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单细胞数学模型的进展

生物工程进展 1995年第3期15卷 25-29页

作者：王渭池欧阳藩中国科学院化工冶金研究所

单细胞数学模型的进展王渭池，欧阳藩（中国科学院化工冶金研究所）单细胞模型（ＳＣＭ）提出已近三十年了，首先提出这一概念的是ＶｏｎＢｅｒｔａｌａｎｆｆｙ“’，在他的“ＳＣＭ”中，细胞的生长是营养物的消化、吸收和外源性代谢... 详细信息

单细胞数学模型的进展王渭池，欧阳藩（中国科学院化工冶金研究所）单细胞模型（ＳＣＭ）提出已近三十年了，首先提出这一概念的是ＶｏｎＢｅｒｔａｌａｎｆｆｙ“’，在他的“ＳＣＭ”中，细胞的生长是营养物的消化、吸收和外源性代谢相互竞争的结果。随后，又有人建立了...

关键词：单细菌模型单细胞数学模型细胞学

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纯化组蛋白引起的DNA凝聚

科学通报 2007年第14期52卷 1615-1619页

作者：冉诗勇王晓玲付文博王渭池李明中国科学院物理研究所凝聚态物理国家实验室北京100080

利用磁镊装置研究了纯化组蛋白对单根DNA的凝聚.当组蛋白浓度从0.002mmol/L提高到0.2mmol/L时,DNA的凝聚速率迅速提高,大于0.2mmol/L时,基本达到饱和.组蛋白在低浓度时,DNA的凝聚曲线呈指数下降形状,而在高浓度时,则转化为S形状.组蛋白... 详细信息

利用磁镊装置研究了纯化组蛋白对单根DNA的凝聚.当组蛋白浓度从0.002mmol/L提高到0.2mmol/L时,DNA的凝聚速率迅速提高,大于0.2mmol/L时,基本达到饱和.组蛋白在低浓度时,DNA的凝聚曲线呈指数下降形状,而在高浓度时,则转化为S形状.组蛋白在结合DNA过程中的协同被用来解释这种转变.低浓度时组蛋白在DNA上随机结合,而在高浓度时,由于已结合上的蛋白对DNA产生的形变会帮助蛋白结合,这种协同作用导致了S形状的产生.在较大的力的作用下,DNA/组蛋白复合体的解离曲线呈阶跃形,台阶的高度约60nm.同时DNA/组蛋白复合体的拉伸曲线相变平台较DNA的相变平台低,说明组蛋白并不能从DNA上完全解离.

关键词： DNA 组蛋白单分子磁镊

利用分子梳技术研究金属离子对DNA与组蛋白结合的影响

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科学通报 2005年第9期50卷 854-860页

作者：刘玉颖王鹏业窦硕星谢平王渭池尹华伟中国科学院物理研究所北京100080

利用分子梳技术研究了一价(Na+,K+)、二价(Mg2+,Ca2+,Mn2+)金属离子对DNA与组蛋白结合的影响.我们将λ-DNA分子、λ-DNA-组蛋白复合体在疏水表面上进行了拉伸,用荧光显微镜直接观察加入金属离子后分子梳的变化.结果表明:Na+,K+,Mg2+,Ca2... 详细信息

利用分子梳技术研究了一价(Na+,K+)、二价(Mg2+,Ca2+,Mn2+)金属离子对DNA与组蛋白结合的影响.我们将λ-DNA分子、λ-DNA-组蛋白复合体在疏水表面上进行了拉伸,用荧光显微镜直接观察加入金属离子后分子梳的变化.结果表明:Na+,K+,Mg2+,Ca2+,Mn2+导致DNA分子上的荧光有不同程度的衰减;Na+,K+在一定程度上抑制DNA与组蛋白的结合;Mg2+,Ca2+,Mn2+增强DNA与组蛋白的结合,并能明显增加DNA与疏水表面的吸附;Mn2+容易导致DNA-组蛋白复合体聚集.

关键词：分子梳技术金属离子 DNA 核酸蛋白质荧光显微技术

二氢叶酸还原酶动力学模型的Hill环流分布

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安徽大学学报（自然科学版） 1992年第1期19卷 79-83页

作者：王渭池黄汝多

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钙释放激活钙离子通道的发现及研究现状

河南师范大学学报（自然科学版） 2009年第6期37卷 103-107页

作者：陈晓芳李丛鑫王鹏业王渭池中国科学院物理研究所软物质物理实验室北京100190

Ca2+释放激活Ca2+(CRAC)通道是位于非兴奋性细胞质膜上的慢Ca2+通道,是非兴奋性细胞(尤其T淋巴细胞和HEK 293细胞)中胞外Ca2+进入细胞内的主要途径.Ca2+内流是T淋巴细胞激活的最重要的生理生化特征之一.Orai1蛋白单体是组成CRAC通道的亚... 详细信息

Ca2+释放激活Ca2+(CRAC)通道是位于非兴奋性细胞质膜上的慢Ca2+通道,是非兴奋性细胞(尤其T淋巴细胞和HEK 293细胞)中胞外Ca2+进入细胞内的主要途径.Ca2+内流是T淋巴细胞激活的最重要的生理生化特征之一.Orai1蛋白单体是组成CRAC通道的亚基,4个Orai1蛋白亚基构成一个四聚体CRAC通道.内质网Ca2+浓度的降低使得STIM1发生定向运动并产生聚集,从而激活了CRAC通道.STIM1蛋白把内质网Ca2+的损耗与CRAC通道上的Ca2+内流联系起来,行使了Ca2+浓度感受器的功能.

关键词： CRAC通道 Orai1蛋白 STIM1蛋白

人可溶性白介素4受体(sIL4R)在大肠杆菌中的表达和纯化

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中国生物化学与分子生物学报 2004年第6期20卷 778-784页

作者：张勇王渭池李元中国医学科学院中国协和医科大学医药生物技术所北京100050 中国科学院物理所软物质物理实验室北京100080

白细胞介素 4 (IL 4 )作为一种多功能的细胞因子在哮喘等变态性炎症反应中具有关键作用 .IL 4通过结合细胞表面的白介素 4受体 (IL 4R)发挥其生物学效应 .sIL 4R缺少跨膜和胞内结构域 ,结合IL 4后不能产生信号传递介导IL 4的生物学活... 详细信息

白细胞介素 4 (IL 4 )作为一种多功能的细胞因子在哮喘等变态性炎症反应中具有关键作用 .IL 4通过结合细胞表面的白介素 4受体 (IL 4R)发挥其生物学效应 .sIL 4R缺少跨膜和胞内结构域 ,结合IL 4后不能产生信号传递介导IL 4的生物学活性 ,但sIL 4R与IL 4结合的高度特异性和极高的亲和力使它非常适合作为理想的IL 4拮抗剂 ,应用于哮喘等疾病治疗 .采用RT PCR方法 ,以人单核细胞总RNA为模板扩增得到编码sIL 4R的基因片段 ,经测序确证后插入大肠杆菌高效表达质粒pBV2 2 0 ,得到重组质粒pBV2 2 0 sIL 4R ,重组质粒转化E .coliDH5α .重组菌经温度诱导后超声破碎得到包涵体 ,经SuperdexHR75分子筛柱和DEAE SepharoseFastFlow离子交换柱进行纯化 ,HPLC检测表明纯度达到 90 % .N端测序证明 ,重组sIL 4R与天然sIL 4RN端序列完全一致 .Western印迹、配基结合印迹对重组sIL 4R进行鉴定 .结果表明 ,重组sIL 4R具有结合IL

关键词：人可溶性白介素-4受体 pBV220 表达与纯化

活血化瘀法治疗真性红细胞增多症血液动力学观察

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天津中医 1987年第3期 32-33页

作者：朱明娟王渭池张大龙中国医学科学院血液学研究所

“血瘀”是与全身或局部的血液循环障碍有关,表现为血流缓慢,瘀滞,血液变浓、变粘、变聚。真性红细胞增多症(下称真红),属“血瘀”证。本所采用活血化瘀法治疗取得可喜疗效。目前有关红细胞蛋白质改变对血液动力学的影响报道尚少。关于... 详细信息

“血瘀”是与全身或局部的血液循环障碍有关,表现为血流缓慢,瘀滞,血液变浓、变粘、变聚。真性红细胞增多症(下称真红),属“血瘀”证。本所采用活血化瘀法治疗取得可喜疗效。目前有关红细胞蛋白质改变对血液动力学的影响报道尚少。关于真红的肢体、脑血管血液动力学改变也有一些报道。动物实验对比积、粘度与血液动力学关系引起一些学者极大兴趣,并研究了细胞浓度增减时对血粘度、体循环和局部血液动力学影响,这些研究能更好地认识人体生理反应与比积改变的关系,阐明某些疾患的病因学和治愈机理的研究。为此我们探讨了真红血液动力学变化规律及其与流变学、微循环关系,以及治愈机理等。

关键词：血液动力学真红循环生理学心输出量心脏功能试验治疗后真性红细胞增多症

Direct Observation of Histone-Induced DNA Shortening

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Chinese Physics Letters 2006年第2期23卷 504-507页

作者：冉诗勇王晓玲付文博赖振华王渭池刘晓晴麦振洪李明 Belting National Laboratory for Condensed Matter Physics Institute of Physics Chinese Academy of Sciences Beijing 100080 Life Science College Capital Normal University Beijjng 100037

We construct a system of magnetic tweezers and apply it to study the interaction between histones and DNA. The condensation of DNA by purified histones at low ionic strengths is directly monitored by recording the length of the DNA as a function of elapsed time. It is found that DNA condensates in a dynamic manner. The binding of hist, ones to DNA is energetically favoured, but the ten,sion applied on DNA tends to unravel the DNA-histone complex, The competition between the two processes determiners the rate of the DNA condensation.

关键词： SINGLE CHROMATIN FIBERS SUPERCOILED DNA RNA-POLYMERASE STRANDED-DNA MOLECULES ELASTICITY FORCE NUCLEOSOMES RESOLUTION TWEEZERS

Effects of CRAC Channel on Spatiotemporal Ca2＋ Patterns in T Cells

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Chinese Physics Letters 2010年第2期27卷 311-314页

作者：李丛鑫陈晓芳王鹏业王渭池 Chinese Acad Sci Inst Phys Beijing Natl Lab Condensed Matter Phys Lab Soft Matter Phys Beijing 100190 Peoples R China

A reaction-diffusion model is built to investigate the temporal and spatial patterns of cytoplasmic Ca2＋ dynamics under the effects of Ca2＋-release activated Ca2＋（CRAC） channels in T cells. Simulation results show a strong dependence of the modulation mode of Ca2＋ oscillation and dynamic patterns of Ca2＋ wave on the influx rate through the CRAC channel （ksoc）. When ksoc is small, cytoplasmic Ca2＋ is modulated as a frequency-modulation （FM） signal, whereas it shows an amplitude modulation （AM） mode after ksoc passes through a critical value. The heterogeneity in spatial Ca2＋ distribution is mostly arising from the influx through CRAC channels in both FM and AM modes. During each Ca2＋ spike, a more sustained cytoplasmic Ca2＋ gradient is maintained in the AM mode rather than in the FM mode.

关键词： Biological physics