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PRR11-Ska2“基因对”在肺癌中的表达与功能分析

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PRR11-Ska2“基因对”在肺癌中的表达与功能分析

作者：王义涛重庆医科大学

学位级别：硕士

PRR11（Proline-rich protein11）是我们最近发现并鉴定的一个参与细胞周期调控和肺癌等肿瘤发生发展的新基因。Ska2(spindle andkinetochore associated complex subunit2)，又称FAM33A(family withsequence similarity33, member A)，也是新近发现的一个与细胞周期调控和肿瘤发生发展均密切相关的新基因，但其在肺癌中的作用仍不甚清楚。我们前期已发现，这两个基因均定位于染色体17q23区，两者共享一个独特的双向启动子，以“头对头”（head-to-head）的方式排列形成一个基因对（gene pairs），且该“基因对”作为一个独立的转录单元发挥作用并受NFYB和p53调控。本研究将在此基础上对Ska2以及PRR11-Ska2“基因对”在肺癌中的表达水平及功能进行初步探索。（1）Ska2在肺癌中的表达水平及临床意义分析采用定量RT-PCR技术检测肺癌组织和肺正常组织中Ska2的表达水平，结果表明，Ska2在肺癌组织中表达水平高于正常肺组织，且与肺癌的病理分级和临床分期密切相关，随着分化和恶性程度的增加Ska2的表达水平不断升高。同时，采用生物信息学手段，分析了Ska2在肺癌中的预后价值，结果表明，Ska2高表达组的病人的总体生存期和预后无复发生存期显著低于低表达组。（2）PRR11-Ska2“基因对”在肺癌中的表达水平及临床意义分析对PRR11与Ska2在各种正常人体组织、肺癌组织和肺癌微阵列数据GSE13213中的表达水平相关性进行了分析。结果表明，在各种正常人体组织中，PRR11与Ska2的表达呈正相关;肺癌组织中PRR11与Ska2的表达呈高度正相关。在肺癌微阵列数据GSE13213中，PRR11与Ska2的表达呈高度正相关，两者的表达水平还与NFYB的表达呈正相关，两者的表达水平在野生型的p53肺癌病人组的表达水平均低于突变型p53肺癌病人组。这些结果提示，PRR11与Ska2在肺癌组织细胞中作为一个独立转录单元发挥作用，两基因在该转录单元中同时高效协调地转录，两者功能相关且同时受p53和NFYB的协调调控。同时，采用生物信息学手段，分析了PRR11-Ska2“基因对”在肺癌中的预后价值，结果显示，PRR11与Ska2同时高表达组的病人的总体生存期和预后无复发生存期显著低于PRR11与Ska2的单独高表达组，表明PRR11-Ska2“基因对”是个更具预后价值的标志物。（3）PRR11-Ska2“基因对”在肺癌中的功能分析采用慢病毒介导的RNA干扰技术，分别在肺癌细胞系A549、H1299中构建了阴性对照以及PRR11与Ska2基因单独沉默和联合沉默的稳定细胞株，分别命名为LV-shRNA-NC、LV-shRNA-PRR11、LV-shRNA-Ska2和LV-shRNA-P+S。Western bloting结果表明，稳定细胞株中PRR11与Ska2基因的表达被有效沉默。细胞表型分析结果表明，在H1299和A549两种肺癌细胞系中，与LV-shRNA-NC阴性对照组稳定细胞株相比，PRR11与Ska2基因单独沉默和联合沉默的LV-shRNA-PRR11、 LV-shRNA-Ska2和LV-shRNA-P+S组稳定细胞株的增殖、迁移及侵袭能力均显著降低;且与PRR11或Ska2基因单独沉默组相比，PRR11与Ska2联合沉默组稳定细胞株的增殖、迁移及侵袭能力的降低程度更为明显。该结果提示，PRR11与Ska2对于肺癌发生发展过程均是必需的，两者功能不仅高度相关，且其功能具有一定的协同或互补效应。进一步通过定量RT-PCR技术检测了各组稳定细胞株中与细胞周期和肿瘤发生发展相关基因（包括CCNA1、CDC2、MAP4K4、RRM1、EPB41L3、CCNA2、NFIB和DHRS2）的表达变化。结果表明，与LV-shRNA-NC阴性对照组稳定细胞株相比，PRR11与Ska2基因单独沉默和联合沉默组稳定细胞株中，上述基因均发生了不同程度的变化（减低或升高），且在H1299和A549两种肺癌细胞系中有所不同。该结果提示，虽然PRR11与Ska2的功能高度相关，但其具体的功能和分子行为机制可能不同，且在不同的细胞系中也有所不同。综上，本研究结果不仅初步证实了Ska2是一个新的参与肺癌发生与发展的新基因，而且也证实了PRR11-Ska2“基因对”对于肺癌的发生发展过程是必需的，在肺癌的分子诊断和靶向治疗中具有潜在应用价值。

关键词： PRR11 Ska2 肺癌增殖迁移侵袭

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基于VIIS-EM的数字存储示波器的研究

基于VIIS-EM的数字存储示波器的研究

作者：王义涛吉林大学

学位级别：硕士

近年来,计算机技术的迅猛发展带动了以计算机为核心的其他工业领域的改革,电子测量领域就是其中之一。以计算机为核心的虚拟仪器技术在近年来的电子测量领域大放光彩,越来越多的开发者投入到虚拟仪器设备的研发中来。以美国为首的发达... 详细信息

近年来,计算机技术的迅猛发展带动了以计算机为核心的其他工业领域的改革,电子测量领域就是其中之一。以计算机为核心的虚拟仪器技术在近年来的电子测量领域大放光彩,越来越多的开发者投入到虚拟仪器设备的研发中来。以美国为首的发达国家已经有了比较成熟的产品,其中仅美国国家仪器(NI)一家公司,目前市面上已经有超过500款成熟的虚拟仪器硬件设备,国外的迅猛发展不断地冲击着国内的电子测试仪器市场,造成了大量的资本流失。所以很有必要研制出有我们自主知识产权的、可靠的、精密的虚拟仪器设备来改善目前的情况。本课题是基于VIIS-EM(Virtual Instrument Integration System for Electronic Measuring,简写为VIIS-EM)系统研制的。VIIS-EM是由吉林大学自主研发的一种面向高校实验教学用的虚拟仪器电子测量集成系统,集成了多块功能板卡。本课题设计了一款基于虚拟仪器技术的动态存储示波器,动态存储功能在实际应用中有着广泛的应用,例如对瞬间或一次性事件的捕获,存储器可以将波形保存供实验者随时复看。设计中对于整个系统中存在的问题也进行了相应的改进与完善,使得系统采集卡有着更好的采样率、更快的数据上传速度等。课题将设计分为硬件采集部分设计和软件的数据处理分析设计,在硬件部分,系统采用的是“FPGA+MCU”的方式作为中央控制单元,通过FPGA实现MCU的地址译码、通信、数据缓存等操作。上层软件采用的是虚拟仪器技术应用最为广泛的开发环境Lab VIEW。Lab VIEW是一种图形化语言,其提供了强大的数据运算与处理能力,软件的兼容性极强,并且有着极为人性化的人机交互界面,使得开发者可以自定义测试选项和功能。在研制的最后,对系统进行了整机的测试,给出了整机测试结果。

关键词：虚拟仪器示波器 Lab VIEW FPGA VIIS-EM

威海地区食源性细菌的分布及病原性海洋弧菌多重降落PCR方法的建立

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威海地区食源性细菌的分布及病原性海洋弧菌多重降落PCR方法的建立

作者：王义涛青岛大学

学位级别：硕士

背景与目的:海洋性弧菌广泛分布于内湾、沿岸、外洋水域、海洋生物体和沉积物中,能够感染鱼类或哺乳动物,并可在人群中引起食物中毒。不少弧菌会导致人或其他动物发病,以霍乱弧菌、创伤弧菌和副溶血弧菌致病力最强。随着海产品消费的不... 详细信息

背景与目的:海洋性弧菌广泛分布于内湾、沿岸、外洋水域、海洋生物体和沉积物中,能够感染鱼类或哺乳动物,并可在人群中引起食物中毒。不少弧菌会导致人或其他动物发病,以霍乱弧菌、创伤弧菌和副溶血弧菌致病力最强。随着海产品消费的不断增多,因海产品传播的细菌性疾病发生范围和频率也逐渐增大。常规的海洋弧菌检测方法即培养法不能满足快速诊断的需要,且某些海洋性弧菌培养困难,因此建立病原性海洋弧菌的快速检测技术,对病原性海洋性弧菌感染的诊断、治疗和维护公共健康具有重要意义。本研究旨在了解威海地区食源性疾病中致病菌的分布情况,建立一种可以同时检测临床标本中创伤弧菌及副溶血性弧菌的多重降落PCR方法,为临床快速诊断创伤弧菌和副溶血弧菌感染提供一种有效手段。方法:收集2017年3月0月威海市立医院食源性疾病就诊患者的粪便标本357例,采用常规培养法结合质谱分析对标本中病原菌进行鉴定。设计针对创伤弧菌（Vibrio vulnificus）细胞溶解素编码基因vvh A和副溶血性弧菌（Vibrio parahaemolyticus）胶原蛋白酶编码基因col的特异性引物,建立单一降落PCR和多重降落PCR反应体系并进行优化,检测各种标准菌株和临床菌株评价单一降落和多重降落PCR的特异性和敏感性。应用多重降落PCR检测103例粪便标本中创伤弧菌和副溶血弧菌,并与细菌培养法结果进行比较,评价多重降落PCR在临床标本检测中的可行性。结果:（1）共检出致病微生物98株,5种疾控要求监测病原微生物致泻大肠埃希菌、副溶血性弧菌、沙门氏菌、诺如病毒和志贺氏菌的比率依次为26.53%、21.43%、20.41%、10.20%和7.14%;另外还检出其它致病性海洋弧菌14株（14.28%）,包括创伤弧菌6株（6.12%）、哈氏弧菌3株（3.06%）、溶藻弧菌3株（3.06）和灿烂弧菌2株（2.04%）,海洋性弧菌的总检出比率为35.71%。（2）单一降落PCR只分别对创伤弧菌或副溶血弧菌检测到特异扩增条带,对其它种类弧菌和非弧菌未出现特异扩增条带;对创伤弧菌和副溶血弧菌的最低检测限分别为104 CFU/ml和103CFU/ml。（3）多重降落PCR可在目标测试菌中同时检测到创伤弧菌和副溶血弧菌的特异性扩增条带,对其它种类弧菌和非弧菌未出现特异扩增条带;对创伤弧菌和副溶血弧菌的最低检测限亦分别为104 CFU/ml和103 CFU/ml。（4）与细菌培养法比较,多重降落PCR检测103份粪便标本中创伤弧菌的灵敏度和特异性分别为l00%和97.94%,副溶血性弧菌的灵敏度与特异性分别为100%和95.12%。结论:（1）威海地区食源性疾病中海洋性弧菌检出率高,需要对其进行监测。（2）成功建立快速检测创伤弧菌和副溶血性弧菌的多重降落PCR方法,灵敏度高,特异性强,可直接用于临床标本中创伤弧菌和副溶血性弧菌的快速检测。

关键词：副溶血弧菌创伤弧菌多重降落PCR 食源性疾病病原性海洋弧菌

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基于微控制器的生物阻抗测量系统设计研究

基于微控制器的生物阻抗测量系统设计研究

作者：王义涛华北理工大学

学位级别：硕士

生物阻抗测量是一种利用生物组织与器官的电特性及其变化规律分析组织成分、结构和病理状况相关的生物医学信息的检测技术,分析研究这一技术意义重大。针对当前生物阻抗测量技术存在的问题,从硬件电路和软件程序设计等方面设计了便携式... 详细信息

生物阻抗测量是一种利用生物组织与器官的电特性及其变化规律分析组织成分、结构和病理状况相关的生物医学信息的检测技术,分析研究这一技术意义重大。针对当前生物阻抗测量技术存在的问题,从硬件电路和软件程序设计等方面设计了便携式生物阻抗测量系统,实现了生物阻抗的精准测量。本课题的主要工作如下:1)完成了生物阻抗测量系统的硬件设计。系统硬件包括电源模块、测量模块、控制模块和通信模块。电源模块采用USB和锂电池组两种供电方式,并对供电电路进行了设计。选用AD5940芯片作为阻抗测量模块的核心,设计了阻抗测量电路。控制模块采用STM32F411RET6作为微控制器进行控制和数据处理。根据上位机的不同,通信模块分别采用了USB和Wi Fi两种通信方式,实现了下位机与上位机之间的通信。使用Altium Designer设计了2层PCB板,实现了系统硬件的集成。2)完成了生物阻抗测量系统的软件设计。系统软件包括下位机软件、PC端软件和手机APP。用C语言设计了下位机软件,包括串口通信程序、SPI通信程序和阻抗测量程序;用Matlab语言设计了PC端软件,包括登录界面、串口通信、参数设置窗口、绘图窗口和数据显示窗口;用Java语言设计了手机APP,包括登录界面、Wi Fi连接界面和主界面。3)对生物阻抗测量系统进行了测试。分别对USB和锂电池组供电时的电源纹波进行测试,USB供电时,5.0V的纹波系数为1.32%,3.3V的纹波系数约为0.8%;锂电池组供电时,5.0V的纹波系数为0.84%,3.3V的纹波系数为0.33%。对晶振和通信模块进行了测试,晶振起振正常,通信模块收发正常。4)用生物阻抗测量系统在0.01Hz～200k Hz频率范围对电阻进行测量,并将测量结果与Fluke 289C高精度数字万用表的测量结果进行对比,得到系统的平均相对误差为0.11%,信噪比为70.15d B。然后,对生物组织的等效电路模型进行测量,并将测量结果与Gamry Reference 600的测量结果进行对比,得到系统的幅值平均绝对误差为-0.64Ω,相角为-0.447°。最后对2名志愿者的右臂进行测量,测量数据与相关研究结果相吻合。此生物阻抗测量系统具有体积小、精度高、频率范围宽和测量稳定可靠的优点,可以为生物医学信息的检测提供方法参考和技术支持。图[55]幅;表[6]个;参[57]篇。

关键词：生物阻抗测量便携式 AD5940 手机APP

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编队协同防空作战中的火力兼容判断研究

现代防御技术 2010年第4期38卷 53-56页

作者：王义涛王超西北工业大学航海学院陕西西安710072 海军大连舰艇学院科研部辽宁大连116018

火力兼容是影响编队协同防空作战能力发挥的一个关键问题。针对编队协同防空作战过程中,怎样判断各舰艇防空武器系统之间是否存在火力冲突的问题,通过对编队防空作战火力兼容原理的分析,建立了编队协同防空作战中的火力兼容判断模型。... 详细信息

火力兼容是影响编队协同防空作战能力发挥的一个关键问题。针对编队协同防空作战过程中,怎样判断各舰艇防空武器系统之间是否存在火力冲突的问题,通过对编队防空作战火力兼容原理的分析,建立了编队协同防空作战中的火力兼容判断模型。能够辅助编队指挥员在制定编队协同防空决策方案时,进行火力兼容检测,从而消除方案中可能存在的火力冲突,保证编队防空作战能力最大程度的发挥。

关键词：协同防空火力兼容舰空导弹

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编队协同防空作战中的电磁兼容判断模型

火力与指挥控制 2011年第6期36卷 64-66页

作者：王超王义涛海军大连舰艇学院辽宁大连116018

电磁兼容是影响编队协同防空作战能力发挥的一个关键问题,针对编队协同防空作战过程中,怎样判断编队各舰艇防空武器系统之间是否存在电磁冲突的问题,通过对编队防空作战电磁兼容原理的分析,建立了编队协同防空作战中的电磁兼容判断模型... 详细信息

电磁兼容是影响编队协同防空作战能力发挥的一个关键问题,针对编队协同防空作战过程中,怎样判断编队各舰艇防空武器系统之间是否存在电磁冲突的问题,通过对编队防空作战电磁兼容原理的分析,建立了编队协同防空作战中的电磁兼容判断模型,能够辅助编队指挥员在制定编队协同防空决策方案时,进行电磁兼容检测,从而消除方案中可能存在的电磁冲突,保证编队防空作战能力最大程度的发挥。

关键词：协同防空电磁兼容舰空导弹电子战

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一种基于海图水深的碍航区自动提取方法

海洋技术 2010年第3期29卷 69-72页

作者：张莉王义涛大连海事大学航海学院辽宁大连116026 海军大连舰艇学院科研部辽宁大连116018

航碍区的提取是舰船航线分析与自动生成的基础。文中提出了一种基于海图水深的碍航区自动提取方法。该方法通过水深三角网的约束构建,安全等深线的自动追踪和碍航区的分析,实现了碍航区自动生成和表达。实验证明,所提方法可以根据安全... 详细信息

航碍区的提取是舰船航线分析与自动生成的基础。文中提出了一种基于海图水深的碍航区自动提取方法。该方法通过水深三角网的约束构建,安全等深线的自动追踪和碍航区的分析,实现了碍航区自动生成和表达。实验证明,所提方法可以根据安全水深变化,自动提取适应于不同舰船的碍航区。

关键词：海图水深碍航区安全等深线

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舰艇编队防空威胁扇面研究

火力与指挥控制 2020年第4期45卷 29-34,39页

作者：吉泽王义涛韩宇海军大连舰艇学院辽宁大连116018

基于敌反舰导弹的“P-R模糊性”,讨论了敌我距离、敌航路选择椭圆对舰艇编队防空警戒扇面的影响,建立了编队防空警戒扇面模型,分析了敌导弹攻击扇面的约束条件,建立了敌导弹攻击扇面模型。基于上述两个模型的相关性,综合考虑敌方反舰导... 详细信息

基于敌反舰导弹的“P-R模糊性”,讨论了敌我距离、敌航路选择椭圆对舰艇编队防空警戒扇面的影响,建立了编队防空警戒扇面模型,分析了敌导弹攻击扇面的约束条件,建立了敌导弹攻击扇面模型。基于上述两个模型的相关性,综合考虑敌方反舰导弹的攻击能力和我编队的防空能力对编队防空威胁扇面的影响,建立了“三类八种”编队防空威胁扇面的分析模型,并给出了结论。为编队防空能力建设和提升提供了理论依据。

关键词：舰艇编队防空威胁扇面反舰导弹防空态势

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顾及高水位影响的潮滩淹没动态仿真算法

系统仿真学报 2007年第14期19卷 3335-3338页

作者：张立华王义涛朱庆刘雁春王庆国海军大连舰艇学院辽宁大连116018 武汉大学湖北武汉430079

正确的潮滩显示信息是海岸带管理、防洪决策等应用的重要决策依据。此文针对传统算法的不足,提出了一种顾及高水位影响的潮滩淹没动态仿真算法。此算法在提取数字伴潮海岸线(DTS)的基础上,快速确定不连通的洼地及其影响域。同时考虑高... 详细信息

正确的潮滩显示信息是海岸带管理、防洪决策等应用的重要决策依据。此文针对传统算法的不足,提出了一种顾及高水位影响的潮滩淹没动态仿真算法。此算法在提取数字伴潮海岸线(DTS)的基础上,快速确定不连通的洼地及其影响域。同时考虑高水位的影响,动态检测不连通洼地的变化,建立洼地索引表,正确有效地对潮滩淹没区进行动态表达。实验结果证明了此算法具有更高的准确性与效率,可以实现顾及高水位影响的潮滩淹没实时动态仿真。

关键词：潮滩淹没高水位仿真洼地