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人脑胶质瘤差异表达的基因的获得及一条全长新基因的克隆

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中华实验外科杂志 2005年第7期22卷 849-851,i002页

作者：祁震宇惠国桢李瑶周宗祥应康谢毅苏州大学附属第一医院神经外科 215006 上海复旦大学遗传工程国家重点开放实验室

目的运用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因,并对其中一条基因进行了初步的研究。方法抽提正常成人脑组织与人脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针,经杂交、洗涤后,通过计算机观察两者表达谱的差异情况,对681F05... 详细信息

目的运用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因,并对其中一条基因进行了初步的研究。方法抽提正常成人脑组织与人脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针,经杂交、洗涤后,通过计算机观察两者表达谱的差异情况,对681F05克隆子进行了Northernblot,5’RACE和生物信息学分析。结果通过4次基因芯片筛选,获得15条与胶质瘤相关的新基因,经Northernblot证实681F05基因在人正常脑组织中低表达,而在人脑胶质瘤中高表达。BLASTn和BLASTx分析显示,它们编码蛋白与线虫Cyp10蛋白同源性分别为52%和72%。cDNA序列分析发现这两上克隆是同一个基因[命名为cyclophilinlikegene(PPIL3)]的两个不同的剪切体(PPIL3a和PPIL3b)。结论基因芯片筛选正常脑组织与人脑胶质瘤差异表达的基因具有样品用量少,高质量,高速度,高敏感等特性。681F05基因可能是与人脑胶质瘤形成有关的一条全长新基因。

关键词：全长新基因差异表达克隆 cDNA序列分析人脑胶质瘤组织生物信息学分析 Northem 正常脑组织基因芯片技术人脑组织 blot mRNA RACE 编码蛋白表达谱计算机低表达高表达同源性剪切体筛选

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特发性正常压力性脑积水步态评估方法的进展

中华神经外科杂志 2020年第11期36卷 1182-1185页

作者：何蒙蒙黄煜伦祁震宇苏州大学附属第一医院神经外科 215000

特发性正常压力性脑积水(iNPH)多见于老年人,特点是脑室扩大但脑脊液压力正常,以步态障碍、认知障碍及尿失禁三联征为主要症状,脑脊液分流术后症状可出现逆转。其中步态障碍是三联征中最先出现且最突出的症状,故术前步态评估将有助于临... 详细信息

特发性正常压力性脑积水(iNPH)多见于老年人,特点是脑室扩大但脑脊液压力正常,以步态障碍、认知障碍及尿失禁三联征为主要症状,脑脊液分流术后症状可出现逆转。其中步态障碍是三联征中最先出现且最突出的症状,故术前步态评估将有助于临床医生诊断iNPH。近年来,国外对iNPH患者步态的客观定量评估研究有了很大进展,而国内依然以主观定性评估为主。本文主要对国外iNPH患者步态评估方法的进展及步态参数的特点进行综述。

关键词：脑脊液压力脑室扩大临床医生三联征步态评估步态障碍脑脊液分流术步态参数

人脑胶质瘤中全长新基因PPIL3的获得及染色体定位和表达谱分析

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中华实验外科杂志 2007年第5期24卷 548-550页

作者：祁震宇惠国桢李瑶顾少华谢毅苏州大学附属第一医院神经外科 215006 复旦大学遗传工程国家重点开放实验室

目的运用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因,并对其中一条基因进行研究。方法抽提正常成人脑组织与人脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针,经杂交、洗涤后,通过计算机观察两者表达谱的差异情况,对681F05克隆子进... 详细信息

目的运用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因,并对其中一条基因进行研究。方法抽提正常成人脑组织与人脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针,经杂交、洗涤后,通过计算机观察两者表达谱的差异情况,对681F05克隆子进行Northern blot,逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR),染色体定位和生物信息学分析。结果通过4次基因芯片筛选,获得15条与胶质瘤相关的新基因,经Northern blot证实681F05基因在人正常脑组织中低表达,而在人脑胶质瘤中高表达。PPIL3基因位于染色体2 q33区段的STS marker stSG2762和SHGC-3074之间。BLASTn和BLASTx分析显示,它们编码蛋白与线虫Cyp-10蛋白同源性分别为52%和72%。cDNA序列分析发现这两上克隆是同一个基因[命名为cyclophilin-like gene(PPIL3)]的两个不同的剪切体(PPIL3a和PPIL3b)。结论基因芯片筛选正常脑组织与人脑胶质瘤差异表达的基因具有样品用量少,高质量,高速度,高敏感等特性。681F05基因可能是与人脑胶质瘤形成有关的一条全长新基因。

关键词：基因芯片胶质瘤差异表达

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脑胶质瘤患者全长新基因的获得及初步研究

中华医学杂志 2001年第18期81卷 1124-1127页

作者：祁震宇惠国桢李瑶唐榕周宗祥夏放顾少华应康谢毅苏州大学附属第一医院神经外科 215006

目的　探讨基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因 ,并对其中一条基因进行初步研究。方法　抽提正常成人脑组织与人脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针 ,经杂交、洗涤后 ,通过计算机观察两者表达谱的差异情况 ,对 5 ... 详细信息

目的　探讨基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因 ,并对其中一条基因进行初步研究。方法　抽提正常成人脑组织与人脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针 ,经杂交、洗涤后 ,通过计算机观察两者表达谱的差异情况 ,对 5 0 7E0 8克隆子进行了Northern印迹、原位杂交、生物信息学分析和染色体定位。结果　通过 4次基因芯片筛选 ,获得 15条与胶质瘤相关的新基因 ,经Northern印迹证实 5 0 7E0 8基因在人正常脑组织中低表达 ,而在人脑胶质瘤中高表达。原位杂交得到相同的结果。BLASTn和BLASTx分析显示 ,5 0 7E0 8基因为全长新基因 ,长度为 2 0 0 2bp ,共编码 2 0 3个氨基酸。本基因命名为人核糖体蛋白L14.2 2。该基因定位于 14号染色体上D14S10 6 6和D14S2 6 5Marker之间。结论　用基因芯片筛选正常脑组织与人脑胶质瘤差异表达的基因 ,具有样品用量少 ,高质量 ,高速度 ,高敏感等特性。 5 0 7E0

关键词：脑胶质瘤全长新基因 507E08基因

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脑胶质瘤中全长新基因PKIβ的克隆与表达

中华神经外科杂志 2007年第9期23卷 674-678页

作者：祁震宇惠国桢李瑶周宗祥顾少华谢毅苏州大学附属第一医院神经外科 215006 上海复旦大学遗传工程国家重点开放实验室

目前世界上在不同组织或不同病理样本中获取差异表达基因的方法有很多种。在各种技术中诸如：差异显示技术，只适用于少量样本，同时跑电泳的工作相当辛苦，并受限于一次电泳样品数量，而高密度的基因芯片，一次就能完成大量样本的基因... 详细信息

目前世界上在不同组织或不同病理样本中获取差异表达基因的方法有很多种。在各种技术中诸如：差异显示技术，只适用于少量样本，同时跑电泳的工作相当辛苦，并受限于一次电泳样品数量，而高密度的基因芯片，一次就能完成大量样本的基因表达水平上的筛选工作。

关键词：克隆与表达全长新基因脑胶质瘤 PKI 差异表达基因差异显示技术基因表达水平基因芯片

全长新基因人核糖体蛋白L14．22在人脑胶质瘤中的研究与体外表达

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中华实验外科杂志 2006年第5期23卷 554-556页

作者：祁震宇惠国桢李瑶周宗祥顾少华应康谢毅苏州大学附属第一医院神经外科 215006 复旦大学遗传工程国家重点开放实验室

目的运用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因。方法抽提正常成人脑组织与人脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针,经杂交、洗涤后,通过计算机观察两者表达谱的差异情况,对507E08克隆子进行了Northern blot,生物信... 详细信息

目的运用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因。方法抽提正常成人脑组织与人脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针,经杂交、洗涤后,通过计算机观察两者表达谱的差异情况,对507E08克隆子进行了Northern blot,生物信息学分析,蛋白表达和氨基酸测序。结果通过4次基因芯片筛选,获得15条与胶质瘤相关的新基因,经Northern blot 证实507E08基因在人正常脑组织中低表达,而在人脑胶质瘤中高表达。原位杂交得到相同的结果。BLASTn和BLAST分析显示,507E08基因为全长新基因,长度为2 002 bp,共编码203个氨基酸。本基因命名为人核糖体蛋白L14．22。经原核表达,在SDS-PAGE胶上获得一条22×103的条带,氨基酸序列分析显示,结果N-端15个氨基酸与序列所示的N-端15个氨基酸残基完全相同。结论基因芯片筛选正常脑组织与人脑胶质瘤差异表达的基因具有样品用量少,高质量,高速度, 高敏感等特性。507E08基因可能是与人脑胶质瘤形成有关的一条全长新基因。

关键词：基因芯片胶质瘤基因表达辐射杂交

一条脑胶质瘤相关的全长基因的生物信息学分析

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江苏医药 2005年第9期31卷 680-682页

作者：祁震宇惠国桢李瑶顾少华谢毅苏州大学附属第一医院神经外科 215006 上海复旦大学遗传工程国家重点开放实验室

目的报道一条脑胶质瘤相关的全长新基因的生物信息学分析及其研究的结果。方法对507E08克隆子进行了测序,生物信息学分析和Northern blot分析。结果507E08基因为全长基因,长度为2002bp,共编码203个氨基酸,命名为人核糖体蛋白L14·22。经... 详细信息

目的报道一条脑胶质瘤相关的全长新基因的生物信息学分析及其研究的结果。方法对507E08克隆子进行了测序,生物信息学分析和Northern blot分析。结果507E08基因为全长基因,长度为2002bp,共编码203个氨基酸,命名为人核糖体蛋白L14·22。经Northern blot证实507E08基因在人正常脑组织中低表达,而在人脑胶质瘤中高表达。结论生物信息学是一种有效分析未知基因的工具。507E08基因可能是与人脑胶质瘤形成有关的一条全长新基因。

关键词：生物信息学基因脑胶质瘤生物信息学分析人脑胶质瘤全长基因 Northern 507E08基因全长新基因 blot

全长新基因PPIL3的获得及在人脑胶质瘤中的表达

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中华实验外科杂志 2008年第4期25卷 480-482页

作者：祁震宇惠国桢李瑶顾少华谢毅苏州大学附属第一医院神经外科 215006 复旦大学遗传工程国家重点开放实验室

目的运用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因，并对其中1条基因进行初步研究。方法抽提正常成人脑组织与人脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针，经杂交、洗涤后，通过计算机观察两者表达谱的差异情况，对681F05... 详细信息

目的运用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因，并对其中1条基因进行初步研究。方法抽提正常成人脑组织与人脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针，经杂交、洗涤后，通过计算机观察两者表达谱的差异情况，对681F05克隆子进行Northern blot，原位杂交和生物信息学分析。结果通过4次基因芯片筛选，获得15条与胶质瘤相关的新基因，经northern blot证实681F05基因在人正常脑组织中低表达，而在人脑胶质瘤中高表达。原位杂交得到相同的结果。BLASTn和BLASTx分析显示，它们编码蛋白与线虫Cyp-10蛋白同源性分别为52％和72％。cDNA序列分析发现这两上克隆是同一个基因（命名为cyclophilin—like gene（PHL3））的两个不同的剪切体（PPIL3a和PPIL3b）。结论基因芯片筛选正常脑组织与人脑胶质瘤差异表达的基因具有样品用量少，高质量，高速度，高敏感等特性。681F05基因可能是与人脑胶质瘤形成有关的一条全长新基因。

关键词：脑胶质瘤基因芯片基因表达

脑胶质瘤相关新基因PKIβ的表达与蛋白质性质的研究

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中华医学杂志 2008年第25期88卷 1778-1782页

作者：祁震宇惠国桢李瑶顾少华谢毅苏州大学附属第一医院神经外科 215006 上海复旦大学遗传工程国家重点开放实验室

目的运用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因，并对其中1条基因进行了克隆和表达。方法抽提正常成人脑组织与脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针，经杂交、洗涤后，通过计算机观察二者表达谱的差异情况，对436F1... 详细信息

目的运用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因，并对其中1条基因进行了克隆和表达。方法抽提正常成人脑组织与脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针，经杂交、洗涤后，通过计算机观察二者表达谱的差异情况，对436F11克隆子进行Northern印迹，生物信息学分析和蛋白质的表达。结果通过4次基因芯片筛选，获得15条与胶质瘤相关的新基因，经Northern印迹证实436F11基因在人正常脑组织中高表达，而在人脑胶质瘤中低表达。BLASTn和BLASTx分析显示，436F11基因为全长新基因，共编码78个氨基酸，其理论相对分子质量为8468等电点为4．69，与鼠PKIβ69％同源，命名为人PKIβ。并在大肠杆菌中得到了PKIβ较高的表达蛋白，经纯化，在SDS—PAGE胶上获得了1条清晰的条带。氨基酸测序和分子量测定与生物信息学结果完全一致。结论基因芯片筛选正常脑组织与人脑胶质瘤差异表达的基因具有样品用量少，高质量，高速度，高敏感等特性。人PKIβ可能是与人脑胶质瘤形成有关的1条全长新基因，这为脑胶质瘤的基因治疗提供了一条新思路。

关键词： cDNA 矩阵神经胶质瘤基因表达