎、猩红热、脓毒症、肺炎、阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征、支气管炎、过敏性鼻炎、臀部脓肿、过敏性紫癜或咽扁桃体炎的患儿,分离自咽拭子23份,痰液5份,脓液3份和血液1份。应用聚合酶链反应技术对32株GAS菌株的7对等位看家基因(gki、gtr、murI、mutS、recP、xpt和yqiL)进行扩增,对目标基因产物进行测序。然后将获得的每个等位基因的基因序列提交至MLST网站,以获得相应的等位基因谱。最后将等位基因谱再次提交至MLST网站,以确认序列分型(ST)。结果emm 1.00及其亚型、emm 4.00、emm 12.00及其亚型、emm 22.00、emm 28.00、emm 75.00和emm 89.00的GAS克隆群分别属于MLST分型中的ST28、ST39、ST36、ST46、ST52、ST49和ST921。结论2016年至2018年导致深圳地区儿童感染的GAS分离株的MLST流行克隆群分别为ST28、ST39、ST36、ST46、ST52、ST49和ST921。

关键词：酿脓链球菌多基因序列分型 emm分型儿童