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《遗传学》课程思政改革与实践

中文科技期刊数据库（引文版）教育科学 2024年第5期 0005-0008页

作者：田昌绪薛明李俊辉陈华谱邓岳文广东海洋大学水产学院广东湛江524088

《遗传学》是广东海洋大学生物科学、水产养殖学和水生动物医学等专业的核心课程。近年来,课程依托线上线下混合式教学优势,深度挖掘思政元素,将思政元素有机融入课程建设的全过程,通过课程团队建设,教学目标重塑,聚焦思政育人的方式方... 详细信息

《遗传学》是广东海洋大学生物科学、水产养殖学和水生动物医学等专业的核心课程。近年来,课程依托线上线下混合式教学优势,深度挖掘思政元素,将思政元素有机融入课程建设的全过程,通过课程团队建设,教学目标重塑,聚焦思政育人的方式方法,初步建成遗传学课程思政元素案例库。通过建设,学生学习积极性增强,成绩稳步提升,学生创新实践能力和团队协作意识显著增强,育人成效明显。

关键词：遗传学课程思政混合式教学育人成效

多鳞[鱼喜](Sillago sihama)高密度遗传连锁图谱构建及生长性状QTL定位分析

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海洋与湖沼 2023年第1期54卷 194-203页

作者：田昌绪朱奕安钟键林星桦叶明慧黄洋张玉蕾朱春华李广丽广东海洋大学水产学院、广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心、广东省水产动物病害防控与健康养殖重点实验室广东湛江524088 南方海洋科学与工程广东省实验室(湛江) 广东湛江524088 湛江海关技术中心广东湛江524022

为构建多鳞[鱼喜](Sillago sihama)遗传连锁图谱并鉴定生长等重要经济性状数量性状位点(QTL),实验通过基因分型测序(GBS)技术对163个多鳞[鱼喜]个体(2个亲本和161个全同胞家系F1代)进行测序及标记分型,并通过复合区间定位法对该物种的... 详细信息

为构建多鳞[鱼喜](Sillago sihama)遗传连锁图谱并鉴定生长等重要经济性状数量性状位点(QTL),实验通过基因分型测序(GBS)技术对163个多鳞[鱼喜]个体(2个亲本和161个全同胞家系F1代)进行测序及标记分型,并通过复合区间定位法对该物种的体重、体高、体厚、眼径、体长和背鳍前长6个生长性状进行QTL定位分析。结果显示,多鳞[鱼喜]首张高密度遗传连锁图谱全长2 154.803 c M,标记间平均遗传距离0.455 c M,共有4 735个SNP标记分配到24个连锁群。QTL定位分析结果发现在6个生长性状中共检测到20个生长显著相关QTL位点,分布在8个连锁群上,单个QTL的LOD值范围为3.02~4.23,可解释的表型变异范围为0.14%~8.42%。其中,在连锁群LG08聚集了8个生长性状显著相关的QTL。通过对候选QTL区间内的基因进行功能注释,共筛选到了19个潜在生长调控相关基因,包含igf1、igf2、sstr5、sst1a、tgfbr2、gas1、igfals、gfg6、gfg20、bmp7、kdm5c、tti1以及rbm10等。实验获得的遗传标记及相关候选基因是多鳞[鱼喜]生长相关性状标记辅助选择(MAS)的有用基因资源,为进一步研究鱼类生长调控机制提供了更多的理论依据。

关键词：多鳞[鱼喜] 基因分型测序(GBS) 数量性状位点(QTL) 生长相关性状候选基因

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12月龄多鳞鱚形态性状对体质量的影响

广东海洋大学学报 2022年第1期42卷 137-143页

作者：余家旺王耀嵘林星桦沈奕君李广丽黄洋朱春华田昌绪广东海洋大学水产学院/广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心/南方海洋科学与工程广东省实验室(湛江) 广东湛江524088

【目的】研究12月龄多鳞鱚(Sillago sihama Forsskål)形态性状与体质量之间的关系,筛选适用于选育的主要形态性状。【方法】测定12个形态性状与体质量的表型参数,通过通径分析、相关分析和多元回归分析估计主要性状对体质量的直接影响... 详细信息

【目的】研究12月龄多鳞鱚(Sillago sihama Forsskål)形态性状与体质量之间的关系,筛选适用于选育的主要形态性状。【方法】测定12个形态性状与体质量的表型参数,通过通径分析、相关分析和多元回归分析估计主要性状对体质量的直接影响和间接影响。【结果】12月龄多鳞鱚13个性状之间的相关系数均达到极显著水平(P<0.01)。通径分析表明,体高(X1)、体厚(X2)、眼径(X7)、体长(X10)和背鳍前长(X11)对体质量(Y)有明显的直接影响;除体长外,其他生长性状对体质量的直接影响均小于它们对体质量的间接影响,同时,体长对体质量的直接影响最大。相关分析表明,上述5个主要性状是体质量变化的主要影响因素。体长对体质量的单独决定系数最大(0.331),5个主要性状对体质量的总决定系数为0.928。建立的以主要性状为自变量、体质量为因变量的回归方程为Y=-13.339+2.913X1+3.352X2-4.467X7+1.473X10+0.763X11。【结论】体长、体厚、眼径、体高和背鳍前长等5个主要性状是影响多鳞鱚体质量的核心性状,其中体长影响最大。

关键词：多鳞鱚形态性状相关分析通径分析多元回归方程

自媒体平台下导师团队制研究生创新能力培养模式的探索与实践

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中文科技期刊数据库（全文版）教育科学 2022年第5期 218-221页

作者：田昌绪石红娟吴天利蒋谋炎李广丽广东海洋大学水产学院广东湛江524088

研究生教育是拔尖创新人才培养的重要阶段,创新能力是研究生培养质量的重要内容。如何营造创新氛围、搭建创新平台、培养创新人才是当前研究生教育改革的关键所在。当前,地方院校研究生教育资源不足、生源质量下降等问题突出,研究生自... 详细信息

研究生教育是拔尖创新人才培养的重要阶段,创新能力是研究生培养质量的重要内容。如何营造创新氛围、搭建创新平台、培养创新人才是当前研究生教育改革的关键所在。当前,地方院校研究生教育资源不足、生源质量下降等问题突出,研究生自主学习和创新能力明显不足。本研究根据地方高校尤其是水产类专业研究生实际需求,营造合理的导师团队,打造自媒体(微信公众号)科研交流平台,通过在微信公众号中设置“学术道德(导师主导)”、“学术前沿(学生主导)”和“实验操作(导师+学生)”等三大模块,将自媒体平台用于加强研究生学术道德思想教育、丰富研究生培养内涵、促进信息交流与思维创新以及了解学术前沿动态的有效途径;同时,构建有效的奖励惩罚机制,探索研究生培养模式的创新,提升研究生学术创新能力。

关键词：公众号导师队伍研究生教育创新能力

胡子鲇(Clarias fuscus)雌雄基因组Survey分析

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基因组学与应用生物学 2023年第6期42卷 610-619页

作者：林星桦周大颜沈奕君吴冠佐吴冠佑陈宇张玉蕾肖珊邓思平李广丽田昌绪广东海洋大学水产学院广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心广东省水产动物病害防控与健康养殖重点实验室湛江524088 广西壮族自治区水产引育种中心南宁530001 广西宏泰水产良种场玉林530031

胡子鲇(Clarias fuscus)是我国华南地区大规模养殖的淡水鱼类。为评估胡子鲇雌雄基因组基本信息,以便为后续构建全基因组精细图谱提供基础,本研究分别选取雌雄胡子鲇进行全基因组Survey分析。根据定长核苷酸串(K-mer)分析,雌鱼和雄鱼基... 详细信息

胡子鲇(Clarias fuscus)是我国华南地区大规模养殖的淡水鱼类。为评估胡子鲇雌雄基因组基本信息,以便为后续构建全基因组精细图谱提供基础,本研究分别选取雌雄胡子鲇进行全基因组Survey分析。根据定长核苷酸串(K-mer)分析,雌鱼和雄鱼基因组大小分别为949.69 Mb和957.96 Mb。雌鱼和雄鱼的杂合率分别为0.27%和0.23%。雌鱼和雄鱼重复序列比例分别为33.83%和33.62%。雌鱼和雄鱼基因组的G+C含量分别为39.98%和39.14%。雌鱼和雄鱼基因组组装的大小分别为926.78 Mb和992.08 Mb,雌鱼和雄鱼组装基因组N50长度分别为3082 bp和2810 bp。简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)筛选结果显示,雌鱼和雄鱼的基因组中分别检测到1295490条和1184183条SSR序列。通过比较基因组分析,鉴定出8445条雌性特异性序列和110743条雄性特异性序列,这些性别特异性序列分别被注释到460个(雌鱼)和822个(雄鱼)基因。本研究为胡子鲇全基因组的后续构建提供了理论依据,并为后续分子育种研究提供了有价值的数据。

关键词：胡子鲇基因组Survey 基因组组装简单重复序列基因组比较

金钱鱼(Scatophagus argus)体色发育及黑斑的形成过程

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海洋与湖沼 2021年第6期52卷 1474-1485页

作者：林晓展张俊鹏黄洋石红娟李广丽田昌绪广东海洋大学水产学院广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心湛江524088 南方海洋科学与工程广东省实验室(湛江) 湛江524088

鱼类的体色图案作为外部形态最显著的特征之一,在动物生存与物种间的交流中起着重要作用。为探究金钱鱼(Scatophagus argus)体色发育及黑斑的形成过程,首先对成年金钱鱼鳍条中色素细胞进行显微观察,采用Olympus体视解剖镜观察了金钱鱼... 详细信息

鱼类的体色图案作为外部形态最显著的特征之一,在动物生存与物种间的交流中起着重要作用。为探究金钱鱼(Scatophagus argus)体色发育及黑斑的形成过程,首先对成年金钱鱼鳍条中色素细胞进行显微观察,采用Olympus体视解剖镜观察了金钱鱼从胚胎色素形成期到仔鱼后期体表色素细胞的种类与分布特征,并跟踪观察了金钱鱼从稚鱼期到成鱼期主要图案黑斑的形成过程,同时对成年金钱鱼的黑斑和非黑斑皮肤进行透射电镜切片观察。结果显示,构成金钱鱼体色共四种色素细胞,分别为:黑色素细胞、黄色素细胞、虹彩色素细胞和红色素细胞,黑色素细胞在胚胎发育阶段最早发生,黄色素细胞和红色素细胞次之,而虹彩色素细胞发生最晚,直到仔鱼后期阶段才观察到。金钱鱼体色仔鱼期(0-24 dph)出现了有趣的变化过程:在0 dph(day post hatching)仔鱼体色较浅到1 dph仔鱼体色明显加深,而2-7 dph仔鱼的躯干部体色出现明显的褪黑现象,在8-24 dph阶段金钱鱼体色又出现了明显的复黑现象,并且在24 dph时通体发黑,在30 dph时虹彩色素细胞在皮肤中的大量出现并形成隐约可见的色素条带,直到幼鱼阶段(50 dph)形成清晰的黑色纵带条纹后不断演变成多个黑斑并在成年金钱鱼中稳定沉积的过程。透射电镜结果发现皮肤中黑色素细胞和虹彩色素细胞数量最多,分布最广。黑斑形成的关键原因是黑素小体和黑色素细胞大量聚集,虹彩色素细胞在其周围大量聚集并形成明显的包围界限。追踪观察了金钱鱼从胚胎色素发育、前期仔鱼、后期仔鱼、稚鱼、幼鱼和成鱼共六个阶段的色素沉积和体色变化过程,为金钱鱼野生群体的年龄鉴定提供了参考,并为进一步的金钱鱼体色改良提供理论指导。

关键词：金钱鱼体色发育褪黑现象复黑现象黑斑形成

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生长相关分子标记在翘嘴鳜五代中的富集

水生生物学报 2016年第5期40卷 951-957页

作者：宋易梁旭方田昌绪吕丽媛赵程华中农业大学水产学院农业部淡水生物繁育重点实验室湖北省淡水渔业协同创新中心武汉430070

为进一步了解人工选育对翘嘴鳜生长相关遗传标记的影响作用,研究以翘嘴鳜"华康1号"的5代选育群体为实验材料,对具有生长相关优势基因型的5个标记的6个位点进行扩增,通过直接测序和聚丙烯酰胺凝胶电泳两种方法分型后,统计其优势基因型个... 详细信息

为进一步了解人工选育对翘嘴鳜生长相关遗传标记的影响作用,研究以翘嘴鳜"华康1号"的5代选育群体为实验材料,对具有生长相关优势基因型的5个标记的6个位点进行扩增,通过直接测序和聚丙烯酰胺凝胶电泳两种方法分型后,统计其优势基因型个体数目在翘嘴鳜5代中的变化。结果显示,在5代群体中,2个单核苷酸多态性位点和4个微卫星位点优势基因型的数目的分布范围为0—4,从F1到F5代,这6个位点优势基因型的平均值分别为0.36、0.71、0.68、0.77和0.94,优势基因型的平均含量随选育世代的增加呈现递增趋势,从侧面反映了人工选育在一定程度上富集了优良基因。此外,对微卫星位点进行了遗传相似性和遗传距离分析,结果显示,随着选育的进行,后续世代与F1的遗传距离有明显的增大趋势,遗传相似性减小,这符合育种的客观规律。但相邻世代间的遗传距离则逐代减小,遗传相似性逐代增大,说明人工选育将遗传相似性较大的群体保留下来了,这种相似性表现在表型上包括生长快、体重大、体长增加等。F1到F5代处于中度遗传多样性的稳定状态,说明群体还存在选育空间。

关键词：优势基因型富集微卫星单核苷酸多态性翘嘴鳜

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翘嘴鳜不同月龄性状的主成分与判别分析

中国水产科学 2014年第6期21卷 1116-1124页

作者：窦亚琪梁旭方易提林张进田昌绪骆小年孙龙芳华中农业大学水产学院农业部淡水生物繁育重点实验室湖北省淡水渔业协同创新中心

为研究翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)早期阶段形态性状的生长规律和生长特征,并判定其最佳生长季节体格与月龄的关系,采用主成分和判别分析的方法对2~6月龄翘嘴鳜的全长、体长、体高、头长、眼径、尾长、尾柄长、尾柄高和体质量等9个性状... 详细信息

为研究翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)早期阶段形态性状的生长规律和生长特征,并判定其最佳生长季节体格与月龄的关系,采用主成分和判别分析的方法对2~6月龄翘嘴鳜的全长、体长、体高、头长、眼径、尾长、尾柄长、尾柄高和体质量等9个性状进行分析。结果表明:翘嘴鳜各月龄各性状间均呈不同程度的正相关,各月龄体质量、全长、体长和体高之间显著相关,眼径与其他性状的相关系数均较小;各月龄第一主成分始终指向翘嘴鳜的生长发育情况,第二主成分有所不同,2~4月龄指向眼睛发育情况,5和6月龄分别指向头部发育和尾部发育情况。通过建立判别式来判断错过最佳生长季节翘嘴鳜的体格与大小相符的月龄,判别结果表明,总的判别准确率为98.87%。翘嘴鳜早期阶段的体长(L)–体质量(W)关系式为:W=2.58×10–2L2.9985(R2=0.994),表明翘嘴鳜早期生长属于等速生长。本研究证明了体质量、体长和体高是影响翘嘴鳜早期生长阶段最重要的性状指标,建立了翘嘴鳜早期生长阶段的判别式,发现了翘嘴鳜早期生长阶段为等速生长,为翘嘴鳜早期生长阶段的选育提供理论依据和理想的测量指标。

关键词：翘嘴鳜形态性状主成分分析判别分析生长

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豹纹鳃棘鲈MBD家族生物信息学分析

基因组学与应用生物学 2021年第11期40卷 3438-3447页

作者：郝瑞娟朱晓闻田昌绪蒋谋炎黄洋朱春华南方海洋科学与工程广东省实验室(湛江)海洋生物资源开发研究中心湛江524006 广东海洋大学水产学院湛江524088

DNA甲基化作为一种重要的表观遗传调控,在鱼类体色形成方面发挥重要作用。本研究通过对豹纹鳃棘鲈(Plectropomus leopardus)基因组范围内的DNA甲基化结合蛋白(methyl-CpG-binding domain,MBD)家族进行分析,探究其家族成员序列特征及其... 详细信息

DNA甲基化作为一种重要的表观遗传调控,在鱼类体色形成方面发挥重要作用。本研究通过对豹纹鳃棘鲈(Plectropomus leopardus)基因组范围内的DNA甲基化结合蛋白(methyl-CpG-binding domain,MBD)家族进行分析,探究其家族成员序列特征及其在豹纹鳃棘鲈体色形成中的作用。利用豹纹鳃棘鲈基因组数据,共鉴定到10个mbd基因,分别命名为mbd1~mbd10。理化性质分析发现MBD家族蛋白分子量介于26.55~288.08kD,理论等电点在5.16~9.78,均属于不稳定蛋白。DNA结构分析显示MBD家族基因的外显子和内含子数量及结构均不一样。豹纹鳃棘鲈MBD蛋白均含有该基因家族典型的MBD结构域,序列比对显示MBD结构域保守性相对较低,但MBD-a及MBD-c结构域序列高度保守。MBD家族进化树分析发现MBD8~MBD10、MBD1~MBD3序列保守分别聚为一支,MBD5~MBD7聚为一支但保守性较前两支较低。Motif分析结果显示,MBD1~MBD3、MBD4~MBD6、MBD8~MBD10保守性较高,与进化树分析结果一致。豹纹鳃棘鲈不同体色转录组数据分析发现,mbd2、mbd6及mbd9基因在不同体色转录组中差异显著,暗示其在豹纹鳃棘鲈体色形成中的重要作用。本研究为进一步研究豹纹鳃棘鲈体色形成表观遗传调控提供了基础资料。

关键词：豹纹鳃棘鲈 mbd DNA甲基化体色