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单囊壳白粉菌候选效应子全基因组预测及其表达特征分析

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分子植物育种 2024年

作者：刘兵黄丽华秦欣欣王喆宁雪飞周继阳王贤磊李群新疆大学生命科学与技术学院新疆生物资源基因工程重点实验室

单囊壳白粉菌(Podosphaera xanthii)是葫芦科作物白粉病主要致病菌，严重危害西瓜、甜瓜、黄瓜等重要园艺作物，其致病机制尚未阐明。病原菌向植物细胞释放效应子(effector)逃避或抑制植物免疫防御促进侵染。为研究单囊壳白粉菌效应子... 详细信息

单囊壳白粉菌(Podosphaera xanthii)是葫芦科作物白粉病主要致病菌，严重危害西瓜、甜瓜、黄瓜等重要园艺作物，其致病机制尚未阐明。病原菌向植物细胞释放效应子(effector)逃避或抑制植物免疫防御促进侵染。为研究单囊壳白粉菌效应子与甜瓜互作机理，创新绿色、安全、高效的甜瓜白粉病生物防治。本研究通过多种生物信息学分析软件对P. xanthii候选效应子进行了全基因组预测；利用TBtools软件对候选效应子构建系统进化树并鉴定功能结构域；并通过实时荧光定量PCR(qPCR)对其中10个候选效应子在P. xanthii侵染甜瓜早期(0 h、6 h、12 h、24 h、72 h)转录水平的表达情况进行分析。结果表明：P. xanthii全基因组编码的12834条蛋白中有191个经典分泌蛋白，其中32个被进一步预测为候选效应子。系统进化树及功能结构域分析结果显示，从32个候选功能效应子中仅鉴定到2个与病原菌致病力相关的功能结构域：low complexity region(11/32)和cerato-platanin (1/32)，而具有相似功能结构域分布的效应子在进化关系上也相近，但32个候选效应子总体间的进化关系较远。qPCR结果表明，有3个候选功能效应子在P. xanthii侵染甜瓜早期显著上调表达，推测它们可能在参与P. xanthii侵染甜瓜过程中具有重要作用。本研究结果为开展P. xanthii效应子功能分析及致病机制研究提供依据。

关键词：单囊壳白粉菌全基因组分泌蛋白效应子致病性

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甜瓜皱叶基因wl的遗传分析与定位

分子植物育种 2024年第5期22卷 1480-1487页

作者：苏比娜·肖克来提李群鲁思梦宁雪飞周继阳阮悦康彩彦王贤磊新疆大学生命科学与技术学院乌鲁木齐830046

甜瓜叶片是进行光合作用的主要器官,其形态对甜瓜果实可溶性固形物(糖度)含量高低产生影响显示为了遗传分析与定位甜瓜皱叶基因wl和叶形性状与果实糖度之间的关系,本研究以甜瓜‘西州蜜25号’(X25)(皱叶)为母本,‘伽师’(平叶)为父本构... 详细信息

甜瓜叶片是进行光合作用的主要器官,其形态对甜瓜果实可溶性固形物(糖度)含量高低产生影响显示为了遗传分析与定位甜瓜皱叶基因wl和叶形性状与果实糖度之间的关系,本研究以甜瓜‘西州蜜25号’(X25)(皱叶)为母本,‘伽师’(平叶)为父本构建F_(2)和F_(2)BC_(1)群体,通过χ^(2)检验法对两群体皱、平叶型植株的分离比分析,研究皱叶基因的遗传规律。结果显示,皱叶亲本‘西州蜜25号’(X25)和平叶亲本‘伽师’杂交获得F1代为平叶,说明皱叶对平叶是隐性遗传。利用SSR(Simple sequence repeat)分子标记结合BSA(Bulk segregant analysis)法,构建皱、平叶DNA池,利用全基因组范围内396个SSR分子标记进行多态性标记的筛选,发现6个具有多态性的SSR标记分别位于LG7(CMGA165和GCM344)、LG8(ECM200和CMACC146)和LG10(CMCT134B和CMN22-15)。对F_(2)、F_(2)BC_(1)群体个体基因型检测对甜瓜皱叶基因wl进行连锁遗传分析与定位,最终在LG10上发现一个皱叶基因wl的主效QTL位点(LOD>3),该基因位于标记CMCT134B与SSR2441之间,物理距离为4.4 Mb。将田间获取的皱叶性状与可溶性固形物(糖度)的数据进行分析,糖度测定描述性结果显示,皱叶性状的糖度明显低于平叶性状的糖度,两种表型的糖度存在显著性差异。本研究为甜瓜皱叶性状的精细定位克隆提供参考。

关键词：甜瓜皱叶基因定位简单序列重复

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甜瓜种质资源遗传多样性的SRAP分析

遗传 2010年第7期32卷 744-751页

作者：陈芸李冠王贤磊新疆大学生命科学与技术学院乌鲁木齐830046 喀什师范学院生命与环境科学系新疆喀什844000

为研究甜瓜材料之间的亲缘关系及其分类,更有效地利用种质资源,为培育新品种提供依据,文章采用SRAP(Sequence-related amplified polymorphism)技术对61份甜瓜种质资源的遗传多样性进行研究。结果表明:从42对引物组合中筛选出16对扩增... 详细信息

为研究甜瓜材料之间的亲缘关系及其分类,更有效地利用种质资源,为培育新品种提供依据,文章采用SRAP(Sequence-related amplified polymorphism)技术对61份甜瓜种质资源的遗传多样性进行研究。结果表明:从42对引物组合中筛选出16对扩增条带清晰、多态性高的引物组合分析供试材料,共检测出452个位点,其中265个为多态性位点,多态性比率达58.63%,平均每对引物组合产生28.56个位点和16.56个多态性位点。61份材料间的相似系数为0.48～0.93,平均为0.73。这些结果说明,供试甜瓜材料具有较为丰富的遗传多样性。聚类分析结果表明,61个甜瓜品种中首先可分为薄皮甜瓜与厚皮甜瓜两大类,彼此亲缘关系最远。以遗传相似系数0.74为截值,可把供试材料分为5个类群。在生态区域中,新疆厚皮甜瓜的Nei’s基因多样性指数(0.2231)和Shannon’s信息指数(0.3422)最高。

关键词：甜瓜 SRAP 遗传多样性

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精细定位甜瓜白粉病抗性基因Pm-M

植物遗传资源学报 2022年第1期23卷 217-225页

作者：刘慧青谢丽琼王贤磊李群宁雪飞新疆大学生命科学与技术学院/新疆生物资源基因工程重点实验室乌鲁木齐830046

以抗白粉病甜瓜品种MR1与感白粉病新疆地方品种新密1号为亲本,构建BC_(1)P_(2)和F_(2)群体,研究白粉病菌Px1B(P.xanthii race 1B)的抗性遗传规律。以BC_(1)P_(2)与F_(2)群体为试验材料,利用BSA(Bulked segregation analysis)结合分子标记技术发掘多态性信息,并开发分子标记进行抗性基因的遗传定位。抗病基因Pm-M位于第12染色体上Indel2276和SSR12212两个标记之间,物理距离为75.54 kb(Chr.12:22765111~22840651),在该区段含有16个基因,其中12个候选基因可能与白粉病抗性相关。本研究结果为抗病基因Pm-M的图位克隆及抗病分子育种奠定了基础。

关键词：甜瓜白粉病精细定位

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我国保障住房供给体系并轨问题研究

华中师范大学学报（人文社会科学版） 2012年第3期51卷 29-37页

作者：邓宏乾王贤磊陈峰华中师范大学经济管理学院湖北武汉430079

我国现有的保障住房供给分类供应体系在多轨运行中逐渐暴露其缺陷与不足,主要存在重产权式保障而轻租赁式保障,保障方式间相互割裂,供给层次划分和准入标准不科学,应保未保和保不应保现象较为突出等问题,导致保障住房分配不公和运行效... 详细信息

我国现有的保障住房供给分类供应体系在多轨运行中逐渐暴露其缺陷与不足,主要存在重产权式保障而轻租赁式保障,保障方式间相互割裂,供给层次划分和准入标准不科学,应保未保和保不应保现象较为突出等问题,导致保障住房分配不公和运行效率低下。从整体视角重新设计住房保障供给体系的顶层制度是解决当前住房改革困局的核心问题。本文通过分析我国保障住房供给体系并轨改革的背景,探讨了将现有保障住房供给体系中廉租住房、公共租赁住房、经济适用住房(含集资建房、合作建房)及含部分限价商品住房统一归并至公共住房体系中,构建以公共租赁住房为主体的住房保障供给体系,实现住房保障公共服务均等化的改革目标,实行住房保障体系的"目标并轨、政策并轨、建设并轨、对象并轨、补贴方式并轨、资金并轨、腾退并轨、管理并轨"。提出"渐进式统一"的并轨改革实施方案,按"分类并轨"和"整合并轨"两个阶段实施,并设置一定的过渡时限,把握好实施过程中的新旧政策衔接,以期为我国政府有关部门制定相关政策提供参考。

关键词：保障住房产权式保障租赁式保障公共住房体系

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基于政府价格管制的限价房价格研究

基于政府价格管制的限价房价格研究

作者：王贤磊华中师范大学

学位级别：硕士

限价房,是在住宅市场供给结构失衡,面向中国城市广大普通家庭的中低价位、中小套型普通商品住房供给严重不足,房价居高不下的市场背景下,做为一种新的政府调控手段,一种完美衔接的住房分类应体系模式产生的。本文从这一背景出发,围绕限... 详细信息

限价房,是在住宅市场供给结构失衡,面向中国城市广大普通家庭的中低价位、中小套型普通商品住房供给严重不足,房价居高不下的市场背景下,做为一种新的政府调控手段,一种完美衔接的住房分类应体系模式产生的。本文从这一背景出发,围绕限价房的价格管制模式,在对限价房的竞价机制和定价方法进行经济学分析的基础上,提出可承受支付能力的限价房价格管制模式,丰富和完善限价房政策的实践。本论文的研究主要包括以下四个部分: 第一部分,在政府价格管制的理论下,结合我国房地产市场的实际特点,通过分析现有的限价房实践,与其他保障性住房模式的比较,达到明晰限价房的性质和定位的目的。第二部分,在解读限价房政策参与的各方,中央政府、地方政府、房地产开发商、住房消费者等多方利益基础上,分析其博弈策略,通过博弈监管模型,重点探讨限价房政策下参与各方的博弈风险与监管。第三部分,通过明晰限价房的性质和定位,分析限价房竞价博弈过程,运用政府价格管制模型,设计限价房的内部定价机制,提出基于可承受支付能力的限价房价格管制方法。第四部分,探讨完善限价房政策实施的策略,提出政府监管限价房政策的对策,以期将限价房政策落到实处,真正成为我国住房分类供应体系中的新成员,在我国住房市场上发挥应有的作用。本文的主要结论是,限价房政策是符合我国国情且行之有效的房地产宏观调控措施,应尽快纳入我国的住房分类供应体系,成为深化我国房地产市场宏观调控、达到稳定房价目标的有力手段,进而促进社会稳定,保证我国现代化建设的顺利进行。

关键词：限价房价格管制博弈可承受支付能力

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甜瓜抗白粉病候选基因片段克隆与序列分析

北方园艺 2013年第19期 110-113页

作者：韩瑞王贤磊李冠新疆大学生命科学与技术学院新疆乌鲁木齐830046

以2个高感白粉病的甜瓜品种"K413"、"JS"和3个高抗品种"H70"、"AN"、"H74"为试材,采用PCR方法,对第Ⅴ连锁群的Pm-AN片段进行克隆分析。结果表明:从"K413"、"JS"、"H70"、"AN"和"H74"中克隆出Pm-AN-N/C 2个片段分别得到830bp和610bp 2个... 详细信息

以2个高感白粉病的甜瓜品种"K413"、"JS"和3个高抗品种"H70"、"AN"、"H74"为试材,采用PCR方法,对第Ⅴ连锁群的Pm-AN片段进行克隆分析。结果表明:从"K413"、"JS"、"H70"、"AN"和"H74"中克隆出Pm-AN-N/C 2个片段分别得到830bp和610bp 2个碱基,分别编码氨基酸286个和192个,同源性分别为99.74%和94.00%。cDNA扩增结果表明,5个甜瓜品种分别出现5种不同的带型,在"JS"、"H70"、"AN"中还出现了2种不同的带型,而且所有带型都有一定的差异。

关键词：甜瓜抗白粉病基因基因克隆序列分析

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新疆甜瓜枯萎病、根腐病病原菌鉴定

新疆农业科学 2010年第6期47卷 1166-1171页

作者：康锋王贤磊李冠新疆大学生命科学与技术学院乌鲁木齐830046

【目的】采用形态学观察和分子鉴定方法对甜瓜病原菌新疆株(前人鉴定为枯萎病病原菌Fusarium oxysporum(Schi)f.***.melonis Snyder et Hansen)、枯萎病病原菌辽宁株和根腐病病原菌(Fusariumsolani(Mart.)Sacc.)进行研究,确定病原菌新疆... 详细信息

【目的】采用形态学观察和分子鉴定方法对甜瓜病原菌新疆株(前人鉴定为枯萎病病原菌Fusarium oxysporum(Schi)f.***.melonis Snyder et Hansen)、枯萎病病原菌辽宁株和根腐病病原菌(Fusariumsolani(Mart.)Sacc.)进行研究,确定病原菌新疆株的种类。【结果】对病原菌新疆株进行形态学观察发现其有蓝色色素,维管束变褐不向上发展。此后又对三种病原菌进行了大亚基rDNA-D1/D2区序列分析、rDNA-ITS区序列分析,两者分析结果表明病原菌新疆株与根腐病病原菌同源性高。【结论】分子鉴定与形态学鉴定结果一致,表明病原菌新疆株为腐皮镰孢菌(Fusarium solani(Mart.)Sacc.)而非尖镰孢菌(Fusariumaxysporum(Schi.)f.***.melonis Snyder et Hansen),是根腐病病原菌,与前人鉴定结果不同。

关键词：甜瓜枯萎病根腐病分子鉴定

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薄荷醇合成关键酶基因的克隆

食品工业科技 2012年第8期33卷 239-241,248页

作者：韩瑞王贤磊高兴旺钟俐新疆大学生命科学与技术学院新疆乌鲁木齐830046

采用Trizol法从12℃处理48h的10d龄薄荷叶片中提取总RNA,通过RT-PCR方法扩增获得薄荷醇合成关键酶基因cDNA(命名为LT,ST),连接到pMD18-T载体上,命名为pMD18-T-LT,pMD18-T-ST。结果表明:扩增的薄荷醇合成酶片段全长约1125bp和942bp。将... 详细信息

采用Trizol法从12℃处理48h的10d龄薄荷叶片中提取总RNA,通过RT-PCR方法扩增获得薄荷醇合成关键酶基因cDNA(命名为LT,ST),连接到pMD18-T载体上,命名为pMD18-T-LT,pMD18-T-ST。结果表明:扩增的薄荷醇合成酶片段全长约1125bp和942bp。将获得的基因成功构建到植物表达载体pCAMBIA1301上,经转化根癌农杆菌GV3101,经菌落PCR进一步鉴定转化结果。实验结果为进一步从分子水平挖掘并利用薄荷醇合成酶关键基因奠定基础。

关键词：薄荷薄荷醇合成酶基因克隆