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2017—2019年湖南省食源性疾病沙门氏菌菌型分布及药敏分析

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实用预防医学 2024年第4期31卷 495-497页

作者：袁青湛志飞陈帅张林青刘方王岚湖南省疾病预防控制中心湖南长沙410153

目的通过对2017—2019年沙门氏菌菌型分布和耐药情况进行分析,为我省食源性沙门氏菌感染的防控提供参考依据。方法按照《国家食源性疾病监测工作手册》对2017—2019年湖南省食源性腹泻病监测点的样本进行沙门氏菌分离、鉴定、血清学分型... 详细信息

目的通过对2017—2019年沙门氏菌菌型分布和耐药情况进行分析,为我省食源性沙门氏菌感染的防控提供参考依据。方法按照《国家食源性疾病监测工作手册》对2017—2019年湖南省食源性腹泻病监测点的样本进行沙门氏菌分离、鉴定、血清学分型,对沙门氏菌采用微量肉汤稀释法进行药敏试验。结果2017—2019年共收集7549份样本,检出沙门氏菌533株,检出率为7.06%;533株沙门氏菌中经血清分型,鼠伤寒沙门氏菌最多(占63.8%),为优势血清型;药敏结果显示沙门氏菌对四环素(84.99%)和氨苄西林(80.61%)的耐药率最高,对亚胺培南(0.56%)最敏感;几种常见血清型在14种抗生素中的耐药,鼠伤寒沙门氏菌、德尔卑沙门氏菌、伦敦沙门氏菌、黄金海岸沙门氏菌均对四环素的耐药率最高,肠炎沙门氏菌对萘啶酸的耐药率最高,鼠伤寒沙门氏菌多重耐药情况严重。结论2017—2019年湖南省食源性沙门氏菌感染主要发生在夏秋季,血清型以鼠伤寒沙门氏菌为优势型别,存在多重耐药,其中鼠伤寒沙门氏菌多重耐药严重,应加强持续性多重耐药监测。

关键词：沙门氏菌血清型药敏分析

2014—2022年湖南省病人来源猪链球菌2型鉴定及毒力基因分析

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实用预防医学 2024年第4期31卷 385-389页

作者：贺子翔湛志飞杨浩夏昕陈生宝刘然覃迪湖南省疾病预防控制中心湖南长沙410153

目的了解2014—2022年湖南省人感染猪链球菌病病人分离株型别分布与毒力基因携带情况,为人感染猪链球菌病的防控提供依据。方法收集2014—2022年湖南省人感染猪链球菌病临床分离株,通过传统生化反应和聚合酶链反应(polymerase chain rea... 详细信息

目的了解2014—2022年湖南省人感染猪链球菌病病人分离株型别分布与毒力基因携带情况,为人感染猪链球菌病的防控提供依据。方法收集2014—2022年湖南省人感染猪链球菌病临床分离株,通过传统生化反应和聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)检测猪链球菌种特异性基因16S rRNA,同时用PCR对2型血清型鉴定基因(兼荚膜多糖毒力基因)cps2J和7种毒力基因进行扩增,用毛细管电泳检测扩增产物,分析病人来源猪链球菌的型别与毒力基因携带情况。结果2014—2022年湖南省38株人感染猪链球菌病临床分离株中,1株为羊链球菌,32株为猪链球菌2型,5株生化鉴定为2型的菌株经分子分型鉴定为猪链球菌其他型别。32株猪链球菌2型菌株中,46.88%的菌株携带全部8种毒力基因,40.63%的菌株携带除mrp外的7种毒力基因。携带cps2J、fbps、ef、gdh、orf2、gapdh 6种毒力基因与携带cps2J、sly、gdh、orf2、gapdh 5种毒力基因的菌株均占3.13%,6.25%的菌株携带cps2J、gdh、orf2、gapdh 4种毒力基因。mrp毒力基因阴性菌株中58.82%(10/17)引起脑膜炎和中毒性休克综合征。结论2014—2022年湖南地区猪链球菌病人来源分离株以多毒力基因2型菌株为主,其毒力机制复杂,对人危害大,需引起持续关注。16S rRNA检测与分子分型能弥补猪链球菌生化鉴定的不足。

关键词：猪链球菌聚合酶链反应毒力基因人感染猪链球菌病分子分型

1447份儿童流感样病例人腺病毒、流感病毒监测结果分析

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实用预防医学 2024年第3期31卷 257-261页

作者：黄超洋向星宇张斯钰黄一伟曾舸李文超王小磊湛志飞湖南省疾病预防控制中心湖南长沙410153 微生物分子生物学湖南省重点实验室湖南长沙410153

目的分析湖南省儿童流感样病例(influenza-like illness,ILI)人腺病毒(human adenovirus,HAdV)和流感病毒(influenza virus,IFV)的监测数据,为相关疾病的防控提供参考依据。方法收集2019年6月—2020年10月湖南省儿童医院发热门诊就诊的... 详细信息

目的分析湖南省儿童流感样病例(influenza-like illness,ILI)人腺病毒(human adenovirus,HAdV)和流感病毒(influenza virus,IFV)的监测数据,为相关疾病的防控提供参考依据。方法收集2019年6月—2020年10月湖南省儿童医院发热门诊就诊的ILI咽拭子标本,并用荧光PCR法检测HAdV、甲/乙型流感病毒(influenza A/B virus,IFV A/B)核酸。HAdV核酸阳性标本用PCR法扩增Hexon基因部分序列并测序、比对分型和构建进化树,IFV A/B核酸阳性标本用荧光RT-PCR法鉴定相应亚型/系。结果共检测儿童ILI咽拭子标本1447份,检出HAdV核酸阳性标本108份,阳性率为7.46%,进一步分型检出7种亚型共67份,包括HAdV-3型28份,HAdV-7型21份,HAdV-4型9份,HAdV-55型5份,HAdV-2型2份,HAdV-1型和HAdV-14型各1份;检出IFV A/B核酸阳性标本113份,阳性率为7.81%,其中甲型H3亚型81份,乙型Victoria(BV)亚系32份。HAdV和IFV混合感染3份。2019年ILI标本的HAdV、IFV阳性率分别为14.65%、12.44%,高于2020年(分别为2.56%和4.65%)。不同性别患儿间HAdV、IFV阳性率差异无统计学意义。HAdV或IFV阳性率在不同年龄组中差异有统计学意义。结论监测期间湖南省儿童ILI感染HAdV分属7种亚型,主要为HAdV-3型和HAdV-7型,感染IFV为甲型H3亚型和乙型BV系。HAdV和IFV普遍感染各年龄儿童,应加强HAdV和IFV监测和防控,减少相关疾病的发生。

关键词：人腺病毒流感病毒流感样病例分型

湖南省食源性环丙沙星-头孢噻肟-阿奇霉素共耐药汤卜逊沙门菌分子特征研究

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中华预防医学杂志 2022年第12期56卷 1745-1750页

作者：陆咪翟卫帅杜鹏程汪洋湛志飞陈帅贾华云白莉中国农业大学动物医学院北京100193 首都医科大学附属北京地坛医院传染病研究所北京100102 湖南省疾病预防控制中心微生物检验科长沙410028 国家食品安全风险评估中心风险评估一室北京100021

目的分析湖南省人源和水产动物源环丙沙星-头孢噻肟-阿奇霉素共耐药汤卜逊沙门菌的分子流行特征。方法对湖南省食源性疾病散发病例粪便样本和水产品样本中分离的汤卜逊沙门菌进行环丙沙星-头孢噻肟-阿奇霉素共耐药菌株的筛选与鉴定,使... 详细信息

目的分析湖南省人源和水产动物源环丙沙星-头孢噻肟-阿奇霉素共耐药汤卜逊沙门菌的分子流行特征。方法对湖南省食源性疾病散发病例粪便样本和水产品样本中分离的汤卜逊沙门菌进行环丙沙星-头孢噻肟-阿奇霉素共耐药菌株的筛选与鉴定,使用肉汤稀释法对11种抗菌药进行体外药敏试验,并利用全基因组测序技术分析菌株的耐药机制以及进化关系。结果从粪便样本和水产品样本中共分离到19株汤卜逊沙门菌,其中9株菌对环丙沙星-头孢噻肟-阿奇霉素共耐药。进一步分析发现8株菌检出IncC质粒,携带质粒介导的喹诺酮类药物耐药基因qepA-qnrS1、β-内酰胺酶耐药基因bla_(CMY-2)和大环内酯类耐药基因mph(A);1株检出IncR质粒,携带qnrB4-aac(6′)-Ib-cr、bla_(OXA-10)和mph(A)耐药基因。遗传环境分析发现qnrS1、qepA、mph(A)和bla_(CMY-2)基因可能分别通过插入序列ISKra4、IS91、IS6100和ISEcp1整合到耐药菌的基因组上。基于核心基因组生成的系统发生树表明,人源和水产动物源环丙沙星-头孢噻肟-阿奇霉素共耐药汤卜逊沙门菌属于同一进化分支,具有较近的遗传进化关系。结论湖南省人源和水产动物源样本中检出对环丙沙星-头孢噻肟-阿奇霉素共耐药汤卜逊沙门菌,提示此类多重耐药菌已在人和水产动物之间传播。

关键词：汤卜逊沙门菌食源性疾病耐药性分子流行特征

2017—2022年湖南省流感样病例病原学监测分析

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疾病监测 2023年

作者：黄一伟曾舸黄超洋王小磊李文超罗垲炜刘然湛志飞湖南省疾病预防控制中心

目的分析2017—2022年湖南省流感样病例病原学监测结果，为全省流行性感冒(流感)防控提供科学依据。方法每周采集来自全省23家哨点医院的流感样病例的咽拭子标本，采用实时荧光定量反转录–聚合酶链式反应法检测标本中的流感病毒型别，... 详细信息

目的分析2017—2022年湖南省流感样病例病原学监测结果，为全省流行性感冒(流感)防控提供科学依据。方法每周采集来自全省23家哨点医院的流感样病例的咽拭子标本，采用实时荧光定量反转录–聚合酶链式反应法检测标本中的流感病毒型别，检测结果可疑的标本采用细胞分离培养法分离病毒，对不同年份、性别、年龄组病例的流感病毒阳性率差异使用χ2检验分析。结果2017—2022年共检测流感样病例标本162773份，流感病毒阳性20885份，阳性率为12.83%。检出的流感病毒的主要型别有4种：H1N1亚型、H3N2亚型、Victoria系和Yamagata系，其构成比分别为19.42%、33.77%、37.14%和9.50%。6年中，流感病毒阳性率最低与最高的年份分别为2020年(3.76%)和2019年(21.50%)。流行高峰主要出现在冬季，偶有夏季和春季高峰。男、女性病例标本流感病毒阳性率分别为12.81%和12.85%。不同年龄组中，5～15岁组阳性率最高(21.69%)，≥60岁组最低(5.83%)。不同市(州)检测阳性率在6.86%～17.47%之间。结论湖南省2017—2022年流感流行呈现季节性特征，各年流行的优势毒株不同，需要加强流感监测，科学研判流行趋势。

关键词：流行性感冒哨点监测病原学

2008-2021年湖南省健康人群脑膜炎奈瑟菌携带率和药物敏感性监测

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中国疫苗和免疫 2023年第3期29卷 326-331页

作者：刘然方明礼夏昕贺子翔戴德芳覃迪湛志飞湖南省疾病预防控制中心微生物分子生物学湖南省重点实验室湖南长沙410000

目的分析湖南省健康人群脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)携带率和药物敏感性。方法2008-2021年在湖南省3个区县按年龄分层选择健康人群,采集咽拭子标本,进行Nm分离培养和药物敏感性试验,分析Nm携带率和耐药率。结果2008-2021... 详细信息

目的分析湖南省健康人群脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)携带率和药物敏感性。方法2008-2021年在湖南省3个区县按年龄分层选择健康人群,采集咽拭子标本,进行Nm分离培养和药物敏感性试验,分析Nm携带率和耐药率。结果2008-2021年湖南省健康人群Nm总携带率为2.23%(175/7841);其中0-2岁、3-4岁、5-6岁、7-14岁、15-19岁、≥20岁分别为0.00%、0.45%、0.28%、4.04%、7.02%、1.44%;A群、B群、C群、X群、Y群、W135群、不可分群Nm分别为0.00%(0株)、1.65%(129株)、0.09%(7株)、0.00%(0株)、0.03%(2株)、0.03%(2株)、0.45%(35株)。143株Nm菌株对青霉素、氨苄西林、头孢噻肟、左氧氟沙星、环丙沙星、米诺环素、复方新诺明的总耐药率分别为1.4%、0.0%、0.0%、29.4%、25.9%、0.0%、86.0%。结论湖南省健康人群Nm携带率以青少年较高,B群和不可分群为优势Nm血清群。建议优化脑膜炎球菌疫苗免疫程序,加强B群Nm疫苗研制和合理使用抗生素。

关键词：脑膜炎奈瑟菌血清群携带率药物敏感性

2018—2021年长沙市诺如病毒暴发疫情流行特征分析

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中国人兽共患病学报 2023年第6期39卷 570-574,609页

作者：姚栋周帅锋欧新华湛志飞陈静芳黄政徐明忠长沙市疾病预防控制中心长沙410008 湖南省疾病预防控制中心长沙410005

目的了解2018年1月至2021年3月长沙市诺如病毒(Norovirus,NoV)暴发疫情的流行病学和进化特征。方法采集2018年1月至2021年3月急性胃肠炎暴发疫情临床病例标本463份,采用实时荧光RT-PCR法进行诺如病毒GI和GII基因群的鉴定;对阳性标本采... 详细信息

目的了解2018年1月至2021年3月长沙市诺如病毒(Norovirus,NoV)暴发疫情的流行病学和进化特征。方法采集2018年1月至2021年3月急性胃肠炎暴发疫情临床病例标本463份,采用实时荧光RT-PCR法进行诺如病毒GI和GII基因群的鉴定;对阳性标本采用特异引物RT-PCR扩增,所得扩增产物测序后进行进化分析。结果2018年1月至2021年3月共报告诺如病毒疫情64起,采集标本463份,NoV检出阳性率为57.67%,男性检出率为60.16%,女性检出率为54.71%;12~18岁年龄组检出率最高,达74.24%。每年冬春季(10月至次年3月)为流行高峰季节;有64.06%(41/64)的疫情发生在托幼机构。64起暴发疫情中由GII基因群NoV引起的占82.81%(53/64),由GI基因群NoV引起的占7.81%(5/64),混合基因型占9.38%(6/64)。GI基因群NoV的具体基因型别有GI.2[P2]、GI.3[P13]、GI.5[P4]、GI.6[P11];测序分型成功的GII基因群NoV具体基因型别有GII.1[P16]、GII.2[P16]、GII.3[P12]、GII.4[P31]、GII.6[P7]、GII.17[P17],以GII.2[P16]型为主。分子进化分析显示GII各型和GI.5[P4]型与同时期北京、上海等地的高度同源;其它GI基因群则主要与国外同时期流行株同源性最高。结论基于长沙市诺如病毒疫情的流行病学特征,应在高发季节对重点场所及重点人群加强监测和健康宣传,及时处置。

关键词：诺如病毒急性胃肠炎暴发基因型

湖南省2例钩端螺旋体病死亡患者流行病学调查报告

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实用预防医学 2023年第8期30卷 975-978页

作者：刘方肖明霞曾舸湛志飞湖南省疾病预防控制中心湖南长沙410000

目的对湖南省2020年报告的2例钩端螺旋体病死亡患者进行流行病学调查。方法采用荧光定量PCR检测其核酸。采用显微凝集试验法对患者的血清进行血清群型的鉴定。采取夹夜法,于2020年10月10日—14日对2例患者田间劳作点附近的周边稻田、土... 详细信息

目的对湖南省2020年报告的2例钩端螺旋体病死亡患者进行流行病学调查。方法采用荧光定量PCR检测其核酸。采用显微凝集试验法对患者的血清进行血清群型的鉴定。采取夹夜法,于2020年10月10日—14日对2例患者田间劳作点附近的周边稻田、土地等环境进行鼠类宿主动物鼠密度的监测,并进行培养。结果荧光定量PCR结果显示,2例患者钩端螺旋体核酸均为阳性。在患者房屋周边环境中,共布放鼠夹624夹,捕获野鼠16只,平均鼠密度2.56%,鼠肾、水和土壤培养均为阴性。结论2020年报告的2例死亡患者来自湖南省凤凰县,结合流行病学调查、临床症状和实验室结果,认为2例病例为钩体病确诊病例(肺出血型)。应针对性采取防控措施加强疫情监测、对重点人群开展健康教育、加强各级医疗卫生机构开展钩体病防治培训、接种钩端螺旋体疫苗,防止钩体病传播蔓延。

关键词：钩端螺旋体流行病学调查死亡病例防制

2018-2021年湖南省人源非O1/非O139群霍乱弧菌药物敏感性及基因组特征

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疾病监测 2022年第11期37卷 1413-1418页

作者：覃迪陈家良贺子翔戴志辉夏昕周海健张红逄波湛志飞湖南省疾病预防控制中心湖南长沙410005 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所北京102206

目的了解2018—2021年间湖南省从病例分离到的非O1/非O139群霍乱弧菌的药物敏感性及基因组特征。方法选取2018—2021年间湖南省腹泻病例肠道标本分离的非O1/非O139群霍乱弧菌分离株4株和非腹泻病例血液标本分离的非O1/非O139群霍乱弧菌... 详细信息

目的了解2018—2021年间湖南省从病例分离到的非O1/非O139群霍乱弧菌的药物敏感性及基因组特征。方法选取2018—2021年间湖南省腹泻病例肠道标本分离的非O1/非O139群霍乱弧菌分离株4株和非腹泻病例血液标本分离的非O1/非O139群霍乱弧菌分离株3株,进行药物敏感性测试以及基因组序列测定,分析其药物敏感性及基因组特征。结果3株血液样品分离株对氨苄西林、诺氟沙星、头孢曲松、美罗培南、米诺环素、复方磺胺甲恶唑、庆大霉素、头孢噻肟、萘啶酸、环丙沙星全部敏感,1株对四环素中介,1株对氯霉素耐药;4株粪便样品分离株对诺氟沙星、头孢曲松、美罗培南、米诺环素、复方磺胺甲恶唑、庆大霉素、头孢噻肟全部敏感,1株对四环素、氯霉素中介,1株对氯霉素耐药,2株对氨苄西林、环丙沙星、萘啶酸耐药;其中1株对氨苄西林、萘啶酸、环丙沙星二重耐药;1株对氨苄西林、萘啶酸、环丙沙星、氯霉素多重耐药。7株非O1/非O139群霍乱弧菌的基因组序列表现出明显的多样性,但是部分菌株在核心基因组和泛基因组都高度相似。基因组序列中均未检出ctxAB基因、VPI-1和VSPII基因组岛。分离自粪便的菌株携带耐药基因的数量是4~8个,分离自血液的菌株携带耐药基因的数量是1~2个。结论湖南省非O1/非O139群霍乱弧菌基因组表现出明显的多样性,菌株对多种抗菌药物耐药,需加强腹泻病例、食品及环境水体中非O1/非O139群霍乱弧菌的菌株型别变异及药物敏感性监测。

关键词：非O1/非O139群霍乱弧菌毒力基因药物敏感性基因组序列