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一种以测序为基础的基因分型方法的建立

中山大学学报（自然科学版） 2001年第5期40卷 83-87页

作者：刘泽寰林蒋海符志彦潘德京徐安龙中山大学生命科学学院广东广州510275

设计了一种自动化的基因分型方法，能够直接利用ＰＣＲ产物的ＤＮＡ测序结果作为数据，通过自动化基因分型程序（ａｕｔｏｍａｔｉｃｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇｐｒｏｇｒａｍ）与一个含有其等位基因序列的数据库进行比较，来完成高精度的... 详细信息

设计了一种自动化的基因分型方法，能够直接利用ＰＣＲ产物的ＤＮＡ测序结果作为数据，通过自动化基因分型程序（ａｕｔｏｍａｔｉｃｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇｐｒｏｇｒａｍ）与一个含有其等位基因序列的数据库进行比较，来完成高精度的基因分型工作．用这种方法对５０个随机挑选的中冈南方人的ＨＬＡ－ＤＰＢ１基因进行广基因分型，证明该方法是可行的，并从中发现了２个不明确杂合子以及一个新的等位基因序列．随后对这些样品克隆测序，发现除了２个不明确杂合子得到了进一步的区分外，其它样品都与前面的分型结果一致，显示了９６％的精确性．通过以上的研究表明，成功建立了一种高精度的、基于序列的分型（ｓｅｑｕｅｎｃｅ－ｂａｓｅｄ　ｔｙｐｉｎｇ）方法．既然该方法能成功分型ＨＬＡ－ＤＰＢ１基因，预示了该方法同样能应用于其它基因的分型．该ＡＧＰ程序可以在ｈｔｔｐ：／ｇｅｎｏｍｅ．ｚｓｕ．ｅｄｕ．ｃｎ免费下载．

关键词：基因分型序列测序 HLA-DPB1 免疫系统

HLA-DQA1、-DRB1等位基因与子宫内膜异位症和子宫腺肌病的比较性研究

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中华医学遗传学杂志 2002年第1期19卷 49-51页

作者：宗利丽潘德京陈为明何援利刘泽寰林江海徐安龙第一军医大学珠江医院妇产科广州510282 中山大学生命科学院生物化学研究室

目的　从免疫遗传学角度比较子宫内膜异位症和子宫腺肌病的异同。方法　采用顺序特异引物聚合酶链反应技术检测 5 1例子宫内膜异位症和 45例子宫腺肌病患者的 HL A- DQA1和 HL A- DRB1等位基因频率 ,并与 44名正常人比较。结果　两患者... 详细信息

目的　从免疫遗传学角度比较子宫内膜异位症和子宫腺肌病的异同。方法　采用顺序特异引物聚合酶链反应技术检测 5 1例子宫内膜异位症和 45例子宫腺肌病患者的 HL A- DQA1和 HL A- DRB1等位基因频率 ,并与 44名正常人比较。结果　两患者组 HL A- DQA1* 0 30 1等位基因频率 (8.8% ,5 .6 % )均明显低于正常对照组 ,差异有显著性 (Pc=0 .0 0 ,Pc=0 .0 0 ) ,而两患者组的 HL A- DQA1* 0 40 1等位基因频率 (7.8% ,10 .0 % )均明显高于对照组 ,差异有显著性 (Pc=0 .0 3,Pc=0 .0 1) ;两患者组之间 HL A-DQA1、- DRB1各等位基因频率比较 ,差异无显著性。结论　子宫内膜异位症及子宫腺肌病均与 HL A-DQA1* 0 30 1、* 0 40 1相关联 ,从 HL A- DQA1、- DRB1角度分析 ,子宫内膜异位症与子宫腺肌病的发病机理可能有共同之处。

关键词：子宫内膜异位症子宫腺肌症遗传易感性人类白细胞抗原-DQA1基因分型人类白细胞抗原-DRB1基因分型顺序特异引物聚合酶链反应

中国南方妇女子宫内膜异位症与HLA-DRB1相关性的研究

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中华医学遗传学杂志 2001年第4期18卷 329-330页

作者：宗利丽何援利刘泽寰林蒋海潘德京徐安龙第一军医大学珠江医院广州510282 中山大学生命科学院

目的　探讨子宫内膜异位症与 HL A- DRB1等位基因相关性。方法　用聚合酶链反应 -序列特异性引物 (PCR- SSP)技术对 5 1例经腹腔镜或外科手术证实的子宫内膜异位症患者和 44名健康育龄妇女 ,进行 HL A- DRB1等位基因的基因分型。结果　... 详细信息

目的　探讨子宫内膜异位症与 HL A- DRB1等位基因相关性。方法　用聚合酶链反应 -序列特异性引物 (PCR- SSP)技术对 5 1例经腹腔镜或外科手术证实的子宫内膜异位症患者和 44名健康育龄妇女 ,进行 HL A- DRB1等位基因的基因分型。结果　两组人群 HL A- DRB1等位基因频率的差异无显著性。结论　子宫内膜异位症与 HL A-

关键词：子宫内膜异位症遗传易感性人类白细胞抗原基因分型聚合酶链反应-序列特异性引物

校正变换矩阵法及其在多组分直接同时测定中的应用

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分析测试学报 1997年第3期16卷 45-48页

作者：司圣柱潘忠孝孙少颖张懋森潘德京中国科技大学应用化学系中山大学生物化学系

将目标变换因子分析中自由浮动技术引入多元校准中，提出了一种新的多组分同时校准法———校正变换矩阵法。该法用于四组分氨基酸人工混合样品分析，结果令人满意，通过与传统目标变换因子分析法比较研究，表明该法用于组分光谱严重共... 详细信息

将目标变换因子分析中自由浮动技术引入多元校准中，提出了一种新的多组分同时校准法———校正变换矩阵法。该法用于四组分氨基酸人工混合样品分析，结果令人满意，通过与传统目标变换因子分析法比较研究，表明该法用于组分光谱严重共线的波长范围时，其校准能力大大优于传统目标变换法。

关键词：多元校准氨基酸光度法 TTFA 多组分体系

用PCR-SSO方法研究云南西部彝族HLA-DQB1基因的多态性

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Acta Genetica Sinica 2001年第2期28卷 107-114页

作者：陈为民黄洪莲刘泽寰陶洪潘德京林蒋海徐安龙中山大学生命科学学院广州510275 云南省卫生防疫站昆明650000

应用PCR朣SO基因分型技术，对我国云南西部地区3代内无血缘关系的76个彝族健康个体进行了HLA-DQB1位点的基因分型。结果显示，在DQB1的38个等位基因中，观察到13个等位基因。云南西部彝族表现为DQB1*0301（36.18%～36.84%）最常见。其... 详细信息

应用PCR朣SO基因分型技术，对我国云南西部地区3代内无血缘关系的76个彝族健康个体进行了HLA-DQB1位点的基因分型。结果显示，在DQB1的38个等位基因中，观察到13个等位基因。云南西部彝族表现为DQB1*0301（36.18%～36.84%）最常见。其他频率大于5%的等位基因还有DQB1*0502（10.53%～11.18%）、DQB1*0401（9.21%）、DQB1*0302（8.55%～9.21%）、DQB1*0601（7.89%）、DQB1*05031（6.58%）、DQB1*03032（5.92%～6.58%）。和其他13个华人群体DQB1等位基因的频率比较分析表明，总体上，云南西部彝族和其他各华人群体间都存在很大的差异。显示其HLA等位基因频率分布的民族独特性。

关键词：彝族 PCR-SSO LA-DQB1 云南 HLA基因多态性

广州地区汉族人乙型肝炎病毒感染与HLA-DPB1基因的相关性研究

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中国病理生理杂志 2002年第8期18卷 907-909页

作者：刘泽寰范新兰林蒋海符志彦潘德京付永贵贾宗剑徐安龙中山大学生命科学学院生物化学系广东广州510275

目的 :探讨人类白细胞抗原 (HLA)的DPB1基因与广州地区汉族人乙型肝炎病毒 (HBV)感染的相关性。方法 :采用测序分型技术 (SBT)对广州地区汉族人中 58例乙型肝炎患者和 75例正常个体的HLA -DPB1基因位点进行了基因分型。结果 :两者的HLA ... 详细信息

目的 :探讨人类白细胞抗原 (HLA)的DPB1基因与广州地区汉族人乙型肝炎病毒 (HBV)感染的相关性。方法 :采用测序分型技术 (SBT)对广州地区汉族人中 58例乙型肝炎患者和 75例正常个体的HLA -DPB1基因位点进行了基因分型。结果 :两者的HLA -DPB1等位基因表现型频率差异均无显著性。结论 :本研究检验的广州地区部分汉族人的HBV感染与HLA

关键词：广州市汉族乙型肝炎病毒感染乙型肝炎病毒 HLA抗原人类白细胞抗原 DPB1基因

云南纳西族HLA-DRB1基因多态性研究及其族源分析

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Acta Genetica Sinica 2001年第12期28卷 1107-1115页

作者：贾宗剑潘德京付永贵陈为民刘泽寰林蒋海朱玉芳陈荣祥符志彦周大鸣徐安龙中山大学生命科学学院生物医药中心广州510275 云南省丽江地区人民医院检验科丽江县674100 云南省澜沧县第一人民医院检验科澜沧县665600 中山大学人类学系广州510275

首次在国内采用本室改进的高分辨率的基于内含子的PCR -SBT分型方法 ,检测云南纳西族HLA -DRB1基因多态性。在 60例纳西族个体中共检出 37种HLA -DRB1等位基因 ,其显著特点是等位基因的类型检出较多 ,频率分布比较平均 ,除 1 2 0 2 1 ( ... 详细信息

首次在国内采用本室改进的高分辨率的基于内含子的PCR -SBT分型方法 ,检测云南纳西族HLA -DRB1基因多态性。在 60例纳西族个体中共检出 37种HLA -DRB1等位基因 ,其显著特点是等位基因的类型检出较多 ,频率分布比较平均 ,除 1 2 0 2 1 ( 1 7 5 0 % )外其他的等位基因频率均低于 8% ,其他较常见的等位基因 ( >5 % )还有 1 40 4 ( 7 5 0 % ) ,1 5 0 4 ( 5 83% ) ,0 4 0 5 1 ( 5 83% ) ,0 80 32 ( 5 83% ) ,0 90 1 2 ( 5 % ) ,0 30 1 1 ( 5 % )。这几种中频等位基因共占可检出等位基因的 35 % ,与 1 2 0 2 1一起共占 5 2 49%。其中DRB1 0 30 5、0 4 38、1 1 2 3、1 1 32、1 31 0、0 81 2为首次在我国人群中检出 ,并且在世界各地人群中也比较罕见。对纳西族和世界各地人群的HLA -DRB1频率进行了聚类分析。比较分析的结果显示纳西族明显属于中国南方族群 ,未显示出其族源来自北方的痕迹。根据遗传数据 ,并参照民族学、历史学研究。

关键词：云南纳西族 PCR-SBT 分型 HLA-DRBI 基因多态性起源

云南西部彝族HLA-DQA1基因构成及中华民族19个华人群体DQA1基因频率的比较分析

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中国免疫学杂志 2001年第1期17卷 20-23页

作者：潘德京黄洪莲刘泽寰陈为民林蒋海陶洪陈荣祥吴文言徐安龙中山大学生命科学学院广州510275 云南省卫生防疫站寄防科昆明650032 云南澜沧县第一人民医院检验科澜沧665600 广州中山大学生命科学学院生化系广州510275

目的 :探讨云南漾濞彝族族群HLA DQA1频率分布特征 ,并与华人 19个群体比较。方法 :采用限制性片段长度多态性分析 (PCR RFLP)方法。结果 :DQA1 0 30 1(31 6 3 % )最高 , 0 40 1(1 0 2 % )最低。卡方总体检验表明 ,该族群与北方六个汉... 详细信息

目的 :探讨云南漾濞彝族族群HLA DQA1频率分布特征 ,并与华人 19个群体比较。方法 :采用限制性片段长度多态性分析 (PCR RFLP)方法。结果 :DQA1 0 30 1(31 6 3 % )最高 , 0 40 1(1 0 2 % )最低。卡方总体检验表明 ,该族群与北方六个汉人群体、满族、新加坡群体及新疆维吾尔族无显著差异 (P >0 0 5 ) ,但有个别基因频率的显著差异 ;布依族、傣族、台湾群体组成复杂 ,与其他群体有很大显著差异 (P >0 0 0 1) ;广东汉人与广西壮族与其他群体也有极其显著的差异 ;哈萨克族与维吾尔族相似 ;维吾尔族与部分北方汉族并无显著差异 ;藏族与哈萨克族、新加坡群体无显著差异。结论 :南方各族群DQA1的复杂构成 ,可能与起源的多样性或地域环境有关。漾濞彝族族群HLA

关键词： PCR-RFLP HLA-DQA1 彝族中华民族基因多态性 D

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新型冠状病毒检测方法的研究

名医 2020年第19期 53-54页

作者：郭涛张钊杨浠潘德京彭年才朱真东南大学MEMS教育部重点实验室苏州大学剑桥-苏大基因组资源中心西安天隆科技有限公司

新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染所致肺炎(COVID-19)已发展为全球性大流行传染病疫情。为满足SARS-CoV-2病毒检测的应急需求,国内外科研机构和企业陆续开发了一系列检测方法。其中,核酸检测法以SARS-CoV-2病毒的特异性基因序列为检测靶标... 详细信息

新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染所致肺炎(COVID-19)已发展为全球性大流行传染病疫情。为满足SARS-CoV-2病毒检测的应急需求,国内外科研机构和企业陆续开发了一系列检测方法。其中,核酸检测法以SARS-CoV-2病毒的特异性基因序列为检测靶标,灵敏度高、特异性强;抗体检测法依赖于SARS-CoV-2抗原与特异性抗体的特定结合,操作简单、检测迅速;抗原检测法可直接证明样本中SARS-CoV-2病毒的存在,但研发难度大,无法立即投入使用。本文综述了目前已用于临床SARS-CoV-2病毒检测的方法,介绍了这些方法的基本原理,分别阐述了其优势与局限性,并展望未来可能应用的新方法、新技术,为SARS-CoV-2病毒检测技术的深化研究提供参考。

关键词：新型冠状病毒新型冠状病毒肺炎核酸检测抗体检测抗原检测