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基于RNA-seq和BSA-seq分析鉴定菜心开花时间性状基因

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基于RNA-seq和BSA-seq分析鉴定菜心开花时间性状基因

作者：王帷千广州大学

学位级别：硕士

菜心是我国华南地区的特色蔬菜,主要以花薹为食,花薹的出现标志着菜心抽薹开花,这是其生命周期中从营养生长转变为生殖生长的关键过程,对生存和繁衍至关重要。抽薹开花时间影响着花薹的品质质量和经济产量,菜心可分为早熟、中熟和晚熟... 详细信息

菜心是我国华南地区的特色蔬菜,主要以花薹为食,花薹的出现标志着菜心抽薹开花,这是其生命周期中从营养生长转变为生殖生长的关键过程,对生存和繁衍至关重要。抽薹开花时间影响着花薹的品质质量和经济产量,菜心可分为早熟、中熟和晚熟三种类型,其开花时间的早晚依次推迟,根据生产季节、地域环境和耕作制度,选择适宜的菜心品种,可有效避免菜心先期抽薹而造成的经济损失和营养物质的转移而造成的品质下降。目前菜心抽薹开花时间的调控机制并不清晰,因此开展菜心抽薹开花时间性状的研究,分析调控菜心抽薹开花时间早晚的分子机制、挖掘调控菜心抽薹开花的相关基因、制定符合花期调控的栽培计划,对扩大菜心产量和优质菜心品种的选育均具有重要意义。为更充分地了解菜心抽薹开花调控的分子机制,以早熟菜心“四九-19号”和晚熟菜心“80天油绿”为材料,对其七叶期和现蕾期的茎尖组织进行转录组测序,分析其转录组特性以探讨菜心发育过程中开花相关基因的表达变化及所处通路。同时利用这两种菜心材料构建F2代分离群体进行BSA混池测序,检测菜心子代的SNP和In Del标记,结合转录组关联分析以期筛选菜心抽薹开花调控相关的候选基因。主要研究结果如下:1.获得两种菜心材料在不同时期的转录组数据,共80.508 Gb高质量数据,获得两种菜心品种间和时期间差异表达基因共23179个。在同时期两个品种间分别鉴定出1990和1248个差异表达基因,其中七叶期上调基因1210个、下调基因780个,现蕾期上调基因574个、下调基因674个。在同品种两个时期间分别鉴定出1965和6007个,其中“四九-19号”菜心上调基因1208个,下调基因757个,“80天油绿”菜心上调基因2750个,下调基因3257个。GO和KEGG功能分析结果表明,菜心在发育过程中需要以光合作用和碳水化合物代谢为基础,并伴随多种次生代谢产物的合成以及蛋白质、糖类、脂质和有机酸等分子的合成、加工及代谢。表明从七叶期到现蕾期的生长过程是影响菜心分化的关键,大量基因差异表达,菜心通过响应光周期、温度等环境因素结合激素诱导下游基因表达及其他转录因子调控茎尖向开花转变。2.从两个菜心品种共有的750个差异表达基因中筛选出16个开花相关基因,涉及光周期途径、自主途径、赤霉素途径、顶端分生组织响应途径、春化途径、温度途径和年龄途径等,14个基因表达模式一致,为上调表达,说明菜心抽薹开花过程受到复杂调控,这些基因是菜心开花调控所必须的,光周期途径、自主途径和赤霉素途径是菜心开花调控的关键途径,同时受到春化途径、温度途径和年龄途径的影响。另外,两种菜心各自所特有的开花基因涉及光周期、自主途径和赤霉素等多个调控途径,表明两种菜心开花调控所涉及的途径基本相同,但由于开花调控途径中的基因响应的种类和差异表达的不一致,造成不同熟性菜心间开花时间早晚的差异。3.以“四九-19号”早熟菜心和“80天油绿”晚熟菜心构建的F2代抽薹开花所需天数在59天到85天不等,介于两者之间,但偏向父本,表明抽薹开花时间性状是数量性状,受多个位点控制。极端群体BSA-seq结果显示,在亲本和子代中均检测到大量SNP和In Del变异。根据变异频率进行关联最终将菜心抽薹开花时间性状定位在A01、A02、A08和A10共4条染色体上的7个不同区间,共计2.423 Mb,其中包含148个基因。4.将候选区间基因进行功能注释、GO和KEGG富集分析以及结合转录组表达量分析,最终筛选到5个候选基因,分别参与开花时间调控和花发育。其中Bra A02g044690.3.5C（HDA5）和Bra A02g025510.3.5C（GA2OX1）分别参与自主途径和赤霉素途径,结合它们在两种菜心转录组种的表达模式存在差异,表明这两个基因对菜心开花起关键调控作用,自主途径和赤霉素途径是菜心的重要开花调控途径。

关键词：菜心开花调控转录组测序混池测序候选基因

生态环境分区管控政策绩效评估指标体系构建及应用

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环境污染与防治 2024年第10期 1538-1542页

作者：李敏徐茂蓉阳攀登王丙晖浙江省生态环境科学设计研究院浙江省环境污染控制技术研究重点实验室中节能实业发展有限公司陆海统筹生态治理与系统调控重点实验室山东省生态环境规划研究院

在生态环境分区管控制度已进入落地实施、体系完善阶段的大背景下，构建一套生态环境分区管控政策绩效评估指标体系，对于完善生态环境分区管控成果评估和监管机制具有重要的作用。基于区域环境绩效评估的理论框架与方法论，兼顾科学性... 详细信息

在生态环境分区管控制度已进入落地实施、体系完善阶段的大背景下，构建一套生态环境分区管控政策绩效评估指标体系，对于完善生态环境分区管控成果评估和监管机制具有重要的作用。基于区域环境绩效评估的理论框架与方法论，兼顾科学性、系统性、可量化和可操作性等原则，创新构建了一个包含生态环境系统改善、资源效率提升、产业高质量发展和生态环境治理能力提升4个维度15项具体指标的评估指标体系，并以某沿海城市为案例开展实证分析。结果表明，该绩效评估指标体系可以反映生态环境分区管控政策实施后的主要成效，评价结果可信。研究结果为地市级生态环境分区管控政策绩效评估指标的体系构建提供了借鉴和参考。

关键词：生态环境分区管控绩效评估指标体系

2022—2023年山东部分地区鸭圆环病毒的遗传进化及分子特征分析

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中国家禽 2024年

作者：曹凤阳郭晶王丙敬高林霄李旭勇山东恩诺基生物工程有限公司聊城大学农学与农业工程学院

为了解山东地区鸭圆环病毒（DuCV）的流行情况并探究其分子特征，试验从山东省部分地区疑似感染鸭圆环病毒的病鸭中采集样品进行病原检测，初步判定为鸭圆环病毒感染，进一步采用常规PCR方法扩增出4株DuCV的全基因组序列，并进行遗传进... 详细信息

为了解山东地区鸭圆环病毒（DuCV）的流行情况并探究其分子特征，试验从山东省部分地区疑似感染鸭圆环病毒的病鸭中采集样品进行病原检测，初步判定为鸭圆环病毒感染，进一步采用常规PCR方法扩增出4株DuCV的全基因组序列，并进行遗传进化和分子特征分析。结果显示：4株病毒的全基因组序列相似性在96.6%～99.6%之间；4株病毒与代表株DQ100076位于同一分支，相似性在97%以上，属于DuCV-1b亚型；4株病毒的Cap蛋白虽然均属于DuCV-1b亚型，但SDJN/0723、SDLC/0311与代表株DQ100076位于同一分支，SDHZ/1021、SDENJ/0429位于另一分支，共有11处氨基酸突变；4株病毒的Rep蛋白较保守，氨基酸序列与代表株参考序列之间差异较小。研究表明，DuCV-1b亚型DuCV是2022—2023年山东地区鸭群中的优势流行基因型，并且病毒基因持续变异，结果为山东地区DuCV的防控提供了参考。

关键词：鸭圆环病毒全基因组遗传进化分子特征

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盾构电气系统元器件检测平台研制与应用

隧道建设（中英文） 2024年第2期44卷 349-359页

作者：刘作威张阐娟王丙超石富明中铁隧道局集团有限公司设备分公司广东广州511466

为解决盾构电气系统元器件手动测试模拟实际工况时加载实时性差、测试精度低、数值波动范围大的问题,基于Wincc7.2设计的人机操作界面和S7-1500 PLC控制系统,利用机械、液压、电气等多源控制系统,采取变温、调压、伺服驱动等多种加载运... 详细信息

为解决盾构电气系统元器件手动测试模拟实际工况时加载实时性差、测试精度低、数值波动范围大的问题,基于Wincc7.2设计的人机操作界面和S7-1500 PLC控制系统,利用机械、液压、电气等多源控制系统,采取变温、调压、伺服驱动等多种加载运行方式,运用专家系统、自适应滤波和主成分分析法相融合的控制策略,对传感器、低压电器模块、小功率变频器模拟盾构实际运行工况,搭建盾构电气系统元器件检测平台。该平台按照操作界面提示,设置不同类型、规格的电气系统元器件参数,能实现模拟现场实际复杂工况下检测元器件全工作范围物理信号的标定对比测试,检测运行效果良好,检测数据准确、完整,大大提高了电气系统元器件检测的准确性。

关键词：盾构电气系统电气系统元器件检测平台

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管窥失眠

科学生活 2024年第8期 120-121页

作者：王丙辉上海天佑医院上海市社会医疗机构协会康复医学分会中国针灸学会上海市针灸学会

失眠是日常生活中难免会遇到的情况,本文提到的失眠主要是指反复发生、长期存在,对患者的正常生活工作产生负面影响的“失眠症”,属于疾病的范畴。因为特定原因偶尔产生的入睡困难,不在讨论之列。易患失眠症的人群年轻失眠症患者,主要... 详细信息

失眠是日常生活中难免会遇到的情况,本文提到的失眠主要是指反复发生、长期存在,对患者的正常生活工作产生负面影响的“失眠症”,属于疾病的范畴。因为特定原因偶尔产生的入睡困难,不在讨论之列。易患失眠症的人群年轻失眠症患者,主要来自三类人群。第一类,工作内容琐碎,对细节准确度要求很高,因此工作时要求专心致志,不能分心。

关键词：入睡困难失眠准确度要求特定原因三类人群分心负面影响日常生活

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针灸治疗中风后面瘫的临床研究进展

中文科技期刊数据库（文摘版）医药卫生 2024年第6期 0021-0024页

作者：王丙辉上海天佑医院上海200331

面瘫的病发是多方面因素共同作用下使得患者面神经受到损伤,进而诱发的病症。现阶段可将面瘫分为周围性面瘫以及中枢性面瘫。对于中风后面瘫患者而言,此类患者多属于中枢性面瘫,是中风后发生率相对较大的并发症。此类患者的主要特征为... 详细信息

面瘫的病发是多方面因素共同作用下使得患者面神经受到损伤,进而诱发的病症。现阶段可将面瘫分为周围性面瘫以及中枢性面瘫。对于中风后面瘫患者而言,此类患者多属于中枢性面瘫,是中风后发生率相对较大的并发症。此类患者的主要特征为面部表情肌群障碍,而口脸歪斜则属于中风后面瘫环最为典型的临床表现,不仅会对患者的外部美观状态造成严重的影响,同时可使得患者出现语言障碍、吞咽障碍等情况,对患者的恢复以及预后造成严重的影响。现阶段在对中风后面瘫患者进行治疗的过程中,治疗方式呈现出多样化的特点,包括把关、物理因子疗法以及针灸等。本文将进一步分析针灸在中风后面瘫患者中的应用进展。

关键词：针灸中风面瘫

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转换问题视角,有效培育“四能”

中学数学教学参考 2024年第4期 5-7页

作者：王丙风王丙风数学工作室

以2020年高考数学新高考卷ⅡI函数综合题为例,给出引导学生解决代数问题的策略和方法,让他们能够发现和提出问题、分析和解决问题。启发学生转换问题视角,能够让其选择恰当的知识、策略和方法解决问题。

关键词：解题教学转换视角函数与导数

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针灸和推拿治疗脑卒中后遗症的效果如何

人人健康 2024年第11期 64-65页

作者：王丙辉上海天佑医院

脑卒中是一种常见的神经系统疾病，其后遗症包括肢体功能障碍、认知障碍等，给患者的生活带来极大困扰。近年来，针灸和推拿作为传统的中医疗法，在治疗脑卒中后遗症方面取得了显著效果。本文将介绍针灸和推拿对脑卒中后遗症的治疗作用...

脑卒中是一种常见的神经系统疾病，其后遗症包括肢体功能障碍、认知障碍等，给患者的生活带来极大困扰。近年来，针灸和推拿作为传统的中医疗法，在治疗脑卒中后遗症方面取得了显著效果。本文将介绍针灸和推拿对脑卒中后遗症的治疗作用、优势和注意事项。

关键词：

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大直径高精度后插法逆作柱施工垂直度控制

工程质量 2024年第1期42卷 81-85,93页

作者：王丙辉北京城建集团有限责任公司北京100088

对于采用盖挖逆作法施工的结构,其临时竖向支撑体系是逆作施工的关键结构,一般为一桩一柱形式,施工方法有先插法和后插法两种,北京城市副中心站综合交通枢纽工程02标段逆作柱采用后插法施工,该建筑B3层为国铁轨行层,对逆作桩柱的施工精... 详细信息

对于采用盖挖逆作法施工的结构,其临时竖向支撑体系是逆作施工的关键结构,一般为一桩一柱形式,施工方法有先插法和后插法两种,北京城市副中心站综合交通枢纽工程02标段逆作柱采用后插法施工,该建筑B3层为国铁轨行层,对逆作桩柱的施工精度要求非常高,通过对后插法逆作桩柱施工工序分析,可分为两个施工阶段,分别为逆作桩施工阶段和逆作柱植入施工阶段。分析逆作桩柱施工的两个阶段,研究在深厚砂层地质条件下,对后插法逆作桩柱的关键工序:逆作桩成孔、逆作柱加工精度、逆作柱植入施工等,分别制定相应的控制措施,确保逆作桩柱达到设计精度。

关键词：灌注桩钢管柱后插法竖向支撑过程控制