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基于多重影响力的公共交通网络中地铁车站脆弱性评价

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安全与环境学报 2022年第6期22卷 3003-3013页

作者：段晓红周翰霖熊怡莲北方工业大学经济管理学院北京100144 北方工业大学信息学院北京100144

为全面衡量地铁车站的脆弱性水平,构建了兼顾自身脆弱性和所受影响的综合脆弱性评价模型。首先,从暴露性、敏感性和适应性3个特征要素出发,辨识客流扰动下地铁车站脆弱性的影响因素,并构建自身脆弱性评价模型;然后,引入多重影响力模型... 详细信息

为全面衡量地铁车站的脆弱性水平,构建了兼顾自身脆弱性和所受影响的综合脆弱性评价模型。首先,从暴露性、敏感性和适应性3个特征要素出发,辨识客流扰动下地铁车站脆弱性的影响因素,并构建自身脆弱性评价模型;然后,引入多重影响力模型分析公共交通网络中节点脆弱性之间的影响关系,构建综合脆弱性评价模型;最后,利用该模型分析北京市典型车站的脆弱性。结果表明,西直门、东直门、国贸和西二旗站的自身脆弱度为0.3097、0.6845、0.3319和0.7090,而综合脆弱度为0.0951、0.1541、0.3407和0.0730。具有最高自身脆弱度和综合脆弱度的车站分别为西二旗站和国贸站。综合评价模型的计算结果兼顾了网络中其他车站对待评估车站的影响,较自身评价模型更具合理性。该模型不仅能够识别自身抵御能力较为薄弱的站点,还能把握脆弱性在网络中的传递和演变路径,为制定客流引导和控制方案提供了依据。

关键词：安全工程公共交通系统地铁车站脆弱性多重影响力模型评价

基于生物信息学方法的FOX基因家族对比分析

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基因组学与应用生物学 2015年第9期34卷 1818-1825页

作者：常凯熊怡淞曲远青吴艾霖陈清红吴丽娟中国人民解放军成都军区总医院实验医学中心高湿医学全军重点实验室成都610083

以FOXA、FOXO和FOXP为核心,利用生物信息学方法对比分析FOX家族成员的分子特征、启动子、蛋白理化性质、蛋白结构、亚细胞定位,构建分析蛋白三维模型并绘制家族系统进化树。结果表明:FOX家族的核酸序列相似性较低,FOXP和FOXN序列内含较... 详细信息

以FOXA、FOXO和FOXP为核心,利用生物信息学方法对比分析FOX家族成员的分子特征、启动子、蛋白理化性质、蛋白结构、亚细胞定位,构建分析蛋白三维模型并绘制家族系统进化树。结果表明:FOX家族的核酸序列相似性较低,FOXP和FOXN序列内含较多内含子,但仍具有溯源性。蛋白的脂肪族氨基酸指数介于49.71到76.11之间,分子量介于29 084到79 586.1之间,较为离散。GRAVY值介于-0.764到-0.179之间,蛋白均表现为亲水性。p I值在亚家族间非常稳定,可作为蛋白分类的辅助指标。对比统计FOX蛋白高级结构各亚家族的保守结构域和功能位点,可见功能域的差异导致了其调节途径的多样。分析结果可为FOX蛋白的研究提供有价值信息,为进一步研究FOX在人体内的疾病发生途径与作用机理提供依据。

关键词：叉头框基因家族生物信息学对比分析分子特征蛋白特征

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冠心病患者血浆相关细胞因子检测及临床意义

国际检验医学杂志 2013年第5期34卷 536-538页

作者：吴艾霖熊怡淞中国人民解放军成都军区总医院检验科四川成都610083

目的检测冠心病(CAD)患者外周血促炎性和抗炎性细胞因子表达水平,并探讨其临床意义。方法收集急性冠状动脉综合征(ACS)患者52例,稳定型心绞痛(SA)患者48例,健康对照(NC)56例,ELISA法检测血浆IL-2、IL-10、IL-12、IFN-γ和IL-17A表达;同... 详细信息

目的检测冠心病(CAD)患者外周血促炎性和抗炎性细胞因子表达水平,并探讨其临床意义。方法收集急性冠状动脉综合征(ACS)患者52例,稳定型心绞痛(SA)患者48例,健康对照(NC)56例,ELISA法检测血浆IL-2、IL-10、IL-12、IFN-γ和IL-17A表达;同时常规测定患者血脂水平,按血脂正常与否将冠心病患者分为血脂正常组和血脂异常组。结果 ACS、SA和NC三组患者血浆IL-12及IFN-γ水平较低,接近或低于试剂盒检测线性范围。ACS和SA组IL-2水平显著高于NC组,差异具有统计学意义。ACS组IL-10和IL-17A表达均显著高于SA组和对照组,而SA组与对照组之间无差异。冠心病血脂正常组和血脂异常组IL-2、IL-10和IL-17A均高于NC组,而冠心病两组之间差异无统计学意义。结论冠心病特别是ACS患者血浆促炎性细胞因子表达增高,负反馈增加抗炎性细胞因子表达,而血脂正常与否与上述细胞因子表达无明显关系。

关键词：冠状动脉疾病细胞因子类炎症酶联免疫吸附测定

热休克蛋白70基因rs1008438多态性与高原肺水肿的相关性

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重庆医学 2015年第5期44卷 593-596页

作者：吴艾霖熊怡淞王艳艳曲远青吴丽娟第三军医大学研究生管理大队重庆400038 成都军区总医院临床实验医学研究与保障中心成都610083

目的探讨热休克蛋白(HSP)70基因启动子区rs1008438位点单核苷酸多态性(SNP)与高原肺水肿(HAPE)之间的关系。方法采用PCR-DNA直接测序法检测100例HAPE组、200例健康对照组个体基因组rs1008438位点的基因分布,分析不同基因型与HAPE的关系... 详细信息

目的探讨热休克蛋白(HSP)70基因启动子区rs1008438位点单核苷酸多态性(SNP)与高原肺水肿(HAPE)之间的关系。方法采用PCR-DNA直接测序法检测100例HAPE组、200例健康对照组个体基因组rs1008438位点的基因分布,分析不同基因型与HAPE的关系;运用ELISA法检测不同基因型HAPE组和健康对照组白细胞细胞质和细胞核HSP70蛋白含量变化;应用蛋白质芯片技术和EVIDENCE180全自动芯片仪分析TNF-α、IL-1β、IL-6表达水平。结果HAPE组,健康对照组rs1008438的TT、GT、GG的基因型频率分别是76.0%、20.0%、4.0%,93.0%、6.5%、0.5%。统计处理显示,HAPE组TT基因型频率明显低于健康对照组(P<0.05);GT、GG基因型患HAPE的危险性是TT基因型的4.195倍,G等位基因相对T等位基因也能明显增加HAPE的发病风险(OR=4.178);ELISA检测结果显示,不同基因型HAPE组HSP70含量均高于健康对照组,且HSP70细胞核/细胞质比值TT基因型高于GT/GG基因型;蛋白质芯片检测表明,HAPE组血清中的TNF-α、IL-1β、IL-6表达水平均明显高于健康对照组。结论 rs1008438位点多态性与HAPE易感性相关,这种相关性可能是由于突变型在基因转录水平通过影响启动子活性而增强HSP70表达,从而导致HAPE的发生。

关键词：多态性,单核苷酸高原肺水肿 rs1008438 热休克蛋白70 启动子

定量RT-PCR测定冠心病患者外周血Siglec-1(CD169)的基因表达水平

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第二军医大学学报 2008年第11期29卷 1307-1310页

作者：熊怡淞王皓吴炜霖周运恒梁艳杨再兴荣光华仲人前第二军医大学长征医院实验诊断科全军医学免疫诊断中心全军临床免疫重点实验室上海200003

目的:建立检测人Siglec-1(sialic acid-binding immunoglobulin-like lectins,唾液酸结合的免疫球蛋白样凝集素1,CD169)mRNA含量的实时荧光定量RT-PCR的方法,并用来测定冠心病患者外周血单个核细胞(PBMCs)中Siglec-1的基因表达水平,探讨Siglec-1基因表达水平与冠状动脉粥样硬化发生发展的关系。方法:基于SYBR Green荧光标记技术,建立实时荧光相对定量RT-PCR方法,在ABI PRISM 7000荧光定量PCR仪上测定了57例冠状动脉粥样硬化性心脏病患者和38例健康对照者外周血中Siglec-1 mRNA的含量。生化常规测定所有入选者血脂水平。结果:冠心病组Siglec-1 mR-NA的平均拷贝数显著高于健康对照组,为健康对照组的3.23(1.28～8.11)倍(P<0.01);其中急性心肌梗死组(AMI)、稳定型心绞痛组(SA)和不稳定型心绞痛组(UA)分别为对照组的3.32(1.38～7.97)、2.56(0.88～7.42)、3.35(1.25～8.96)倍,而三组之间差异无统计学意义;冠心病血脂正常组和血脂异常组的Siglec-1 mRNA平均拷贝数无显著差异。结论:成功建立了人Siglec-1基因表达含量的实时荧光定量RT-PCR检测方法;冠心病患者Siglec-1 mRNA的含量显著高于健康对照组,且其含量高低与血脂无关;Siglec-1mRNA含量在冠心病患者外周血单核细胞上表达显著升高,说明冠心病患者外周血单核细胞已经发生巨噬细胞化,单核巨噬细胞介导的免疫炎症反应在冠心病发生发展过程中起重要作用。

关键词：冠状动脉硬化 Siglec-1 逆转录聚合酶链反应

类风湿关节炎患者外周血单个核细胞唾液酸结合免疫球蛋白样凝集素-1的表达及与疾病活动度的关系

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中华风湿病学杂志 2013年第4期17卷 221-224,I0001页

作者：熊怡淞程悦吴艾霖王艳艳熊杰仲人前成都军区总医院检验科 610083 成都军区总医院肾内科 610083 第二军医大学附属长征医院实验诊断科

目的观察唾液酸结合免疫球蛋白样凝集素-1（Siglec-1）在类风湿关节炎（RA）患者外周血单个核细胞（PBMCs）上的表达水平，并探讨其与RA疾病活动度的关系。方法分别采用流式细胞术及实时荧光定量反转录聚合酶链反应（RT-PCR）检测42例R... 详细信息

目的观察唾液酸结合免疫球蛋白样凝集素-1（Siglec-1）在类风湿关节炎（RA）患者外周血单个核细胞（PBMCs）上的表达水平，并探讨其与RA疾病活动度的关系。方法分别采用流式细胞术及实时荧光定量反转录聚合酶链反应（RT-PCR）检测42例RA患者、28例骨关节炎患者和26名健康对照者外周血Siglec-1蛋白和mRNA表达，并将Siglec-1表达与28个关节疾病活动度评分（DAS28）以及超敏c反应蛋白（hs-CRP）作相关性分析。组间均数比较采用t检验，相关性分析采用Pearson相关分析。结果流式细胞仪检测发现，RA组Siglec-1阳性细胞占PBMCs比例为（15．2±7．6）％，明显高于骨关节炎组[（2．3±2．6）％]和健康对照组[（2．1±1．6）％，t值分别为8．615，8．661；P均〈0．01]，并且表达Siglec-1的细胞主要为单核细胞；RA组Siglec-1mRNA的相对表达量为（3．4±1．5），明显高于骨关节炎组（1．2±0.4）和健康对照组（1．0±0．4）（￡值分别为3．446，3．966；P均〈0．05）。而骨关节炎组和健康对照组之间Siglec-1蛋白和mRNA表达差异无统计学意义（P〉0．05）。此外，RA患者Siglec—1的表达与DAS28及hs-CRP均呈正相关（r值分别为0．89，0．48；P均〈0．01）。结论RA患者外周血PBMCs已经激活并高表达Siglec-1，Siglec-1可能作为无创性指标用于监测RA疾病活动度和炎症程度。

关键词：关节炎,类风湿流式细胞术膜糖蛋白类免疫球蛋白类单核细胞

类风湿关节炎患者外周血单核细胞Siglec-1的表达及与疾病活动度的关系

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类风湿关节炎患者外周血单核细胞Siglec-1的表达及与疾病活动度的...

四川地区冠心病患者CYP2C19基因多态性检测

第17次全国风湿病学学术会议

作者：熊怡淞吴艾霖王艳艳吴丽娟熊杰中国人民解放军成都军区总医院

为观察免疫球蛋白样凝集素(Siglec-1)蛋白和mRNA在类风湿关节炎(RA)患者外周血白细胞的表达情况,并探讨其与疾病活动度的相关性。分别采用流式细胞术及实时荧光定量反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测42例RA患者,

关键词：

来源： cnki会议评论

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检验医学与临床 2017年第10期14卷 1363-1365页

作者：曾敏熊怡淞俞娟常凯吴艾霖中国人民解放军成都军区总医院检验科 610083 成都医学院检验医学院 610500 南通大学附属医院检验科江苏南通226001

目的检测四川地区冠心病患者CYP2C19基因的多态性,分析基因型与性别、年龄及临床分型之间的相关性。方法采用DNA微阵列芯片法检测131例被确诊为冠心病患者的CYP2C19基因型,结合患者的性别、年龄、临床分型进行分组,探讨这些因素与CYP2C1... 详细信息

目的检测四川地区冠心病患者CYP2C19基因的多态性,分析基因型与性别、年龄及临床分型之间的相关性。方法采用DNA微阵列芯片法检测131例被确诊为冠心病患者的CYP2C19基因型,结合患者的性别、年龄、临床分型进行分组,探讨这些因素与CYP2C19基因多态性的相关性。结果 131例冠心病患者中,有5种基因型被检测到,分别为CYP2C19*1/*1(636GG,681GG)、CYP2C19*1/*2(636GG,681GA)、CYP2C19*1/*3(636GA,681GG)、CYP2C19*2/*2(636GG,681AA)、CYP2C19*2/*3(636GA,681GA)。分布频率分别为53例(40.5%)、54例(41.2%)、6例(4.6%)、13例(9.9%)、5例(3.8%),而CYP2C19*3/*3(636AA,681GG)未被检测到。不同性别冠心病患者CYP2C19的基因型、等位基因频率差异无统计学意义(P>0.05);不同性别的代谢型患者,其CYP2C19的基因型分布差异具有统计学意义(χ~2=6.527,P=0.038)。不同年龄和临床分型冠心病患者CYP2C19的基因型、等位基因频率、代谢型分布差异无统计学意义(P<0.05)。结论冠心病患者的CYP2C19基因型分布、等位基因频率分布与性别、年龄和疾病临床分型无关。

关键词： CYP2C19 冠心病基因芯片基因多态性

自身免疫性疾病噬菌体抗体库的构建和初步鉴定

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国际检验医学杂志 2009年第7期30卷 625-626,629页

作者：吴炜霖夏维陆慧琦熊怡淞杨再兴周琳韩焕兴仲人前第二军医大学长征医院实验诊断科全军医学免疫诊断中心 200003 上海市第一人民医院检验科 200080

目的构建系统性红斑狼疮（SLE）、类风湿性关节炎（RA）、强直性脊柱炎、干燥综合症（SS）、原发性胆汁性肝硬化（PBC）等自身免疫性疾病的噬菌体抗体库。方法从多例确诊的高滴度自身免疫病患者外周血淋巴细胞中抽提总RNA，用RT—PCR方... 详细信息

目的构建系统性红斑狼疮（SLE）、类风湿性关节炎（RA）、强直性脊柱炎、干燥综合症（SS）、原发性胆汁性肝硬化（PBC）等自身免疫性疾病的噬菌体抗体库。方法从多例确诊的高滴度自身免疫病患者外周血淋巴细胞中抽提总RNA，用RT—PCR方法分别扩增免疫球蛋白分子轻链κ、λ基因及重链Fd基因。经SacI和XbaI限制性双酶切后，在T4连接酶的作用下，将轻链基因片段克隆入同样双酶切的pComb3Hss载体中以构建轻链文库，随后将重链Fd段PCR产物经XhoI和SpeI双酶切后载入同样处理的κ/λpComb3Hss载体，然后将重组质粒κ/λ—Fd-pComb3Hss转化大肠杆菌XL1-Blue。用辅助噬菌体M13K07感染XL1-Blue，则可在噬菌体表面表达出随机的重组抗体库。结果提取的淋巴细胞总RNA及合成的cDNA质量好，PCR扩增了长度为660bp的轻链κ、λ基因及重链Fd基因，成功构建了库容为4×10^4的轻链抗体库和库容为6×10^4的Fab片段噬菌体抗体库，酶切及PCR鉴定均正确无误。结论成功构建了自身免疫性疾病的噬菌体抗体库，为进-步筛选出高亲和力抗体打下了基础。

关键词：自身免疫疾病细菌噬菌体抗体