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水稻抗旱数量性状位点（QTLs）的基因挖掘研究

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水稻抗旱数量性状位点（QTLs）的基因挖掘研究

作者：汪旭升浙江大学

学位级别：硕士

水稻是世界上最主要的粮食作物之一，干旱同其他环境胁迫一样，是影响作物产量的重要制约因素。水稻的抗旱性状是由多基因控制的数量性状，目前对抗旱性状的遗传改良主要集中在对抗旱数量基因位点的研究，通过不同的生理机理或在不同的... 详细信息

水稻是世界上最主要的粮食作物之一，干旱同其他环境胁迫一样，是影响作物产量的重要制约因素。水稻的抗旱性状是由多基因控制的数量性状，目前对抗旱性状的遗传改良主要集中在对抗旱数量基因位点的研究，通过不同的生理机理或在不同的环境条件下多基因的累加效应来表现抗旱性。为了寻找抗旱数量性状位点的潜在基因，我们选用Azucena和IR64的重组近交系，分别对产量性状和在胁迫与非胁迫的环境条件下进行大田实验。研究表明，这个群体的分离主要是由于在半矮杆基因(sd1)两侧区域的等位基因的变异引起，同时这个区段也是引起产量变异的重要位点。为了对这一区段进行进一步的研究，我们发展了一个生物信息学的程序(IRISNP)，利用公布的两套水稻基因组序列--国际水稻基因组测序中心测序的粳稻(Japonica)和北京基因组中心测序的籼稻(Indica)，通过在候选基因的序列中比对来寻找基因中的SNPs。本论文以水稻半矮杆基因区域的候选基因为例，详细描述了建立IRISNP数据库、SNPs发现的程序、互联网查询界面和SNPs搜寻结果输出的整个过程。研究结果表明，有175个基因位于1号染色体上半矮杆基因两侧的区域(RM212-RM319)，同时对这些基因进行了功能分类，其中48个具有已知功能的基因，23为伪基因，24个未知功能的蛋白但有表达序列标签(EST)匹配的基因，80个为假蛋白的基因。另外，在已知功能的基因中深入研究发现有16个基因与抗旱有紧密相关。

关键词：水稻基因组基因挖掘单核苷酸多态性候选基因

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湖南省网络舆情应对能力提升研究

湖南省网络舆情应对能力提升研究

作者：汪旭升湖南大学

学位级别：硕士

当前,互联网正深刻改变着人类的信息传播方式和生产生活方式,“人人互联”“人人被互联”已成为现实,民众直接拥有政治资源和参与政治生活已成为一个不可阻挡的趋势,网络舆情也正以“内容威胁”的形式影响着社会公共安全,给当前各级政... 详细信息

当前,互联网正深刻改变着人类的信息传播方式和生产生活方式,“人人互联”“人人被互联”已成为现实,民众直接拥有政治资源和参与政治生活已成为一个不可阻挡的趋势,网络舆情也正以“内容威胁”的形式影响着社会公共安全,给当前各级政府管理和社会大局稳定带来挑战。湖南省作为全国网络舆情大省,近年来发生了很多引起全社会关注的热点舆情,对湖南经济社会发展造成了一定的影响。顺应新形势、新时代发展趋势,提升网络舆情应对能力成为湖南各级政府亟需解决的现实课题。本文立足湖南省网络舆情应对现状,以提升湖南省网络舆情应对能力为落脚点,综合运用公共管理学、传播学等多种理论及方法。网络舆情应对能力主要包括网络文化构建、网络舆情发现、研究判断、引导与网络危机处置等五个方面。地方政府网络舆情应对能力是舆情趋好的前提,而网络舆情有效管控则是地方政府应对能力的体现。近年来,湖南省在网络舆情应对方面开展了积极探索,网络舆情应对体系初步构建、舆情应对联动逐步有序化、网络监督渠道不断拓宽,网络舆论生态治理已见成效,但期间也凸显出网络文化构建能力比较匮乏、网络舆情发现能力存在短板、网络舆情研判能力相对薄弱、网络舆情引导能力略显不足、网络危机处置能力亟需提高等五方面问题。湖南省在舆情应对的价值认知不充分、互联网媒介环境复杂多变、舆情应对的技术架构欠完善、舆情人才队伍有待专业化、政府信息公开欠全面、网络监督体系不成熟等网络舆情管控生态环境下,应按照实事求是、以人为本、及时准确和平衡报道的原则,提升网络舆情应对能力。网络舆情应对能力提升重点是:提高提升领导干部网络智能、凝聚起网络空间正能量、及时化解舆情事件负效应。根据本文的研究,对提升湖南省网络舆情应对能力提出了要完善网络法治体系建设、推动网上办事大厅建设、着力推进数据共享建设和加强网信人才队伍建设。

关键词：网络舆情舆情研判应对能力提升路径政策建议

体育游戏教学法对五年级学生体育兴趣及身体素质的影响研究

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体育游戏教学法对五年级学生体育兴趣及身体素质的影响研究

作者：汪旭升南京体育学院

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水稻14-3-3蛋白家族的生物信息学分析

Acta Genetica Sinica 2005年第7期32卷 726-732页

作者：金谷雷汪旭升朱军浙江大学生物信息学研究所杭州310029

通过隐马尔柯夫模型(HiddenMarkovModel,HMM),对粳稻(***)基因组的蛋白质数据库进行搜索,结果获得8个1433蛋白的同源序列,其中发现4个新基因。通过对所有粳稻的1433蛋白的DNA序列与各种表达序列标签(ExpressionSequenceTags,ESTs)进一... 详细信息

通过隐马尔柯夫模型(HiddenMarkovModel,HMM),对粳稻(***)基因组的蛋白质数据库进行搜索,结果获得8个1433蛋白的同源序列,其中发现4个新基因。通过对所有粳稻的1433蛋白的DNA序列与各种表达序列标签(ExpressionSequenceTags,ESTs)进一步比对,为1433蛋白找到了ESTs的证据。结果说明这些基因在水稻不同的处理和不同的部位都有所表达,而且不同成员之间的表达模式存在较大的差异。蛋白质多序列联配分析结果表明,存在可能的功能多态位点。通过基因结构和染色体定位的分析,确认了水稻基因组中存在ε样和非ε样两类1433蛋白。此外,对目前植物中的1433家族作了初步的进化分析。

关键词： 14-3-3蛋白生物信息学分析家族隐马尔柯夫模型 Markov 蛋白质数据库表达序列标签 Model DNA序列染色体定位水稻基因组同源序列 ESTs 表达模式分析结果多态位点基因结构进化分析行搜索 sp. 新基因粳稻植物

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含有多个滞量的微分差分方程周期解的存在性

浙江农业大学学报 1994年第5期20卷 496-500页

作者：李大庆汪旭升浙江中医学院高等数学研究室广西中医学院高等数学研究室

本文给出了比ＫａｐｐｌｅｍＪＬ和温立华等人对Ｘ（ｔ）＝-ｇ（ｘ（ｔ），ｘ（ｔ-ｒ＿１）＋ｆ（ｘ（ｔ-ｒ＿２））］一般系统更广泛一类的泛函微分方程Ｘ（ｔ）＝-ｇ（ｘ（ｔ），ｘ（ｔ-τ＿１），ｘ（ｔ-τ＿２）），［ｆ（ｘ（ｔ-... 详细信息

本文给出了比ＫａｐｐｌｅｍＪＬ和温立华等人对Ｘ（ｔ）＝-ｇ（ｘ（ｔ），ｘ（ｔ-ｒ＿１）＋ｆ（ｘ（ｔ-ｒ＿２））］一般系统更广泛一类的泛函微分方程Ｘ（ｔ）＝-ｇ（ｘ（ｔ），ｘ（ｔ-τ＿１），ｘ（ｔ-τ＿２）），［ｆ（ｘ（ｔ-τ＿１））＋ｆ（ｘ（ｔ-τ＿２））］的非常数周期解存在的充分条件。

关键词：微分差分方程周期解存在性滞量

数量性状位点(QTLs)内候选基因的生物信息学分析方法

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浙江林学院学报 2008年第1期25卷 104-108页

作者：吴家胜汪旭升浙江林学院林业与生物技术学院浙江临安311300 浙江大学生物信息学研究所浙江杭州310029

几乎所有的农作物都开展了QTL(quantitative trait loci)定位研究,定位的方法也很多,如区间作图、复合区间作图、基于混合线性模型的复合区间作图和贝叶斯作图等,但这些研究方法均有它们自身的缺陷,定位的QTL在基因组上区间仍然很大,精... 详细信息

几乎所有的农作物都开展了QTL(quantitative trait loci)定位研究,定位的方法也很多,如区间作图、复合区间作图、基于混合线性模型的复合区间作图和贝叶斯作图等,但这些研究方法均有它们自身的缺陷,定位的QTL在基因组上区间仍然很大,精度不高。为了更好地理解QTLs的分子生物学基础。文章简要地介绍了利用生物信息学方法分析QTL区间内候选基因的方法,并着重从遗传、基因组结构、表达和功能等方面来剖析QTL内的候选基因,为将来更好地利用QTL提供了借鉴。

关键词：遗传学数量性状位点候选基因生物信息学综述

水稻全基因组R基因鉴定及候选RGA标记开发

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科学通报 2005年第11期50卷 1085-1089页

作者：汪旭升吴为人金谷雷朱军浙江大学农业与生物技术学院生物信息学研究所福建农林大学作物科学学院福州350002 福建农林大学作物科学学院

用45个已知功能的植物抗病(R)基因序列对粳稻全基因组序列进行搜索, 共找出2119个R基因同源序列或类似物(RGA), 表明RGA在水稻基因组中成簇存在, 呈非随机分布. 采用隐马尔柯夫模型(HMM), 将这些RGA按其功能域分成了21类. 将粳稻的RGA... 详细信息

用45个已知功能的植物抗病(R)基因序列对粳稻全基因组序列进行搜索, 共找出2119个R基因同源序列或类似物(RGA), 表明RGA在水稻基因组中成簇存在, 呈非随机分布. 采用隐马尔柯夫模型(HMM), 将这些RGA按其功能域分成了21类. 将粳稻的RGA与籼稻的基因组序列进行比较, 共找到702个两亚种间等位的RGA, 并发现其中有671个(占95.6%)RGA的基因组序列(包括编码区和非编码区)在两亚种间存在长度差异(InDel), 表明水稻RGA在两亚种间存在很高的多态性. 通过在InDel两侧设计引物并进行e-PCR验证, 共开发出402个基于PCR的、表现为共显性的候选RGA标记. 这些候选标记在两亚种间的长度差异在1～742 bp之间, 平均为10.26 bp. 有关数据均可从我们的网站(http://***/RGAs/***)上获得.

关键词： RGA 标记基因鉴定开发隐马尔柯夫模型全基因组序列水稻基因组非随机分布 index 亚种间植物抗病同源序列非编码区行搜索序列对类似物 R基因功能域多态性 PCR 共显性粳稻长度行比籼稻

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基于水稻基因组序列SSR的多态性分析

中国水稻科学 2005年第4期19卷 303-307页

作者：陈仲中汪旭升朱军浙江大学生物信息学研究所浙江杭州310029

根据Monsanto公司所发布的6655个序列[由简单重复序列(SSR)及其两翼各100个碱基组成],通过生物信息学的方法,找到了在籼稻(***)品种93-11与粳稻(***)品种日本晴的基因组序列中匹配最好的1453个同源位点。在这些位点中,93-11和日本晴中... 详细信息

根据Monsanto公司所发布的6655个序列[由简单重复序列(SSR)及其两翼各100个碱基组成],通过生物信息学的方法,找到了在籼稻(***)品种93-11与粳稻(***)品种日本晴的基因组序列中匹配最好的1453个同源位点。在这些位点中,93-11和日本晴中分别搜索到了1449个和1451个SSR。通过对SSR的分类比较,发现在93-11和日本晴的相同位点存在1175个具有相同基序的SSR,其中371个具有相同的基序和重复个数,804个具有相同的基序但重复次数有差异。具有相同基序但重复次数有差异的SSR类型中,频率最高的是2个核苷酸的重复子,占62.94%,基序为5个和6个核苷酸的SSR则较少。对水稻这两个品种相应区域SSR的多态性比较分析,揭示了用这些特定类型的SSR可以在这两个品种的特定区域发展新的SSR标记,并为研究这两个品种之间遗传变异、基因组功能之间的差异等提供依据。

关键词：简单重复序列水稻多态性

看,永远流浪的天才灵魂——《列夫·托尔斯泰》课堂教学实录

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读写月报 2016年第36期 55-61页

作者：汪旭升浙江省金华市第五中学

【设计突破】散文是作者心灵的抒发,阅读散文是心灵的碰撞、交感。茨威格散文超越了常人思想极致,突破到常人感官和情感无法抵达的深邃处,洒脱到极致,行文全无章法。《列夫·托尔斯泰》一课,文本关键词可提炼为:外貌、眼睛(目光)、内心... 详细信息

【设计突破】散文是作者心灵的抒发,阅读散文是心灵的碰撞、交感。茨威格散文超越了常人思想极致,突破到常人感官和情感无法抵达的深邃处,洒脱到极致,行文全无章法。《列夫·托尔斯泰》一课,文本关键词可提炼为:外貌、眼睛(目光)、内心世界、天才的灵魂、幸福。教学设计关键词则是"矛盾":矛盾的人物、矛盾的词句、矛盾的结构、矛盾的情感。对立统一,形神兼备,最终触摸托翁那一颗永远流浪的天才灵魂——神的一滴。

关键词：托尔斯泰茨威格教学实录《列夫·托尔斯泰》