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中国地方稻种初级核心种质粳稻SSR遗传多样性研究

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中国地方稻种初级核心种质粳稻SSR遗传多样性研究

作者：王美兴新疆农业大学

学位级别：硕士

本文以中国地方稻种初级核心种质中的1395份粳稻为材料，结合孙俊立硕士论文中关于籼亚种(1313份)的分析，研究了籼亚种和粳亚种的遗传分化、粳亚种的系统遗传多样性和地理遗传多样性;同时探讨了中国地方稻种资源核心种质构建所需SSR引... 详细信息

本文以中国地方稻种初级核心种质中的1395份粳稻为材料，结合孙俊立硕士论文中关于籼亚种(1313份)的分析，研究了籼亚种和粳亚种的遗传分化、粳亚种的系统遗传多样性和地理遗传多样性;同时探讨了中国地方稻种资源核心种质构建所需SSR引物的组成及群体大小对核心种质取样比例的影响。现将研究结果总结如下：以36对SSR标记的37个位点对籼粳分化和粳亚种的遗传多样性的研究结果表明，总体上来说籼亚种的基因多样性籼稍大于粳亚种。籼粳分化系数在0.012—0.233之间，籼的标志性等位基因是RM270-08，粳亚种的标志性等位基因是RM258-13、RM262-06、RM23-12、RM267-13。地方稻种资源的遗传分化有明显的层次性，籼粳分化＞粳亚种的水陆分化＞粳亚种的粘糯分化，从DNA水平上证实了丁颖关于中国栽培稻种以下分类的合理性。粳亚种的遗传多样性在稻区及亚区间存在差异，遗传多样性在地理上呈现中国南方大于北方的趋势，虽然在粳亚种内水陆的分化系数不高，但是在某些亚区的分化程度非常大，例如第二稻区的第二亚区。以省份为稻作区域的划分标准时，各省份的基因多样性以及籼粳遗传分化南方省份间相当，北方省份间的差异稍大，但与以稻区及亚区为划分标准相比基因多样性有所降低，遗传分化系数有所升高。以325份材料对不同引物组成(数量和多态性不同)与聚类取样和遗传多样性评价间的关系的分析表明，随机选取的36对SSR引物完全能够满足核心种质构建和遗传多样性评价工作的需要。以36对SSR引物的37个位点和2708份核心种质材料进行取样比例的研究结果认为，随着压缩比例的增大压缩群体的基因多样性指数先升高再降低，等位基因的数量和等位基因覆盖率持续下降并且速率逐渐加大。群体的大小对取样比例有较大的影响，大群体的取样比例显著小于小群体的取样比例。以此数据所做回归分析的结果表明，对于一个拥有50000多份材料的中国地方稻种群体来说，取样5％就可以得到原始群体90％以上的遗传变异。

关键词：地方稻种核心种质遗传多样性基因多样性遗传分化

广西普通野生稻(Oryza rufipogon Griff)表型性状和SSR多样性研究

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Acta Genetica Sinica 2004年第9期31卷 934-940页

作者：余萍李自超张洪亮李道远王美兴孙俊立王象坤中国农业大学农业部作物基因组学与遗传改良重点实验室广西农科院水稻所南宁530007

以中国普通野生稻初级核心种质中广西普通野生稻部分中的 2 2 3份野生稻为材料 ,以平均分布于水稻 12条染色体上的 34对SSR引物和中国稻种资源目录中的表型性状分析广西普通野生稻SSR位点的等位变异、多样性的地理分布及不同生长习性间... 详细信息

以中国普通野生稻初级核心种质中广西普通野生稻部分中的 2 2 3份野生稻为材料 ,以平均分布于水稻 12条染色体上的 34对SSR引物和中国稻种资源目录中的表型性状分析广西普通野生稻SSR位点的等位变异、多样性的地理分布及不同生长习性间的多样性分布等。结果表明 ,每对引物检测到的多态性片段 7～ 4 8条 ,平均为 2 4 .91条 ,普通野生稻的等位变异数明显大于地方稻种 ,在所分析的SSR位点中杂合位点比例变化在 1.35 %～ 81.31%之间 ,平均为 32 .0 1% ,与自花授粉的栽培稻相比具有较高的杂合率 ;北纬 2 2°～ 2 3°和 2 3°～ 2 4°范围内的两个区域内(一个包括隆安、扶绥和邕宁三县 ,另一个包括象州、来宾、武宣、玉林和贵港五个县 )所包含的普通野生稻数量多 ,遗传多样性大 ,在DNA水平上是广西普通野生稻的遗传多样性中心 ,而表型性状多样性中心是在北纬 2 1°～ 2 2°和2 2°～ 2 3°,其多样性分布与DNA水平不完全一致。在 4种生长习性间 ,DNA水平上的遗传多样性大小依次为匍匐型 ,倾斜型 ,半直立型和直立型 ,表型水平的多样性与DNA水平的多样性基本一致。

关键词：普通野生稻表型性状 SSR标记遗传多样性

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糯玉米可溶性糖组分特征与采后品质特性

浙江农业学报 2022年第6期34卷 1133-1140页

作者：任梦云杜龙岗王美兴黄益峰浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所浙江杭州310021

糯玉米采收后的鲜食品质是衡量品种优劣的重要标准之一,为进一步探讨糯玉米品质形成与可溶性糖含量的关系,以63份糯玉米自交系为材料,采用高效液相色谱-蒸发光散射检测法(HPLC-ELSD)测定采后不同贮藏期果穗中可溶性糖含量,同时测定其中... 详细信息

糯玉米采收后的鲜食品质是衡量品种优劣的重要标准之一,为进一步探讨糯玉米品质形成与可溶性糖含量的关系,以63份糯玉米自交系为材料,采用高效液相色谱-蒸发光散射检测法(HPLC-ELSD)测定采后不同贮藏期果穗中可溶性糖含量,同时测定其中8份优异材料蒸煮前后可溶性糖含量的变化。结果表明:蒸煮前后糯玉米果穗都含有果糖、葡萄糖和蔗糖。鲜样中,蔗糖含量最高,平均含量为44.22 mg·g^(-1),占可溶性糖的65.61%,果糖和葡萄糖含量接近,平均含量分别为11.30 mg·g^(-1)和10.49 mg·g^(-1)。鲜样中可溶性糖含量高低主要是由蔗糖决定。蒸煮过后,糯玉米熟样中蔗糖和还原性糖含量均下降。可溶性糖和蔗糖是判断糯玉米生化甜度的两个重要指标。随着贮藏时间的延长,糯玉米鲜样中可溶性糖含量呈下降趋势,降解速率的快慢主要由蔗糖决定。根据可溶性糖含量与降解速率,筛选了两份糯玉米特异可溶性糖种质,研究结果可为鲜食玉米采后保鲜技术提供科学依据。

关键词：糯玉米贮藏耐性糖代谢高效液相色谱-蒸发光散射检测法

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中国籼稻亚种内的群体结构及地理生态分化

科学通报 2012年第4期57卷 248-257页

作者：张冬玲张洪亮齐永文王美兴孙俊立丁立李自超中国农业大学教育部作物杂种优势与利用重点实验室北京市作物遗传改良实验室北京100193 广州甘蔗糖业研究所广州510316 浙江农业科学院作物与核利用研究所杭州310021 农业部科技教育司北京100026 中国农业科学院作物科学研究所北京100081

籼稻是亚洲和世界其他一些地区广为种植的主要栽培稻亚种,同时也是我国杂交水稻恢复系的主要来源.研究籼稻亚种内的遗传结构和遗传多样性对中国栽培稻亚种内的分类和演化以及水稻杂种优势利用具有重要的理论和实践意义.本研究通过36个SS... 详细信息

籼稻是亚洲和世界其他一些地区广为种植的主要栽培稻亚种,同时也是我国杂交水稻恢复系的主要来源.研究籼稻亚种内的遗传结构和遗传多样性对中国栽培稻亚种内的分类和演化以及水稻杂种优势利用具有重要的理论和实践意义.本研究通过36个SSR标记对1582份籼稻地方品种的群体结构和地理生态分化进行了分析.结果表明,利用分子标记所做基于模型和基于遗传距离的群体结构表现一致,即早籼稻生态型可划分为4个地理生态群,中间型生态型可划分为3个地理生态群,晚籼稻生态型可划分为2个地理生态群.当地的生态环境和空间隔离是形成地理分化的主要原因.地理生态群既体现了品种间的遗传差异又是对不同生态环境适应的反映,可用于籼稻亚种内杂种优势群划分的依据.根据SSR标记在各个生态型及地理生态群的基因型分布,筛选了可用于鉴别各生态型和地理生态群的SSR特征等位变异并建立了相应的SSR分子判别式.通过SSR分子判别式选择籼稻的中间类型开展籼粳杂种优势研究以及选择不同地理生态类型开展籼稻亚种内杂种优势研究,有助于突破籼粳杂种优势利用的障碍和加强籼稻亚种内杂种优势利用.

关键词：生态地理分化籼稻 SSR标记

棉花盐胁迫途径中蛋白磷酸化同源基因(GhSOS2)2种剪接体的克隆及表达分析

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中国农业科学 2010年第21期43卷 4341-4348页

作者：李付振邱新棉王美兴刘传亮浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所经济作物实验室中国农业科学院棉花研究所/农业部棉花遗传改良重点开放实验室

【目的】了解棉花在盐胁迫条件下相关基因的表达,并克隆与抗(耐)盐相关的重要基因。【方法】通过筛选棉花EST数据库,并对目标EST序列进行整合,对中棉所49在非盐胁迫和盐胁迫条件下进行处理并利用RT-PCR的方法克隆了质膜Na+/H+逆向转运... 详细信息

【目的】了解棉花在盐胁迫条件下相关基因的表达,并克隆与抗(耐)盐相关的重要基因。【方法】通过筛选棉花EST数据库,并对目标EST序列进行整合,对中棉所49在非盐胁迫和盐胁迫条件下进行处理并利用RT-PCR的方法克隆了质膜Na+/H+逆向转运蛋白途径中的1个蛋白磷酸化同源基因,命名为GhSOS2,并通过实时荧光定量PCR对其表达特征进行分析。【结果】序列分析表明,该基因成熟mRNA的剪接存在2种可选择性的剪接体,分别命名为GhSOS2a(GenBank登录号:GU188960)和GhSOS2b(GenBank登录号:GU188961),分别编码445和421个氨基酸残基。由于剪接方式的差异,导致GhSOS2a比GhSOS2b多出一个外显子(长度为72bp)。实时荧光定量PCR分析表明,GhSOS2a在非盐胁迫和盐胁迫条件下的根茎组织、叶组织均表达,但GhSOS2b仅在盐胁迫条件下的根茎组织、叶组织表达,且表达量远高于GhSOS2a。【结论】在棉花盐胁迫过程中,GhSOS2存在2种可选择性剪接体,而且可能主要是GhSOS2b参与棉花的质膜Na+/H+逆向转运蛋白途径并发挥一定作用。

关键词：棉花盐胁迫选择性剪接体 GhSOS2 实时荧光定量PCR

基于ISSR指纹的甘薯食用品种的遗传多样性分析

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核农学报 2014年第7期28卷 1197-1202页

作者：季志仙王美兴范宏环吴列洪朱金庆浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所浙江杭州310021

运用ISSR分子指纹技术检测甘薯基因组DNA的多态性,是鉴定甘薯遗传多样性和亲缘关系有效的方法之一。本研究选用6个ISSR标记对17份甘薯品种进行了DNA指纹扩增,共扩增出55条谱带,其中多态性谱带50条,多态性水平为90.91%;UBC825引物扩增出... 详细信息

运用ISSR分子指纹技术检测甘薯基因组DNA的多态性,是鉴定甘薯遗传多样性和亲缘关系有效的方法之一。本研究选用6个ISSR标记对17份甘薯品种进行了DNA指纹扩增,共扩增出55条谱带,其中多态性谱带50条,多态性水平为90.91%;UBC825引物扩增出带型最多,有16种;根据Nei’s遗传距离计算获得的聚类树状图表明,在GS为0.625时,参试的17份甘薯品种分为4个组群;遗传相似性分析表明,顶芽菜用品种间遗传相似系数最高0.877,叶柄食用品种和烤薯型品种之内的遗传相似系数分别为0.778和0.740。结果表明甘薯主要食用间具有较好的遗传多样性,但同类型品种间却又有较高的遗传相似性,这类品种需要引进或创制新资源。

关键词：甘薯 ISSR标记分子指纹遗传多样性

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基于线粒体片段序列分析锁阳的谱系地理学

分子植物育种 2022年

作者：任梦云关潇陈彦君杜龙岗王美兴黄益峰浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所浙江省农业科学院浙江省数字旱粮重点实验室中国环境科学研究院

为阐明锁阳(Cynomorium songaricum)的地理结构与遗传多样性，本研究从DNA水平上利用ccmFN2和atpA两个基因序列对中国西北地区18个野生居群的188个锁阳个体进行研究，结果表明锁阳的ccmFN2序列总长度为420 bp，共6个变异位点，定义12个...

为阐明锁阳(Cynomorium songaricum)的地理结构与遗传多样性，本研究从DNA水平上利用ccmFN2和atpA两个基因序列对中国西北地区18个野生居群的188个锁阳个体进行研究，结果表明锁阳的ccmFN2序列总长度为420 bp，共6个变异位点，定义12个单倍型C1-C12。atpA片段长度为484 bp，共5个变异位点，定义9个单倍型A1-A9。将两个线粒体片段ccmFN2/atpA用Paup 4.0软件进行序列一致性检验(P>0.05)，联合分析结果显示，两套线粒体片段共904 bp，有11个变异位点，定义27个单倍型(M1-M27)，其中单倍型M3总体水平上频率最高，总体种群的单倍型多态性Hd=0.658 94，核苷酸多态性π=0.00383。锁阳线粒体遗传结构分析结果显示，种群间遗传距离与地理距离间不存在相关性，未表现出遗传分化，AMOVA分析结果表明锁阳属的主要变异来源于种群内。该研究为锁阳的系统分类、资源保护与鉴定以及人工繁育提供一定的分子证据。

关键词：

甜玉米可溶性糖组分特征及其采后降解规律分析

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分子植物育种 2022年第16期20卷 5408-5414页

作者：任梦云杜龙岗王美兴黄益峰浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所杭州310021

本研究以62份优质甜玉米自交系为材料,利用高效液相色谱-蒸发光散射检测器法(HPLC-ELSD)开展不同基因型甜玉米自交系采后贮藏过程中糖分的动态变化规律。结果表明,甜玉米中含有果糖、葡萄糖和蔗糖三种可溶性性糖,蔗糖是可溶糖的主要成分... 详细信息

本研究以62份优质甜玉米自交系为材料,利用高效液相色谱-蒸发光散射检测器法(HPLC-ELSD)开展不同基因型甜玉米自交系采后贮藏过程中糖分的动态变化规律。结果表明,甜玉米中含有果糖、葡萄糖和蔗糖三种可溶性性糖,蔗糖是可溶糖的主要成分,甜玉米的生化甜度与蔗糖和果糖的含量有关,蔗糖是其决定性因素(P<0.01)。总体来说,随着贮藏时间的延长,可溶性糖含量下降。不同基因型甜玉米可溶性糖降解速率存在差异。根据可溶性糖含量的动态变化,筛选了6份特异性优质材料。D93(超甜低降解速率)和D13(加强型低降解速率),随着贮藏时间的延长,果糖和葡萄糖均先增加后降低,蔗糖的变化相反,表明在低降解速率材料中,先动员蔗糖分解成葡萄糖和果糖的途径占主导地位,其呼吸作用缓慢。D70(超甜高降解速率和)和D160(加强型高降解速率)的蔗糖含量一直呈现下降趋势,不再和果糖及葡萄糖的趋势保持一致,表明在这些材料中,采后呼吸作用强烈。8 h后可溶性糖及蔗糖含量下降剧烈,说明甜玉米的最佳贮藏时间是在8 h内,为超甜玉米采后保鲜技术和新品种的选育提供理论基础。

关键词：甜玉米种质资源糖代谢机理 HPLC-ELSD

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船舶监理中的细节

交通建设与管理 2008年第8期 83-84页

作者：张瑞安王美兴

老子说:"天下难事,必做于易;天下大事,必做于细"。受公司委托,作为船舶监造小组一名船东方的监理代表前往造船厂,参加船舶建造工作。船舶监造过程,细节繁多,每个细节都做到位,是对监理人员的最大考验:面对考验,我们没有放松自己,没有放... 详细信息

老子说:"天下难事,必做于易;天下大事,必做于细"。受公司委托,作为船舶监造小组一名船东方的监理代表前往造船厂,参加船舶建造工作。船舶监造过程,细节繁多,每个细节都做到位,是对监理人员的最大考验:面对考验,我们没有放松自己,没有放过船舶建造过程中的任何细节。船舶交付时最大限度地维护了船东的利益。

关键词：船舶监造船舶建造设备图纸审查监理船厂净油机细节维修保养空压机