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陆地棉保守与非保守性IncRNA的功能比较分析

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陆地棉保守与非保守性IncRNA的功能比较分析

作者：汪露瑶南京农业大学

学位级别：硕士

远缘杂交和多倍化导致的基因组震荡(genomeshock)是基因组进化的动力。基本上所有的被子植物在进化上都经历了一次或多次的多倍化事件,异源四倍体棉就是多倍化为基础造就一个重要的经济作物。棉属基因组加倍后,在形态上倾向于植株果实... 详细信息

远缘杂交和多倍化导致的基因组震荡(genomeshock)是基因组进化的动力。基本上所有的被子植物在进化上都经历了一次或多次的多倍化事件,异源四倍体棉就是多倍化为基础造就一个重要的经济作物。棉属基因组加倍后,在形态上倾向于植株果实种子变大,生物量提高。异源四倍体陆地棉(uplandcotton,Gossypium hirsutum)和海岛棉(***)因为在目标产量和适应性方面的优势被驯化并且不断改良,在世界范围内广泛种植。基因组远缘杂交和多倍化带来的优势效应的分子机理并不清楚。长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在棉属各个物种之间表现出很强的特异性,主要是由于在远缘杂交和多倍化过程中经历了表达上的重编程造成的。在杂交和多倍化过程中产生剧烈表达变异的非保守性lncRNA与保守性的lncRNA是否具有转录行为方式和调控功能等方面的差异,还是未知的。本课题根据lncRNA的保守性差异对其在杂种与多倍化优势形成和分子调控机理方面,开展了初步研究。为了研究lncRNA在杂交和多倍化造成的genome shock中的生物学效应,我们对二倍体推测祖先种亚洲棉(***,A2)、雷蒙德氏棉(***,Ds)和异源四倍体陆地棉(***,AD1)的基因组和转录组进行了分析,根据lncRNA在二倍体和四倍体棉花基因组间的序列相似度和共线性关系,将陆地棉lncRNA分成了保守性lncRNA 607个和非保守性lncRNA 5910个。进一步通过比较基因组学、共表达网络分析、病毒诱导基因沉默技术对lncRNA进行了初步的功能分析,发现与蛋白编码基因(proteincodinggene,PCG)相比,lncRNA在面对高温、低温、盐害和干旱等非生物胁迫时,表达水平更容易发生改变,且比PCG更加特异性地响应不同类型的非生物胁迫。非保守性lncRNA与邻近编码基因的距离要比保守性lncRNA距离邻近编码基因更近,且倾向于与邻近编码基因的表达呈现出一种正相关关系。在大规模的lncRNA功能筛选过程中,我们发现保守性lncRNA和非保守性lncRNA均可能具有生长发育和非生物逆境耐受的调控功能。对一个保守性的lncRNA XLOC27558和一个非保守性lncRNA XLOC48490进行了功能探究。通常来说,植物氮代谢和运输能力越强,植物的耐旱性越好,目前结果表明XLOC27558可能通过trans-作用于氮合成代谢途径的蛋白编码基因。XLOC48490是在棉花基因组加倍过程中由于DNA大片段的缺失变异,造成DNA甲基化程度改变而激活转录产生的一个lncRNA。这一染色质结构上的差异可能通过cis-作用于一个邻近的编码胆碱单加氧酶的基因表达活性。胆碱单加氧酶是甜菜碱合成的关键酶,该基因表达活性的差异可能直接其编码蛋白质的功能,进而影响植物干旱胁迫下的渗透压,参与棉花的干旱调控途径。以上两个功能性lncRNA的研究结果表明,保守与非保守性lncRNA都可以通过顺式(cis-)和反式(trans-)作用参与棉花抗旱性调控。基因组震荡可以激活产生新的lncRNA,并在基因组进化的过程中发生新功能化,在植物环境适应性进化中起到新的调控作用。研究数据表明,lncRNA在提高作物对非生物胁迫耐受性方面具有潜在是应用价值。

关键词：棉花保守性lncRNA 非保守性lncRNA 顺式调控反式调控非生物胁迫

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曼陀罗绘画改善儿童社交焦虑的干预研究

曼陀罗绘画改善儿童社交焦虑的干预研究

作者：汪露瑶淮北师范大学

学位级别：硕士

随着当今社会各类不恰当的教育思想以及观念的蔓延,儿童面临的精神压力越来越大,导致了较多心理疾病的“低龄化”现象,其中就包括较为常见的儿童社交焦虑。儿童社交焦虑指的是儿童对于社交环境的焦虑以及紧张心理,这严重影响了儿童心理... 详细信息

随着当今社会各类不恰当的教育思想以及观念的蔓延,儿童面临的精神压力越来越大,导致了较多心理疾病的“低龄化”现象,其中就包括较为常见的儿童社交焦虑。儿童社交焦虑指的是儿童对于社交环境的焦虑以及紧张心理,这严重影响了儿童心理以及行为的健康发展。社交焦虑现象在儿童时期若得不到及时干预,则很有可能随着年龄增长加剧,或伴随终身。在积极寻找解决方法之时,研究者发现曼陀罗绘画疗法有其独特的优势:一方面,在荣格早期心灵创伤之际曾用曼陀罗图形来进行自我疗愈,后在临床中运用曼陀罗绘画对患者进行心理治疗并取得成功。荣格与后人的研究造就了曼陀罗绘画治疗强大的理论基础。另一方面,曼陀罗绘画以游戏为本质,相比于传统语言形式的心理治疗方法,它更符合儿童的兴趣并且具有更高的信息传达率,绘画分析师在儿童绘画过程中能够捕获更多的有效信息。然而,研究者通过对已有文献的阅读、整理与分析后发现,曼陀罗绘画的本土化研究较少,且研究方法存在局限。因此本研究结合曼陀罗绘画,对儿童社交焦虑的改善展开了实证研究:研究一使用La Greca等人编制的《儿童社交焦虑量表（SASC）》为测评工具,对合肥市多特望潜校区158名在册儿童进行社交焦虑测量。其次,对回收后的问卷数据进行筛选、分析,旨在了解儿童社交焦虑现状,并考察其在年龄、性别、年级等人口学变量上的统计学差异,进一步探索儿童社交焦虑的影响因素。研究二将社交焦虑前测数据按照27%的比例进行高低分组,在高分组内随机选取30人,分为实验组和对照组各15人。实验组进行一周一个小时的曼陀罗绘画课程,共持续8周,对照组不进行曼陀罗绘画干预,同时研究期间保证两组儿童不接受除曼陀罗绘画干预以外的干预措施。干预过程中使用数理统计,每隔两周进行一次实验组与对照组的社交焦虑水平后测,从而考察曼陀罗绘画改善儿童社交焦虑的有效性。研究结果发现:（1）儿童总体社交焦虑水平偏高并成正态分布。（2）儿童的社交焦虑水平会受到性别、年级、居住地类型、独生子女类型多方面的影响。（3）曼陀罗绘画能有效降低儿童社交焦虑水平,在一定程度上可以改善儿童社交焦虑症状,缓解儿童的社交压力。基于研究结果本文从家庭教育、学校教育以及相关教育工作者等角度提出以下建议:（1）父母应当鼓励独生子女社交,多给子女提供社交的机会。（2）在学校中可以适当开设曼陀罗绘画课程。（3）相关教育者需要重视城市小学低年级儿童的社交焦虑。

关键词：曼陀罗绘画儿童社交焦虑绘画治疗

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陆地棉MIKC^C基因家族的全基因组分析

棉花学报 2017年第6期29卷 495-503页

作者：周娜汪露瑶张天真胡艳南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室南京210095

【目的】MIKC^C是1类保守的转录因子家族,参与调控植物的开花时间和花器官发育。通过对MIKC^C家族进行全基因组学分析,为深入研究MIKC^C在棉花开花及花器官发育的分子调控机理提供基础。【方法】利用HMMER 3.0及pfam种子文件鉴定棉花全... 详细信息

【目的】MIKC^C是1类保守的转录因子家族,参与调控植物的开花时间和花器官发育。通过对MIKC^C家族进行全基因组学分析,为深入研究MIKC^C在棉花开花及花器官发育的分子调控机理提供基础。【方法】利用HMMER 3.0及pfam种子文件鉴定棉花全基因组MIKC^C基因,结合其表达量进行偏向表达及聚类分析。【结果】在陆地棉基因组中共鉴定发现100个MIKC^C基因,分为11个亚类。表达聚类分析显示,棉花MIKC^C基因的表达模式大致可分为4个不同的类群,说明这类基因在棉花进化中出现了功能分化。100个MIKC^C基因中,有12个基因具有miRNA靶位点。【结论】研究结果显示MIKC^C家族基因在棉花纤维中存在功能分化,而且可能受到miRNA的调控,这为进一步研究该家族基因的功能提供信息参考。

关键词：陆地棉 MIKCC基因功能分化 miRNA

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“盘他”的转喻义演变及语用移情功能

文教资料 2021年第26期 5-9页

作者：汪露瑶暨南大学华文学院广东广州510610

“盘他”作为一个典型的动宾短语在2018年掀起了一股热潮,使用率不断攀升,涉及的语义域越来越广,表达的情感内涵越来越丰富。本文探讨该词在不断使用中的转喻义演变和语用移情功能及以其为代表的网络流行词出现并流行的原因。

关键词： “盘他” 转喻义语用移情情感态势

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棉花EXO70基因家族全基因组的鉴定及种间比较

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中国农业科学 2023年第23期56卷 4621-4663页

作者：董琰钰徐碧玉董泽宇汪露瑶陈锦文方磊浙江大学农业与生物技术学院

【目的】当前四倍体棉花的主栽品种是陆地棉与海岛棉，陆地棉产量高且适应性好，海岛棉纤维品质优异但产量一般。EXO70是胞外分泌体（exocyst complex）中的关键亚基，在植物生长发育、胁迫响应等方面发挥重要作用。通过全基因组水平鉴... 详细信息

【目的】当前四倍体棉花的主栽品种是陆地棉与海岛棉，陆地棉产量高且适应性好，海岛棉纤维品质优异但产量一般。EXO70是胞外分泌体（exocyst complex）中的关键亚基，在植物生长发育、胁迫响应等方面发挥重要作用。通过全基因组水平鉴定和分析陆地棉与海岛棉EXO70基因家族成员，并研究其在纤维发育、环境适应等方面的功能，有助于揭示陆地棉与海岛棉种间性状差异形成的分子基础。【方法】从拟南芥数据库（TAIR）获取EXO70家族蛋白序列作为参考序列，采用HMMER、ExPASy、MEME、TBtools等分析工具对陆地棉TM-1和海岛棉Hai7124基因组中EXO70家族成员进行鉴定与分析，系统比较该家族在基因表达模式、重要农艺性状的相关性、逆境响应等方面的异同点。【结果】通过对陆地棉和海岛棉的基因组水平分析，均鉴定出54个EXO70家族成员，根据系统进化发育可将其分为8个分支。陆地棉和海岛棉同源基因可一一对应，分布在陆地棉与海岛棉的20条染色体上，绝大多数成员为单外显子，但是两者间有12对同源基因在阅读框序列上存在较大差异。陆地棉与海岛棉大部分同源基因表达模式类似，但在同一纤维发育时期表达量存在差异，如分支A中的GH＿A04G1208与同源基因GB＿A04G1253。重要农艺性状关联分析中发现，海岛棉有16个EXO70基因与纤维品质性状显著相关，多于陆地棉；陆地棉有13个基因与产量性状衣分显著相关，多于海岛棉。发现部分性状关联的差异可能由海陆种间的基因结构差异造成，如GH＿A11G3714和GB＿A11G3791。在不同逆境胁迫下，陆地棉中有25个基因受诱导，显著多于海岛棉中10个受诱导基因。【结论】在棉花四倍体形成、分化与驯化过程中，陆地棉与海岛棉EXO70家族基因序列结构相对保守，基因表达模式也保持较高的一致性。海岛棉有更多的EXO70基因与纤维品质性状相关，陆地棉有更多的基因与产量性状相关且对环境逆境更为敏感。

关键词：陆地棉海岛棉 EXO70基因家族表达模式性状关联分析逆境响应