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利用PCR仪进行DNA克隆反应的半自动操作

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遗传 1998年第1期20卷 36-37页

作者：柏邵春刘万清贺林中国科学院上海生命科学研究中心

利用ＰＣＲ仪进行ＤＮＡ克隆反应的半自动操作柏邵春刘万清贺林（中国科学院上海生命科学研究中心，上海２０００３１）Ｓｅｍｉ－ａｕｔｏｍａｔｅｄＤＮＡＣｌｏｎｉｎｇＲｅａｃｔｉｏｎｓＵｓｉｎｇＰＣＲＴｈｅｒｍａｌＣｙｃｌｅ... 详细信息

利用ＰＣＲ仪进行ＤＮＡ克隆反应的半自动操作柏邵春刘万清贺林（中国科学院上海生命科学研究中心，上海２０００３１）Ｓｅｍｉ－ａｕｔｏｍａｔｅｄＤＮＡＣｌｏｎｉｎｇＲｅａｃｔｉｏｎｓＵｓｉｎｇＰＣＲＴｈｅｒｍａｌＣｙｃｌｅｒＢＡＩＳｈａｏｃｈｕｎＬＩＵＷａ...

关键词： PCR仪 DNA 克隆半自动操作

应用FLUPD-DD-PCR检测血清饥饿对胶质瘤细胞mRNA表达的影响

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科学通报 1999年第22期44卷 2398-2401页

作者：柏邵春刘万清石贤民贺林中国科学院上海生理研究所上海200031

荧光通用引物差异显示PCR(FLUPD DD PCR)是以荧光通用引物和相应 1 0碱基随机引物进行DD PCR扩增 ,在荧光自动测序仪上进行电泳 .通过对电泳图谱的分析进行特异条带的确定 ,使准确度和自动化程度大大提高 ,尤其对于表达量上有差异的cDN... 详细信息

荧光通用引物差异显示PCR(FLUPD DD PCR)是以荧光通用引物和相应 1 0碱基随机引物进行DD PCR扩增 ,在荧光自动测序仪上进行电泳 .通过对电泳图谱的分析进行特异条带的确定 ,使准确度和自动化程度大大提高 ,尤其对于表达量上有差异的cDNA片段 ,这一方法比传统的DD PCR更为方便 .cy5标记的通用引物的使用和银染显带直接进行条带回收 ,进一步提高了该方法的效率和准确性 .应用这一方法 ,对血清饥饿处理的胶质瘤细胞的特异表达的mRNA进行了初步研究 ,并得到了 4条与该处理有关的EST .经过与GenBank数据库比较发现 ,其中 3条为未知的新EST ,1条与小鼠的EST完全同源 ,表明血清饥饿涉及到许多新基因的开启表达或某些基因的表达量上调 ,可诱发细胞发生多方面的生理反应 .

关键词： FLUPD-DD-PCR 血清饥饿胶质瘤细胞 mRNA

散发性结直肠癌20号染色体等位基因杂合缺失

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Chinese Medical Journal 2002年第10期115卷 1529-1532页

作者：彭志海周崇治张放凌云唐华美裘国强柏邵春刘万清贺林上海市第一人民医院普通外科上海200080 中国科学院上海生物科学研究所上海200031

目的抑癌基因的杂合缺失被认为是结直肠癌形成的关键步骤之一,本研究利用微卫星DNA标记杂合缺失分析法对散发性结直肠癌20号染色体杂合缺失情况进行研究, 并探讨其意义.方法 83例结直肠癌病人的肿瘤及正常组织的DNA,经PCR反应后,以ABI P... 详细信息

目的抑癌基因的杂合缺失被认为是结直肠癌形成的关键步骤之一,本研究利用微卫星DNA标记杂合缺失分析法对散发性结直肠癌20号染色体杂合缺失情况进行研究, 并探讨其意义.方法 83例结直肠癌病人的肿瘤及正常组织的DNA,经PCR反应后,以ABI Pr ism 377自动荧光测序仪进行电泳,以GeneScan2.1和Genotyper3.1 软件进行基因分型. 结果整条染色体的平均杂合缺失率为22.8%,20号染色体短臂平均杂合缺失率为26.7%,长臂平均杂合缺失率为21.1%.20号染色体整个短臂及长臂20q11.1至20q1 3.1均表现出很高的杂合缺失率.结论在散发性结直肠癌中20号染色体存在明显的基因组不稳定现象,提示结直肠癌相关基因的存在.

关键词：等位基因散发性结直肠癌 20号染色体杂合缺失

散发性结肠直肠癌肿瘤分化及转移相关基因杂合缺失分析

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中华外科杂志 2002年第10期40卷 776-779页

作者：彭志海张放周崇治裘国强柏邵春刘万清贺林上海第一人民医院普外科 200080 中国科学院上海生理所

目的　探讨散发性结肠直肠癌患者 2号染色体上可能的肿瘤转移相关基因位点。方法　以 2号染色体上 30个不同荧光标记的高度多态性微卫星引物对 83例散发性结肠直肠癌患者基因组DNA扩增相应的微卫星位点 ,用ABIPRISM 377测序仪进行基因扫... 详细信息

目的　探讨散发性结肠直肠癌患者 2号染色体上可能的肿瘤转移相关基因位点。方法　以 2号染色体上 30个不同荧光标记的高度多态性微卫星引物对 83例散发性结肠直肠癌患者基因组DNA扩增相应的微卫星位点 ,用ABIPRISM 377测序仪进行基因扫描 ,检测各位点杂合缺失率 ,比较与肿瘤分期、分化的关系。结果　 2 4个位点获得有效数据 ,平均遗传距离为 11厘摩 (cM) ,杂合缺失率平均为 15 16 % ,较高的有 2个位点 :D2S2 0 6 (2q33 37)的 32 0 8%和D2S36 4 (2q32 1)的31 0 3% ,其余位点的杂合缺失率均小于 2 0 0 0 % ;D2S14 2 (2q2 4 1)、D2S12 6 (2q35 )、D2S2 2 11(2p2 4 2 )、D2S30 5 (2p2 3 3)的杂合缺失率随着肿瘤恶性程度的增加而增高 ,后 2个位点间的缺失有相关性。结论　已知几个错配修复基因位点附近的微卫星位点并无高频杂合缺失发生 ,D2S30 5 (2p2 3 3)到D2S2 2 11(2p2 4 2 )之间区域为整体性缺失 ,此区域和D2S14 2 (2q2 4 1)、D2S12 6 (2q35 ) 2个位点与肿瘤的恶性程度相关 ,提示存在未知的肿瘤分化和转移相关基因的可能。

关键词：散发性直肠癌肿瘤分化杂合子丢失肿瘤转移结肠肿瘤微卫星位点

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肿瘤分子遗传学研究方法进展

国外医学（遗传学分册） 1999年第5期22卷 247-251页

作者：柏邵春赵三虎贺林中国科学院上海生理研究所上海200031 上海市第一人民医院神经外科中国科学院上海生命科学研究中心

肿瘤的发生是具有其分子生物学基础的。自80年代以来许多技术相继开发应用到肿瘤的分子遗传学研究，并取得了显著的成效。这些检测DNA变异的手段按检测对象分为两类，一类主要用于基因组DNA的检测，如肿病原癌基因和抑癌基因的定位克降... 详细信息

肿瘤的发生是具有其分子生物学基础的。自80年代以来许多技术相继开发应用到肿瘤的分子遗传学研究，并取得了显著的成效。这些检测DNA变异的手段按检测对象分为两类，一类主要用于基因组DNA的检测，如肿病原癌基因和抑癌基因的定位克降、比较基因组杂交、代表性差异分析；用于cDNA或mRNA水平的技术包括消减杂交、差异显示PCR、cDNA代表性差异分析对、DNA芯片及探针微列冲等。这些技术的应用为肿瘤的分子造传学研究开拓了一个崭新的领域。

关键词：肿瘤分子遗传学癌基因抑癌基因研究方法

散发性结直肠癌患者18号染色体高频杂合缺失的研究

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中华实验外科杂志 2002年第4期19卷 320-321页

作者：张放周崇治凌云柏邵春刘万清裘国强贺林彭志海上海市第一人民医院普外科 200080 中国科学院上海生理学研究所人类分子遗传实验室

目的　探讨散发性结直肠癌患者 18号染色体上抑癌基因相关的杂合缺失 (LOH )情况 ,并探索新的抑癌基因位点。方法　对 83例散发性结直肠癌患者基因组DNA用 14个不同荧光标记的高度多态性微卫星引物 ,扩增相应的微卫星位点 ,平均距离为 1... 详细信息

目的　探讨散发性结直肠癌患者 18号染色体上抑癌基因相关的杂合缺失 (LOH )情况 ,并探索新的抑癌基因位点。方法　对 83例散发性结直肠癌患者基因组DNA用 14个不同荧光标记的高度多态性微卫星引物 ,扩增相应的微卫星位点 ,平均距离为 10厘摩 (centi morgan ,cM )。用ABIPRISM 3 77测序仪进行基因扫描 ,统计各位点杂合缺失率。结果　在 12个获得有效数据的微卫星位点中 ,平均杂合缺失率为 3 6.78% ,18p中最高为D18S5 3 (3 8.0 9% ) ,18q中最高为D18S474(5 5 .74% )。 4位患者的 18号染色体所有杂合位点都存在缺失 ,3 0位患者的杂合缺失位点不少于 5 0 % (平均 6个 /人 ) ;缺失位点少于 5 0 %的有 5 3人 (平均 1个 /人 )。结论　结直肠癌患者 18号染色体存在高频的LOH ,并以整体缺失为特点。存在高频LOH的区域定位有转化生长因子 (TGF)信号传导相关基因、结直肠癌缺失基因 (DCC)、Rb结合蛋白 8(RbBP8) ,特别是TGF信号传导相关基因MADH 2、4、转化生长因子 β1反应元件 (TGF β1)等的缺失可能对结直肠癌的发生有重要影响。 18p也有存在未知抑癌基因的可能。

关键词：散发性结直肠癌 18号染色体高频杂合缺失肿瘤抑制基因微卫星位点基因扫描

5-羟色胺转运体基因VNTR位点与双相情感性障碍的关联分析

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中华医学遗传学杂志 1998年第6期15卷 345-348页

作者：刘万清顾牛范冯国鄞张建刚李胜柏邵春沈韬贺林中国科学院上海生命科学研究中心上海精神卫生中心英国阿伯丁大学

目的探讨５－羟色胺转运体基因第２内含子ＶＮＴＲ区域在中国人群中的群体遗传学背景，以及与双相情感障碍的关系。方法利用ＰＣＲ等方法在１７０个随机健康中国人中对５－羟色胺转运体基因第２内含子的ＶＮＴＰ多态性位点进行了群体遗... 详细信息

目的探讨５－羟色胺转运体基因第２内含子ＶＮＴＲ区域在中国人群中的群体遗传学背景，以及与双相情感障碍的关系。方法利用ＰＣＲ等方法在１７０个随机健康中国人中对５－羟色胺转运体基因第２内含子的ＶＮＴＰ多态性位点进行了群体遗传学研究，并就该位点与双相情感障碍的关系进行了关联分析。结果该位点在中国人群中的多态信息含量为０．１２，杂合度为１２％，且符合孟德尔遗传方式；其基因型分布、等位片段频率在中国汉族人群与高加索人种间存在着极显著性差异（Ｐ＜１０－８）；在与情感性障碍的关联分析中发现该多态性位点的等位片段１０与双相情感障碍女性群体存在着显著的关联（Ｐ＝０．０４３）。结论该结果表明：５－羟色胺转运体基因ＶＮＴＲ的位点多态性在中国人群与高加索人群间存在极显著的差异；同时，在男女性双相情感障碍群体中的差别可能暗示了该疾病的发病机理在性别上的差异。

关键词：情感障碍双相情感障碍羟色胺转运体基因 VNTR

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城市轨道交通突发事件风险等级判别方法

吉林大学学报（工学版） 2024年第2期54卷 427-435页

作者：范博松邵春福中国人民公安大学交通管理学院北京100038 北京交通大学综合交通运输大数据应用技术交通运输行业重点实验室北京100044 新疆大学交通运输工程学院乌鲁木齐830046

为提升风险等级判别的准确性,破解城市轨道交通系统风险实时管控和事件应急处理的关键问题,构建了改进的特征选择算法(Im-F-score+XGB)对突发事件风险因素的特征进行筛选,通过分析城市轨道交通突发事件的基础数据,计算各风险特征的重要... 详细信息

为提升风险等级判别的准确性,破解城市轨道交通系统风险实时管控和事件应急处理的关键问题,构建了改进的特征选择算法(Im-F-score+XGB)对突发事件风险因素的特征进行筛选,通过分析城市轨道交通突发事件的基础数据,计算各风险特征的重要度,挖掘不同特征对突发事件风险等级的影响程度,得到突发事件风险等级判定的重要特征;同时,采用多时间窗循环扫描方法和加权级联残差森林模型相融合的思路,获得突发事件风险等级与风险特征的映射关系,建立了改进的突发事件风险等级判别模型(Im-F-GCF)。通过与RF、HGBDT、GCF、LightGBM 4个代表模型对比分析,显示出本文提出的Im-F-GCF模型的有效性。

关键词：交通运输规划与管理城市轨道交通突发事件风险等级特征选择加权级联残差森林

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阶段性技术适配:基层政府数字化转型的渐进路径分析

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求实 2024年第3期 31-43,M0004页

作者：邵春霞程风同济大学政治与国际关系学院上海年200092

阶段性技术适配是指基层政府数字化转型过程中数字技术应用与基层治理变革的适配,即影响数字技术应用的变革动力、数字技术和基层治理体系及能力在各阶段的相互匹配。其中,变革动力与数字技术的适配在实践中体现为技术应用的差异性发展... 详细信息

阶段性技术适配是指基层政府数字化转型过程中数字技术应用与基层治理变革的适配,即影响数字技术应用的变革动力、数字技术和基层治理体系及能力在各阶段的相互匹配。其中,变革动力与数字技术的适配在实践中体现为技术应用的差异性发展阶段,而数字技术与基层治理体系及能力的适配则表现为技术科层系统的不断发展与成熟。基层政府要注重在数字治理变革各阶段实现技术与治理的适配:一方面,结合主要动力变化,及时转变数字技术的应用方式;另一方面,根据数字技术应用所处阶段,适时调整技术定位以激发治理体系与治理能力的良性互动。

关键词：政府治理数字政府数字技术基层治理技术适配技术动力