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作者：申绍祎西南大学

学位级别：硕士

薄鳅属(Leptobotia)鱼类是长江上游鱼类的重要组成部分。目前在长江上游较常见的有红唇薄鳅(Leptobotia rubrilabris)、长薄鳅(Leptobotia elongata)、小眼薄鳅(Leptobotia microphthalma)和紫薄鳅(Leptobotia taeniops)四种。四种薄鳅具有同为底栖性鱼类,以水生动物或小鱼为食,喜流水环境,产漂流性卵,具有短距洄游习性等相似特征,但分布上有一定差异。红唇薄鳅主要分布于长江上游干流、岷江、沱江等;长薄鳅主要分布于长江中上游干流、岷江、嘉陵江等,分布比红唇薄鳅略广;小眼薄鳅分布范围较窄,主要在岷江及长江干流宜宾到重庆一带;紫薄鳅分布较广,在宜宾以下长江主要干支流均能发现。近年来长江上游地区在大规模建设梯级水电站,梯级水电站的建设开发会导致洄游路线的破坏,从而改变鱼类遗传结构。本研究于2016年5月至2017年9月主要在长江上游攀枝花、宜宾(岷江)、南溪、合江、江津、巴南等江段采集样本,延伸至长江中游宜昌、监利、嘉鱼、九江。运用线粒体cyt b序列和控制区序列为分子标记,对其种群遗传结构进行了研究,结果如下:1.红唇薄鳅:共采集120尾红唇薄鳅,主要来自长江上游南溪、合江、江津、巴南江段。结果显示,红唇薄鳅cyt b序列检出了55个变异位点和43个单倍型,平均单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.901和0.0032。控制区序列共检出54个变异位点和72个单倍型,平均单倍型多样性(Hd)为0.972,核苷酸多样性(Pi)为0.0070。Network网络关系和系统发育NJ树结果显示红唇薄鳅单倍型不按地理分布聚类,但是分成了2个谱系,表明红唇薄鳅群体发生了同域遗传分化。AMOVA分析显示,红唇薄鳅两个谱系间有显著遗传分化,但各地理群体间没有发生遗传分化。与2012年(向家坝蓄水)前采集的样本进行对比分析,显示不同时间群体间也没有显著遗传分化。中性检验、错配分析及BSP(Bayesian skyline plot)分析表明红唇薄鳅种群在距今约9万年前发生过种群扩张事件。2.长薄鳅:共采集长薄鳅194尾,主要来自长江上游攀枝花、南溪、合江、江津、巴南和长江中游宜昌江段。分析显示长薄鳅cyt b序列共检出38个变异位点和34个单倍型,平均单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.625和0.0010。控制区基因序列检出57变异位点和55个单倍型,平均单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.925和0.0040。Network网络关系和系统发育NJ树不显示谱系分化。AMOVA分析显示长薄鳅各个群体间无显著遗传分化,长江上游群体与中游群体也没有显著差异。与2012年(向家坝蓄水)前采集的样本进行对比分析,显示不同时间群体间没有显著遗传分化。中性检验、错配分析及BSP分析表明长薄鳅约3.5万年前,即晚更新世时期发生过种群扩张事件。3.小眼薄鳅:对长江上游江津段和岷江下游宜宾段共104尾小眼薄鳅进行了分析。结果显示,小眼薄鳅cyt b序列共检出35个变异位点和37个单倍型,平均单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.899和0.0040。控制区序列总共检出50个变异位点和65个单倍型,平均单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.959和0.0043。Network网络关系和系统发育NJ树没有显示谱系分化。AMOVA分析显示小眼薄鳅遗传变异绝大部分来自群体内部,群体间无显著遗传分化(F<0.05)。中性检验、错配分析及BSP分析显示小眼薄鳅在距今约3万年前,即晚更新世时期发生过种群扩张事件。4.紫薄鳅:共采集紫薄鳅215尾,主要来自长江上游南溪、合江、江津、巴南以及长江中游监利、嘉鱼和九江江段。紫薄鳅cyt b序列共检出21个变异位点和22个单倍型,平均单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.643和0.0011。控制区序共检出20个变异位点和22个单倍型,平均单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.656和0.0023。Network网络关系和系统发育NJ树不显示谱系分化。AMOVA分析显示紫薄鳅遗传变异绝大部分来自群体内部,群体间无显著遗传分化(F<0.05)。中性检验、错配分析及BSP分析表明紫薄鳅种群在距今约1万年前发生过种群扩张事件。5.四种薄鳅遗传结构比较:四种薄鳅中,红唇薄鳅遗传多样性较高,其次是小眼薄鳅和长薄鳅,紫薄鳅遗传多样性最低。4种鱼的遗传多样性高低与其种群扩张时间相对应,其扩张时间先后依次是红唇薄鳅、长薄鳅、小眼薄鳅和紫薄鳅。四种薄鳅均未出现地理遗传分化,但红唇薄鳅显示出同域分化现象。对比向家坝蓄水前后群体遗传结构表明,水电站建设对四种薄鳅遗传结构的影响暂未显现出来。

关键词：长江上游薄鳅属线粒体DNA 遗传多样性

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长江上游小眼薄鳅线粒体DNA遗传多样性

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生态学杂志 2017年第10期36卷 2824-2830页

作者：申绍祎田辉伍刘绍平陈大庆吕浩汪登强西南大学生命科学学院重庆400715 中国水产科学院长江水产研究所农业部长江中上游渔业资源环境科学观测实验站武汉430223 西南大学动物科技学院重庆400715

小眼薄鳅是长江上游特有的小型鱼类,自然分布狭窄。本研究采用线粒体细胞色素b(cytochrome b,cyt b)和控制区序列,对长江上游江津段和岷江下游宜宾段两个群体共108尾小眼薄鳅(Leptobotia microphthalma)样本的遗传多样性和遗传结构进行... 详细信息

小眼薄鳅是长江上游特有的小型鱼类,自然分布狭窄。本研究采用线粒体细胞色素b(cytochrome b,cyt b)和控制区序列,对长江上游江津段和岷江下游宜宾段两个群体共108尾小眼薄鳅(Leptobotia microphthalma)样本的遗传多样性和遗传结构进行了分析。结果表明:小眼薄鳅群体cyt b序列共检出28个多态位点,34种单倍型,平均单倍型多样性指数(Hd)和核苷酸多样性指数(Pi)分别为0.889和0.00382;控制区序列共检出变异位点49个,单倍型65种,Hd指数和Pi指数分别为0.958和0.00420。分子方差分析(AMOVA)显示:小眼薄鳅采样点群体内的变异大于群体间的变异,遗传变异绝大部分来自群体内部,群体间无显著遗传分化(F_(ST)0.25),提示小眼薄鳅种群内部可能有隔离的产生。核苷酸错配分布及Tajima's D中性检验结果显示小眼薄鳅可能未发生种群扩张事件。

关键词：小眼薄鳅长江线粒体DNA 遗传多样性

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沱江宽体华鳅繁殖特性

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动物学杂志 2014年第5期49卷 699-706页

作者：王永明谢碧文王芳岳兴建王淯齐泽民吴英申绍祎内江师范学院生命科学学院长江上游鱼类资源保护与利用四川省重点实验室特色农业资源研究与利用四川省高校重点实验室内江641112 内江市第六中学内江641000

对2010年4~11月采集于沱江资中段的573尾宽体华鳅（Sinibotia reevesae）进行了繁殖特性研究。结果表明：宽体华鳅性腺发育分为6期,5月卵巢发育到Ⅳ期,精巢发育到Ⅴ期。繁殖期在5~8月,盛期为6~7月,可通过胸鳍和生殖孔差异辨别性别。繁... 详细信息

对2010年4~11月采集于沱江资中段的573尾宽体华鳅（Sinibotia reevesae）进行了繁殖特性研究。结果表明：宽体华鳅性腺发育分为6期,5月卵巢发育到Ⅳ期,精巢发育到Ⅴ期。繁殖期在5~8月,盛期为6~7月,可通过胸鳍和生殖孔差异辨别性别。繁殖群体雌雄性比为1∶1.15,2~3龄性成熟,性成熟最小年龄两性均为2龄,为补充群体占优势的繁殖群体。雄性（Ⅴ期）最小性成熟个体体长71 mm,体重5.43 g,成熟系数4.76%,雌性（Ⅲ期）最小性成熟个体体长76 mm,体重7.80 g,成熟系数1.46%。成熟卵巢中卵子大小基本一致,卵径分布为单峰型,属于单次产卵类型;繁殖群体体长76~120 mm,体重7.80~41.60 g;卵小,沉性,野生条件下胚胎发育需要流速较快的流水环境。

关键词：宽体华鳅繁殖特性沱江

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岷江下游产漂流性卵鱼类早期资源现状

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长江流域资源与环境 2019年第3期28卷 586-593页

作者：吕浩田辉伍申绍祎段辛斌刘绍平中国水产科学研究院长江水产研究所湖北武汉430223 西南大学动物科技学院重庆400715

为了解岷江下游干流江段产漂流性鱼类早期资源状况,于2016和2017年的5月7日～7月30日在岷江下游干流江段进行鱼类早期资源调查。调查发现:产漂流性卵鱼类18种,其中长江上游特有鱼类8种,分别是小眼薄鳅(Leptobotia microphthalrna)、长薄... 详细信息

为了解岷江下游干流江段产漂流性鱼类早期资源状况,于2016和2017年的5月7日～7月30日在岷江下游干流江段进行鱼类早期资源调查。调查发现:产漂流性卵鱼类18种,其中长江上游特有鱼类8种,分别是小眼薄鳅(Leptobotia microphthalrna)、长薄鳅(Leptobotia elongate)、红唇薄鳅(Leptobotia rubrilaris)、异鳔鳅鮀(Xenophysogobio boulengeri)、裸体异鳔鳅鮀(Xenophysogobio nudicorpa)、四川华鳊(Sinibrama taeniatus)、中华金沙鳅(Jinshaia sinensis)和短身金沙鳅(Jinshaia abbreviata)。主要产卵场有喜捷镇、高场镇和蕨溪镇3处。小眼薄鳅和长薄鳅的产卵规模相对较大,分别为652.75×10~6粒或尾和368.01×10~6粒或尾。典型对应分析结果显示,鲢(Hypophthalmichthys molitrix)和草鱼(Ctenopharyngodon idellus)产卵时断面流量相对增大,透明度相对降低;吻鮈(Rhinogobio typus)产卵期间江水透明度相对较高;随着流速增加,中华金沙鳅(Jinshaia sinensis)和短身金沙鳅(Jinshaia.abbreviata)卵漂流密度均相应增加。

关键词：岷江下游漂流性卵鱼类早期资源

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黄石爬鮡消化系统组织学观察

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重庆师范大学学报（自然科学版） 2015年第6期32卷 42-45,F0002页

作者：王永明申绍祎史晋绒谢碧文齐泽民王芳内江师范学院生命科学学院长江上游鱼类资源保护与利用四川省重点实验室四川内江641112

采用解剖和光镜技术详细观察了黄石爬鮡(Euchiloglanis kishinouyei)消化系统的组织结构。结果显示黄石爬鮡的消化系统由消化道和消化腺组成:1)消化道包括口咽腔、食道、胃、肠及肛门共5部分组成,肠道系数(肠道长度与鱼体全长的比值)为0... 详细信息

采用解剖和光镜技术详细观察了黄石爬鮡(Euchiloglanis kishinouyei)消化系统的组织结构。结果显示黄石爬鮡的消化系统由消化道和消化腺组成:1)消化道包括口咽腔、食道、胃、肠及肛门共5部分组成,肠道系数(肠道长度与鱼体全长的比值)为0.52±0.05,为典型的肉食性鱼类;口咽腔及食道粘膜层上皮为复层扁平上皮,内含杯状细胞、棒状细胞及味蕾;胃呈"V"形,粘膜层上皮为单层柱状上皮,无杯状细胞,胃腺在贲门部及盲囊部丰富,幽门部缺失;肠由前肠、中肠、后肠等3部分组成,肠道由前向后粘膜皱褶数量依次减少,粘膜皱褶及粘膜上皮柱状细胞高度依次降低,杯状细胞数量逐渐增多,肌肉层逐渐增厚。2)消化腺由肝胰脏和胆囊组成,肝脏分两叶,胰腺弥散分布于肝脏和肠系膜上,胆囊呈椭圆形,体积较大。黄石爬鮡消化系统的组织结构特点与其消化、吸收作用密切相关。

关键词：黄石爬鮡消化系统组织学

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岷江下游干流段鱼类资源现状及其多样性分析

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长江流域资源与环境 2018年第1期27卷 88-96页

作者：吕浩田辉伍段辛斌陈大庆申绍祎刘绍平西南大学动物科技学院重庆400715 中国水产科学研究院长江水产研究所湖北武汉430223 西南大学生命科学学院重庆400715

2014~2016年在岷江下游干流开展了4次鱼类资源调查,共采集到鱼类71种(亚种),隶属于3目11科51属,其中包括长江上游特有鱼类16种。不同调查江段鱼类组成相似性指数分析结果显示,宜宾和乐山江段相似性指数最低,70%;宜宾和屏山江段相似性指... 详细信息

2014~2016年在岷江下游干流开展了4次鱼类资源调查,共采集到鱼类71种(亚种),隶属于3目11科51属,其中包括长江上游特有鱼类16种。不同调查江段鱼类组成相似性指数分析结果显示,宜宾和乐山江段相似性指数最低,70%;宜宾和屏山江段相似性指数最高,92.19%。岷江下游干流江段主要经济鱼类为鲤(Cyprinus carpio)、光泽黄颡鱼(Pelteobaggrus nitidus)和瓦氏黄颡鱼(Pelteobagrus vachelli),在岷江下游整个江段渔获物中各占16.10%、13.96%和12.32%。对调查到的71种鱼类产卵类型进行分析结果显示,产粘性卵鱼类和漂流性卵鱼类分别占渔获物总重量的68.28%和27.07%。不同调查时间和不同江段多样性指数存在差异,其中5~7月份调查到的鱼类多样性指数高于10~12月份调查结果;乐山和犍为江段间鱼类均匀度Pielou指数存在显著差异(P<0.05)。从调查结果看,岷江下游干流段鱼类种类丰富,渔获物数量较高,但受岷江下游梯级开发的影响,资源前景不容乐观,需加强保护措施。

关键词：岷江下游鱼类组成多样性繁殖类型

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长江上游特有鱼类红唇薄鳅线粒体控制区遗传多样性研究

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淡水渔业 2017年第4期47卷 83-90页

作者：申绍祎田辉伍汪登强陈大庆刘绍平西南大学生命科学学院淡水鱼类资源与生殖发育教育部重点实验室水产科学重庆市市级重点实验室重庆400715 中国水产科学院长江水产研究所农业部长江中上游渔业资源环境科学观测实验站武汉430223

红唇薄鳅(Leptobotia rubrilabris)是长江上游特有鱼类,近年来资源量不断下降。本研究利用线粒体控制区序列片段(896 bp)分析了长江上游红唇薄鳅的遗传多样性及遗传结构,为其资源保护提供科学依据。共采集了119尾样本,来自长江上游江津... 详细信息

红唇薄鳅(Leptobotia rubrilabris)是长江上游特有鱼类,近年来资源量不断下降。本研究利用线粒体控制区序列片段(896 bp)分析了长江上游红唇薄鳅的遗传多样性及遗传结构,为其资源保护提供科学依据。共采集了119尾样本,来自长江上游江津、四川南溪、岷江下游蕨溪等。结果显示,共检测到58个单倍型,平均单倍型多样性为0.967,平均核苷酸多样性0.006 7,表明红唇薄鳅种群具有较高的遗传多样性。单倍型NETWORK网络关系图和分析系统树结果显示红唇薄鳅单倍型不按地理分布聚类,但是明显分成了2个谱系,表明红唇薄鳅群体发生了同域遗传分化。AMOVA分析结果显示,采样点和采样时间的群体间没有发生遗传分化。中性检验、错配分析及BSP(Bayesian skyline plot)分析表明红唇薄鳅Lineage 1种群在距今0.007 5~0.055 Ma(百万年)期间发生过种群选择或扩张事件。

关键词：红唇薄鳅(Leptobotia rubrilabris) 长江上游线粒体控制区遗传多样性

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长江上游特有鱼类红唇薄鳅线粒体控制区遗传多样性研究

长江上游特有鱼类红唇薄鳅线粒体控制区遗传多样性研究

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2017年中国水产学会学术年会

作者：申绍祎田辉伍汪登强陈大庆刘绍平西南大学生命科学学院中国水产科学研究院长江水产研究所

红唇薄鳅是长江上游特有鱼类,近年来资源量不断下降。本研究利用线粒体控制区序列片段(896bp)分析了长江上游红唇薄鳅的遗传多样性及遗传结构,为其资源保护提供科学依据。共采集了119尾样本,来自长江上游江津、四川南溪、岷江下游蕨溪... 详细信息

红唇薄鳅是长江上游特有鱼类,近年来资源量不断下降。本研究利用线粒体控制区序列片段(896bp)分析了长江上游红唇薄鳅的遗传多样性及遗传结构,为其资源保护提供科学依据。共采集了119尾样本,来自长江上游江津、四川南溪、岷江下游蕨溪等。结果显示,共检测到58个单倍型,平均单倍型多样性为0.967,平均核苷酸多样性0.0067,表明红唇薄鳅种群具有较高的遗传多样性。单倍型NETWORK网络关系图和分析系统树结果显示红唇薄鳅单倍型不按地理分布聚类,但是明显分成了2个谱系,表明红唇薄鳅群体发生了同域遗传分化。AMOVA分析结果显示,采样点和采样时间的群体间没有发生遗传分化。中性检验、错配分析及BSP(Bayesian skyline plot)分析表明红唇薄鳅Lineange 1种群在距今0.0075.055 Ma(百万年)期间发生过种群选择或扩张事件。

关键词：红唇薄鳅长江上游线粒体控制区遗传多样性

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长江上游异鳔鳅鮀线粒体控制区遗传多样性

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生态学杂志 2018年第5期37卷 1438-1443页

作者：董微微汪登强田辉伍俞立雄申绍祎段辛斌陈大庆西南大学生命科学学院重庆北碚400715 农业部长江中上游渔业资源环境科学观测实验站中国水产科学研究院长江水产研究所武汉430223

异鳔鳅鮀(Xenophysogobio boulengeri)是长江上游特有鱼类,目前主要分布在长江上游干流及岷江江段,近年来其资源量呈显著下降趋势。本研究采用线粒体DNA(mt DNA)控制区序列,分析江津、南溪、犍为和水富4个群体共178尾异鰾鳅鮀的遗传多... 详细信息

异鳔鳅鮀(Xenophysogobio boulengeri)是长江上游特有鱼类,目前主要分布在长江上游干流及岷江江段,近年来其资源量呈显著下降趋势。本研究采用线粒体DNA(mt DNA)控制区序列,分析江津、南溪、犍为和水富4个群体共178尾异鰾鳅鮀的遗传多样性。结果表明:异鳔鳅鮀线粒体控制区序列共检测出38个变异位点,定义41个单倍型;平均单倍型多样性(Hd)和平均核苷酸多样性(Pi)分别为0.817和0.002;分子方差分析(AMOVA)显示总群体间无显著遗传分化,绝大部分变异来自群体内部;但基因流(Nm)分析显示部分群体间基因交流受到阻碍,两两群体间的FST值支持部分群体间出现初步分化;错配分布及中性检验表明,异鳔鳅鮀在历史上曾发生过群体扩张事件,发生群体扩张的时间是0.0173 Ma;单倍型网络结构及NJ系统发育分析显示异鳔鳅鮀遗传结构比较单一。基于上述结论,应将异鳔鳅鮀作为一个整体进行就地保护。

关键词：异鳔鳅鮀线粒体DNA控制区遗传多样性长江上游

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岷江下游干流段鱼类资源现状及其多样性分析

岷江下游干流段鱼类资源现状及其多样性分析

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2017年中国水产学会学术年会

作者：吕浩田辉伍段辛斌陈大庆申绍祎刘绍平西南大学动物科技学院中国水产科学研究院长江水产研究所

2014-2016年在岷江下游干流开展了4次鱼类资源调查,共采集到鱼类71种（亚种）,隶属于3目11科51属,其中包括长江上游特有鱼类16种。不同调查江段鱼类组成相似性指数分析结果显示,宜宾和乐山江段相似性指数最低,70%;宜宾和屏山江段相似性... 详细信息

2014-2016年在岷江下游干流开展了4次鱼类资源调查,共采集到鱼类71种（亚种）,隶属于3目11科51属,其中包括长江上游特有鱼类16种。不同调查江段鱼类组成相似性指数分析结果显示,宜宾和乐山江段相似性指数最低,70%;宜宾和屏山江段相似性指数最高,92.19%。岷江下游干流江段主要经济鱼类为鲤（Cyprinus carpio）、光泽黄颡鱼（Pelteobaggrus nitidus）和瓦氏黄颡鱼（Pelteobagrus vachelli）,在岷江下游整个江段渔获物中各占16.10%、13.96%和12.32%。对调查到的71种鱼类产卵类型进行分析结果显示,产粘性卵鱼类和漂流性卵鱼类分别占渔获物总重量的68.28%和27.07%。不同调查时间和不同江段多样性指数存在差异,其中5-7月份调查到的鱼类多样性指数高于10-12月份调查结果;乐山和犍为江段间鱼类均匀度Pielou指数存在显著差异（P＜0.05）。从调查结果看,岷江下游干流段鱼类种类丰富,渔获物数量较高,但受岷江下游梯级开发的影响,资源前景不容乐观,需加强保护措施。

关键词：岷江下游鱼类组成多样性繁殖类型

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