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基于近红外的多相偏最小二乘模型组合分析实现茶叶原料品种鉴定与溯源的研究

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光谱学与光谱分析 2010年第10期30卷 2650-2653页

作者：周健成浩曾建明王丽鸳韦康贺巍王伟峰刘栩国家茶树改良中心中国农业科学院茶叶研究所浙江杭州310008 南京农业大学茶学系江苏南京210095

为实现茶叶的品种溯源,以近红外光谱分析技术为基础,尝试采用PLS、欧氏距离等方法的组合来实现茶叶的特殊原料品种的鉴别、具体品种识别分析。结果表明:研究中以4个品种(龙井43,群体种、迎霜和乌牛早)的茶树鲜叶为制成的茶叶样本为材料... 详细信息

为实现茶叶的品种溯源,以近红外光谱分析技术为基础,尝试采用PLS、欧氏距离等方法的组合来实现茶叶的特殊原料品种的鉴别、具体品种识别分析。结果表明:研究中以4个品种(龙井43,群体种、迎霜和乌牛早)的茶树鲜叶为制成的茶叶样本为材料,分别建立了4个不同原料加工成的茶叶样本的PLS鉴定模型,对定标集样本识别的准确率分别为89.8%,90.9%,96.1%和99.5%,验证集的识别准确率分别为87.1%,84.2%,96.1%和97.5%;而采用4个品种鉴定模型的组合分析"初次识别"并且结合欧氏距离法进行"二次识别"后,最终对4种不同品种茶叶样本的原料品种的识别准确率分别为90.3%(定标集)和83.5%(验证集)。该研究为实现特殊品种加工成茶叶的鉴定以及成品茶的品种溯源提供了一种参考方法。

关键词：茶品种溯源近红外偏最小二乘法欧氏距离

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茶树花转录组微卫星分布特征

作物学报 2014年第1期40卷 80-85页

作者：王丽鸳韦康张成才成浩中国农业科学院茶叶研究所/国家茶树改良中心浙江杭州310008

利用Perl语言,对茶树花转录组序列进行大通量SSR位点的发掘,发现含SSR的序列10 290条,共12 582个SSR,平均2.41 kb出现一个SSR。在茶树花的转录组中共发现340种碱基重复模式,所占比例最高的是(AG/CT)n(44.99%)。在49 586条注释成功的茶树... 详细信息

利用Perl语言,对茶树花转录组序列进行大通量SSR位点的发掘,发现含SSR的序列10 290条,共12 582个SSR,平均2.41 kb出现一个SSR。在茶树花的转录组中共发现340种碱基重复模式,所占比例最高的是(AG/CT)n(44.99%)。在49 586条注释成功的茶树花Unigene中,共发现10 490个SSR位点,其中位于编码区的1917个,其出现频率仅为0.102 SSR/1000 bp,而非编码区为3.072 SSR/1000 bp。在基因编码区中出现频率最高的是三碱基微卫星(1140,59.5%),其次是六碱基微卫星(524,27.3%)。茶树花转录组所含微卫星以重复长度小于20 bp的序列最多,大于20 bp的仅为25.2%。茶树花转录组中,含微卫星基因的平均表达水平显著低于不含微卫星基因,其中含复杂微卫星基因的平均基因表达水平最低。

关键词：茶树微卫星花转录组

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基于转录组测序对茶树GST基因表达的研究

茶叶科学 2016年第5期36卷 513-522页

作者：张亚真韦康王丽鸳成浩中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心农业部茶树生物学与资源利用重点实验室浙江杭州310008

谷胱甘肽转移酶(Glutathione S-transferases,GSTs)在植物体内普遍存在,是一类具有多种生物学功能的超家族蛋白酶。本研究通过对中黄2号、龙井43在正常光照和遮荫处理下的转录组测序,筛选获得了49个Cs GSTs基因家族成员,并对其中19个在... 详细信息

谷胱甘肽转移酶(Glutathione S-transferases,GSTs)在植物体内普遍存在,是一类具有多种生物学功能的超家族蛋白酶。本研究通过对中黄2号、龙井43在正常光照和遮荫处理下的转录组测序,筛选获得了49个Cs GSTs基因家族成员,并对其中19个在芽叶中表达量较高的Cs GSTs基因进行了序列分析和聚类分析。另外对表达量较高的8个候选基因进行荧光定量表达分析,研究它们在龙井43不同叶位中的表达模式。结果表明这些Cs GSTs基因在一芽一叶到第六叶中均有表达,但各自呈现出不同的变化规律。Cs GST20在龙井43一芽一叶到第六叶中的表达量逐渐上升,可能与植物抗胁迫有关,而Cs GST24的表达量则显著下降,可能与花青素代谢有关。

关键词：茶树转录组测序谷胱甘肽转移酶表达分析

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基于化学指纹图谱的绿茶原料品种判别分析

中国农业科学 2008年第8期41卷 2413-2418页

作者：成浩王丽鸳周健刘栩叶阳陆文渊中国农业科学院茶叶研究所/中国茶树改良中心

【目的】探索化学指纹图谱在建立绿茶原料品种属性鉴别验证技术方面应用的可行性与潜力。【方法】利用HPLC和信息融合原理,按单一产地和混合产地两种原则,建立根据不同原料品种分组的绿茶样本的多元数字化化学指纹图谱,并采用逐步判别... 详细信息

【目的】探索化学指纹图谱在建立绿茶原料品种属性鉴别验证技术方面应用的可行性与潜力。【方法】利用HPLC和信息融合原理,按单一产地和混合产地两种原则,建立根据不同原料品种分组的绿茶样本的多元数字化化学指纹图谱,并采用逐步判别分析技术进行样本的分类判别研究和验证。【结果】采用杭州西湖区、绍兴新昌县和丽水莲都区共3个产地的样本各自建立的单一产地判别函数,其回判正确率、交叉验证正确率和外部验证正确率均为100%;采用8市(县)混合样本建立的判别函数,其回判正确率为99.2%,交叉验证成功率为97.7%,外部验证正确率为100%。【结论】HPLC建立的绿茶多元化学指纹图谱能够较好地表征茶叶样本的品种属性,在此基础上有望建立一种对茶产品原料品种的判别验证技术。

关键词：绿茶化学指纹图谱判别分析品种

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植物谷胱甘肽转移酶在类黄酮累积中的作用

植物生理学报 2015年第11期51卷 1815-1820页

作者：张亚真张芬王丽鸳韦康成浩中国农业科学院茶叶研究所、国家茶树改良中心、农业部茶树生物学与资源利用重点实验室杭州310008

植物谷胱甘肽转移酶(GSTs)是一类广泛存在于植物中的多功能蛋白,参与调节植物次生代谢、解毒和防御等。深入研究GSTs在类黄酮累积中的作用,对于揭示植物类黄酮累积的调控机制具有重要意义。本文主要从GSTs的分类出发,对近年来不同类别G... 详细信息

植物谷胱甘肽转移酶(GSTs)是一类广泛存在于植物中的多功能蛋白,参与调节植物次生代谢、解毒和防御等。深入研究GSTs在类黄酮累积中的作用,对于揭示植物类黄酮累积的调控机制具有重要意义。本文主要从GSTs的分类出发,对近年来不同类别GSTs在类黄酮累积中的作用进行了综述。

关键词：植物谷胱甘肽转移酶类黄酮转运

茶树亚硝酸还原酶基因CsNiR的克隆及表达分析

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园艺学报 2016年第7期43卷 1348-1356页

作者：张芬王丽鸳成浩韦康胡娟张成才刘圆吴立赟李海琳中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心杭州310008

以‘龙井43’茶树叶片的c DNA为模板,利用RT PCR技术克隆了茶树亚硝酸还原酶基因(CsNiR),得到完整的ORF全长为1 764 bp,编码587个氨基酸;所推导的氨基酸序列与垂枝桦(Betula pendula)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)、菠菜(Spinacia ole... 详细信息

以‘龙井43’茶树叶片的c DNA为模板,利用RT PCR技术克隆了茶树亚硝酸还原酶基因(CsNiR),得到完整的ORF全长为1 764 bp,编码587个氨基酸;所推导的氨基酸序列与垂枝桦(Betula pendula)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)、菠菜(Spinacia oleracea)和水稻(Oryza sativa)的同源性均大于76%。生物信息学分析表明,CsNiR分子量为68.648 k D,等电点为6.12,为亲水性的非分泌蛋白;二级结构的预测显示,Cs Ni R具有完整的Ni R蛋白结构,含血红素蛋白β–化合物区域和4Fe-4S区域。实时荧光定量结果表明,该基因在成熟叶片中表达量高于一芽二叶和根。采用营养液水培3个茶树品种,在氮饥饿两周后分别供应正常氮素和低氮素(1和0.1 mmol·L^(-1) NH4NO3),q RT-PCR测定发现,正常氮素处理的2 h和6 h,诱导根CsNiR表达量显著增加,叶片中的表达量变化延迟到24 h之后,且变化幅度存在基因型之间的差异;低氮处理对CsNiR表达量的影响相对较小。因此,研究Cs Ni R基因的表达特性及其在茶树氮素利用中所发挥的作用,需结合茶树基因型、组织部位、供氮水平等进行综合评价。

关键词：茶树亚硝酸还原酶克隆基因表达氮素

基于近红外的Fisher分类法识别茶叶原料品种的研究

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光学学报 2009年第4期29卷 1117-1121页

作者：周健成浩叶阳王丽鸳贺巍刘栩陆文渊中国农业科学院茶叶研究所茶树资源与改良研究中心国家茶树改良中心浙江杭州310008 南京农业大学江苏南京210095

提出一种可对成品茶的原料品种进行准确识别的方法。在实验中对不同原料品种（龙井43。与其他品种）制成的茶叶样本进行近红外光谱的采集，通过主成分分析（principal component analysis，PCA）后获得了20个主成分，利用逐步回归法筛选... 详细信息

提出一种可对成品茶的原料品种进行准确识别的方法。在实验中对不同原料品种（龙井43。与其他品种）制成的茶叶样本进行近红外光谱的采集，通过主成分分析（principal component analysis，PCA）后获得了20个主成分，利用逐步回归法筛选出8个主成分作为自变量，建立茶叶原料品种的Fisher识别函数对成品茶的原料品种进行识别分析。实验结果表明建立的识别函数能很好地对茶叶的原料品种进行准确识别，在定标集中的识别准确率达到了96．8％，并月．利用外部样本进行验证的识别准确率也达到了93．5％。本实验证实了利用PCA和Fisher识别组合分析识别成品茶原料品种的可行性。

关键词：光学鉴别茶原料品种识别近红外逐步回归

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基于茶树EST-SNP的CAPS标记开发

分子植物育种 2013年第6期11卷 817-824页

作者：张成才王丽鸳韦康成浩中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心杭州310008

为了促进SNP技术在茶树遗传育种中的应用,本文探讨了将茶树SNPs转化成CAPS标记进行检测的可行性。首先,对从茶树ESTs中挖掘的候选SNPs进行重测序验证;然后,对确证的SNPs进行限制性内切酶识别位点分析,筛选出引起酶切识别位点改变的SNPs... 详细信息

为了促进SNP技术在茶树遗传育种中的应用,本文探讨了将茶树SNPs转化成CAPS标记进行检测的可行性。首先,对从茶树ESTs中挖掘的候选SNPs进行重测序验证;然后,对确证的SNPs进行限制性内切酶识别位点分析,筛选出引起酶切识别位点改变的SNPs;使用相应的引物从茶树基因组中扩增这些SNPs所在的片段,然后对扩增产物进行酶切和电泳检测,将SNPs转化为CAPS标记;最后,随机选择了14个CAPS标记,在25个茶树品种中进行多态性分析,以验证标记的可用性。结果,经重测序验证,在8个茶树品种中共检测到162个SNPs;将39个SNPs成功转化为CAPS标记;在14个随机选择的CAPS标记中有13个在25个品种中表现出多态性,多态性信息含量(PIC)介于0.043和0.497之间,平均0.311;另外1个标记在25个品种中均为杂合。结果表明,本文构建的将茶树SNPs转化为CAPS标记的方法,可以方便地用于茶树SNPs的检测;该方法能够促进SNP技术在茶树遗传育种研究中的应用;同时,本文报道的39个CAPS标记可以用于茶树遗传多态性检测和茶树遗传图谱构建等方面的研究。

关键词：茶树 EST SNP CAPS 遗传多态性

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茶树EST-SNP分布特征及标记开发

茶叶科学 2012年第4期32卷 369-376页

作者：王丽鸳张成才成浩韦康中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心浙江杭州310008

对NCBI网上公开的12757条茶树ESTs序列进行聚类,成功构建了茶树的独立基因(Unigene)数据库,发现茶树的EST序列冗余率约为68.2%。初步建立了茶树EST-SNP标记开发体系,明确了茶树EST中SNP的分布规律,茶树编码区的SNP发生频率约为0.58%,平... 详细信息

对NCBI网上公开的12757条茶树ESTs序列进行聚类,成功构建了茶树的独立基因(Unigene)数据库,发现茶树的EST序列冗余率约为68.2%。初步建立了茶树EST-SNP标记开发体系,明确了茶树EST中SNP的分布规律,茶树编码区的SNP发生频率约为0.58%,平均200bp就有1个SNP位点,并进一步推算出茶树基因组DNA序列的杂合率约为0.38%,平均300个碱基就可能出现1个杂合位点。从237个多基因聚类簇中发现了818个SNP候选位点,设计了25对SNP引物进行DNA重测序验证,发现EST-SNP候选位点的多态检出率为75%。

关键词：茶树表达序列标签单核苷酸序列多态性