检索结果-南通市图书馆

八倍体草莓DNA指纹图谱的构建与初步遗传分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国农业大学学报 2023年第2期28卷 35-42页

作者：刘国霞张全芳杨雪谭晴晴胡悦范阳阳姚川崔刚步迅陈雪燕刘炳福山东省农业科学院农作物种质资源研究所济南250100 山东普朗特农业技术有限公司济南250100 山东省农业科学院休闲农业研究所济南250100

为对草莓品种进行分子鉴定,从59对SSR引物中筛选出18对多态性好的引物,采用毛细管电泳检测方法对84份八倍体草莓品种进行标记分析,检测每个标记等位变异大小,并进行初步遗传分析。将每个引物对84份草莓扩增的带型按照一定原则进行数字标... 详细信息

为对草莓品种进行分子鉴定,从59对SSR引物中筛选出18对多态性好的引物,采用毛细管电泳检测方法对84份八倍体草莓品种进行标记分析,检测每个标记等位变异大小,并进行初步遗传分析。将每个引物对84份草莓扩增的带型按照一定原则进行数字标注,为了简化编码,引物P1~P18分别编号为字母A~R,将引物编号与相应的带型编码进行组合得到该样品在特定引物的扩增产物编码,按照18对引物顺序串联这些编码形成该品种的DNA指纹图谱。结果表明:18对SSR引物共扩增得到多态性条带150个,不同引物扩增到多态性条带数4~17个,共检测到377个带型;各引物的多态性信息含量(PIC)值为0.494~0.908,平均值为0.738;利用18对SSR引物共构建了84个草莓品种的DNA指纹图谱。聚类分析结果表明:在遗传相似系数为0.99时能将所有品种区分开,一些来源相同的品种被优先聚在一起。综上,本研究成功构建84个草莓品种的DNA指纹图谱,这些品种遗传关系较近。

关键词：草莓 SSR DNA指纹图谱遗传分析

3种常见金银花致病菌多重实时荧光定量PCR检测方法研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

山东农业科学 2023年第7期55卷 145-151页

作者：朱桐杉刘艳艳谭晴晴刘国霞陈雪燕步迅王文博于子涵张全芳张永清山东中医药大学药学院山东济南250355 山东省农业科学院农作物种质资源研究所山东济南250100 山东省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所山东济南250100 山东中医药大学附属医院山东济南250013

为了建立可同时检测炭疽病病原菌(Colletotrichum gloeosporioides)、白粉病病原菌(Erysiphe lonicera)和褐斑病病原菌(Cercospora rhamni)3种金银花重要叶部病原菌的多重实时荧光定量PCR快速检测方法,本试验基于3种病原菌ITS片段序列... 详细信息

为了建立可同时检测炭疽病病原菌(Colletotrichum gloeosporioides)、白粉病病原菌(Erysiphe lonicera)和褐斑病病原菌(Cercospora rhamni)3种金银花重要叶部病原菌的多重实时荧光定量PCR快速检测方法,本试验基于3种病原菌ITS片段序列分别设计特异引物和TaqMan荧光探针,并制备重组质粒建立标准曲线;对建立的多重实时荧光定量PCR检测方法进行特异性、灵敏度、准确性验证。结果表明,本研究建立的多重实时荧光定量PCR快速检测方法仅针对金银花炭疽病、白粉病和褐斑病病原菌有特异性扩增;最低检测限为2.94×10^(2)copies/μL,比普通PCR法高100倍;利用本方法检测15份有叶部病害症状的金银花病叶,与DNA测序结果完全一致。综之,本研究建立的多重实时荧光PCR检测方法特异性强、灵敏度高,为金银花炭疽病、白粉病和褐斑病的早期诊断提供了技术支持。

关键词：金银花炭疽病白粉病褐斑病多重实时荧光定量PCR

适用于多重荧光SSR检测的玉米基因组DNA提取方法

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

玉米科学 2016年第2期24卷 29-34页

作者：张全芳张荦嘉梁水美李燕郭庆法姚国旗鲁守平步迅山东省农业科学院生物技术研究中心/山东省作物遗传改良与生态生理重点实验室济南250100 山东省实验中学校济南250001 山东省农业科学院玉米研究所/小麦玉米国家工程实验室/农业部黄淮海北部玉米生物学与遗传育种重点实验室济南250100

通过比较植物DNA提取试剂盒法、SDS法、磁珠法和质粒DNA小提试剂盒法提取玉米叶片全基因组DNA的质量,确定最适用于多重荧光SSR检测的方法。结果表明,4种方法获得全基因组DNA的ODA260/ODA280平均值分别为1.92、2.16、2.22和2.00;DNA浓度... 详细信息

通过比较植物DNA提取试剂盒法、SDS法、磁珠法和质粒DNA小提试剂盒法提取玉米叶片全基因组DNA的质量,确定最适用于多重荧光SSR检测的方法。结果表明,4种方法获得全基因组DNA的ODA260/ODA280平均值分别为1.92、2.16、2.22和2.00;DNA浓度平均值分别为19.16、2 050.58、69.12、53.56 ng/μL。比较发现,SDS法和植物DNA提取试剂盒法因为提取DNA杂质多和提取成本高,均不适用于多重SSR-PCR大量样本的检测;质粒DNA小提试剂盒法和磁珠法提取的全基因组DNA都适用于多重SSR-PCR检测,分别适合人工操作和机械自动化提取。

关键词：玉米基因组DNA提取方法多重荧光SSR标记

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

北柴胡成花基因的克隆及时空表达分析

药学学报 2021年第4期56卷 1188-1196页

作者：李敏张全芳蒲高斌刘艳艳刘谦步迅张永清山东中医药大学山东济南250355 山东省农业科学院生物技术研究中心山东济南250100

开花是植物生长发育的关键环节,本研究从北柴胡植株中克隆得到4个与成花相关的基因,分别命名为BcSVP、BcPAF1、BcCO、BcFT,并进行了同源性比对;以actin和EF-1α作为双内参,对4个基因在北柴胡植株不同器官和不同发育阶段的时空表达差异... 详细信息

开花是植物生长发育的关键环节,本研究从北柴胡植株中克隆得到4个与成花相关的基因,分别命名为BcSVP、BcPAF1、BcCO、BcFT,并进行了同源性比对;以actin和EF-1α作为双内参,对4个基因在北柴胡植株不同器官和不同发育阶段的时空表达差异进行分析。结果表明,BcSVP主要在根中表达,相对表达量较低;BcPAF1和BcCO在不同部位均有较高表达,二者相对表达量伴随花期进程均呈先上升后缓慢下降趋势;BcFT基因主要在茎中表达,相对表达量在盛花期急剧上升。本文首次克隆并分析了与北柴胡植株成花相关4个基因的相对表达量,为解析柴胡植株成花分子调控机制奠定了基础。

关键词：北柴胡成花基因克隆时空表达模式

基于荧光SSR标记的玉米自交系遗传结构解析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

植物遗传资源学报 2017年第1期18卷 19-31页

作者：张全芳梁水美李燕刘艳艳范阳阳郭庆法鲁守平步迅山东省农业科学院生物技术研究中心/山东省作物遗传改良与生态生理重点试验室济南250100 山东省农业科学院玉米研究所/小麦玉米国家工程试验室/农业部黄淮海北部玉米生物学与遗传育种重点试验室济南250100

利用多重SSR-PCR荧光标记检测技术,对本单位自育和引进的259份玉米自交系进行遗传多样性和亲缘关系分析,并以11个归属于不同杂种优势群的代表自交系为参照进行群体结构分析。结果显示,50对SSR引物共检测到214个等位基因变异,基因多态性... 详细信息

利用多重SSR-PCR荧光标记检测技术,对本单位自育和引进的259份玉米自交系进行遗传多样性和亲缘关系分析,并以11个归属于不同杂种优势群的代表自交系为参照进行群体结构分析。结果显示,50对SSR引物共检测到214个等位基因变异,基因多态性指数的平均值为0.50,每个SSR标记的多态性信息量(PIC)平均值为0.44。用UPGMA方法将270份自交系划分成3大类群,进一步进行数值化杂种优势群分析,以明确所用种质资源的杂优类群利用方向,为玉米自交系的有效利用和品种的选育提供依据。

关键词：玉米自交系分子标记遗传多样性

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

乌头驴和三粉驴微卫星遗传多态性分析

中国畜牧杂志 2017年第1期53卷 44-50页

作者：刘艳艳谭晴晴范阳阳张全芳盛清凯贾涛董书光步迅山东省农业科学院生物技术研究中心山东省农业科学院应用生命科学实验室胶类中药源性DNA分子鉴定实验室山东济南250010 山东省农业科学院畜牧兽医研究所山东省畜禽疫病防治与繁育重点实验室山东济南250100 山东禹城惠民农业科技有限公司山东省德州黑驴养殖繁育保种基地山东省农业科学院地方驴品种资源保护科研中心山东禹城251200 山东东阿国胶堂阿胶药业有限公司山东东阿252201

实验旨在了解德州驴中乌头驴和三粉驴2个品系的遗传多态性。利用13个微卫星位点,通过建立多重多色毛细管电泳荧光检测方法,对39头三粉驴和16头乌头驴进行遗传多样性分析,对等位基因数、多态信息含量(PIC)、遗传杂合度和有效等位基因数... 详细信息

实验旨在了解德州驴中乌头驴和三粉驴2个品系的遗传多态性。利用13个微卫星位点,通过建立多重多色毛细管电泳荧光检测方法,对39头三粉驴和16头乌头驴进行遗传多样性分析,对等位基因数、多态信息含量(PIC)、遗传杂合度和有效等位基因数进行统计分析。结果表明:13对微卫星位点三粉驴PIC指数平均值为0.47,乌头驴PIC指数平均值为0.40,德州驴2个品系PIC总的平均值为0.47。其中乌头驴品系平均等位基因数为3.31,平均观测杂合度为0.27,有效等位基因数为2.11。三粉驴品系平均等位基因数为4.46,平均观测杂合度为0.33,有效等位基因数为2.61。由此可见,三粉驴比乌头驴的遗传多态性高,但2个驴品系的遗传杂合度均偏低,遗传变异程度较小。

关键词：微卫星遗传多样性乌头驴三粉驴

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

花生EST资源的SSR信息分析

花生学报 2008年第4期37卷 6-11页

作者：柳展基孙萍步迅山东省农科院高新技术研究中心山东省作物与畜禽品质改良生物技术重点实验室山东济南250100

微卫星或简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)存在于表达序列标签(expressedsequence tags,ESTs)中。为了在花生中开发EST-SSR功能性标记,利用生物信息学对NCBI公共数据库中的41501条花生ESTs序列进行EST-SSRs特征分析。剔除冗... 详细信息

微卫星或简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)存在于表达序列标签(expressedsequence tags,ESTs)中。为了在花生中开发EST-SSR功能性标记,利用生物信息学对NCBI公共数据库中的41501条花生ESTs序列进行EST-SSRs特征分析。剔除冗余序列,得到全长为5125.94kb的无冗余EST8391条。在这些序列中搜索出1109个SSR,分布于946条EST中,出现频率是11.27%。这些EST-SSR的平均长度为18.16bp,平均分布频率1/4.62kb。在1～6bp的重复基元中,三核苷酸重复基元的SSRs出现频率最高(49.23%),其次是二核苷酸(32.83%)、单核苷酸(14.88%)。AG/CT和AAG/CTT是二、三核苷酸中的优势重复基元,分别占二、三核苷酸重复的71.43%和31.50%。本研究为开发多态性花生微卫星标记提供了候选序列。

关键词：花生 EST SSR 频率特性

一种鉴定西红花和红花源性成分的实时荧光PCR方法

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国中药杂志 2018年第23期43卷 4575-4581页

作者：张全芳刘艳艳谭晴晴姜欣欣陈雪燕葛付存步迅张永清山东农业科学院生物技术研究中心应用生命科学实验室山东济南250100 山东省百味堂中药饮片有限公司山东济南250108 山东中医药大学药学院天然药物研究所山东济南250355

该研究根据GenBank中的ITS2序列设计引物,基于SYBRGreen荧光PCR技术建立了一种能快速、灵敏和特异的鉴别西红花和红花源性的实时荧光定量PCR检测体系。与中草药DNA条形码技术相比,该方法检测时间短、特异性强、灵敏度高。利用该方法检... 详细信息

该研究根据GenBank中的ITS2序列设计引物,基于SYBRGreen荧光PCR技术建立了一种能快速、灵敏和特异的鉴别西红花和红花源性的实时荧光定量PCR检测体系。与中草药DNA条形码技术相比,该方法检测时间短、特异性强、灵敏度高。利用该方法检测15份样品,其中4份为红花,8份样品为西红花,3份为其他源性,与中草药DNA条形码检测结果一致。该方法为药材中西红花与红花源性的快速鉴定奠定了基础。

关键词： sYBRGreen实时荧光定量PCR 西红花红花源性鉴定

化妆品中动物源性成分多重实时荧光PCR检测方法的研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

日用化学工业 2016年第8期46卷 479-484页

作者：刘艳艳霍胜楠梁水美卞如如张卉步迅山东省农业科学院生物技术研究中心山东济南250100 山东省农业科学院应用生命科学实验室山东济南250100 山东省食品药品检验研究院山东济南250101

使用优化的Chelex-100结合玻璃奶法提取膏状、液态和固态化妆品中的动物源性DNA;根据驴、马和牛线粒体16S rRNA基因序列设计通用引物和特异性探针,建立了一次性检测化妆品中驴、马和牛3种动物源性成分的多重实时荧光PCR体系,检出限均为0... 详细信息

使用优化的Chelex-100结合玻璃奶法提取膏状、液态和固态化妆品中的动物源性DNA;根据驴、马和牛线粒体16S rRNA基因序列设计通用引物和特异性探针,建立了一次性检测化妆品中驴、马和牛3种动物源性成分的多重实时荧光PCR体系,检出限均为0.001 ng。并对市售的面霜、洗面奶和面膜进行盲样检测,验证了体系的可靠性和准确性。

关键词：化妆品多重实时荧光PCR 动物源性成分