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抗菌肽AMP-17抗白念珠菌作用靶点鉴定

生物工程学报 2023年第1期39卷 304-317页

作者：杨隆兵田竺青周罗雄孙朝琴黄明娇田淳仁彭建国果贵州医科大学基础医学院现代病原生物学特色重点实验室贵州贵阳550025 贵州医科大学环境污染与疾病监控教育部重点实验室贵州贵阳550025 贵州医科大学转化医学研究中心贵州贵阳550025 贵州医科大学公共卫生与健康学院贵州贵阳550025

白念珠菌(Candida albicans)是侵袭性真菌感染的主要致病性病原体。抗菌肽AMP-17有较强的抗念珠菌活性,经AMP-17作用白念珠菌后的蛋白组学结果显示,细胞壁(XOG1)和氧化应激(SRR1)蛋白基因表达差异显著,提示AMP-17可能通过影响XOG1和SRR... 详细信息

白念珠菌(Candida albicans)是侵袭性真菌感染的主要致病性病原体。抗菌肽AMP-17有较强的抗念珠菌活性,经AMP-17作用白念珠菌后的蛋白组学结果显示,细胞壁(XOG1)和氧化应激(SRR1)蛋白基因表达差异显著,提示AMP-17可能通过影响XOG1和SRR1基因发挥其抗白念珠菌作用。为进一步探究XOG1和SRR1基因是否为AMP-17的作用靶点,本研究利用规律成簇间隔短回文重复序列相关蛋白9(clustered regulatory interspaced short palindromic repeats-associated protein 9,CRISPR/Cas9)系统构建了白念珠菌xog1Δ/Δ和srr1Δ/Δ缺失菌;表型观察结果发现除XOG1基因缺失可影响白念珠菌的体外应激和菌丝形成,2个基因缺失对白念珠菌生长繁殖和生物膜形成无明显影响;药敏实验分析显示AMP-17对xog1Δ/Δ和srr1Δ/Δ缺失菌的MIC80值从野生菌的8μg/mL增至16μg/mL,而对srr1Δ/Δ::srr1回补菌的MIC80值降至野生菌水平。此外,AMP-17抑制2株缺失菌生物膜形成的能力均较野生菌明显降低,表明缺失菌在酵母态及生物膜形成过程中对AMP-17的敏感性均降低,提示XOG1和SRR1基因可能是AMP-17发挥抗白念珠菌的潜在靶点。本研究结果为进一步探讨新型肽类抗真菌药物的抗菌机制提供了一定的实验依据和基础。

关键词：抗菌肽 AMP-17 白念珠菌 XOG1 SRR1 规律成簇间隔短回文重复序列相关蛋白9(CRISPR/Cas9)

抗菌肽AMP-17对黄曲霉抑制作用的初步研究

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食品与发酵工业 2022年第20期48卷 64-69页

作者：朱丽娟国果田竺青孙朝琴杨隆兵黄明娇刘鉴彭建石帮慧贵州医科大学基础医学院现代病原生物学重点特色实验室贵州贵阳550025 贵州医科大学转化医学研究中心贵州贵阳550025 贵州医科大学生物与工程学院环境污染监测与疾病控制重点实验室贵州贵阳550025 贵州医科大学公共卫生与健康学院贵州贵阳550025

探讨抗菌肽AMP-17对食源性微生物黄曲霉孢子萌发、菌丝生长、产毒等的影响。通过微量液体稀释法测定AMP-17对黄曲霉最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)并绘制生长曲线。血球计数板及干重法计算经AMP-17作用后,黄曲霉... 详细信息

探讨抗菌肽AMP-17对食源性微生物黄曲霉孢子萌发、菌丝生长、产毒等的影响。通过微量液体稀释法测定AMP-17对黄曲霉最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)并绘制生长曲线。血球计数板及干重法计算经AMP-17作用后,黄曲霉的孢子萌发率、菌丝生长抑制率。酶联免疫吸附法分析AMP-17对黄曲霉毒素产量的影响。扫描电镜观察AMP-17作用后黄曲霉孢子及菌丝体的形态结构变化。结果显示,AMP-17对黄曲霉的MIC为50μg/mL;生长曲线显示其能显著抑制黄曲霉的生长;50μg/mL AMP-17作用后黄曲霉孢子萌发率为8%,菌丝抑制率可达72.5%;低浓度的AMP-17即可显著降低黄曲霉毒素的合成;经AMP-17干预后,黄曲霉孢子及菌丝形态结构均遭到明显破坏。因此AMP-17对黄曲霉的生长及产毒具有显著抑制作用。该研究结果为AMP-17应用于食品防腐提供了实验依据,可进一步丰富食物防腐剂种类。

关键词：抗菌肽 AMP-17 黄曲霉抑制作用

分子体系自由能地貌图的变分分析及AI算法实现

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物理学报 2024年第6期73卷 82-94页

作者：杜泊船田圃吉林大学生命科学学院长春130012 吉林大学人工智能学院长春130012

精确描述复杂分子体系的自由能地貌图是理解和操控其行为,并进一步实现分子设计制造工业化的重要基础.刻画高维空间自由能地貌图的主要挑战是其往往在不同时空间尺度上具有多个层次,每个层次都可能有不止一个亚稳态被相应的自由能垒分开... 详细信息

精确描述复杂分子体系的自由能地貌图是理解和操控其行为,并进一步实现分子设计制造工业化的重要基础.刻画高维空间自由能地貌图的主要挑战是其往往在不同时空间尺度上具有多个层次,每个层次都可能有不止一个亚稳态被相应的自由能垒分开,且跨越路径有可能不止一条.另外很多体系涉及非线性行为,这使得理论解析和直接使用分子模拟都有很大困难.针对这些挑战,多年来研究者们发展了多种多样的增强采样方法,但往往需要很多经验选择和操作,从而一方面使得研究进程较为缓慢,另一方面也让误差控制成为困难.变分虽然在物理、统计和工程中已经被广泛应用并取得巨大成功,但在复杂分子体系中的应用却随着神经网络的发展刚刚开始.本文将对这些探索性工作的主要方向、进展和局限进行简要总结,也对将来的可能发展给出展望,希望能够激发更多对基于变分的分子体系自由能地貌图人工智能算法的关注和努力,促进大分子药物、分子生物机器等实践应用的发展.

关键词：变分神经网络复杂分子体系自由能地貌图

融合模型求解与深度学习的可见光通信非线性均衡器

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兵工学报 2024年第2期45卷 466-473页

作者：田大明苗圃青岛大学电子信息学院山东青岛266071

沃尔特拉非线性后均衡器(Volterra Series Nonlinear Post-Equalizer,VS-NPE)可以补偿可见光通信(Visible Light Communication,VLC)的非线性失真和多径效应,但其结构复杂且均衡精度有限。在VS-NPE内核求解基础上,提出一种基于阈值自学... 详细信息

沃尔特拉非线性后均衡器(Volterra Series Nonlinear Post-Equalizer,VS-NPE)可以补偿可见光通信(Visible Light Communication,VLC)的非线性失真和多径效应,但其结构复杂且均衡精度有限。在VS-NPE内核求解基础上,提出一种基于阈值自学习近似消息传递(Learned Threshold Approximate Message Passing,LTAMP)网络的非线性均衡器。修正样本观测矩阵以克服其列高度相关的缺陷;在改进近似消息传递(Approximate Message Passing,AMP)算法迭代的基础上,将算法每一次迭代的计算过程映射为一层特殊的神经网络,经逐层展开后构建出完整的LTAMP均衡器。所提方法融合了模型求解和深度学习的优势,可从样本中学习最佳的AMP参数,以克服其对噪声敏感且输出不稳定的缺陷,进而提升内核求解稳定性与计算精度。仿真结果表明,与稳固阈值AMP算法相比,所提方法在误码率为1×10^(-3)时能取得2 dB的信噪比增益,且对样本噪声具有较强的自适应性,展现出优异的非线性失真补偿能力。

关键词：沃尔特拉非线性后均衡器可见光通信近似消息传递算法深度学习

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家蝇新型抗菌肽抗肿瘤活性研究

中国临床药理学杂志 2022年第11期38卷 1207-1210页

作者：田竺青杨隆兵朱丽娟孙朝琴黄明娇彭建刘鉴国果贵州医科大学基础医学院现代病原生物学特色重点实验室贵州贵阳550025 贵州医科大学环境污染与疾病监控教育部重点实验室贵州贵阳550025 贵州医科大学转化医学研究中心贵州贵阳550025

目的研究家蝇抗菌肽17(AMP-17)和家蝇天蚕素18(C18)抗菌肽对肿瘤细胞的体外抗肿瘤活性。方法将人白血病细胞(K562、Hel)、人结肠癌细胞(DLD-1、Caco2)、人肝癌细胞(HepG2)、人喉癌细胞(HEP-2)、人肺癌细胞(A549)分为正常组(只加完全培养... 详细信息

目的研究家蝇抗菌肽17(AMP-17)和家蝇天蚕素18(C18)抗菌肽对肿瘤细胞的体外抗肿瘤活性。方法将人白血病细胞(K562、Hel)、人结肠癌细胞(DLD-1、Caco2)、人肝癌细胞(HepG2)、人喉癌细胞(HEP-2)、人肺癌细胞(A549)分为正常组(只加完全培养基)、阳性对照组(9.38,18.75,37.50,75.00和150.00μg·mL^(-1)盐酸阿霉素)、AMP-17实验组(60,80,100,120和140μg·mL^(-1) AMP-17)和C18实验组(10,20,40,60和80μg·mL^(-1) C18)。用细胞计数试剂盒-8(CCK-8)法测定肿瘤细胞增殖的抑制能力,计算半抑制浓度(IC_(50));用CCK-8法检测AMP-17和C18对人正常单核细胞(THP-1)的细胞毒性;用微量分光光度法测定AMP-17和C18对小鼠红细胞的半数溶血值(HC_(50))。结果AMP-17、C18均可抑制肿瘤细胞增殖,AMP-17对肿瘤细胞K562、Hel、DLD-1、Caco-2、HEP-2、HepG2和A549的IC_(50)值分别为(58.91±3.57),(80.81±1.16),(98.37±4.25),(88.16±3.46),(64.56±2.05),(70.03±1.78)和>150μg·mL^(-1);C18对上述肿瘤细胞的IC_(50)值分别为(26.80±0.20),(14.17±2.42),(13.59±2.48),(54.64±3.48),(36.30±0.23),(72.15±5.08)和(28.82±1.11)μg·mL^(-1)。AMP-17、C18和阳性药盐酸阿霉素对THP-1的IC_(50)值分别为(60.90±1.55),(32.60±1.21)和(8.51±0.81)μg·mL^(-1)。AMP-17和C18对红细胞的HC_(50)分别为>80和(44.41±5.45)μg·mL^(-1)。结论AMP-17、C18具有抗肿瘤活性,但C18溶血性较强。

关键词：家蝇抗菌肽17 家蝇天蚕素18 抗肿瘤活性细胞毒性溶血性

基于ECOC平衡随机森林的雷达降水粒子分类

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系统工程与电子技术 2024年第5期46卷 1599-1606页

作者：李海田众钱君中国民航大学天津市智能信号与图像处理重点实验室天津300300 中国航空工业集团公司雷华电子技术研究所江苏无锡214063

针对数据不平衡情况下的降水粒子分类问题,提出了一种基于纠错输出码(error correcting output code,ECOC)平衡随机森林的双偏振气象雷达降水粒子分类方法。首先,将多类别降水粒子数据集编码为多个二分类数据集;然后,对二分类数据集进... 详细信息

针对数据不平衡情况下的降水粒子分类问题,提出了一种基于纠错输出码(error correcting output code,ECOC)平衡随机森林的双偏振气象雷达降水粒子分类方法。首先,将多类别降水粒子数据集编码为多个二分类数据集;然后,对二分类数据集进行有放回的平衡重采样,构建多棵分类回归树;最后,利用所有的分类回归树联合进行降水粒子分类。对实测数据的处理结果表明,所提方法能够在保证总体准确率较高的情况下,大幅提高少数类的分类效果。

关键词：双偏振气象雷达降水粒子分类数据不平衡纠错输出码平衡随机森林

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复杂系统理论在社会治理中的应用综述

电子科技大学学报 2024年第3期53卷 462-472页

作者：田逢时疏学明汪秉宏中国人民警察大学智慧警务学院廊坊065000 清华大学安全科学学院北京100084 中国科学技术大学近代物理系合肥230026

经济持续发展和社会不断进步对社会治理现代化提出了新的要求。社会是一个典型的复杂系统,社会治理研究迫切需要从复杂系统的角度,依靠多学科的交叉融合,从整体上加以解决。该文选取复杂系统相关研究方法,对社会治理中疫情防控、谣言管... 详细信息

经济持续发展和社会不断进步对社会治理现代化提出了新的要求。社会是一个典型的复杂系统,社会治理研究迫切需要从复杂系统的角度,依靠多学科的交叉融合,从整体上加以解决。该文选取复杂系统相关研究方法,对社会治理中疫情防控、谣言管控、智慧交通和智慧消防4个典型场景进行了重点分析,总结了复杂系统理论在社会治理领域应用中存在的问题,对下一步主要发展的方向进行了展望。

关键词：复杂系统社会治理谣言管控智慧交通智慧消防

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论图书出版机构的社会职能

中国出版 2024年第14期 25-30页

作者：田大余云南出版集团

图书出版机构作为一种社会组织，承担着多方面的社会职能。在文化建设方面，有传递资讯、传输知识、传导价值、传播文化、传承文明、涵养精神等职能；在政治建设方面，有理论武装、宣传教育等职能；在社会建设方面，有社会化、社会教化... 详细信息

图书出版机构作为一种社会组织，承担着多方面的社会职能。在文化建设方面，有传递资讯、传输知识、传导价值、传播文化、传承文明、涵养精神等职能；在政治建设方面，有理论武装、宣传教育等职能；在社会建设方面，有社会化、社会教化、社会激励与约束、社会服务、教育服务等职能；在经济建设方面，有产品供给、价值创造、社会就业等职能。图书出版机构应当准确把握自身职能定位，以为国家立心、为民族立魂、为时代立传的情怀，更好地承担起举旗帜、聚民心、育新人、兴文化、展形象的使命任务。

关键词：文化传播图书出版机构社会职能

切片厚度和护色处理对热风干燥雪花梨干品质的影响

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保鲜与加工 2024年第6期24卷 40-47页

作者：滑竺青赵江丽杨壮易岸威王永霞关军锋河北工程大学生命科学与食品工程学院河北邯郸056000 河北省农林科学院生物技术与食品科学研究所河北石家庄050051

采用热风干燥法制备雪花梨干。以色泽、硬度、弹性、咀嚼性、总酚、总黄酮、可溶性糖和感官评分为评价指标,考察切片厚度(3、4、5、6、7、8 mm)和护色处理(CaCl_(2)、NaCl、D-异抗坏血酸钠、柠檬酸溶液浸泡、热烫)对梨干品质的影响,并以... 详细信息

采用热风干燥法制备雪花梨干。以色泽、硬度、弹性、咀嚼性、总酚、总黄酮、可溶性糖和感官评分为评价指标,考察切片厚度(3、4、5、6、7、8 mm)和护色处理(CaCl_(2)、NaCl、D-异抗坏血酸钠、柠檬酸溶液浸泡、热烫)对梨干品质的影响,并以Z-score(Z值)综合模型进行评价,优选出适宜的切片厚度和护色处理。结果表明:随着切片厚度的增加,梨干的颜色变深,硬度、弹性和咀嚼性增大,总酚和总黄酮含量降低,可溶性糖含量增加;Z-score综合模型评价结果显示,切片厚度为4 mm时,Z值总和最高。护色处理均能改善梨干色泽,提高总酚和总黄酮含量,但可溶性糖含量降低。D-异抗坏血酸钠处理组梨干的亮度值(L^(*))最高,红绿值(a^(*))和蓝黄值(b^(*))最低,色差值(ΔE)最小;CaCl_2处理提高了梨干的硬度;热烫处理降低了梨干的弹性和咀嚼性。Z-score综合模型评价结果显示,以0.8 g/100 mL D-异抗坏血酸钠溶液浸泡护色的Z值总和最高。综上,热风干燥制备雪花梨干的厚度和护色条件为:切片厚度4 mm、0.8 g/100 mL D-异抗坏血酸钠溶液浸泡10 min。

关键词：梨干热风干燥工艺条件品质雪花梨