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β-淀粉样蛋白多态性的分子动力学模拟研究

β-淀粉样蛋白多态性的分子动力学模拟研究

作者：单升升大连理工大学

学位级别：硕士

阿尔兹海默病(Alzheimer's Disease, AD)是一种以认知功能障碍为特征的神经退行性疾病,严重威胁老年人健康。淀粉样蛋白p(Aβ)的错误折叠和异常聚集是导致AD的主要原因之一。Ap单体构象呈多态性分布,不同构象之间处于动态平衡,利用理论... 详细信息

阿尔兹海默病(Alzheimer's Disease, AD)是一种以认知功能障碍为特征的神经退行性疾病,严重威胁老年人健康。淀粉样蛋白p(Aβ)的错误折叠和异常聚集是导致AD的主要原因之一。Ap单体构象呈多态性分布,不同构象之间处于动态平衡,利用理论模拟研究Aβ构象变化的热力学特征和动力学过程,成为揭示AD发病机理的重要方法。Ap单点突变体与家族性AD发病机理密切相关。研究发现A21、E22、D23、M35位点的单点突变能够增大或减小Ap的聚集倾向,但对这些突变体如何影响Ap的构象转变进而调控Ap聚集的分子机制仍然缺乏深入理解。其次,体内金属离子如Zn,Cu和Fe等离子能够促进Ap聚集导致生成具有细胞毒性的Ap寡聚体,与AD的发病机理密切相关。研究金属离子与Ap的相互作用能够从分子水平上揭示金属离子对Ap构象多态性的影响。最后,近年实验表明可溶性的Ap寡聚体比成熟的纤维体具有更大的细胞毒性。Ap寡聚体富含p-折叠构象,结构也具有多态性分布的特点。研究由处于p-折叠构象的Ap在水溶液中自发聚集过程的动力学行为有助于揭示Ap寡聚体的结构和功能特征,阐明Ap寡聚体形成的热力学和动力学因素。因此,本文研究的主要内容包括：(1)利用副本交换分子动力学模拟对Aβ42及其突变体(A21G、E22G、E22K、 E22Q、D23N、E22 △和Met35OX)的构象空间进行采样。综合二面角动力学分析以及马尔科夫模型阐述了Aβ42及其突变体的自由能地貌、微观状态以及动力学性质。本文模拟结果揭示单点突变能够改变Aβ42的自由能地貌;Aβ42及其突变体的二面角势能曲线相互之间具有不同程度的差异,但是势能曲线上的最低点没有显著发生改变。马尔科夫模型进一步揭示了Aβ42中E22和D23突变体相对于Aβ42具有多个微观状态转化枢纽,以致增加了Aβ42构象相互转换的路径,最终加速Aβ42的聚集。相反,A21G和Met35OX突变体的构象转变更倾向发生于同-个微观状态体系。马尔科夫动态网格模型与自由能地貌图相结合揭示了A21G和Met35OX不同微观状态之间的转变在动力学上是可行的,但是在热力学上是不容易发生的。(2)利用副本交换分子动力学研究了结合Zn2+的Aβ40/Aβ42的多态性特征。利用二面角动力学分析策略计算了结合Zn2+的Aβ40 (Aβ40-Zn2+)和Aβ42 (Aβ42-Zn2+)单个二面角的势能分布,同时运用二面角主成分分析刻画了Aβ40-Zn2+和Aβ42-Zn2+的势能面。最后利用马尔科夫模型建立了Aβ40-Zn2+和Aβ42-Zn2+构象转变的动态网络。本文结果表明：Aβ40-Zn2+和Aβ42-Zn2+单个二面角的势能分布具有很大的相似程度,其中由Val24-Gly25-Ser26-Asn27构成的二面角差异最大;Aβ40-Zn2++和Aβ42-Zn2++的势能面均很平坦,反映了结合Zn2+的Ap构象转变需要克服的能垒较低,不同构象处于动态平衡,呈现多态性的特征;马尔科夫模型进一步揭示了Aβ40-zn2+和Aβ42-Zn2+构象转变的动态特征,由一定相似程度的构象聚类而成的微观状态均处于折叠网络的中转节点,从动力学上反映了结合Zn2+的Ap构象转变容易发生。特别的,发现p折叠结构在含Zn2+的Aβ构象中作用微小,与实验结果一致。(3)利用常规分子动力学方法研究了含p-发夹结构的Zn2+-Aβ40单体在水溶液中自发聚集成寡聚体的过程以及Zn2+对Zn2-Aβ40单体和Zn2+-Aβ4寡聚体中β-发夹结构影响;利用MM-PBSA方法探讨了Zn2+-Aβ40寡聚体的热力学特性。结果表明：Zn2+-Aβ40单体中的β-发夹结构在水溶液中不稳定;两个Zn2+-Aβ40单体能够自组装形成相对稳定的二聚体(Aβ40-Zn2+)2且p-发夹结构没有发生明显的改变;(Aβ40)2中两个Aβ40单体的相对位置发生改变并且结构变的无序,揭示Zn2+有助于稳定(Aβ40-Zn2+)2中的β-发夹结构和两个单体非纤维体取向。MM/PBSA计算结果说明(Aβ40-Zn2+)2和(Aβ40-Zn2+)4在水溶液中是可溶的;由二聚体进一步聚集生成其它寡聚体[(Aβ40-Zn2+)n>2]在热力学上是可行的;本文研究表明(Aβ40-Zn2+)2可能是形成更大Zn2+-Aβ40寡聚体的结构单元。综上所述,本文利用分子动力学模拟揭示了Aβ构象空间多态性的特征以及单体突变,金属离子和聚集过程对Aβ多态性的影响。Ap突变体的构象虽然仍呈现多态性,但构象转换的微观动力学已经发生深刻变化;金属Zn2+降低了Aβ单体构象转变的势能,导致Ap构象的平衡分布发生变化,特别是p-折叠构象的布局降低;结合Zn2+的Ap寡聚体比单体热力学上更稳定,单体结合的方式明显不同于成熟纤维体,揭

关键词：淀粉样蛋白β 金属离子寡聚体分子动力学模拟马尔科夫模型

(Ti,Al)N涂层应力沿层深分布的调整及大厚度涂层的制备

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金属学报 2012年第3期48卷 277-282页

作者：赵升升程毓常正凯王铁钢孙超深圳职业技术学院深圳518055 中国科学院金属研究所沈阳110016

利用电弧离子镀技术在不锈钢基体上制备了(Ti,Al)N涂层,研究了N_2分压改变对涂层残余应力沿层深分布及相关力学性能的影响.结果表明,低N_2分压下,(Ti,Al)N涂层残余应力沿层深分布较均匀,随N_2分压的增加,涂层应力沿层深呈"钟罩型"分布,... 详细信息

利用电弧离子镀技术在不锈钢基体上制备了(Ti,Al)N涂层,研究了N_2分压改变对涂层残余应力沿层深分布及相关力学性能的影响.结果表明,低N_2分压下,(Ti,Al)N涂层残余应力沿层深分布较均匀,随N_2分压的增加,涂层应力沿层深呈"钟罩型"分布,且全膜厚的应力值也明显增大;通过对涂层生长结构及微观成分分析,初步探讨了应力分布机理.随N_2分压的增加,涂层硬度会显著增加,而膜/基结合力则大幅下降;采用改变N_2分压工艺制备(Ti,Al)N涂层,可有效调整涂层残余应力沿层深分布趋势,改善其力学性能,并可成功制备厚度在130μm以上的硬质涂层.

关键词： (Ti,A1)N 硬质涂层应力分布调整应力 N_2分压

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食品中亲电物质的最新研究进展

食品科学 2012年第15期33卷 331-334页

作者：李磊周昇昇河南商业高等专科学校食品系河南郑州450044 河南省疾病预防控制中心公共卫生研究所河南郑州450016

食品中的亲电物质是高效低毒的核转录因子NF-E2相关因子2(Nrf2)诱导剂,通过Keap1/Nrf2/ARE通路激活Ⅱ相酶和抗氧化酶的转录。Ⅱ相酶和抗氧化蛋白可发挥慢速、长效的抗氧化和解毒作用。目前已经发现食品中有9类亲电物质,它们具有相似的... 详细信息

食品中的亲电物质是高效低毒的核转录因子NF-E2相关因子2(Nrf2)诱导剂,通过Keap1/Nrf2/ARE通路激活Ⅱ相酶和抗氧化酶的转录。Ⅱ相酶和抗氧化蛋白可发挥慢速、长效的抗氧化和解毒作用。目前已经发现食品中有9类亲电物质,它们具有相似的结构特征。研究和开发食品中的亲电物质,将成为功能性食品新的研究领域。

关键词：食品中的亲电物质基因营养学功能性食品 Ⅱ相酶

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基于标准化法评估的牦牛酸奶加工工艺

食品与生物技术学报 2018年第3期37卷 297-302页

作者：李升升靳义超青海大学畜牧兽医科学院青海西宁810016

为优化牦牛酸奶的加工工艺,通过标准化法评估研究了牦牛奶杀菌条件、菌种接种体积分数、发酵温度、后酸化时间对牦牛酸奶品质的影响。结果表明,牦牛乳在90℃下杀菌10 min,添加0.15%混合乳酸菌发酵剂、在43±1℃条件下发酵至凝固,4℃后酸... 详细信息

为优化牦牛酸奶的加工工艺,通过标准化法评估研究了牦牛奶杀菌条件、菌种接种体积分数、发酵温度、后酸化时间对牦牛酸奶品质的影响。结果表明,牦牛乳在90℃下杀菌10 min,添加0.15%混合乳酸菌发酵剂、在43±1℃条件下发酵至凝固,4℃后酸化24 h,制得的牦牛酸奶品质好。

关键词：牦牛酸奶发酵品质标准化

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第五届国际肢体重建大会见闻

中国修复重建外科杂志 2022年第12期36卷 1571-1572页

作者：杜辉关升升秦泗河北京积水潭医院足踝外科北京100035 美国加州湾区足踝外科诊所美国加州95008 国家康复辅具研究中心附属康复医院矫形骨科北京100176

十月初的台风轻轻掠过尤卡坦半岛后,墨西哥坎昆迎来了数个阳光明媚的大晴天,也迎来了第五届国际Ilizarov方法研究与应用学会(ASAMI)和国际肢体延长与重建学会(ILLRS)联合大会(简称“国际肢体重建大会”)。这是全世界肢体延长与重建领域... 详细信息

十月初的台风轻轻掠过尤卡坦半岛后,墨西哥坎昆迎来了数个阳光明媚的大晴天,也迎来了第五届国际Ilizarov方法研究与应用学会(ASAMI)和国际肢体延长与重建学会(ILLRS)联合大会(简称“国际肢体重建大会”)。这是全世界肢体延长与重建领域最高级别的学术盛会,继美国迈阿密、澳大利亚布里斯班。

关键词：布里斯班肢体延长美国迈阿密尤卡坦半岛 Ilizarov 澳大利亚

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热处理对牦牛肉品质的影响及其相关性分析

食品与机械 2016年第4期32卷 207-210页

作者：李升升青海省畜牧兽医科学院青海西宁810016 青海大学畜牧兽医科学院青海西宁810016

为研究热处理对牦牛肉品质的影响及各指标间的相关性,通过对牦牛背最长肌分别加热至中心温度50,60,70,80,90℃,测定不同热处理温度对牦牛肉肉色、剪切力、蒸煮损失、热收缩率以及感官品质的影响,并进行相关性分析。结果表明:随着温度的... 详细信息

为研究热处理对牦牛肉品质的影响及各指标间的相关性,通过对牦牛背最长肌分别加热至中心温度50,60,70,80,90℃,测定不同热处理温度对牦牛肉肉色、剪切力、蒸煮损失、热收缩率以及感官品质的影响,并进行相关性分析。结果表明:随着温度的升高,牦牛肉的蒸煮损失、热收缩率、剪切力显著增大(P<0.05);L*值和a*值显著下降(P<0.05);中心温度为80℃时,牦牛肉的感官品质较好;相关性分析表明,除感官评价外,L*值、a*值、长度收缩率、宽度收缩率、高度收缩率、剪切力、蒸煮损失各指标均显著相关(P<0.05)。总体来看,热处理使得牦牛肉的品质下降,但适宜的热处理有助于牦牛肉的感官品质提高。

关键词：牦牛肉热处理食用品质相关性分析

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传统风水学对山水城镇空间形态影响

传统风水学对山水城镇空间形态影响

作者：韩升升青岛理工大学

学位级别：硕士

论文从风水的角度研究山水城镇空间形态的构建,风水是中国传统文化的一个组成部分,是传统文化精髓的映射,其中体现了中国古代的哲学、美学思想,许多内容在今天仍然具有重大的现实意义。山水城镇是中国传统的理想栖居模式,这在中国传统... 详细信息

论文从风水的角度研究山水城镇空间形态的构建,风水是中国传统文化的一个组成部分,是传统文化精髓的映射,其中体现了中国古代的哲学、美学思想,许多内容在今天仍然具有重大的现实意义。山水城镇是中国传统的理想栖居模式,这在中国传统文学艺术——山水诗、山水画中得到充分体现,是古代城镇建设的理想模式,也是现代城镇建设的榜样。本文将“风水”比作“文化”,将“山水城镇”比作“家”。论文以文化与家(古代山水城镇、现代山水城镇、未来山水城镇)作为一条研究线索。论文内容主要分为四章:第一章,绪论。在阐述研究背景的基础上,对风水、山水城镇相关研究内容做了总结,并指出了研究的意义,研究框架和研究方法。第二章,风水理论在中国传统文化的映射。介绍了风水的文化渊源、美学、哲学内涵,以及其在城镇空间形态控制方面的理论和方法,结合阆中古城的空间格局中风水的运用,总结了风水范式的空间特征。第三章,传统风水学在城镇规划布局中的理论及运用——中国传统理想栖居模式。在对山水城镇概念界定的基础上,从空间特征、景观形态特征、文化内涵等方面描述了山水城镇作为的家的特点。全面分析和学习阆中古城的风水意象和在风水格局下的空间形态。最后,继承与创新——风水下清原山水城镇空间形态的构建。以清原满族自治县为例,将上述研究成果应用到清原山水城镇的规划布局、景观构建之中。第四章,结论与展望。总结研究结论,并对后续研究做了展望。

关键词：风水文化山水城镇家空间形态

新疆西天山博故图金矿床地质地球化学特征及成因研究

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新疆西天山博故图金矿床地质地球化学特征及成因研究

作者：孙升升中国地质大学(北京)

学位级别：硕士

博故图金矿床是西天山近年新发现的一处大型金矿床,位于新疆特克斯县城北东部依什基里克成矿带东段。金矿体赋存于下石炭统大哈拉军山组火山岩地层中的NW或EW向断裂构造破碎带内,呈脉状或透镜状。由金矿体到两侧火山岩地层围岩,基本对... 详细信息

博故图金矿床是西天山近年新发现的一处大型金矿床,位于新疆特克斯县城北东部依什基里克成矿带东段。金矿体赋存于下石炭统大哈拉军山组火山岩地层中的NW或EW向断裂构造破碎带内,呈脉状或透镜状。由金矿体到两侧火山岩地层围岩,基本对称依次出现硅化、黄铁绢英岩化、青磐岩化等热液蚀变。矿石矿物主要有黄铁矿、毒砂、方铅矿、闪锌矿、银金矿,脉石矿物主要有石英、玉髓、方解石、绢云母等。电子探针观测发现矿石中自然金主要在黄铁矿内呈包裹金,或在其他金属硫化物粒间赋存。对主要成矿阶段石英中的包裹体测温,成矿温度为129℃60℃,平均温度165℃;成矿流体盐度为0.4%NaCleqv,平均为3.9%NaCleqv;含金脉石英氢氧同位素分析和计算表明,成矿流体δ18O水-SMOW=-4.2‰.4‰,δDV-SMOW=-94.1‰111.2‰,主体属低温低盐度的循环大气降水。矿区金属硫化物的δ34S V-CDT范围为-7.5‰.8‰,均值为0.45‰,接近于原始地幔硫;矿石的REE配分曲线与矿区以及西天山大哈拉军山组火山岩具有明显的相似性,矿石铅和火山岩铅同位素组成特征基本一致,206Pb/204Pb=18.2438.535,207Pb/204Pb=15.5655.753,208Pb/204Pb=38.0218.647,结合载金黄铁矿的187Os/188Os(i)平均值为0.774±0.076,γOs(t)平均值为520,显示成矿物质主要来自赋矿围岩大哈拉军山组火山岩。矿区赋矿围岩英安质凝灰岩锆石U-Pb年龄为353.4±2.0Ma,钾长花岗岩锆石U-Pb年龄345.9±3.5Ma,依什基里克成矿带大哈拉军山组火山岩年龄为344±6Ma68.3±1.7Ma,矿石中载金黄铁矿的Re-Os等时线年龄为356.1±9.3Ma(MSWD=16),矿床和火山岩几乎同时形成。基于以上研究,博故图金矿床形成与古天山洋向伊犁板块下俯冲有关,应为浅成低温热液型金矿。论文为新疆西天山依什基里克成矿带金矿地质勘探提供新的指导。

关键词： H-O-S-Pb同位素示踪成岩成矿时代博故图金矿浅成低温热液金矿新疆西天山

陇东南部林缘山区青贮玉米品种筛选及其高效栽培研究

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草业学报 2025年第1期 191-202页

作者：王新友王小兰张万昌李颖马永玲王晓寅王建刚王海青岳贝凡刘永福王永宏刘珊白美婷甘肃开放大学

为筛选出适宜陇东南部林缘山区栽培的青贮玉米品种，并确定其合理的栽培方式，本试验先以5份青贮玉米品种为研究对象，通过田间试验比较了不同品种在该地区的生产性能和营养成分含量，并采用灰色关联度分析法进行综合评价发现：铁研53... 详细信息

为筛选出适宜陇东南部林缘山区栽培的青贮玉米品种，并确定其合理的栽培方式，本试验先以5份青贮玉米品种为研究对象，通过田间试验比较了不同品种在该地区的生产性能和营养成分含量，并采用灰色关联度分析法进行综合评价发现：铁研53表现最好，可作为主推品种。再以优势品种铁研53为材料，分别探究了不同施氮量(0、70、140、210和280 kg N·hm-2)和不同种植密度(60000、67500、75000、82500和90000株·hm-2)对铁研53产量和品质的影响。结果表明：铁研53产量在施氮210 kg N·hm-2时达到最大，为38.80 t·hm-2，施氮280 kg N·hm-2时产量并未随施氮量的增加而显著增加，但其营养品质在施氮280 kg N·hm-2时最好。铁研53随密度的增加产量增加，在密度为90000株·hm-2时产量最高；虽然种植密度为75000株·hm-2时粗蛋白含量达到最高，但粗蛋白产量在种植密度为90000株·hm-2时达到最高。为兼顾产量和利润，本研究通过拟合施氮量与产量和经济效益的关系，初步推荐该地区铁研53的适宜施氮量为280.74 kg N·hm-2。另外，综合考虑产量和品质，推荐铁研53种植密度为90000株·hm-2。

关键词：青贮玉米产量品质灰色关联度分析法种植密度施氮量

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