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基于深度学习的非编码RNA识别方法研究

基于深度学习的非编码RNA识别方法研究

作者：熊思琪西安理工大学

学位级别：硕士

高通量转录组测序技术有望发现新的蛋白质编码和非编码转录本序列,特别是从头测序技术获得的数据中识别长链非编码RNA(lncRNA)。lncRNA是一种长度大于200nt且不具备任何编码蛋白质能力的RNA序列。lncRNA在许多阶段发挥着重要的生物学功... 详细信息

高通量转录组测序技术有望发现新的蛋白质编码和非编码转录本序列,特别是从头测序技术获得的数据中识别长链非编码RNA(lncRNA)。lncRNA是一种长度大于200nt且不具备任何编码蛋白质能力的RNA序列。lncRNA在许多阶段发挥着重要的生物学功能,例如转录和生命过程的调控。从海量的基因组测序数据中准确地识别出lncRNA,能够为日后探索其内部结构、功能预测打下基础。动植物lncRNA由于其样本数量少、基因组注释差以及结构复杂,导致识别较为困难。本文基于深度学习算法,分别从动物和植物的RNA中识别出lncRNA。本文的主要研究内容和创新点包括以下三个部分:(1)提出了基于注意力机制的lncRNA识别方法。该方法基于软注意力机制和多层感知机,整合RNA序列的内在特征k-mer使用频率和ORF长度,构建“Lnc-Attention”分类模型识别人类的lncRNA,在测试集上达到了 0.964的准确率,优于其他传统的基于机器学习分类算法和基于深度学习的分类算法,具有较高的识别准确率。(2)基于卷积神经网络提出了一种有效识别lncRNA的方法,取名为“Coding-Net”分类方法。该方法提取RNA序列特征,直接输入到模型中进行训练,使用1×3非对称卷积核提取特征信息,提高了预测准确率,在人类数据集上达到了 0.993准确率,优于传统的基于机器学习和现有的基于深度学习的lncRNA识别方法。此外,Coding-Net方法在跨物种预测上有较好的普适性,在五个物种上准确率均大于0.9。最后,该方法特别适用于灵长类动物,在该类动物上预测准确率均大于0.94。(3)基于Coding-Net分类方法提出了一种名为“PlantCoding-Net”模型预测植物的lncRNA。该方法选用基因注释丰富的模式植物拟南芥作为训练数据集,采用基于深度学习的PlantCoding-Net分类方法识别植物lncRNA。该模型在测试集上达到了 0.957的准确率,相比CPC2,PLEK和LncRNAdeep方法识别准确率分别提高4.1、20和3.6个百分点。本文提出的基于深度学习的Lnc-Attention分类方法和Coding-Net分类方法均能有效地识别动物的lncRNA,为进一步研究人类lncRNA功能奠定了基础。提出的PlantCoding-Net分类方法可以准确地识别植物的lncRNA,以便更好地理解植物基因组的功能和结构,从而为植物基因组的研究提供更深入的认识。本文提出的两种方法各有优势,Lnc-Attention分类方法适用于预测数据量较多的情况;由于Coding-Net方法模型网络结构更为复杂,训练时参数更多,预测所需时间和内存更多,适用于预测数据量较少的情况。

关键词： lncRNA识别 k-mers 开放阅读框深度学习卷积神经网络注意力机制多层感

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《东方杂志》近代化学科学知识报道研究

《东方杂志》近代化学科学知识报道研究

作者：熊思琪河北大学

学位级别：硕士

诞生于1904年的《东方杂志》是近代出版史上出版时间最长、规模最大、最有影响力的刊物,被誉为“杂志界的重镇”。它出版发行长达45年,有过四次迁址、三次停刊的曲折经历,也见证了诸如辛亥革命、五四运动、“新文化“运动、抗日战争、... 详细信息

诞生于1904年的《东方杂志》是近代出版史上出版时间最长、规模最大、最有影响力的刊物,被誉为“杂志界的重镇”。它出版发行长达45年,有过四次迁址、三次停刊的曲折经历,也见证了诸如辛亥革命、五四运动、“新文化“运动、抗日战争、解放战争等重要的历史事件,它的办刊思想也随着时代变化而不断发生转变,从创刊时期“启导国民,联络东亚”到“顺应世界之潮流”“舆论的顾问者”,到“求中国智识者的新生”“为文化而奋斗,为国难而牺牲”,再到“以阐明学术为主旨”“发扬文化传播学术”。《东方杂志》刊载内容包罗万象,极具专业性与学术性,是重要的历史文献资料,堪称“中国近现代史的资料库”,其中有关近代自然科学的报道丰富全面,涉及了物理、化学、生物、天文等各个领域。本文对《东方杂志》近代化学科学报道做专门研究,通过对杂志文本的整理与分析,根据《东方杂志》发行期间的时代背景、重大历史事件和杂志主编的办刊风格以及自然科学文章发表特点进行了近代化学报道分期,划分为初创期（1904-1911）、发展期（1912-1919）、成熟期（1920-1931）、曲折期（1932-1941）和衰退期（1943-1948）,并对不同时期的《东方杂志》办刊风格、内容以及化学报道的特征进行分析。除此之外,还对《东方杂志》的栏目设置、近代化学图书广告和商品广告、“东方画报”图片和近代化学文章中出现的图片进行了分析研究。《东方杂志》的近代化学报道内容丰富覆盖范围广,注重科学性与时效性,不仅刊登了许多近代化学的理论知识,还介绍了许多西方最新的化学技术,这些化学技术和发明成果可以应用于社会的方方面面,非常具有实用性。《东方杂志》近代化学科学报道真实地记录了我国近代化学的发展,推动了近代化学在中国的传播,对启蒙民众的化学思想、和我国其他行业的发展进步有着重大贡献,并且对现代教育也有一定的启示作用。

关键词：《东方杂志》自然科学近代化学科学传播

粉末尺寸对等离子喷涂Li_(1.3)Al_(0.3)Ti_(1.7)(PO_(4))_(3)电解质成分与结构的影响

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储能科学与技术 2024年第10期13卷 3307-3318页

作者：熊思琪卜晓晨雒晓涛李长久西安交通大学材料科学与工程学院金属材料强度国家重点实验室陕西西安710049

全固态锂离子电池(ASSLiBs)由于其能量密度高、安全性好、长期稳定性优越等特点,被广泛研究应用于替代液态电解质锂电池,而发展致密高性能固态电解质的低成本大规模制备技术是推动ASSLiBs商业应用的关键。NASICON型Li_(1.3)Al_(0.3)Ti_(... 详细信息

全固态锂离子电池(ASSLiBs)由于其能量密度高、安全性好、长期稳定性优越等特点,被广泛研究应用于替代液态电解质锂电池,而发展致密高性能固态电解质的低成本大规模制备技术是推动ASSLiBs商业应用的关键。NASICON型Li_(1.3)Al_(0.3)Ti_(1.7)(PO_(4))_(3)(LATP)固态电解质因其离子电导率高、化学稳定性优越,有望应用于ASSLiBs制造。本研究采用具有低成本制造特征的大气等离子喷涂技术制备了LATP单个粒子和涂层,系统研究了喷涂参数和粉末粒径对涂层中的P元素含量和涂层的组织结构的影响,探讨了喷涂过程中P元素蒸发损失存在的尺寸效应。结果表明电弧功率对可完全熔化的LATP粒子的临界直径具有显著影响,能够完全熔化的最大粉末粒径随电弧功率的增加而增大,在42 kW下,50μm以下的粉末可以完全熔化;在完全熔化条件下,当粉末粒径小于25μm时,P的损失量随着粉末粒径的增大而减少;当粒径大于25μm时,P的蒸发损失达到最小且随粉末粒径变化较小;电弧功率对P的蒸发影响显著,当电弧功率从34 kW增加至42 kW时,P的损失量从5%增加至10%。采用粒径范围30~50μm的LATP粉末,通过喷涂参数适配,可以制备具有良好层间结合,相结构稳定的适合于ASSLiBs的致密LATP电解质。

关键词：全固态锂离子电池等离子喷涂 LATP 元素优先蒸发尺寸效应

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我国政府会计信息披露问题研究

企业科技与发展 2020年第1期 24-25页

作者：熊思琪武汉大学政治与公共管理学院

政府会计信息披露随着社会政治和经济的发展,日益受到重视。通过会计信息披露反映在社会公众中,政府工作信息变得更加透明和重要,为阳光政府建设提供了一条安全、有效的途径。文章分析了当前政府会计信息披露制度的现状和存在的问题,结... 详细信息

政府会计信息披露随着社会政治和经济的发展,日益受到重视。通过会计信息披露反映在社会公众中,政府工作信息变得更加透明和重要,为阳光政府建设提供了一条安全、有效的途径。文章分析了当前政府会计信息披露制度的现状和存在的问题,结合当前的背景,提出了解决这些问题的措施。在当前的经济学领域中,相关研究尚不成熟,许多制度和管理体制仍然制约着政府会计披露的发展。因此,它具有非有重要的现实意义,可以用来分析政府会计信息披露的现状和存在的问题。

关键词：政府会计信息披露问题对策

2%利多卡因雾化吸入对ICU机械通气患者行纤维支气管镜检查效果的影响

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齐鲁护理杂志 2017年第4期23卷 124-124,F0003页

作者：熊琴熊思琪南昌大学第一附属医院江西南昌330006

目的:探讨利多卡因雾化吸入麻醉对ICU机械通气患者行纤维支气管镜检查效果的影响。方法:将80例ICU行纤维支气管镜检查的机械通气患者随机分为观察组和对照组各40例,对照组在纤维支气管镜气道内滴注2%盐酸利多卡因5 ml,在纤维支气管镜表... 详细信息

目的:探讨利多卡因雾化吸入麻醉对ICU机械通气患者行纤维支气管镜检查效果的影响。方法:将80例ICU行纤维支气管镜检查的机械通气患者随机分为观察组和对照组各40例,对照组在纤维支气管镜气道内滴注2%盐酸利多卡因5 ml,在纤维支气管镜表面涂抹利多卡因胶浆;观察组患者在行纤维支气管镜检查前给予2%利多卡因雾化吸入作为术前麻醉,观察患者心率、血压、血氧饱和度及呼吸频率的变化。比较两组麻醉效果、检查时间和不良反应发生情况。结果:观察组麻醉效果优于对照组(P<0.05);观察组恶心、呛咳等不良反应发生率低于对照组,一次性成功率高于对照组,操作时间短于对照组(P<0.01);观察组患者最高收缩压、心率、呼吸频率及血氧饱和度等各项生命指标平稳水平优于对照组(P<0.05)。结论:2%利多卡因雾化吸入的麻醉方式在ICU机械通气患者行纤维支气管镜检查过程中,麻醉效果好,提高了检查的安全性,患者易于接受和配合。

关键词：利多卡因雾化吸入纤维支气管镜机械通气

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岳塘经开区：用心服务项目企业送上锦旗

岳塘经开区：用心服务项目企业送上锦旗

湘潭日报

作者：马贵熊思琪

本报讯（记者马贵通讯员熊思琪）“感谢岳塘经开区，感谢你们为企业发展提供了帮助！”4月19日上午，湘潭市湘越智谷商务秘书有限公司、湖南湘越智谷园区管理服务有限公司相关负责人来到园区，将一面写着“栽下梧桐树引得凤凰来”... 详细信息

本报讯（记者马贵通讯员熊思琪）“感谢岳塘经开区，感谢你们为企业发展提供了帮助！”4月19日上午，湘潭市湘越智谷商务秘书有限公司、湖南湘越智谷园区管理服务有限公司相关负责人来到园区，将一面写着“栽下梧桐树引得凤凰来”的锦旗送到岳塘经开区党工委副书记、管委会......

关键词：经开区

来源： cnki报纸评论

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严字当头转作风干字为先强园区

严字当头转作风干字为先强园区

粉末尺寸对等离子喷涂Na_(3)Zr_(2)Si_(2)PO_(12)电解质成分和组织结构的影响

湘潭日报

作者：马贵胡宁熊思琪

在面向作风“顽疾”的“亮剑”行动中，岳塘经开区围绕中心工作和重点任务，聚焦“七不”现象、“十类”问题，坚持严字当头、干字为先，为保持园区平稳健康的经济环境、风清气正的政治环境、国泰民安的社会环境提供了坚强的作风保障。... 详细信息

在面向作风“顽疾”的“亮剑”行动中，岳塘经开区围绕中心工作和重点任务，聚焦“七不”现象、“十类”问题，坚持严字当头、干字为先，为保持园区平稳健康的经济环境、风清气正的政治环境、国泰民安的社会环境提供了坚强的作风保障。今年上半年，在市对区考核的16项主要经......

关键词：转作风经开区

来源： cnki报纸评论

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热喷涂技术 2023年第1期15卷 1-12页

作者：陈楠卜晓晨熊思琪雒晓涛李长久西安交通大学材料科学与工程学院金属材料强度国家重点实验室西安710049

全固态钠离子电池由于安全性和元素丰度等天然优势,在大规模储能领域具有巨大的应用潜力。全固态电池的核心是固态电解质,NASICON型的Na_(3)Zr_(2)Si_(2)PO_(12)(NZSP)电解质因为离子电导率高、热稳定性与力学性能优异等优点而受到广泛... 详细信息

全固态钠离子电池由于安全性和元素丰度等天然优势,在大规模储能领域具有巨大的应用潜力。全固态电池的核心是固态电解质,NASICON型的Na_(3)Zr_(2)Si_(2)PO_(12)(NZSP)电解质因为离子电导率高、热稳定性与力学性能优异等优点而受到广泛关注。本研究采用大气等离子喷涂沉积单个NZSP扁平粒子和沉积体,系统研究了粉末粒度分布和喷涂参数对NZSP粒子元素蒸发和沉积体组织结构的影响。通过沉积单个粒子,揭示了等离子喷涂参数对NZSP粉末粒子的熔化程度和Na、P元素优先蒸发的影响规律。结果表明,等离子电弧功率与氢气流量对其蒸发影响显著,元素蒸发损失量存在明显的粒子尺寸效应,粒径小于约35μm时,随粒径的减小,Na与P的蒸发损失量显著增加,当粒径增加至35μm以上时,Na与P的蒸发损失量受粒径的影响显著减小且整体损失量也有限;通过对粒径范围的控制能够将等离子喷涂过程中Na元素的损失量控制在10%以下,P元素损失量控制在20%以下。采用粒径范围30~50μm的NZSP粉末,结合大气等离子喷涂参数控制可以得到无明显层状结构的良好层间结合的组织结构致密电解质,表明大气等离子喷涂在全固态钠离子电池固态电解质的制备中具有广阔的应用前景。

关键词：等离子喷涂 NASICON电解质 Na_(3)Zr_(2)Si_(2)PO_(12) 元素优先蒸发尺寸效应

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多方法融合的社交平台辟谣效果影响因素研究

情报杂志 2025年第1期 155-163页

作者：熊思奇夏志杰上海工程技术大学管理学院

[研究目的]为提高社交平台辟谣效果，探究平台辟谣效果的核心影响因素及组态路径，以期为平台提供更为有效的辟谣策略。[研究方法]以“新浪微博”平台为研究对象，基于启发-系统模型构建影响社交平台辟谣效果的12个前因条件变量；采用5... 详细信息

[研究目的]为提高社交平台辟谣效果，探究平台辟谣效果的核心影响因素及组态路径，以期为平台提供更为有效的辟谣策略。[研究方法]以“新浪微博”平台为研究对象，基于启发-系统模型构建影响社交平台辟谣效果的12个前因条件变量；采用5种机器学习模型进行对比实验，结合SHAP可解释框架分析并提取核心变量；运用fsQCA对核心变量进行归因，得出提高辟谣效果的多重组态路径。[研究结果/结论]结果发现，来源影响力、辟谣微博的情感倾向以及是否是热门话题是社交平台有效辟谣的核心条件变量，并存在5条高效的辟谣路径及其归因模式，为社交平台辟谣领域提供了理论支持和实践基础。

关键词：社交平台网络谣言辟谣微博归因分析情感倾向热门话题可解释机器学习 fsQCA