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国家基因组科学数据中心:现状及展望

中国科学：生命科学 2024年第6期54卷 1088-1100页

作者：陈梅丽王彦青李茹姣马英克张思思张欣宋述慧肖景发赵文明章张鲍一明中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心北京100101 中国科学院大学北京100049

面向我国人口健康和社会可持续发展的重大战略需求,国家基因组科学数据中心(National Genomics Data Center,NGDC)自2019年成立以来,已初步建成具有自主知识产权、安全可控、涵盖领域广的多维组学数据汇交、存储、管理和共享体系,涵盖... 详细信息

面向我国人口健康和社会可持续发展的重大战略需求,国家基因组科学数据中心(National Genomics Data Center,NGDC)自2019年成立以来,已初步建成具有自主知识产权、安全可控、涵盖领域广的多维组学数据汇交、存储、管理和共享体系,涵盖基础组学数据资源、国家人类遗传资源、重要战略生物资源、生物安全资源以及生物信息分析工具和平台等,为人口健康、公共安全、育种改良、生物多样性等相关研究提供重要资源和参考信息.截至目前,NGDC已存储和管理27.6 PB的数据量,数据编号被Springer Nature,Elsevier,Wiley,Taylor&Francis等全球主要出版集团推荐或认可.尽管NGDC已连续六年被本领域国际权威期刊《核酸研究》称为与美国NCBI、欧洲EBI齐名的国际主要生物数据中心,但与国际一流数据中心仍存在一定差距.展望未来,NGDC将重点聚焦于数据智能审编、数据融合检索、生物大数据云平台、前沿算法工具等,同时在经费争取、人才培养和国际合作方面加大工作力度,建成国际领先的基因组科学数据中心,支撑我国生命与健康科学领域的科技创新发展和自立自强.

关键词：基因组生物信息大数据多组学人类遗传资源汇交管理国家基因组科学数据中心国家生物信息中心

枸橼酸氢钾钠对尿酸结石患者肠道微生态的调节作用

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中华实验外科杂志 2024年第6期41卷 1168-1172页

作者：曹程王李胜陈创顾宇伟邵雨帆章幸诞范波苏州大学附属常熟医院(常熟市第一人民医院)泌尿外科常熟215500

目的探讨枸橼酸氢钾钠溶石治疗对尿酸结石患者肠道菌群及其代谢产物的影响。方法前瞻性纳入苏州大学附属常熟医院2021年12月至2023年8月收治的40例尿酸结石(UAS)患者为UAS组,纳入同时期40例非结石(NS)健康对照者为NS组。对术后有多处残... 详细信息

目的探讨枸橼酸氢钾钠溶石治疗对尿酸结石患者肠道菌群及其代谢产物的影响。方法前瞻性纳入苏州大学附属常熟医院2021年12月至2023年8月收治的40例尿酸结石(UAS)患者为UAS组,纳入同时期40例非结石(NS)健康对照者为NS组。对术后有多处残留或肾下盏难以清除的长径>6 mm的结石患者进行枸橼酸氢钾钠溶石治疗。对受试者进行血、尿生化检测,粪便16S核糖体RNA(rRNA)基因测序及短链脂肪酸(SCFAs)含量测定。利用SPSS 22.0、Mothur、R语言和Unparse软件对数据变量进行分析。结果UAS组血肌酐[92.50(30.25)μmol/L比(73.38±16.95)μmol/L,Z=-3.759,P<0.01]、血尿酸[(505.25±104.96)μmol/L比(365.75±91.69)μmol/L,t=6.331,P<0.01]高于NS组,UAS组尿pH值[5.50(1.00)比6.00(0.50),Z=-4.194,P<0.01]低于NS组。UAS组患者肠道菌群多样性的Ace指数[(181.25±57.38)比212.89(86.10),Z=-3.579,P<0.01]、Chao1指数(180.77±57.16比232.82±58.84,t=3.932,P<0.01)和Shannon指数(2.68±0.51比2.95±0.56,t=2.233,P<0.05)低于NS组。UAS组患者肠道中拟杆菌属菌[478.13(301.40)比300.06(204.28),Z=-2.365,P<0.05]和梭杆菌属[13.74(99.13)比0.42(4.43),Z=-4.344,P<0.01]丰度高于NS组,毛螺菌属[0.24(19.95)比9.89(25.19),Z=-2.732,P<0.01]、副萨特氏菌属[0.33(9.66)比3.77(17.53),Z=-2.142,P<0.05]和双歧杆菌属[0.43(1.17)比2.12(12.94),Z=-2.719,P<0.01]丰度低于NS组。15例UAS患者接受枸橼酸氢钾钠溶石治疗。治疗后患者血尿酸水平[(444.67±74.66)μmol/L比(520.67±101.23)μmol/L,t=2.340,P<0.05]、结石最长径[(4.27±1.16)mm比(9.87±3.52)mm,t=5.846,P<0.01]和结石平均CT值[(399.57±78.27)HU比(501.84±106.90)HU,t=2.990,P<0.01]低于治疗前,尿pH值[6.50(0.50)比5.00(0.50),Z=-4.608,P<0.01]高于治疗前。治疗后梭杆菌属丰度[3.98(53.76)比20.22(168.62),Z=-2.189,P<0.05]低于治疗前,Lachnoclostridium(48.91±22.41比26.63±18.30,t=-2.436,P<0.05)、副萨特氏菌属[(35.70±21.93)比0.16(16.91),Z=-2.087,P<0.05]丰度高于治疗前。治疗后患者粪便中丁酸水平高于治疗前(1017.05±438.37比669.94±258.97,t=-2.156,P<0.05)。结论尿酸结石患者具有独特的肠道微生态特征,枸橼酸氢钾钠溶石治疗能调节该类患者的肠道菌群及代谢产物。对肠道微生物及SCFAs的靶向调节有望提高药物治疗效果,预防结石复发。

关键词：尿酸结石枸橼酸氢钾钠肠道菌群短链脂肪酸

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元启发式算法在特征选择中的应用研究

福建电脑 2024年第9期40卷 22-25页

作者：徐枫哲颜赫伟顾俊锴王毛奕陆炎杰章国道杭州电子科技大学人文艺术与数字媒体学院杭州310018

2型糖尿病是影响中老年人生命质量的疾病。及早发现糖尿病能延缓疾病并发症,可以提高病人的生存质量。为辅助检测2型糖尿病的患病风险,本文提出了一种基于元启发的特征选取方法,用于构建糖尿病患病风险预测模型时的特征选取。对比实验... 详细信息

2型糖尿病是影响中老年人生命质量的疾病。及早发现糖尿病能延缓疾病并发症,可以提高病人的生存质量。为辅助检测2型糖尿病的患病风险,本文提出了一种基于元启发的特征选取方法,用于构建糖尿病患病风险预测模型时的特征选取。对比实验的结果表明,本文方法能提高特征抽取的速度和相对准确度,可用于构建2型糖尿病患病风险的预测模型。

关键词： 2型糖尿病特征选择元启发式算法

桑白皮汤含药血清调控人支气管上皮细胞黏液高分泌的机制研究

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中国中医急症 2024年第4期33卷 587-590页

作者：谭卫刘雨张钰李福星彭朗萍章澳谭光波湖南中医药大学湖南长沙410208 湖南省中医研究院湖南长沙412000 湖南省中医药研究院附属医院湖南长沙412000

目的探究桑白皮汤调控人支气管上皮细胞黏液高分泌的机制。方法制备桑白皮汤含药血清和乙酰半胱氨酸溶液,采用15%香烟溶液和20 ng/mL脂多糖溶液对人支气管上皮细胞进行气道黏液高分泌造模,按照药物干预分为桑白皮汤组、乙酰半胱氨酸组... 详细信息

目的探究桑白皮汤调控人支气管上皮细胞黏液高分泌的机制。方法制备桑白皮汤含药血清和乙酰半胱氨酸溶液,采用15%香烟溶液和20 ng/mL脂多糖溶液对人支气管上皮细胞进行气道黏液高分泌造模,按照药物干预分为桑白皮汤组、乙酰半胱氨酸组、空白组及模型组,采用CCK-8法检测人支气管上皮细胞活性、电子显微镜下观察细胞形态及WB法检测数据挖掘中预测的白细胞介素-1β(IL-1β)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)蛋白表达。结果实验显示,模型组与空白组对比,细胞活性降低,桑白皮汤组与模型组对比,细胞活性升高(P<0.05)。模型组与空白组对比,炎症细胞因子IL-1β、TNF-α蛋白表达明显增多(P<0.05),表明气道黏液高分泌造模成功。桑白皮汤组、乙酰半胱氨酸组与模型组对比,IL-1β、TNF-α蛋白表达明显降低(P<0.05)。结论桑白皮汤含药血清可显著降低IL-1β、TNF-α蛋白表达,其治疗气道黏液高分泌的机制与调控炎症因子IL-1β、TNF-α有关。

关键词：气道黏液高分泌桑白皮汤人支气管上皮细胞炎症因子

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水轮机调速器冗余设计方法初探

电力设备管理 2024年第11期 138-140页

作者：马金平章泽生朱荣巧荣红吴春旺初云鹏陈晓勇云南华电金沙江中游水电开发有限公司梨园发电分公司南瑞集团有限公司

水轮机调速器是水电厂控制系统中的核心设备之一,为确保其可靠性,采用冗余设计是当前最有效和最常用的手段。本文提出了调速器冗余设计配置的一些原则,介绍了冗余的归类方法,详细论述了部分关键元器件冗余的具体实现方法,提出了数据统... 详细信息

水轮机调速器是水电厂控制系统中的核心设备之一,为确保其可靠性,采用冗余设计是当前最有效和最常用的手段。本文提出了调速器冗余设计配置的一些原则,介绍了冗余的归类方法,详细论述了部分关键元器件冗余的具体实现方法,提出了数据统计在冗余中的作用,这将为水电厂调速器系统安全、高效运行提供良好的解决途径。

关键词：水电机组调速器冗余故障归类统计

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旴江龚氏小儿推拿治疗手法与取穴特色撷英

江西中医药 2024年第1期55卷 4-6页

作者：程柳夏雷翔董志威章甜肖东赟喻文章海凤江西中医药大学南昌330004 江西中医药大学附属医院南昌330006

旴江小儿推拿流派的形成与发展在小儿推拿史上具有一定的意义,通过挖掘相关古籍,从手法、取穴等多个方面总结旴江小儿推拿的特色。首先是取穴方面:以特定为主,经穴为辅;循经取穴,点面结合。其次是手法方面:以法随证出,补泻有度;十二手法... 详细信息

旴江小儿推拿流派的形成与发展在小儿推拿史上具有一定的意义,通过挖掘相关古籍,从手法、取穴等多个方面总结旴江小儿推拿的特色。首先是取穴方面:以特定为主,经穴为辅;循经取穴,点面结合。其次是手法方面:以法随证出,补泻有度;十二手法,相互配合。最后落实到治疗方面:以辨证推治,扶正固本;手法方药,相辅相成。

关键词：旴江医学小儿推拿取穴特色推拿手法龚廷贤龚居中

利用Tol2转座子系统构建响应缺氧的转基因斑马鱼

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中国海洋药物 2024年第4期43卷 60-66页

作者：王苗苗郑栋栋崔晓楠唐艳飞刘云章李筠卢玲中国海洋大学海洋药物教育部重点实验室医药学院山东青岛266003

目的构建可以响应缺氧的转基因斑马鱼并用于以缺氧诱导因子HIF-1α为作用靶点的药物筛选。方法构建p T2(HRE-sv40mp-GFP)和p T2(HREM-sv40mp-GFP)2种转座质粒,在细胞中转染质粒并在常氧和缺氧的条件下观察细胞内绿色荧光蛋白(green fl... 详细信息

目的构建可以响应缺氧的转基因斑马鱼并用于以缺氧诱导因子HIF-1α为作用靶点的药物筛选。方法构建p T2(HRE-sv40mp-GFP)和p T2(HREM-sv40mp-GFP)2种转座质粒,在细胞中转染质粒并在常氧和缺氧的条件下观察细胞内绿色荧光蛋白(green fluorescent protein,GFP)表达情况;将2种转座质粒分别显微注射到斑马鱼胚胎中,将胚胎进行缺氧处理并观察胚胎绿色荧光强度以验证转基因斑马鱼的缺氧响应性。经过多代筛选得到稳定遗传的Tg(HRE-sv40mp:GFP)和Tg(HREM-sv40mp:GFP)转基因斑马鱼;用HIF-1α抑制剂LW6和白杨素分别对缺氧的Tg(HRE-sv40mp:GFP)斑马鱼胚胎进行处理,在胚胎发育至48 hpf(Hour post fertilization,受精后小时)时进行拍照并对不同荧光强度的斑马鱼数量进行统计。结果通过细胞实验证明了2种转座质粒构建成功;缺氧能够诱导转基因斑马鱼Tg(HRE-sv40mp:GFP)体内GFP的表达,但对转基因斑马鱼Tg(HREM-sv40mp:GFP)体内GFP的表达没有影响;LW6和白杨素均能够抑制缺氧条件下Tg(HRE-sv40mp:GFP)斑马鱼体内GFP的表达。结论成功构建可以响应缺氧并用于HIF-1α靶点药物筛选的转基因斑马鱼模型Tg(HRE-sv40mp:GFP)。

关键词：缺氧 HIF-1α 斑马鱼药物筛选

基于目络理论探讨调血通络法在糖尿病视网膜病变治疗中的应用

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河北中医药学报 2024年第3期39卷 17-20,51页

作者：庞午张越张铭连李亚杨赞章毛爱玲冯琳河北省眼科医院/河北省眼部疾病临床医学研究中心/河北省眼科学重点实验室河北邢台054001

糖尿病视网膜病变(diabetes retinopathy,DR)是最常见的糖尿病(diabetes mellitus,DM)慢性并发症之一,是工作年龄人群首位的致盲性眼病。其眼底表现为视网膜微血管瘤、出血、水肿、渗出、玻璃体积血,甚至视网膜脱离等,归属于中医眼科“... 详细信息

糖尿病视网膜病变(diabetes retinopathy,DR)是最常见的糖尿病(diabetes mellitus,DM)慢性并发症之一,是工作年龄人群首位的致盲性眼病。其眼底表现为视网膜微血管瘤、出血、水肿、渗出、玻璃体积血,甚至视网膜脱离等,归属于中医眼科“消渴目病”“视瞻昏渺”“云雾移睛”等范畴。其眼底病变进行性加重,病因病机虚实夹杂,错综复杂。张铭连教授基于目络理论和多年的临床研究,认为其主要病理机制为“目络郁(瘀)阻”,调血通络法为其主要治法。本文将阐释基于目络理论制定的调血通络法在治疗DR的认识和临床应用。

关键词：调血通络目络郁(瘀)阻糖尿病视网膜病变

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书法互鉴视域下针灸学术传承教育内容刍议

中国中医药现代远程教育 2024年第6期22卷 23-27页

作者：刘立安孙永章孟月刘飞王育林周立群北京中医药大学国学院北京100029 中华中医药学会北京100029 北京中医药大学东直门医院教育处北京100700 北京中医药大学教师工作部北京100029 北京中医药大学中医学院北京100029

针灸与书法因其文化根性,均是具有中国特色、中国风格、中国气派的学术体系的重要组成,二者在指导思想、学术理论、实践范式上有一定通应之处。文章瞄准针灸的教育与传承,以居于针灸与书法底层的取象思维为先导,对针灸与书法在理论、实... 详细信息

针灸与书法因其文化根性,均是具有中国特色、中国风格、中国气派的学术体系的重要组成,二者在指导思想、学术理论、实践范式上有一定通应之处。文章瞄准针灸的教育与传承,以居于针灸与书法底层的取象思维为先导,对针灸与书法在理论、实践、传承等方面进行了贯通性考探与举例。进一步引书道之“活水”滋济针灸之道,析出针灸从业者在学习实践中需要力量与敏度训练并重,凝练明确了针刺手法力、气、意三层次,将形而上的“意”与“学箭悟禅”技艺哲学对参,并落在较具实践性的“韵”上,以图丰富针灸教育的学术内容以及初步探索相应传承范式。

关键词：针灸学象思维书法中医传承教育技艺哲学